MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis NZ-05/33 chromosome

Total Repeats: 32191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017518	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856166
2	NC_017518	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856166
3	NC_017518	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856166
4	NC_017518	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856166
5	NC_017518	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856166
6	NC_017518	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856167
7	NC_017518	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856167
8	NC_017518	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
9	NC_017518	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
10	NC_017518	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856168
11	NC_017518	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
12	NC_017518	TCG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
13	NC_017518	TCG	3	9	1471	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
14	NC_017518	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856168
15	NC_017518	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856168
16	NC_017518	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
17	NC_017518	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
18	NC_017518	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856168
19	NC_017518	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
20	NC_017518	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856168
21	NC_017518	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856168
22	NC_017518	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
23	NC_017518	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
24	NC_017518	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
25	NC_017518	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856168
26	NC_017518	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856168
27	NC_017518	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856168
28	NC_017518	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
29	NC_017518	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856168
30	NC_017518	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856168
31	NC_017518	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856168
32	NC_017518	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856168
33	NC_017518	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017518	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017518	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856169
36	NC_017518	TCC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385856169
37	NC_017518	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856169
38	NC_017518	CAC	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856169
39	NC_017518	TGT	2	6	2749	2754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856169
40	NC_017518	CCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856169
41	NC_017518	CGG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856169
42	NC_017518	CGG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856169
43	NC_017518	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856170
44	NC_017518	GAT	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856170
45	NC_017518	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856170
46	NC_017518	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856170
47	NC_017518	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856170
48	NC_017518	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856170
49	NC_017518	GCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856170
50	NC_017518	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856170
51	NC_017518	TTC	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856170
52	NC_017518	GGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856170
53	NC_017518	TGC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856170
54	NC_017518	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017518	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856171
56	NC_017518	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856171
57	NC_017518	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856171
58	NC_017518	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017518	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017518	CGG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856172
61	NC_017518	CAA	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856172
62	NC_017518	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856172
63	NC_017518	CGG	2	6	4728	4733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856172
64	NC_017518	AAC	3	9	4736	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856172
65	NC_017518	CGT	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856172
66	NC_017518	CTG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856172
67	NC_017518	CGA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856172
68	NC_017518	AAC	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856172
69	NC_017518	TCG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856172
70	NC_017518	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856172
71	NC_017518	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856173
72	NC_017518	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
73	NC_017518	CCG	3	9	5170	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
74	NC_017518	CTG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856173
75	NC_017518	ACA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385856173
76	NC_017518	AGA	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856173
77	NC_017518	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856173
78	NC_017518	AGA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856173
79	NC_017518	CGT	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856173
80	NC_017518	CCG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
81	NC_017518	CCG	3	9	5662	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856173
82	NC_017518	GCT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856173
83	NC_017518	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856173
84	NC_017518	CCA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856173
85	NC_017518	CAA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017518	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856174
87	NC_017518	GCC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856174
88	NC_017518	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856174
89	NC_017518	CGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
90	NC_017518	AGC	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856175
91	NC_017518	CCG	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
92	NC_017518	CGC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
93	NC_017518	CGG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856175
94	NC_017518	GCG	3	9	6565	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856175
95	NC_017518	ATC	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856175
96	NC_017518	ACG	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856175
97	NC_017518	GCC	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
98	NC_017518	TTC	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856175
99	NC_017518	CCG	3	9	6811	6819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
100	NC_017518	TGG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856175
101	NC_017518	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856175
102	NC_017518	AAG	2	6	7064	7069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385856175
103	NC_017518	TCT	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385856175
104	NC_017518	TTG	2	6	7111	7116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385856175
105	NC_017518	GCA	2	6	7130	7135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856175
106	NC_017518	GCC	2	6	7212	7217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856175
107	NC_017518	CGT	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856175
108	NC_017518	TCA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856175
109	NC_017518	GTC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856175
110	NC_017518	GGT	2	6	7609	7614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856176
111	NC_017518	GAT	2	6	7907	7912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385856176
112	NC_017518	AAT	2	6	7944	7949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385856176
113	NC_017518	CGA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856176
114	NC_017518	GAC	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856176
115	NC_017518	TGC	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
116	NC_017518	TGC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
117	NC_017518	TGC	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
118	NC_017518	TGG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856176
119	NC_017518	TGG	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385856176
120	NC_017518	GCG	2	6	8240	8245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856176
121	NC_017518	TGC	2	6	8352	8357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856176
122	NC_017518	CCG	3	9	8584	8592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_017518	CGC	2	6	8725	8730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856177
124	NC_017518	CCA	2	6	8908	8913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856177
125	NC_017518	GAC	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856177
126	NC_017518	TCG	2	6	9045	9050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385856177
127	NC_017518	GGC	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856177
128	NC_017518	ACC	2	6	9129	9134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385856177
129	NC_017518	GCC	2	6	9137	9142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385856177
130	NC_017518	GAC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385856177
131	NC_017518	ATC	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385856177
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257	NC_017518	CCG	2	6	19427	19432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
258	NC_017518	GGC	2	6	19525	19530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385856186
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