MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 5839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385856166
2	NC_017518	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385856166
3	NC_017518	GTCC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	25 %	50 %	385856168
4	NC_017518	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	385856168
5	NC_017518	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017518	CGGA	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	385856169
7	NC_017518	GCCC	2	8	3031	3038	0 %	0 %	25 %	75 %	385856169
8	NC_017518	TGCC	2	8	3812	3819	0 %	25 %	25 %	50 %	385856171
9	NC_017518	ACAA	2	8	4037	4044	75 %	0 %	0 %	25 %	385856171
10	NC_017518	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_017518	CGCC	2	8	5365	5372	0 %	0 %	25 %	75 %	385856173
12	NC_017518	TTTC	2	8	5493	5500	0 %	75 %	0 %	25 %	385856173
13	NC_017518	GCAC	2	8	6155	6162	25 %	0 %	25 %	50 %	385856174
14	NC_017518	GGCA	2	8	6312	6319	25 %	0 %	50 %	25 %	385856175
15	NC_017518	TCGG	2	8	6676	6683	0 %	25 %	50 %	25 %	385856175
16	NC_017518	CGCC	2	8	6950	6957	0 %	0 %	25 %	75 %	385856175
17	NC_017518	GTTT	2	8	7163	7170	0 %	75 %	25 %	0 %	385856175
18	NC_017518	TCGG	2	8	7267	7274	0 %	25 %	50 %	25 %	385856175
19	NC_017518	GACG	2	8	7299	7306	25 %	0 %	50 %	25 %	385856175
20	NC_017518	GTTT	2	8	7668	7675	0 %	75 %	25 %	0 %	385856176
21	NC_017518	TCTT	2	8	8506	8513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017518	ACGC	2	8	8764	8771	25 %	0 %	25 %	50 %	385856177
23	NC_017518	CATC	2	8	9400	9407	25 %	25 %	0 %	50 %	385856177
24	NC_017518	TTTA	2	8	10392	10399	25 %	75 %	0 %	0 %	385856178
25	NC_017518	CGAC	2	8	10461	10468	25 %	0 %	25 %	50 %	385856178
26	NC_017518	CAGC	2	8	11182	11189	25 %	0 %	25 %	50 %	385856178
27	NC_017518	CAGG	2	8	11197	11204	25 %	0 %	50 %	25 %	385856178
28	NC_017518	GAAG	2	8	11586	11593	50 %	0 %	50 %	0 %	385856179
29	NC_017518	GGAC	2	8	11756	11763	25 %	0 %	50 %	25 %	385856179
30	NC_017518	CCGA	2	8	12986	12993	25 %	0 %	25 %	50 %	385856180
31	NC_017518	GGCA	2	8	13359	13366	25 %	0 %	50 %	25 %	385856181
32	NC_017518	GGCA	2	8	13468	13475	25 %	0 %	50 %	25 %	385856181
33	NC_017518	ACAA	2	8	14305	14312	75 %	0 %	0 %	25 %	385856181
34	NC_017518	TAAA	2	8	14807	14814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017518	TCAG	2	8	15219	15226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017518	TAAA	2	8	16191	16198	75 %	25 %	0 %	0 %	385856182
37	NC_017518	GTTC	2	8	16847	16854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017518	ATTT	2	8	17382	17389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017518	TTTC	2	8	18095	18102	0 %	75 %	0 %	25 %	385856184
40	NC_017518	GGGT	2	8	18284	18291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017518	TGGG	2	8	18292	18299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017518	CCGT	2	8	25184	25191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017518	TGTT	2	8	25245	25252	0 %	75 %	25 %	0 %	385856193
44	NC_017518	TAAA	2	8	25521	25528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017518	TGCC	2	8	25904	25911	0 %	25 %	25 %	50 %	385856194
46	NC_017518	CGGA	2	8	26028	26035	25 %	0 %	50 %	25 %	385856194
47	NC_017518	GGCG	2	8	26316	26323	0 %	0 %	75 %	25 %	385856194
48	NC_017518	TTTG	2	8	26971	26978	0 %	75 %	25 %	0 %	385856195
49	NC_017518	CAGT	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	385856195
50	NC_017518	GTCC	2	8	27628	27635	0 %	25 %	25 %	50 %	385856195
