MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240355 chromosome

Total Repeats: 1261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017517	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385854195
2	NC_017517	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385854196
3	NC_017517	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385854196
4	NC_017517	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385854198
5	NC_017517	CCAGC	2	10	4772	4781	20 %	0 %	20 %	60 %	385854200
6	NC_017517	AAGGC	2	10	6080	6089	40 %	0 %	40 %	20 %	385854202
7	NC_017517	GCTTT	2	10	6440	6449	0 %	60 %	20 %	20 %	385854203
8	NC_017517	TACCG	2	10	8556	8565	20 %	20 %	20 %	40 %	385854204
9	NC_017517	TCAAT	2	10	9469	9478	40 %	40 %	0 %	20 %	385854205
10	NC_017517	CCCGT	2	10	10503	10512	0 %	20 %	20 %	60 %	385854206
11	NC_017517	CACGC	2	10	10798	10807	20 %	0 %	20 %	60 %	385854207
12	NC_017517	TCCCG	2	10	11652	11661	0 %	20 %	20 %	60 %	385854207
13	NC_017517	TGTCG	2	10	13108	13117	0 %	40 %	40 %	20 %	385854208
14	NC_017517	ATTTC	2	10	20238	20247	20 %	60 %	0 %	20 %	385854215
15	NC_017517	CAAAC	2	10	23936	23945	60 %	0 %	0 %	40 %	385854220
16	NC_017517	CCGCG	2	10	25199	25208	0 %	0 %	40 %	60 %	385854221
17	NC_017517	AAGGC	2	10	26959	26968	40 %	0 %	40 %	20 %	385854222
18	NC_017517	AGGGC	2	10	29081	29090	20 %	0 %	60 %	20 %	385854223
19	NC_017517	AAACC	2	10	29784	29793	60 %	0 %	0 %	40 %	385854224
20	NC_017517	TCCGC	2	10	33084	33093	0 %	20 %	20 %	60 %	385854226
21	NC_017517	GCGCC	2	10	37608	37617	0 %	0 %	40 %	60 %	385854230
22	NC_017517	CATTC	2	10	37665	37674	20 %	40 %	0 %	40 %	385854230
23	NC_017517	AGGTG	2	10	38112	38121	20 %	20 %	60 %	0 %	385854231
24	NC_017517	GTCGG	2	10	38801	38810	0 %	20 %	60 %	20 %	385854231
25	NC_017517	GGGCT	2	10	40775	40784	0 %	20 %	60 %	20 %	385854232
26	NC_017517	GGCGG	2	10	44273	44282	0 %	0 %	80 %	20 %	385854235
27	NC_017517	GCGGT	2	10	44749	44758	0 %	20 %	60 %	20 %	385854236
28	NC_017517	GCGCG	2	10	45146	45155	0 %	0 %	60 %	40 %	385854236
29	NC_017517	ACGGC	2	10	45691	45700	20 %	0 %	40 %	40 %	385854236
30	NC_017517	GAAAA	2	10	47855	47864	80 %	0 %	20 %	0 %	385854237
31	NC_017517	GAACG	2	10	48510	48519	40 %	0 %	40 %	20 %	385854237
32	NC_017517	TTTGA	2	10	48957	48966	20 %	60 %	20 %	0 %	385854237
33	NC_017517	GAAAA	2	10	49620	49629	80 %	0 %	20 %	0 %	385854237
34	NC_017517	AAACC	2	10	56555	56564	60 %	0 %	0 %	40 %	385854239
35	NC_017517	GCCAA	2	10	57514	57523	40 %	0 %	20 %	40 %	385854240
36	NC_017517	GTGCG	2	10	58906	58915	0 %	20 %	60 %	20 %	385854241
37	NC_017517	TGCCG	2	10	69330	69339	0 %	20 %	40 %	40 %	385854247
38	NC_017517	TGGCT	2	10	69659	69668	0 %	40 %	40 %	20 %	385854247
39	NC_017517	TGCCC	2	10	70266	70275	0 %	20 %	20 %	60 %	385854247
40	NC_017517	TCTTT	2	10	72150	72159	0 %	80 %	0 %	20 %	385854249
41	NC_017517	TGCTA	2	10	75542	75551	20 %	40 %	20 %	20 %	385854251
42	NC_017517	AGGCC	2	10	76753	76762	20 %	0 %	40 %	40 %	385854252
43	NC_017517	AAGCA	2	10	78328	78337	60 %	0 %	20 %	20 %	385854253
44	NC_017517	TTTAA	2	10	78578	78587	40 %	60 %	0 %	0 %	385854253
