MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis M01-240355 chromosome

Total Repeats: 1659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017517	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385854195
2	NC_017517	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385854196
3	NC_017517	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385854196
4	NC_017517	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385854198
5	NC_017517	CCAGC	2	10	4772	4781	20 %	0 %	20 %	60 %	385854200
6	NC_017517	AAGGC	2	10	6080	6089	40 %	0 %	40 %	20 %	385854202
7	NC_017517	GCTTT	2	10	6440	6449	0 %	60 %	20 %	20 %	385854203
8	NC_017517	TACCG	2	10	8556	8565	20 %	20 %	20 %	40 %	385854204
9	NC_017517	TCAAT	2	10	9469	9478	40 %	40 %	0 %	20 %	385854205
10	NC_017517	CCCGT	2	10	10503	10512	0 %	20 %	20 %	60 %	385854206
11	NC_017517	CACGC	2	10	10798	10807	20 %	0 %	20 %	60 %	385854207
12	NC_017517	TCCCG	2	10	11652	11661	0 %	20 %	20 %	60 %	385854207
13	NC_017517	TGTCG	2	10	13108	13117	0 %	40 %	40 %	20 %	385854208
14	NC_017517	ATTTA	2	10	13455	13464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017517	GGAAA	2	10	17152	17161	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017517	TTTTA	2	10	17304	17313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017517	AATTT	2	10	17529	17538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017517	ATTTC	2	10	20238	20247	20 %	60 %	0 %	20 %	385854215
19	NC_017517	CCGCT	2	10	20496	20505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017517	CAAAC	2	10	23936	23945	60 %	0 %	0 %	40 %	385854220
21	NC_017517	CCGCG	2	10	25199	25208	0 %	0 %	40 %	60 %	385854221
22	NC_017517	AAGGC	2	10	26959	26968	40 %	0 %	40 %	20 %	385854222
23	NC_017517	AGGGC	2	10	29081	29090	20 %	0 %	60 %	20 %	385854223
24	NC_017517	AAACC	2	10	29784	29793	60 %	0 %	0 %	40 %	385854224
25	NC_017517	TCCGC	2	10	33084	33093	0 %	20 %	20 %	60 %	385854226
26	NC_017517	GCCTT	2	10	35916	35925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017517	GCAGG	2	10	36002	36011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017517	GCGCC	2	10	37608	37617	0 %	0 %	40 %	60 %	385854230
29	NC_017517	CATTC	2	10	37665	37674	20 %	40 %	0 %	40 %	385854230
30	NC_017517	AGGTG	2	10	38112	38121	20 %	20 %	60 %	0 %	385854231
31	NC_017517	GTCGG	2	10	38801	38810	0 %	20 %	60 %	20 %	385854231
32	NC_017517	GGGCT	2	10	40775	40784	0 %	20 %	60 %	20 %	385854232
33	NC_017517	GGCGG	2	10	44273	44282	0 %	0 %	80 %	20 %	385854235
34	NC_017517	GCGGT	2	10	44749	44758	0 %	20 %	60 %	20 %	385854236
35	NC_017517	GCGCG	2	10	45146	45155	0 %	0 %	60 %	40 %	385854236
36	NC_017517	ACGGC	2	10	45691	45700	20 %	0 %	40 %	40 %	385854236
37	NC_017517	CCCGT	2	10	46619	46628	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017517	GAAAA	2	10	47855	47864	80 %	0 %	20 %	0 %	385854237
39	NC_017517	GAACG	2	10	48510	48519	40 %	0 %	40 %	20 %	385854237
40	NC_017517	TTTGA	2	10	48957	48966	20 %	60 %	20 %	0 %	385854237
41	NC_017517	GAAAA	2	10	49620	49629	80 %	0 %	20 %	0 %	385854237
42	NC_017517	CAATT	2	10	49963	49972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017517	AAACC	2	10	56555	56564	60 %	0 %	0 %	40 %	385854239
44	NC_017517	CCCGC	2	10	57052	57061	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_017517	GCCAA	2	10	57514	57523	40 %	0 %	20 %	40 %	385854240
