MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 1336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017518	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_017518	TCTT	2	8	8506	8513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017518	TAAA	2	8	14807	14814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017518	TCAG	2	8	15219	15226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017518	GTTC	2	8	16847	16854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017518	ATTT	2	8	17382	17389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017518	GGGT	2	8	18284	18291	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017518	TGGG	2	8	18292	18299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017518	CCGT	2	8	25184	25191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017518	TAAA	2	8	25521	25528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017518	GGGA	2	8	30732	30739	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017518	TGCC	2	8	30777	30784	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017518	CTCG	2	8	30842	30849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017518	CGGG	2	8	31456	31463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017518	GTTC	2	8	33336	33343	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017518	GCCG	2	8	34272	34279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017518	TCCG	2	8	35137	35144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017518	TGTT	2	8	37307	37314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017518	GGGT	2	8	38778	38785	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017518	TTGG	2	8	38852	38859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017518	GACG	2	8	38959	38966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017518	AAGG	2	8	39041	39048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017518	TTTC	2	8	39063	39070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017518	ATCG	2	8	39513	39520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017518	ACCT	2	8	45920	45927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017518	ACCC	2	8	46007	46014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_017518	AAAG	2	8	46134	46141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017518	AATA	2	8	46382	46389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017518	TTTG	2	8	47599	47606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017518	GGGC	2	8	47830	47837	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017518	TGAG	2	8	48045	48052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017518	ACCG	2	8	48280	48287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017518	CCAT	2	8	48312	48319	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017518	ATCC	2	8	48481	48488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017518	GCGG	2	8	48617	48624	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017518	CGGG	2	8	53064	53071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017518	TTGG	2	8	54214	54221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017518	TTGC	2	8	55028	55035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017518	TTGA	2	8	55308	55315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017518	GAAT	2	8	55406	55413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017518	GGAA	2	8	57095	57102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017518	AGAC	2	8	57181	57188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017518	GCTT	2	8	57339	57346	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017518	TGGT	2	8	57506	57513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017518	GTAG	2	8	58691	58698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017518	AGAA	2	8	58803	58810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017518	GTTT	2	8	59239	59246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017518	GCGA	2	8	59713	59720	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017518	AAAC	2	8	60253	60260	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017518	GACA	2	8	60408	60415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017518	AAAG	2	8	60550	60557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017518	ACTG	2	8	62390	62397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017518	TCGG	2	8	63800	63807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017518	TTTG	2	8	65406	65413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017518	CAGA	2	8	70256	70263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017518	GATA	2	8	71676	71683	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017518	TCCC	2	8	73027	73034	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017518	TATC	2	8	74342	74349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017518	ATTT	2	8	78927	78934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017518	GGAC	2	8	85424	85431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017518	ATTT	2	8	85455	85462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017518	TATT	2	8	90100	90107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017518	GAAG	2	8	93559	93566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017518	CAAT	2	8	93603	93610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017518	TAAA	2	8	93629	93636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017518	CCGC	2	8	93906	93913	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_017518	TTTC	2	8	95413	95420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017518	GGAA	2	8	96844	96851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017518	CCGT	2	8	98439	98446	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017518	TCAA	2	8	98454	98461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017518	TTAC	2	8	98601	98608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017518	CTGT	2	8	100159	100166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017518	ATTT	2	8	103811	103818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017518	TTAT	2	8	104014	104021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017518	ATCA	2	8	104330	104337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017518	TATT	2	8	104566	104573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017518	CAAC	2	8	105296	105303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017518	CTTA	2	8	105399	105406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017518	AGCA	2	8	105757	105764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017518	TGAA	2	8	106128	106135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017518	ATAA	2	8	106607	106614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017518	ATCA	2	8	106969	106976	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017518	TTAT	2	8	111003	111010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017518	AAAT	2	8	112378	112385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017518	TTCC	2	8	112525	112532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017518	CAGC	2	8	112606	112613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017518	AATA	2	8	113129	113136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017518	AAAT	2	8	113224	113231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017518	CTAA	2	8	113302	113309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017518	TTAG	2	8	113324	113331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017518	CTAA	2	8	113332	113339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017518	AATA	2	8	114057	114064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017518	AAAG	2	8	114137	114144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017518	GCGG	2	8	116839	116846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017518	TGGC	2	8	117044	117051	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017518	GACG	2	8	117316	117323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017518	TGCC	2	8	117451	117458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017518	CTTG	2	8	118865	118872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017518	GCCC	2	8	127603	127610	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_017518	GAAA	2	8	129985	129992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017518	AAAC	2	8	130036	130043	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017518	ATAG	2	8	130167	130174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017518	CGCC	2	8	132950	132957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_017518	ATAA	2	8	135032	135039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017518	AAGG	2	8	135125	135132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017518	ATTT	2	8	138326	138333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017518	AAAT	2	8	138358	138365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017518	CTTC	2	8	142752	142759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017518	CAAT	2	8	152529	152536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017518	TCAA	2	8	169826	169833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017518	GGGC	2	8	187235	187242	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017518	AGGG	2	8	188572	188579	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017518	CGGG	2	8	188715	188722	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017518	CGGG	2	8	190222	190229	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017518	CGGA	2	8	191837	191844	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017518	TTCT	2	8	191926	191933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017518	TTTG	2	8	196433	196440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017518	GCAA	2	8	204717	204724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017518	CTGT	2	8	206101	206108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017518	TTTG	2	8	207692	207699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017518	TAAT	2	8	208812	208819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017518	AAAT	2	8	213067	213074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017518	GCGG	2	8	217069	217076	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017518	CGAC	2	8	218152	218159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017518	GGAT	2	8	221897	221904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017518	GGAT	2	8	222033	222040	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017518	GGAT	2	8	222169	222176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017518	GGAT	2	8	222305	222312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017518	GGAT	2	8	222441	222448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017518	TCCA	2	8	222794	222801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017518	GTTT	2	8	224555	224562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017518	TCCG	2	8	225595	225602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017518	TTTC	2	8	226936	226943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017518	GGTA	2	8	227407	227414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017518	GTTG	2	8	229140	229147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017518	AAAT	2	8	229561	229568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017518	TCTA	2	8	229601	229608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017518	GGCA	2	8	231814	231821	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017518	GGGC	2	8	232388	232395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017518	CCGC	2	8	232423	232430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_017518	AAAG	2	8	232520	232527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017518	ACAA	2	8	235973	235980	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017518	TCTT	2	8	237226	237233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017518	CTCC	2	8	237426	237433	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_017518	GACG	2	8	244581	244588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017518	AATT	2	8	245414	245421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017518	AAGT	2	8	245620	245627	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017518	ATCA	2	8	246294	246301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017518	TATT	2	8	249151	249158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017518	GGAT	2	8	252604	252611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017518	CAAG	2	8	252639	252646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017518	AAAC	2	8	252787	252794	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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