MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240355 chromosome

Total Repeats: 398

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017517	ATTTA	2	10	13455	13464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017517	GGAAA	2	10	17152	17161	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017517	TTTTA	2	10	17304	17313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017517	AATTT	2	10	17529	17538	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017517	CCGCT	2	10	20496	20505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017517	GCCTT	2	10	35916	35925	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_017517	GCAGG	2	10	36002	36011	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017517	CCCGT	2	10	46619	46628	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017517	CAATT	2	10	49963	49972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017517	CCCGC	2	10	57052	57061	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_017517	TCGTG	2	10	62296	62305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017517	GGGAG	2	10	63921	63930	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017517	AGGTT	2	10	64863	64872	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017517	ATTTT	2	10	67278	67287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017517	CGGCG	2	10	73533	73542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017517	AATGG	2	10	73556	73565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017517	GGGTA	2	10	73740	73749	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017517	TCGGC	2	10	74133	74142	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017517	CTACC	2	10	88663	88672	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_017517	CCATT	2	10	88848	88857	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017517	CCGCG	2	10	88868	88877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017517	GGCAA	2	10	95500	95509	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017517	ACCAA	2	10	105180	105189	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017517	ATTTA	2	10	106002	106011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017517	AAATA	2	10	106012	106021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017517	ATTAA	2	10	106037	106046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017517	TGCCG	2	10	120036	120045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017517	CTTTA	2	10	155248	155257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017517	AATTT	2	10	159911	159920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017517	TTTAT	2	10	175726	175735	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017517	TGCCG	2	10	177128	177137	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017517	TAAAA	2	10	193990	193999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017517	ATAAA	2	10	230963	230972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017517	CTGCC	2	10	231075	231084	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_017517	CAAAC	2	10	239407	239416	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017517	CTCTT	2	10	254181	254190	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017517	ATTTT	2	10	254242	254251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017517	CATTT	2	10	255309	255318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017517	TTTTA	2	10	271570	271579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017517	CGAAA	2	10	291439	291448	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017517	TGCCG	2	10	307468	307477	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017517	TTGAT	2	10	311988	311997	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017517	TCATT	2	10	316581	316590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017517	CGTGG	2	10	318261	318270	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017517	TAAAA	2	10	321250	321259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017517	TCGTG	2	10	323747	323756	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017517	GGGAG	2	10	325372	325381	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017517	AGGTT	2	10	326314	326323	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017517	TTTCG	2	10	335728	335737	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017517	TAAAA	2	10	343446	343455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017517	CACGG	2	10	343508	343517	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017517	AAAGC	2	10	348888	348897	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017517	TTTCC	2	10	348934	348943	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017517	ATTGT	2	10	351383	351392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017517	GGCGG	2	10	355215	355224	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017517	CAAAA	2	10	356941	356950	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017517	ATTTG	2	10	368758	368767	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017517	CCGCA	2	10	379748	379757	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_017517	GGCGG	2	10	381548	381557	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017517	TTTAA	2	10	387757	387766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017517	CAACC	2	10	390291	390300	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017517	TCTGT	2	10	397528	397537	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017517	CGGTA	2	10	401287	401296	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017517	TCAAA	2	10	406728	406737	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017517	GTTTG	2	10	413859	413868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017517	TCCTT	2	10	420799	420808	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017517	ATAGG	2	10	421674	421683	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017517	TATGT	2	10	421995	422004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017517	TGCCG	2	10	430959	430968	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017517	CGGGT	2	10	437302	437311	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017517	CATGC	2	10	437591	437600	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017517	GCCGT	2	10	439152	439161	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017517	ACAAA	2	10	447906	447915	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017517	GCCGT	2	10	456677	456686	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017517	TAAAA	2	10	460983	460992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017517	GATTG	2	10	461250	461259	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017517	GAAGA	10	50	478229	478278	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017517	AAGGC	2	10	481449	481458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017517	GGCAA	2	10	485704	485713	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017517	TACAG	2	10	485808	485817	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017517	GTATT	2	10	485826	485835	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017517	AATTG	2	10	496971	496980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017517	GGATT	2	10	502850	502859	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017517	CGGAT	2	10	502947	502956	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017517	GTAAA	2	10	504497	504506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017517	GGCGG	2	10	506347	506356	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017517	GCCGT	2	10	512540	512549	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017517	ATAAA	2	10	514187	514196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017517	GTTTT	2	10	522788	522797	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017517	ATGAA	2	10	526268	526277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017517	CAAAC	2	10	535449	535458	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017517	GTAAT	2	10	537332	537341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017517	TTTGA	2	10	538730	538739	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017517	GTAAT	2	10	539216	539225	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017517	GTGAA	2	10	551421	551430	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017517	TTTTC	2	10	553001	553010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017517	GTTAT	2	10	565810	565819	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017517	AATTT	2	10	566097	566106	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017517	TCCGC	2	10	567832	567841	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_017517	GAAAA	2	10	568616	568625	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017517	GCGGG	2	10	589654	589663	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017517	ACAGA	2	10	596335	596344	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017517	TTATA	2	10	597595	597604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017517	TTTTG	2	10	601847	601856	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017517	GTTTT	2	10	607366	607375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017517	ATATT	2	10	611521	611530	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017517	TTGAT	2	10	626383	626392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017517	GCGCG	2	10	627890	627899	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017517	