MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis H44/76 chromosome

Total Repeats: 1595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017516	AAAAT	2	10	823	832	80 %	20 %	0 %	0 %	385852233
2	NC_017516	CGCAA	2	10	1306	1315	40 %	0 %	20 %	40 %	385852234
3	NC_017516	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385852234
4	NC_017516	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385852234
5	NC_017516	TTTTC	2	10	4154	4163	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017516	AAGGC	2	10	6081	6090	40 %	0 %	40 %	20 %	385852240
7	NC_017516	GCTTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385852241
8	NC_017516	TACCG	2	10	8623	8632	20 %	20 %	20 %	40 %	385852242
9	NC_017516	TCAAT	2	10	9690	9699	40 %	40 %	0 %	20 %	385852243
10	NC_017516	CGCGC	2	10	10703	10712	0 %	0 %	40 %	60 %	385852244
11	NC_017516	CCCGT	2	10	10724	10733	0 %	20 %	20 %	60 %	385852244
12	NC_017516	CGCGC	2	10	13247	13256	0 %	0 %	40 %	60 %	385852246
13	NC_017516	TGTCG	2	10	13329	13338	0 %	40 %	40 %	20 %	385852246
14	NC_017516	ATTTA	2	10	13676	13685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017516	CTTGC	2	10	17086	17095	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017516	GGAAA	2	10	17710	17719	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017516	TTTTA	2	10	17862	17871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017516	AATTT	2	10	18087	18096	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017516	AGGGC	2	10	27652	27661	20 %	0 %	60 %	20 %	385852259
20	NC_017516	AAACC	2	10	28355	28364	60 %	0 %	0 %	40 %	385852260
21	NC_017516	TCCGC	2	10	31655	31664	0 %	20 %	20 %	60 %	385852262
22	NC_017516	GCCTT	2	10	34487	34496	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017516	CATTC	2	10	36238	36247	20 %	40 %	0 %	40 %	385852266
24	NC_017516	AGGTG	2	10	36684	36693	20 %	20 %	60 %	0 %	385852267
25	NC_017516	GGGCT	2	10	39348	39357	0 %	20 %	60 %	20 %	385852268
26	NC_017516	GGCGG	2	10	42846	42855	0 %	0 %	80 %	20 %	385852271
27	NC_017516	GCGGT	2	10	43322	43331	0 %	20 %	60 %	20 %	385852272
28	NC_017516	GCGCG	2	10	43719	43728	0 %	0 %	60 %	40 %	385852272
29	NC_017516	ACGGC	2	10	44264	44273	20 %	0 %	40 %	40 %	385852272
30	NC_017516	CCCGT	2	10	48041	48050	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_017516	CGGCG	2	10	48379	48388	0 %	0 %	60 %	40 %	385852274
32	NC_017516	GAAAA	2	10	49258	49267	80 %	0 %	20 %	0 %	385852274
33	NC_017516	GAACG	2	10	49907	49916	40 %	0 %	40 %	20 %	385852274
34	NC_017516	TTTGA	2	10	50348	50357	20 %	60 %	20 %	0 %	385852274
35	NC_017516	GAAAA	2	10	51014	51023	80 %	0 %	20 %	0 %	385852274
36	NC_017516	CAATT	2	10	51357	51366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017516	GTTGG	2	10	53843	53852	0 %	40 %	60 %	0 %	385852275
38	NC_017516	AAACC	2	10	56233	56242	60 %	0 %	0 %	40 %	385852276
39	NC_017516	CCCGC	2	10	56730	56739	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
40	NC_017516	GTGCG	2	10	58584	58593	0 %	20 %	60 %	20 %	385852278