45	NC_017517	GATTT	2	10	80491	80500	20 %	60 %	20 %	0 %	385854255
46	NC_017517	TGTAT	2	10	81885	81894	20 %	60 %	20 %	0 %	385854256
47	NC_017517	AAAAG	2	10	82069	82078	80 %	0 %	20 %	0 %	385854257
48	NC_017517	TTTGA	2	10	82692	82701	20 %	60 %	20 %	0 %	385854257
49	NC_017517	TGGCT	2	10	83625	83634	0 %	40 %	40 %	20 %	385854258
50	NC_017517	GCAAG	2	10	84906	84915	40 %	0 %	40 %	20 %	385854260
51	NC_017517	GCGCG	2	10	85965	85974	0 %	0 %	60 %	40 %	385854260
52	NC_017517	CAACG	2	10	86887	86896	40 %	0 %	20 %	40 %	385854260
53	NC_017517	TTGAT	2	10	87200	87209	20 %	60 %	20 %	0 %	385854261
54	NC_017517	TTTCC	2	10	87521	87530	0 %	60 %	0 %	40 %	385854261
55	NC_017517	ATTTT	2	10	87869	87878	20 %	80 %	0 %	0 %	385854261
56	NC_017517	CCCGT	2	10	93104	93113	0 %	20 %	20 %	60 %	385854265
57	NC_017517	CCGTA	2	10	93341	93350	20 %	20 %	20 %	40 %	385854265
58	NC_017517	ACATC	2	10	94242	94251	40 %	20 %	0 %	40 %	385854266
59	NC_017517	CGCAA	2	10	95954	95963	40 %	0 %	20 %	40 %	385854267
60	NC_017517	AAACC	2	10	103441	103450	60 %	0 %	0 %	40 %	385854273
61	NC_017517	CAGGT	2	10	107619	107628	20 %	20 %	40 %	20 %	385854275
62	NC_017517	TTTGA	2	10	108329	108338	20 %	60 %	20 %	0 %	385854275
63	NC_017517	AATGA	2	10	109036	109045	60 %	20 %	20 %	0 %	385854276
64	NC_017517	GAACA	2	10	110921	110930	60 %	0 %	20 %	20 %	385854276
65	NC_017517	CGTGC	2	10	112213	112222	0 %	20 %	40 %	40 %	385854279
66	NC_017517	GCCGC	2	10	113384	113393	0 %	0 %	40 %	60 %	385854280
67	NC_017517	AATTG	2	10	114169	114178	40 %	40 %	20 %	0 %	385854281
68	NC_017517	AAAAT	2	10	114430	114439	80 %	20 %	0 %	0 %	385854281
69	NC_017517	CGGCG	2	10	116270	116279	0 %	0 %	60 %	40 %	385854284
70	NC_017517	CAGGT	2	10	117736	117745	20 %	20 %	40 %	20 %	385854286
71	NC_017517	CGCCT	2	10	118422	118431	0 %	20 %	20 %	60 %	385854287
72	NC_017517	GGTAT	2	10	118662	118671	20 %	40 %	40 %	0 %	385854287
73	NC_017517	GGCGC	2	10	118913	118922	0 %	0 %	60 %	40 %	385854287
74	NC_017517	GGCGC	3	15	120459	120473	0 %	0 %	60 %	40 %	385854289
75	NC_017517	CAAAG	2	10	120668	120677	60 %	0 %	20 %	20 %	385854289
76	NC_017517	GCGCC	2	10	121875	121884	0 %	0 %	40 %	60 %	385854290
77	NC_017517	GGCGC	2	10	122104	122113	0 %	0 %	60 %	40 %	385854290
78	NC_017517	TGAGT	2	10	123721	123730	20 %	40 %	40 %	0 %	385854292
79	NC_017517	GGCAA	2	10	124298	124307	40 %	0 %	40 %	20 %	385854292
80	NC_017517	CGGCG	2	10	126065	126074	0 %	0 %	60 %	40 %	385854293
81	NC_017517	GTTTT	2	10	126738	126747	0 %	80 %	20 %	0 %	385854294
82	NC_017517	CGTGT	2	10	128502	128511	0 %	40 %	40 %	20 %	385854296
83	NC_017517	GAAAA	2	10	128916	128925	80 %	0 %	20 %	0 %	385854296
84	NC_017517	AGGGC	2	10	129053	129062	20 %	0 %	60 %	20 %	385854296
85	NC_017517	TAATA	2	10	131770	131779	60 %	40 %	0 %	0 %	385854298
86	NC_017517	GCACC	2	10	132565	132574	20 %	0 %	20 %	60 %	385854300
87	NC_017517	GAAGG	2	10	136491	136500	40 %	0 %	60 %	0 %	385854304
88	NC_017517	GTACC	2	10	138062	138071	20 %	20 %	20 %	40 %	385854307
89	NC_017517	TTCCT	2	10	139692	139701	0 %	60 %	0 %	40 %	385854310
90	NC_017517	TTGGG	2	10	143093	143102	0 %	40 %	60 %	0 %	385854310