51	NC_017518	CCAG	2	8	27850	27857	25 %	0 %	25 %	50 %	385856195
52	NC_017518	TCGG	2	8	28140	28147	0 %	25 %	50 %	25 %	385856195
53	NC_017518	TGTT	2	8	28335	28342	0 %	75 %	25 %	0 %	385856195
54	NC_017518	CCAA	2	8	29642	29649	50 %	0 %	0 %	50 %	385856196
55	NC_017518	GCGA	2	8	29860	29867	25 %	0 %	50 %	25 %	385856196
56	NC_017518	GGCA	2	8	29895	29902	25 %	0 %	50 %	25 %	385856196
57	NC_017518	TGAT	2	8	30190	30197	25 %	50 %	25 %	0 %	385856196
58	NC_017518	GGGA	2	8	30732	30739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017518	TGCC	2	8	30777	30784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017518	CTCG	2	8	30842	30849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017518	GCAG	2	8	31161	31168	25 %	0 %	50 %	25 %	385856197
62	NC_017518	CGGG	2	8	31456	31463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017518	CTTC	2	8	32469	32476	0 %	50 %	0 %	50 %	385856198
64	NC_017518	GGCA	2	8	32621	32628	25 %	0 %	50 %	25 %	385856198
65	NC_017518	CCGG	2	8	33010	33017	0 %	0 %	50 %	50 %	385856198
66	NC_017518	GTTC	2	8	33336	33343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017518	GCCG	2	8	33799	33806	0 %	0 %	50 %	50 %	385856199
68	NC_017518	GCCG	2	8	34272	34279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017518	TCCG	2	8	35137	35144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017518	AACC	2	8	35629	35636	50 %	0 %	0 %	50 %	385856200
71	NC_017518	CAGG	2	8	35797	35804	25 %	0 %	50 %	25 %	385856200
72	NC_017518	CCGC	2	8	35900	35907	0 %	0 %	25 %	75 %	385856200
73	NC_017518	CGGT	2	8	36045	36052	0 %	25 %	50 %	25 %	385856200
74	NC_017518	TGTT	2	8	37307	37314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017518	TTGT	2	8	37364	37371	0 %	75 %	25 %	0 %	385856202
76	NC_017518	GGCG	2	8	37408	37415	0 %	0 %	75 %	25 %	385856202
77	NC_017518	GGCG	2	8	37741	37748	0 %	0 %	75 %	25 %	385856202
78	NC_017518	GGTC	2	8	38134	38141	0 %	25 %	50 %	25 %	385856202
79	NC_017518	TTTC	2	8	38233	38240	0 %	75 %	0 %	25 %	385856202
80	NC_017518	GGGT	2	8	38778	38785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017518	TTGG	2	8	38852	38859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017518	GACG	2	8	38959	38966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017518	AAGG	2	8	39041	39048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017518	TTTC	2	8	39063	39070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017518	ATCG	2	8	39513	39520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017518	GGCG	2	8	39981	39988	0 %	0 %	75 %	25 %	385856203
87	NC_017518	CGAA	2	8	39992	39999	50 %	0 %	25 %	25 %	385856203
88	NC_017518	TCCG	2	8	40662	40669	0 %	25 %	25 %	50 %	385856203
89	NC_017518	AAAC	2	8	40824	40831	75 %	0 %	0 %	25 %	385856203
90	NC_017518	GAAC	2	8	41682	41689	50 %	0 %	25 %	25 %	385856204
91	NC_017518	GCAG	2	8	41900	41907	25 %	0 %	50 %	25 %	385856205
92	NC_017518	TCCG	2	8	42200	42207	0 %	25 %	25 %	50 %	385856205
93	NC_017518	TGTT	2	8	43103	43110	0 %	75 %	25 %	0 %	385856206
94	NC_017518	GACA	2	8	43730	43737	50 %	0 %	25 %	25 %	385856206
95	NC_017518	GCAG	2	8	43899	43906	25 %	0 %	50 %	25 %	385856206
96	NC_017518	AAAG	2	8	43927	43934	75 %	0 %	25 %	0 %	385856206
97	NC_017518	GGCG	2	8	44515	44522	0 %	0 %	75 %	25 %	385856207
98	NC_017518	TGCT	2	8	44766	44773	0 %	50 %	25 %	25 %	385856207
99	NC_017518	CATC	2	8	44799	44806	25 %	25 %	0 %	50 %	385856207
