MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis M01-240355 chromosome

Total Repeats: 5953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017517	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385854194
2	NC_017517	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385854194
3	NC_017517	GTCC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	25 %	50 %	385854196
4	NC_017517	CTGC	2	8	2389	2396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017517	CGGA	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	385854197
6	NC_017517	GCCT	2	8	3186	3193	0 %	25 %	25 %	50 %	385854198
7	NC_017517	TGCC	2	8	3812	3819	0 %	25 %	25 %	50 %	385854199
8	NC_017517	CAAA	2	8	3909	3916	75 %	0 %	0 %	25 %	385854199
9	NC_017517	CCCG	2	8	4157	4164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_017517	CGCC	2	8	5364	5371	0 %	0 %	25 %	75 %	385854201
11	NC_017517	TTTC	2	8	5492	5499	0 %	75 %	0 %	25 %	385854201
12	NC_017517	GCAC	2	8	6153	6160	25 %	0 %	25 %	50 %	385854202
13	NC_017517	GGCA	2	8	6310	6317	25 %	0 %	50 %	25 %	385854203
14	NC_017517	TCGG	2	8	6674	6681	0 %	25 %	50 %	25 %	385854203
15	NC_017517	CGCC	2	8	6948	6955	0 %	0 %	25 %	75 %	385854203
16	NC_017517	GTTT	2	8	7161	7168	0 %	75 %	25 %	0 %	385854203
17	NC_017517	TCGG	2	8	7265	7272	0 %	25 %	50 %	25 %	385854203
18	NC_017517	GACG	2	8	7297	7304	25 %	0 %	50 %	25 %	385854203
19	NC_017517	ACGC	2	8	7679	7686	25 %	0 %	25 %	50 %	385854204
20	NC_017517	CATC	2	8	8315	8322	25 %	25 %	0 %	50 %	385854204
21	NC_017517	GTCA	2	8	8592	8599	25 %	25 %	25 %	25 %	385854204
22	NC_017517	TTTA	2	8	9154	9161	25 %	75 %	0 %	0 %	385854205
23	NC_017517	CGAC	2	8	9223	9230	25 %	0 %	25 %	50 %	385854205
24	NC_017517	CAGC	2	8	9944	9951	25 %	0 %	25 %	50 %	385854205
25	NC_017517	CAGG	2	8	9959	9966	25 %	0 %	50 %	25 %	385854205
26	NC_017517	GTAT	2	8	10233	10240	25 %	50 %	25 %	0 %	385854206
27	NC_017517	GAAG	2	8	10348	10355	50 %	0 %	50 %	0 %	385854206
28	NC_017517	GGAC	2	8	10518	10525	25 %	0 %	50 %	25 %	385854206
29	NC_017517	CCGG	2	8	11236	11243	0 %	0 %	50 %	50 %	385854207
30	NC_017517	CCGA	2	8	11748	11755	25 %	0 %	25 %	50 %	385854207
31	NC_017517	GGCA	2	8	12121	12128	25 %	0 %	50 %	25 %	385854208
32	NC_017517	GGCA	2	8	12230	12237	25 %	0 %	50 %	25 %	385854208
33	NC_017517	CCCG	2	8	13003	13010	0 %	0 %	25 %	75 %	385854208
34	NC_017517	CGCC	2	8	13056	13063	0 %	0 %	25 %	75 %	385854208
35	NC_017517	ACAA	2	8	13067	13074	75 %	0 %	0 %	25 %	385854208
36	NC_017517	TAAA	2	8	13570	13577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017517	TCAG	2	8	13980	13987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017517	TAAA	2	8	14010	14017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017517	CCTG	2	8	14551	14558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017517	ATCC	2	8	14573	14580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017517	TAAA	2	8	15430	15437	75 %	25 %	0 %	0 %	385854209
42	NC_017517	GGAA	2	8	15656	15663	50 %	0 %	50 %	0 %	385854209
43	NC_017517	CCTC	2	8	15935	15942	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_017517	CGAT	2	8	16482	16489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017517	GCCT	2	8	16519	16526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017517	ATTT	2	8	16593	16600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017517	TTTC	2	8	17317	17324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017517	GGGT	2	8	17505	17512	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017517	TGGG	2	8	17513	17520	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017517	ATGG	2	8	17740	17747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017517	GGAT	2	8	19804	19811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017517	TGAT	2	8	23182	23189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017517	CTGG	2	8	23452	23459	0 %	25 %	50 %	25 %	385854220