41	NC_017516	GTAGC	2	10	61758	61767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017516	TCGTG	2	10	61975	61984	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017516	AGAAA	2	10	62936	62945	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017516	GGGAG	2	10	63600	63609	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017516	AGGTT	2	10	64542	64551	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017516	TTTGC	2	10	66269	66278	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017516	ATTTT	2	10	66888	66897	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017516	TGCCG	2	10	68940	68949	0 %	20 %	40 %	40 %	385852284
49	NC_017516	TGGCT	2	10	69269	69278	0 %	40 %	40 %	20 %	385852284
50	NC_017516	TGCCC	2	10	69876	69885	0 %	20 %	20 %	60 %	385852284
51	NC_017516	TCTTT	2	10	71769	71778	0 %	80 %	0 %	20 %	385852286
52	NC_017516	GCGTA	2	10	71995	72004	20 %	20 %	40 %	20 %	385852287
53	NC_017516	GGGTA	2	10	73359	73368	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017516	TCGGC	2	10	73752	73761	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017516	TGCTA	2	10	75161	75170	20 %	40 %	20 %	20 %	385852288
56	NC_017516	AGGCC	2	10	76372	76381	20 %	0 %	40 %	40 %	385852289
57	NC_017516	AAGCA	2	10	77947	77956	60 %	0 %	20 %	20 %	385852290
58	NC_017516	TTTAA	2	10	78197	78206	40 %	60 %	0 %	0 %	385852290
59	NC_017516	GATTT	2	10	80110	80119	20 %	60 %	20 %	0 %	385852292
60	NC_017516	TGTAT	2	10	81512	81521	20 %	60 %	20 %	0 %	385852293
61	NC_017516	AAAAG	2	10	81696	81705	80 %	0 %	20 %	0 %	385852294
62	NC_017516	TTTGA	2	10	82319	82328	20 %	60 %	20 %	0 %	385852294
63	NC_017516	TGGCT	2	10	83252	83261	0 %	40 %	40 %	20 %	385852295
64	NC_017516	GCAAG	2	10	84533	84542	40 %	0 %	40 %	20 %	385852297
65	NC_017516	GCGCG	2	10	85592	85601	0 %	0 %	60 %	40 %	385852297
66	NC_017516	CAACG	2	10	86514	86523	40 %	0 %	20 %	40 %	385852297
67	NC_017516	TTGAT	2	10	86827	86836	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017516	TTTCC	2	10	87148	87157	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017516	ATTTT	2	10	87497	87506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017516	CTACC	2	10	88294	88303	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_017516	TACGC	2	10	89659	89668	20 %	20 %	20 %	40 %	385852298
72	NC_017516	CCCGT	2	10	92745	92754	0 %	20 %	20 %	60 %	385852301
73	NC_017516	CCGTA	2	10	92982	92991	20 %	20 %	20 %	40 %	385852301
74	NC_017516	ACATC	2	10	93883	93892	40 %	20 %	0 %	40 %	385852302
75	NC_017516	GGCAA	2	10	95138	95147	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017516	CGCAA	2	10	95592	95601	40 %	0 %	20 %	40 %	385852303
77	NC_017516	ACCGC	2	10	101887	101896	20 %	0 %	20 %	60 %	385852308
78	NC_017516	AAACC	2	10	102329	102338	60 %	0 %	0 %	40 %	385852308
79	NC_017516	ACCAA	2	10	104004	104013	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017516	ATTTA	2	10	104366	104375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017516	AAATA	2	10	104376	104385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017516	ATTAA	2	10	104400	104409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017516	CAGGT	2	10	105983	105992	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017516	TTTGA	2	10	106693	106702	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017516	AATGA	2	10	107585	107594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017516	GAACA	2	10	109469	109478	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017516	CGTGC	2	10	110775	110784	0 %	20 %	40 %	40 %	385852312