100	NC_017518	ACCT	2	8	45920	45927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017518	ACCC	2	8	46007	46014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_017518	AAAG	2	8	46134	46141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017518	AATA	2	8	46382	46389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017518	TTTG	2	8	47599	47606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017518	GGGC	2	8	47830	47837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017518	TGAG	2	8	48045	48052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017518	ACCG	2	8	48280	48287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017518	CCAT	2	8	48312	48319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017518	ATCC	2	8	48481	48488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017518	GCGG	2	8	48617	48624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017518	CGAG	2	8	50121	50128	25 %	0 %	50 %	25 %	385856208
112	NC_017518	CGGA	2	8	50338	50345	25 %	0 %	50 %	25 %	385856208
113	NC_017518	TGCC	2	8	50347	50354	0 %	25 %	25 %	50 %	385856208
114	NC_017518	CTGC	2	8	50418	50425	0 %	25 %	25 %	50 %	385856208
115	NC_017518	GGCG	2	8	52003	52010	0 %	0 %	75 %	25 %	385856209
116	NC_017518	CGGG	2	8	53064	53071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017518	TGCG	2	8	53175	53182	0 %	25 %	50 %	25 %	385856210
118	NC_017518	TTGG	2	8	54214	54221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017518	GAAG	2	8	54370	54377	50 %	0 %	50 %	0 %	385856211
120	NC_017518	TCCT	2	8	54644	54651	0 %	50 %	0 %	50 %	385856211
121	NC_017518	TGCC	2	8	54919	54926	0 %	25 %	25 %	50 %	385856211
122	NC_017518	TTGC	2	8	55028	55035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017518	TTGA	2	8	55308	55315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017518	GAAT	2	8	55406	55413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017518	AATG	2	8	55445	55452	50 %	25 %	25 %	0 %	385856212
126	NC_017518	GCGG	2	8	55491	55498	0 %	0 %	75 %	25 %	385856212
127	NC_017518	GTAT	2	8	55813	55820	25 %	50 %	25 %	0 %	385856212
128	NC_017518	TTGG	2	8	55892	55899	0 %	50 %	50 %	0 %	385856212
129	NC_017518	ATGA	2	8	56441	56448	50 %	25 %	25 %	0 %	385856213
130	NC_017518	GGAA	2	8	57095	57102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017518	AGAC	2	8	57181	57188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017518	GCTT	2	8	57339	57346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017518	TGGT	2	8	57506	57513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017518	GTAG	2	8	58691	58698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017518	AGAA	2	8	58803	58810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017518	GTTT	2	8	59239	59246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017518	GCGA	2	8	59713	59720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017518	AAAC	2	8	60253	60260	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017518	GACA	2	8	60408	60415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017518	AAAG	2	8	60550	60557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017518	ACTG	2	8	62390	62397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017518	TACT	2	8	63483	63490	25 %	50 %	0 %	25 %	385856215
143	NC_017518	TTGT	2	8	63653	63660	0 %	75 %	25 %	0 %	385856215
144	NC_017518	TCGG	2	8	63800	63807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017518	TGTA	2	8	64968	64975	25 %	50 %	25 %	0 %	385856216
146	NC_017518	GACC	2	8	65236	65243	25 %	0 %	25 %	50 %	385856216
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