54	NC_017517	ACAA	2	8	23700	23707	75 %	0 %	0 %	25 %	385854220
55	NC_017517	AGTG	2	8	24049	24056	25 %	25 %	50 %	0 %	385854220
56	NC_017517	GGGA	2	8	24241	24248	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017517	TGTT	2	8	25571	25578	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017517	TATT	2	8	25985	25992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017517	TAAA	2	8	26000	26007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017517	CCGG	2	8	26077	26084	0 %	0 %	50 %	50 %	385854222
61	NC_017517	TGCC	2	8	26383	26390	0 %	25 %	25 %	50 %	385854222
62	NC_017517	GGAC	2	8	26508	26515	25 %	0 %	50 %	25 %	385854222
63	NC_017517	TTTG	2	8	27449	27456	0 %	75 %	25 %	0 %	385854223
64	NC_017517	GCGG	2	8	27909	27916	0 %	0 %	75 %	25 %	385854223
65	NC_017517	TCGG	2	8	28618	28625	0 %	25 %	50 %	25 %	385854223
66	NC_017517	TGTT	2	8	28813	28820	0 %	75 %	25 %	0 %	385854223
67	NC_017517	CCAA	2	8	30120	30127	50 %	0 %	0 %	50 %	385854224
68	NC_017517	GCGA	2	8	30338	30345	25 %	0 %	50 %	25 %	385854224
69	NC_017517	GGCA	2	8	30373	30380	25 %	0 %	50 %	25 %	385854224
70	NC_017517	TGAT	2	8	30668	30675	25 %	50 %	25 %	0 %	385854224
71	NC_017517	CTCG	2	8	31320	31327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017517	CGGG	2	8	31934	31941	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017517	CTTC	2	8	32947	32954	0 %	50 %	0 %	50 %	385854226
74	NC_017517	GGCA	2	8	33099	33106	25 %	0 %	50 %	25 %	385854226
75	NC_017517	CCGG	2	8	33488	33495	0 %	0 %	50 %	50 %	385854226
76	NC_017517	GTTC	2	8	33814	33821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017517	GCCG	2	8	34277	34284	0 %	0 %	50 %	50 %	385854227
78	NC_017517	GCCG	2	8	34750	34757	0 %	0 %	50 %	50 %	385854228
79	NC_017517	TCCG	2	8	35616	35623	0 %	25 %	25 %	50 %	385854228
80	NC_017517	AACC	2	8	36103	36110	50 %	0 %	0 %	50 %	385854229
81	NC_017517	CAGG	2	8	36271	36278	25 %	0 %	50 %	25 %	385854229
82	NC_017517	CCGC	2	8	36374	36381	0 %	0 %	25 %	75 %	385854229
83	NC_017517	TGTT	2	8	37779	37786	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017517	TTGT	2	8	37837	37844	0 %	75 %	25 %	0 %	385854231
85	NC_017517	GGCG	2	8	37881	37888	0 %	0 %	75 %	25 %	385854231
86	NC_017517	TTTC	2	8	38706	38713	0 %	75 %	0 %	25 %	385854231
87	NC_017517	GGGT	2	8	39251	39258	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017517	TTGG	2	8	39325	39332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017517	GACG	2	8	39432	39439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017517	AAGG	2	8	39514	39521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017517	ATCG	2	8	39985	39992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017517	GGCG	2	8	40453	40460	0 %	0 %	75 %	25 %	385854232
93	NC_017517	CGAA	2	8	40464	40471	50 %	0 %	25 %	25 %	385854232
94	NC_017517	TCCG	2	8	41134	41141	0 %	25 %	25 %	50 %	385854232
95	NC_017517	AAAC	2	8	41296	41303	75 %	0 %	0 %	25 %	385854232
96	NC_017517	GAAC	2	8	42154	42161	50 %	0 %	25 %	25 %	385854233
97	NC_017517	GCAG	2	8	42372	42379	25 %	0 %	50 %	25 %	385854234
