MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240355 chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017517	CGGTGG	2	12	24976	24987	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017517	GGCTTG	2	12	31189	31200	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017517	TTGCCG	2	12	39446	39457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017517	CGGCAT	2	12	40173	40184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017517	TATAAG	2	12	80704	80715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017517	AAATTT	2	12	105906	105917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017517	CTTATG	2	12	115748	115759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017517	GGAAAA	2	12	134162	134173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017517	TAAACC	2	12	180708	180719	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017517	CAAAAA	2	12	194184	194195	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017517	CAAAAA	2	12	194500	194511	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017517	TTCGGT	2	12	200576	200587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017517	CAAAAA	2	12	224391	224402	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017517	CAAAAA	2	12	225414	225425	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017517	AAGTGA	2	12	238823	238834	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017517	TCCCTT	2	12	245975	245986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017517	TTAAAT	2	12	291159	291170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017517	TTAAAT	2	12	307022	307033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017517	TAAAAA	2	12	311598	311609	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017517	CTTTGC	2	12	331866	331877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017517	TTCGGT	2	12	335782	335793	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017517	ATTTAA	2	12	343766	343777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017517	TTTGAA	2	12	363575	363586	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017517	GCGAAA	2	12	387285	387296	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017517	TTAAAT	2	12	399328	399339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017517	TTCGGA	6	36	402487	402522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017517	TTCAGA	6	36	402523	402558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017517	TTGATA	2	12	422378	422389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017517	TGATTT	2	12	439313	439324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017517	AAACGC	2	12	450829	450840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017517	ACCGAA	2	12	478787	478798	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017517	TTTCCG	2	12	481557	481568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017517	TTAAAT	2	12	485652	485663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017517	TTCGGT	2	12	502082	502093	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017517	ATAAAA	2	12	524060	524071	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017517	TTAAAT	2	12	535494	535505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017517	TATGCT	2	12	566809	566820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017517	TTAAAT	2	12	596150	596161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017517	CAAATC	2	12	596352	596363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017517	GGTTTT	2	12	607025	607036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017517	AATTTA	2	12	610619	610630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017517	ATGCCG	2	12	617470	617481	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017517	CGAAAA	2	12	628127	628138	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017517	AAATCC	2	12	638963	638974	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017517	TCGGTT	2	12	639352	639363	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017517	TCGGTT	2	12	639705	639716	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017517	AAAAAC	2	12	641053	641064	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017517	TTCAAA	2	12	648763	648774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017517	ATCCGC	2	12	658481	658492	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017517	CGGACA	2	12	679388	679399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017517	TTATGT	2	12	710319	710330	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017517	TTCGGT	2	12	743202	743213	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017517	TTTTTG	2	12	760814	760825	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017517	ATTTAA	2	12	763869	763880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017517	CCTTAA	2	12	769321	769332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017517	ATTTAA	2	12	769646	769657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017517	GAATCC	2	12	769695	769706	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017517	CGTTTG	2	12	793245	793256	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017517	CGCCTG	2	12	805373	805384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017517	AAAATA	2	12	808906	808917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017517	TTCGGA	2	12	818847	818858	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017517	GGAAAG	2	12	879855	879866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017517	TTAAAT	2	12	881353	881364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017517	ACGGAT	2	12	894798	894809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017517	GTCGAT	2	12	896961	896972	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017517	ATCAAA	2	12	904853	904864	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017517	TTTATC	2	12	904942	904953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017517	AAGGAT	2	12	915464	915475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017517	AAGGAA	2	12	928006	928017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017517	ATTTAT	2	12	928906	928917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017517	TTCAAT	2	12	928918	928929	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017517	TTGGGT	2	12	943713	943724	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017517	TAATCA	2	12	970185	970196	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017517	ATTTAA	2	12	976097	976108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017517	ATTTAA	2	12	1010105	1010116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017517	TCTTTG	2	12	1022015	1022026	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017517	ATTTTT	2	12	1028122	1028133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017517	TTAAAT	2	12	1033643	1033654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017517	AAAACC	2	12	1038406	1038417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017517	TTGTTT	2	12	1051394	1051405	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017517	ATTTAA	2	12	1052668	