46	NC_017517	GTGCG	2	10	58906	58915	0 %	20 %	60 %	20 %	385854241
47	NC_017517	TCGTG	2	10	62296	62305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017517	GGGAG	2	10	63921	63930	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017517	AGGTT	2	10	64863	64872	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017517	ATTTT	2	10	67278	67287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017517	TGCCG	2	10	69330	69339	0 %	20 %	40 %	40 %	385854247
52	NC_017517	TGGCT	2	10	69659	69668	0 %	40 %	40 %	20 %	385854247
53	NC_017517	TGCCC	2	10	70266	70275	0 %	20 %	20 %	60 %	385854247
54	NC_017517	TCTTT	2	10	72150	72159	0 %	80 %	0 %	20 %	385854249
55	NC_017517	CGGCG	2	10	73533	73542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017517	AATGG	2	10	73556	73565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017517	GGGTA	2	10	73740	73749	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017517	TCGGC	2	10	74133	74142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017517	TGCTA	2	10	75542	75551	20 %	40 %	20 %	20 %	385854251
60	NC_017517	AGGCC	2	10	76753	76762	20 %	0 %	40 %	40 %	385854252
61	NC_017517	AAGCA	2	10	78328	78337	60 %	0 %	20 %	20 %	385854253
62	NC_017517	TTTAA	2	10	78578	78587	40 %	60 %	0 %	0 %	385854253
63	NC_017517	GATTT	2	10	80491	80500	20 %	60 %	20 %	0 %	385854255
64	NC_017517	TGTAT	2	10	81885	81894	20 %	60 %	20 %	0 %	385854256
65	NC_017517	AAAAG	2	10	82069	82078	80 %	0 %	20 %	0 %	385854257
66	NC_017517	TTTGA	2	10	82692	82701	20 %	60 %	20 %	0 %	385854257
67	NC_017517	TGGCT	2	10	83625	83634	0 %	40 %	40 %	20 %	385854258
68	NC_017517	GCAAG	2	10	84906	84915	40 %	0 %	40 %	20 %	385854260
69	NC_017517	GCGCG	2	10	85965	85974	0 %	0 %	60 %	40 %	385854260
70	NC_017517	CAACG	2	10	86887	86896	40 %	0 %	20 %	40 %	385854260
71	NC_017517	TTGAT	2	10	87200	87209	20 %	60 %	20 %	0 %	385854261
72	NC_017517	TTTCC	2	10	87521	87530	0 %	60 %	0 %	40 %	385854261
73	NC_017517	ATTTT	2	10	87869	87878	20 %	80 %	0 %	0 %	385854261
74	NC_017517	CTACC	2	10	88663	88672	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017517	CCATT	2	10	88848	88857	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017517	CCGCG	2	10	88868	88877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_017517	CCCGT	2	10	93104	93113	0 %	20 %	20 %	60 %	385854265
78	NC_017517	CCGTA	2	10	93341	93350	20 %	20 %	20 %	40 %	385854265
79	NC_017517	ACATC	2	10	94242	94251	40 %	20 %	0 %	40 %	385854266
80	NC_017517	GGCAA	2	10	95500	95509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017517	CGCAA	2	10	95954	95963	40 %	0 %	20 %	40 %	385854267
82	NC_017517	AAACC	2	10	103441	103450	60 %	0 %	0 %	40 %	385854273
83	NC_017517	ACCAA	2	10	105180	105189	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017517	ATTTA	2	10	106002	106011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017517	AAATA	2	10	106012	106021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017517	ATTAA	2	10	106037	106046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017517	CAGGT	2	10	107619	107628	20 %	20 %	40 %	20 %	385854275
88	NC_017517	TTTGA	2	10	108329	108338	20 %	60 %	20 %	0 %	385854275
89	NC_017517	AATGA	2	10	109036	109045	60 %	20 %	20 %	0 %	385854276
90	NC_017517	GAACA	2	10	110921	110930	60 %	0 %	20 %	20 %	385854276
91	NC_017517	CGTGC	2	10	112213	112222	0 %	20 %	40 %	40 %	385854279