98	NC_017517	TCCG	2	8	42672	42679	0 %	25 %	25 %	50 %	385854234
99	NC_017517	TGTT	2	8	43575	43582	0 %	75 %	25 %	0 %	385854235
100	NC_017517	GACA	2	8	44202	44209	50 %	0 %	25 %	25 %	385854235
101	NC_017517	GCAG	2	8	44371	44378	25 %	0 %	50 %	25 %	385854235
102	NC_017517	AAAG	2	8	44399	44406	75 %	0 %	25 %	0 %	385854235
103	NC_017517	GGCG	2	8	44987	44994	0 %	0 %	75 %	25 %	385854236
104	NC_017517	GCTT	2	8	45722	45729	0 %	50 %	25 %	25 %	385854236
105	NC_017517	ATGG	2	8	46078	46085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017517	GGAT	2	8	46434	46441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017517	ACCT	2	8	46959	46966	25 %	25 %	0 %	50 %	385854237
108	NC_017517	TTGG	2	8	47029	47036	0 %	50 %	50 %	0 %	385854237
109	NC_017517	TTTC	2	8	47149	47156	0 %	75 %	0 %	25 %	385854237
110	NC_017517	CTAC	2	8	47809	47816	25 %	25 %	0 %	50 %	385854237
111	NC_017517	GGGC	2	8	48863	48870	0 %	0 %	75 %	25 %	385854237
112	NC_017517	GGAC	2	8	49301	49308	25 %	0 %	50 %	25 %	385854237
113	NC_017517	ACCG	2	8	49325	49332	25 %	0 %	25 %	50 %	385854237
114	NC_017517	CCAT	2	8	49357	49364	25 %	25 %	0 %	50 %	385854237
115	NC_017517	ATCC	2	8	49526	49533	25 %	25 %	0 %	50 %	385854237
116	NC_017517	GCGG	2	8	49662	49669	0 %	0 %	75 %	25 %	385854237
117	NC_017517	GGAT	2	8	50586	50593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017517	ATGG	2	8	51433	51440	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017517	GGAT	2	8	51887	51894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017517	CGAA	2	8	52309	52316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017517	CGAA	2	8	52806	52813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017517	GGAT	2	8	52860	52867	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017517	CGAA	2	8	53083	53090	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017517	CGAG	2	8	54092	54099	25 %	0 %	50 %	25 %	385854238
125	NC_017517	CGGA	2	8	54309	54316	25 %	0 %	50 %	25 %	385854238
126	NC_017517	TGCC	2	8	54318	54325	0 %	25 %	25 %	50 %	385854238
127	NC_017517	GGCG	2	8	55974	55981	0 %	0 %	75 %	25 %	385854239
128	NC_017517	CGGG	2	8	57035	57042	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017517	TGCG	2	8	57146	57153	0 %	25 %	50 %	25 %	385854240
130	NC_017517	TTGG	2	8	58185	58192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017517	GAAG	2	8	58341	58348	50 %	0 %	50 %	0 %	385854241
132	NC_017517	TCCT	2	8	58615	58622	0 %	50 %	0 %	50 %	385854241
133	NC_017517	TGCC	2	8	58890	58897	0 %	25 %	25 %	50 %	385854241
134	NC_017517	TTGC	2	8	58999	59006	0 %	50 %	25 %	25 %	385854242
135	NC_017517	TTGA	2	8	59278	59285	25 %	50 %	25 %	0 %	385854242
136	NC_017517	GAAT	2	8	59376	59383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017517	AATG	2	8	59415	59422	50 %	25 %	25 %	0 %	385854243
138	NC_017517	GCGG	2	8	59461	59468	0 %	0 %	75 %	25 %	385854243
139	NC_017517	GTAT	2	8	59783	59790	25 %	50 %	25 %	0 %	385854243
140	NC_017517	TTGG	2	8	59862	59869	0 %	50 %	50 %	0 %	385854243
141	NC_017517	ATGA	2	8	60411	60418	50 %	25 %	25 %	0 %	385854244
142	NC_017517	AGAC	2	8	61150	61157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017517	GCTT	2	8	61308	61315	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017517	GTAG	2	8	62660	62667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017517	AGAA	2	8	62772	62779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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