GTAAA	2	10	627984	627993	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017517	TTTCA	2	10	631342	631351	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017517	ATTTG	2	10	633517	633526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017517	GCCTT	2	10	635686	635695	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017517	GCGCG	2	10	635807	635816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017517	TTTTC	2	10	636642	636651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017517	TGATA	2	10	651559	651568	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017517	GTTCG	2	10	651596	651605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017517	TAATA	2	10	670544	670553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017517	TTTTA	2	10	676971	676980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017517	GTTTG	2	10	678442	678451	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017517	TCCAA	2	10	683395	683404	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017517	TTCTT	2	10	689794	689803	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017517	TGGAA	2	10	709021	709030	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017517	TAAAA	2	10	709458	709467	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017517	CAAAA	2	10	711574	711583	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017517	AAAAC	2	10	720172	720181	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017517	TTATT	2	10	734548	734557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017517	TCTTT	2	10	751948	751957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017517	ATTTT	2	10	755236	755245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017517	TGGGG	2	10	763957	763966	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017517	TGCGT	2	10	769280	769289	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017517	AAATA	2	10	774675	774684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017517	GCTTG	2	10	775657	775666	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017517	GAAAA	2	10	778314	778323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017517	TTTAA	2	10	778346	778355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017517	TTTGA	2	10	779150	779159	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017517	GGGTA	2	10	780833	780842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017517	GTTTT	2	10	791683	791692	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017517	GAATG	2	10	792475	792484	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017517	ATCAT	2	10	813139	813148	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017517	GTCGG	2	10	814443	814452	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017517	GCGGA	2	10	823037	823046	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017517	ATGGG	2	10	823193	823202	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017517	ACGGC	2	10	827258	827267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017517	TTTTC	2	10	831293	831302	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017517	TTTTC	2	10	832398	832407	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017517	CGCGC	2	10	839825	839834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
147	NC_017517	TTGAA	2	10	865857	865866	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017517	TGCCG	2	10	867350	867359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017517	CGAAA	2	10	872596	872605	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017517	GATAA	2	10	874389	874398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017517	GTGGA	2	10	879819	879828	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017517	GGCGG	2	10	881001	881010	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017517	GGCGG	2	10	881227	881236	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
154	NC_017517	ATTGA	2	10	881967	881976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017517	CCTTA	2	10	905278	905287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_017517	TTTTG	2	10	915406	915415	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017517	GCGCG	2	10	915420	915429	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
159	NC_017517	CAAAA	2	10	938921	938930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017517	GTTGA	2	10	963233	963242	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_017517	TTGTT	2	10	974077	974086	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017517	GAAGA	11	55	978811	978865	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017517	CGATG	2	10	993337	993346	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
167	NC_017517	TAACA	2	10	994285	994294	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_017517	AAAGA	2	10	1005838	1005847	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017517	GGGGA	2	10	1015044	1015053	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017517	GTTGC	2	10	1047780	1047789	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017517	GTTGC	2	10	1047933	1047942	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_017517	GTTGC	2	10	1048677	1048686	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017517	GTTGC	2	10	1049028	1049037	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_017517	TTTGA	2	10	1072888	1072897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017517	GTATG	2	10	1088273	1088282	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017517	CTAAT	2	10	1103820	1103829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
183	NC_017517	CTGCA	2	10	1108499	1108508	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_017517	GTAAG	2	10	1108688	1108697	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017517	GAAAG	2	10	1112755	1112764	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017517	ATTGA	2	10	1119252	1119261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017517	TGATT	2	10	1119506	1119515	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017517	CGGAA	2	10	1154463	1154472	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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225	NC_017517	CTGCC	2	10	1302254	1302263	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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265	NC_017517	GCATT	2	10	1462195	1462204	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_017517	GGAAT	2	10	1474971	1474980	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017517	GATTT	2	10	1483614	1483623	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017517	TTACC	2	10	1486204	1486213	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
270	NC_017517	GCCCT	2	10	1494145	1494154	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
271	NC_017517	GAAGA	15	75	1497559	1497633	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017517	GAAGA	17	85	1500307	1500391	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017517	TGCGG	2	10	1505793	1505802	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
274	NC_017517	TAACA	2	10	1511955	1511964	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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276	NC_017517	TCAAA	2	10	1521996	1522005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
277	NC_017517	TTTGA	2	10	1537910	1537919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_017517	TTGAA	2	10	1548687	1548696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017517	TTTCA	2	10	1550180	1550189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
281	NC_017517	AATTT	2	10	1557210	1557219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017517	TTATT	2	10	1559321	1559330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017517	TAAAA	2	10	1561554	1561563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017517	ATTTT	2	10	1561589	1561598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017517	AACTT	2	10	1561604	1561613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_017517	GATTT	2	10	1561703	1561712	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017517	CGCCC	2	10	1567718	1567727	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
289	NC_017517	GGCAA	3	15	1567917	1567931	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
290	NC_017517	GCGAA	2	10	1568081	1568090	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
291	NC_017517	CCCCT	2	10	1568117	1568126	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
292	NC_017517	TAGGT	2	10	1569547	1569556	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_017517	AAATT	2	10	1591479	1591488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_017517	ATTTT	2	10	1619224	1619233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_017517	ATTTT	2	10	1722463	1722472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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325	NC_017517	TGCGG	2	10	1732082	1732091	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_017517	AACGC	2	10	1810110	1810119	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
333	NC_017517	TCTAA	2	10	1815063	1815072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
334	NC_017517	TCTAA	2	10	1815847	1815856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
335	NC_017517	TTTCC	2	10	1816964	1816973	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.