1052679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017517	TTAAAT	2	12	1060523	1060534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017517	TGGCGG	2	12	1062812	1062823	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017517	CAAATT	2	12	1067223	1067234	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017517	AATTTG	2	12	1088558	1088569	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017517	ATTTAA	2	12	1103688	1103699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017517	CCTCTG	2	12	1119539	1119550	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017517	CAAAGC	2	12	1136178	1136189	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017517	CCCGTT	2	12	1153795	1153806	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017517	GAAAAA	2	12	1178548	1178559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017517	GAAACC	2	12	1187457	1187468	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017517	TGCGGG	2	12	1220001	1220012	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017517	AACGTT	2	12	1225674	1225685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017517	TGCCGA	2	12	1238878	1238889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017517	CTTCGT	2	12	1258014	1258025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017517	GCTGTG	2	12	1266247	1266258	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017517	TTTCAG	2	12	1292785	1292796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017517	CCGGCT	2	12	1292898	1292909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017517	AAACAC	2	12	1309346	1309357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017517	GCTGCC	2	12	1326342	1326353	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017517	GCCAAA	2	12	1367892	1367903	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017517	GCGTTG	2	12	1385476	1385487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017517	AACAAA	2	12	1386132	1386143	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017517	TATCAA	2	12	1390481	1390492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017517	TAAATA	2	12	1410397	1410408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017517	GACAAA	2	12	1411649	1411660	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017517	GACGGC	2	12	1418638	1418649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017517	AAAAAT	2	12	1418786	1418797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017517	TTAATT	2	12	1421455	1421466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017517	ATTTTT	2	12	1432480	1432491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017517	ATTTAA	2	12	1432528	1432539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017517	TTAAAT	2	12	1438597	1438608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017517	GCCATA	2	12	1442311	1442322	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017517	AAGAGA	2	12	1443634	1443645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017517	ACAGGC	2	12	1494201	1494212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017517	AACCCA	2	12	1529044	1529055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017517	TTCGGT	2	12	1533976	1533987	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017517	TTCGGT	2	12	1534256	1534267	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017517	TTCGGT	2	12	1534536	1534547	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017517	TTCGGT	2	12	1534665	1534676	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017517	TTAAAT	2	12	1553735	1553746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017517	ATTTAA	2	12	1553812	1553823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017517	AAAACG	2	12	1562800	1562811	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017517	TTAAAT	2	12	1567865	1567876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017517	GTCAAA	2	12	1619613	1619624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017517	CTTTGC	2	12	1620100	1620111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017517	TTAAAT	2	12	1626658	1626669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017517	ATTTAA	2	12	1644218	1644229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017517	GATACG	2	12	1654847	1654858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017517	GATTCA	2	12	1656705	1656716	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017517	ACCGAA	2	12	1662513	1662524	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017517	ACCGAA	2	12	1662828	1662839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017517	TTAAAT	2	12	1663083	1663094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017517	AACCGA	2	12	1672176	1672187	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017517	GCAGCC	2	12	1685551	1685562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017517	AAAATC	2	12	1705166	1705177	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017517	GCCTTC	2	12	1711647	1711658	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017517	CATTTC	2	12	1751678	1751689	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017517	ATTTTG	2	12	1845507	1845518	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017517	ATTTAA	2	12	1850926	1850937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017517	CGCGGT	2	12	1851141	1851152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017517	GAATTT	2	12	1866987	1866998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017517	ATTTAA	2	12	1869261	1869272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017517	TTCGGT	2	12	1899646	1899657	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017517	TTAAAT	2	12	1908851	1908862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017517	TCAAAA	2	12	1924665	1924676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017517	CCAATG	2	12	1926088	1926099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017517	TCATAA	2	12	1926382	1926393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_017517	AAAACG	2	12	1930803	1930814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_017517	ATTTAA	2	12	1937317	1937328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017517	GGGTTG	2	12	1962766	1962777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017517	ATTTAA	2	12	2000849	2000860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017517	CAGCAT	2	12	2000961	2000972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017517	TTAAAT	2	12	2011877	2011888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017517	CGCCCC	2	12	2020851	2020862	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
156	NC_017517	TTAAAT	2	12	2033400	2033411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017517	CGGCAT	2	12	2062898	2062909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_017517	TTCGGT	2	12	2104083	2104094	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017517	CGGCTT	2	12	2127839	2127850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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168	NC_017517	TTAAAT	2	12	2283441	2283452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.