92	NC_017517	GCCGC	2	10	113384	113393	0 %	0 %	40 %	60 %	385854280
93	NC_017517	AATTG	2	10	114169	114178	40 %	40 %	20 %	0 %	385854281
94	NC_017517	AAAAT	2	10	114430	114439	80 %	20 %	0 %	0 %	385854281
95	NC_017517	CGGCG	2	10	116270	116279	0 %	0 %	60 %	40 %	385854284
96	NC_017517	CAGGT	2	10	117736	117745	20 %	20 %	40 %	20 %	385854286
97	NC_017517	CGCCT	2	10	118422	118431	0 %	20 %	20 %	60 %	385854287
98	NC_017517	GGTAT	2	10	118662	118671	20 %	40 %	40 %	0 %	385854287
99	NC_017517	GGCGC	2	10	118913	118922	0 %	0 %	60 %	40 %	385854287
100	NC_017517	TGCCG	2	10	120036	120045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017517	GGCGC	3	15	120459	120473	0 %	0 %	60 %	40 %	385854289
102	NC_017517	CAAAG	2	10	120668	120677	60 %	0 %	20 %	20 %	385854289
103	NC_017517	GCGCC	2	10	121875	121884	0 %	0 %	40 %	60 %	385854290
104	NC_017517	GGCGC	2	10	122104	122113	0 %	0 %	60 %	40 %	385854290
105	NC_017517	TGAGT	2	10	123721	123730	20 %	40 %	40 %	0 %	385854292
106	NC_017517	GGCAA	2	10	124298	124307	40 %	0 %	40 %	20 %	385854292
107	NC_017517	CGGCG	2	10	126065	126074	0 %	0 %	60 %	40 %	385854293
108	NC_017517	GTTTT	2	10	126738	126747	0 %	80 %	20 %	0 %	385854294
109	NC_017517	CGTGT	2	10	128502	128511	0 %	40 %	40 %	20 %	385854296
110	NC_017517	GAAAA	2	10	128916	128925	80 %	0 %	20 %	0 %	385854296
111	NC_017517	AGGGC	2	10	129053	129062	20 %	0 %	60 %	20 %	385854296
112	NC_017517	TAATA	2	10	131770	131779	60 %	40 %	0 %	0 %	385854298
113	NC_017517	GCACC	2	10	132565	132574	20 %	0 %	20 %	60 %	385854300
114	NC_017517	GAAGG	2	10	136491	136500	40 %	0 %	60 %	0 %	385854304
115	NC_017517	GTACC	2	10	138062	138071	20 %	20 %	20 %	40 %	385854307
116	NC_017517	TTCCT	2	10	139692	139701	0 %	60 %	0 %	40 %	385854310
117	NC_017517	TTGGG	2	10	143093	143102	0 %	40 %	60 %	0 %	385854310
118	NC_017517	CATAC	2	10	145569	145578	40 %	20 %	0 %	40 %	385854311
119	NC_017517	GTGAT	2	10	146448	146457	20 %	40 %	40 %	0 %	385854311
120	NC_017517	CCTGC	2	10	151799	151808	0 %	20 %	20 %	60 %	385854317
121	NC_017517	CAAAC	2	10	154621	154630	60 %	0 %	0 %	40 %	385854320
122	NC_017517	CTTTA	2	10	155248	155257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017517	TGATT	2	10	158042	158051	20 %	60 %	20 %	0 %	385854326
124	NC_017517	AATGC	2	10	158736	158745	40 %	20 %	20 %	20 %	385854327
125	NC_017517	GTAAA	2	10	159687	159696	60 %	20 %	20 %	0 %	385854330
126	NC_017517	AATTT	2	10	159911	159920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017517	TCAAA	2	10	160759	160768	60 %	20 %	0 %	20 %	385854332
128	NC_017517	TTTGG	2	10	161570	161579	0 %	60 %	40 %	0 %	385854334
129	NC_017517	GAAAT	2	10	165416	165425	60 %	20 %	20 %	0 %	385854341
130	NC_017517	AAAAT	2	10	165678	165687	80 %	20 %	0 %	0 %	385854343
131	NC_017517	GGGTT	2	10	167165	167174	0 %	40 %	60 %	0 %	385854346
132	NC_017517	GTCAT	2	10	167687	167696	20 %	40 %	20 %	20 %	385854347
133	NC_017517	GCAAA	2	10	170060	170069	60 %	0 %	20 %	20 %	385854350
134	NC_017517	CGGTT	2	10	170090	170099	0 %	40 %	40 %	20 %	385854350
135	NC_017517	TGGTT	2	10	174577	174586	0 %	60 %	40 %	0 %	385854353
136	NC_017517	CGGCG	2	10	175130	175139	0 %	0 %	60 %	40 %	385854354
137	NC_017517	CCAAA	2	10	175519	175528	60 %	0 %	0 %	40 %	385854354
138	NC_017517	TTTAT	2	10	175726	175735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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