91	NC_017517	CATAC	2	10	145569	145578	40 %	20 %	0 %	40 %	385854311
92	NC_017517	GTGAT	2	10	146448	146457	20 %	40 %	40 %	0 %	385854311
93	NC_017517	CCTGC	2	10	151799	151808	0 %	20 %	20 %	60 %	385854317
94	NC_017517	CAAAC	2	10	154621	154630	60 %	0 %	0 %	40 %	385854320
95	NC_017517	TGATT	2	10	158042	158051	20 %	60 %	20 %	0 %	385854326
96	NC_017517	AATGC	2	10	158736	158745	40 %	20 %	20 %	20 %	385854327
97	NC_017517	GTAAA	2	10	159687	159696	60 %	20 %	20 %	0 %	385854330
98	NC_017517	TCAAA	2	10	160759	160768	60 %	20 %	0 %	20 %	385854332
99	NC_017517	TTTGG	2	10	161570	161579	0 %	60 %	40 %	0 %	385854334
100	NC_017517	GAAAT	2	10	165416	165425	60 %	20 %	20 %	0 %	385854341
101	NC_017517	AAAAT	2	10	165678	165687	80 %	20 %	0 %	0 %	385854343
102	NC_017517	GGGTT	2	10	167165	167174	0 %	40 %	60 %	0 %	385854346
103	NC_017517	GTCAT	2	10	167687	167696	20 %	40 %	20 %	20 %	385854347
104	NC_017517	GCAAA	2	10	170060	170069	60 %	0 %	20 %	20 %	385854350
105	NC_017517	CGGTT	2	10	170090	170099	0 %	40 %	40 %	20 %	385854350
106	NC_017517	TGGTT	2	10	174577	174586	0 %	60 %	40 %	0 %	385854353
107	NC_017517	CGGCG	2	10	175130	175139	0 %	0 %	60 %	40 %	385854354
108	NC_017517	CCAAA	2	10	175519	175528	60 %	0 %	0 %	40 %	385854354
109	NC_017517	TGAAA	2	10	176431	176440	60 %	20 %	20 %	0 %	385854355
110	NC_017517	TTGAT	2	10	176781	176790	20 %	60 %	20 %	0 %	385854355
111	NC_017517	GCCGC	2	10	177522	177531	0 %	0 %	40 %	60 %	385854356
112	NC_017517	CGGCG	2	10	179140	179149	0 %	0 %	60 %	40 %	385854357
113	NC_017517	CTCGG	2	10	185184	185193	0 %	20 %	40 %	40 %	385854362
114	NC_017517	GCCGT	2	10	187686	187695	0 %	20 %	40 %	40 %	385854364
115	NC_017517	ACCAA	2	10	188528	188537	60 %	0 %	0 %	40 %	385854365
116	NC_017517	TGCCG	2	10	191103	191112	0 %	20 %	40 %	40 %	385854368
117	NC_017517	GTTGC	2	10	191418	191427	0 %	40 %	40 %	20 %	385854368
118	NC_017517	CCTGC	2	10	199454	199463	0 %	20 %	20 %	60 %	385854375
119	NC_017517	GGTGC	2	10	201529	201538	0 %	20 %	60 %	20 %	385854376
120	NC_017517	CGGGG	2	10	203255	203264	0 %	0 %	80 %	20 %	385854377
121	NC_017517	CCGCG	2	10	203935	203944	0 %	0 %	40 %	60 %	385854377
122	NC_017517	TGCGG	2	10	204359	204368	0 %	20 %	60 %	20 %	385854377
123	NC_017517	TGCGT	2	10	204837	204846	0 %	40 %	40 %	20 %	385854377
124	NC_017517	GCGCC	2	10	205743	205752	0 %	0 %	40 %	60 %	385854378
125	NC_017517	AAATT	2	10	207996	208005	60 %	40 %	0 %	0 %	385854380
126	NC_017517	GTTTT	2	10	209331	209340	0 %	80 %	20 %	0 %	385854382
127	NC_017517	GCCGT	2	10	210956	210965	0 %	20 %	40 %	40 %	385854384
128	NC_017517	GCCGT	2	10	211085	211094	0 %	20 %	40 %	40 %	385854384
129	NC_017517	TGTCG	2	10	211659	211668	0 %	40 %	40 %	20 %	385854385
130	NC_017517	GGCAG	2	10	213194	213203	20 %	0 %	60 %	20 %	385854386
131	NC_017517	GTCAA	2	10	214770	214779	40 %	20 %	20 %	20 %	385854387
132	NC_017517	CCTTT	2	10	215374	215383	0 %	60 %	0 %	40 %	385854387
133	NC_017517	AAATG	2	10	215590	215599	60 %	20 %	20 %	0 %	385854387
134	NC_017517	GGCGC	2	10	218526	218535	0 %	0 %	60 %	40 %	385854390
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