88	NC_017516	GCCGC	2	10	111945	111954	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017516	AATTG	2	10	112729	112738	40 %	40 %	20 %	0 %	385852313
90	NC_017516	AAAAT	2	10	112990	112999	80 %	20 %	0 %	0 %	385852313
91	NC_017516	CGGCG	2	10	114833	114842	0 %	0 %	60 %	40 %	385852316
92	NC_017516	CAGGT	2	10	116299	116308	20 %	20 %	40 %	20 %	385852318
93	NC_017516	CGCCT	2	10	116985	116994	0 %	20 %	20 %	60 %	385852319
94	NC_017516	GGTAT	2	10	117225	117234	20 %	40 %	40 %	0 %	385852319
95	NC_017516	GGCGC	2	10	117476	117485	0 %	0 %	60 %	40 %	385852319
96	NC_017516	TGCCG	2	10	118599	118608	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017516	TGGCG	2	10	119021	119030	0 %	20 %	60 %	20 %	385852321
98	NC_017516	CAAAG	2	10	119231	119240	60 %	0 %	20 %	20 %	385852321
99	NC_017516	GCGCC	2	10	120438	120447	0 %	0 %	40 %	60 %	385852322
100	NC_017516	GGCGC	2	10	120667	120676	0 %	0 %	60 %	40 %	385852322
101	NC_017516	TGAGT	2	10	122281	122290	20 %	40 %	40 %	0 %	385852324
102	NC_017516	CGGCG	2	10	122785	122794	0 %	0 %	60 %	40 %	385852324
103	NC_017516	GGCAA	2	10	122858	122867	40 %	0 %	40 %	20 %	385852324
104	NC_017516	GTTTT	2	10	125298	125307	0 %	80 %	20 %	0 %	385852326
105	NC_017516	CGTGT	2	10	127068	127077	0 %	40 %	40 %	20 %	385852328
106	NC_017516	GAAAA	2	10	127482	127491	80 %	0 %	20 %	0 %	385852328
107	NC_017516	CAAAT	2	10	128517	128526	60 %	20 %	0 %	20 %	385852328
108	NC_017516	TAATA	2	10	130336	130345	60 %	40 %	0 %	0 %	385852330
109	NC_017516	GAAGG	2	10	133974	133983	40 %	0 %	60 %	0 %	385852335
110	NC_017516	TTGGG	2	10	140575	140584	0 %	40 %	60 %	0 %	385852341
111	NC_017516	CATAC	2	10	143051	143060	40 %	20 %	0 %	40 %	385852342
112	NC_017516	GTGAT	2	10	143930	143939	20 %	40 %	40 %	0 %	385852342
113	NC_017516	CCTGC	2	10	149281	149290	0 %	20 %	20 %	60 %	385852347
114	NC_017516	TTATG	2	10	151215	151224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017516	CTTTA	2	10	151822	151831	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017516	GAAAA	2	10	153529	153538	80 %	0 %	20 %	0 %	385852354
117	NC_017516	TGATT	2	10	154616	154625	20 %	60 %	20 %	0 %	385852356
118	NC_017516	AATGC	2	10	155310	155319	40 %	20 %	20 %	20 %	385852357
119	NC_017516	GTAAA	2	10	156261	156270	60 %	20 %	20 %	0 %	385852360
120	NC_017516	AATTT	2	10	156485	156494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017516	TCAAA	2	10	157333	157342	60 %	20 %	0 %	20 %	385852362
122	NC_017516	TTTGG	2	10	158144	158153	0 %	60 %	40 %	0 %	385852364
123	NC_017516	GAAAT	2	10	161990	161999	60 %	20 %	20 %	0 %	385852371
124	NC_017516	AAAAT	2	10	162252	162261	80 %	20 %	0 %	0 %	385852373
125	NC_017516	GGGTT	2	10	163739	163748	0 %	40 %	60 %	0 %	385852376
126	NC_017516	GTCAT	2	10	164261	164270	20 %	40 %	20 %	20 %	385852377
127	NC_017516	GCAAA	2	10	166633	166642	60 %	0 %	20 %	20 %	385852380
128	NC_017516	CGGTT	2	10	166663	166672	0 %	40 %	40 %	20 %	385852380
129	NC_017516	TGGTT	2	10	171150	171159	0 %	60 %	40 %	0 %	385852383
130	NC_017516	CGGCG	2	10	171703	171712	0 %	0 %	60 %	40 %	385852384
131	NC_017516	CCAAA	2	10	172092	172101	60 %	0 %	0 %	40 %	385852384
132	NC_017516	TTTAT	2	10	172299	172308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017516	TGAAA	2	10	173004	173013	60 %	20 %	20 %	0 %	385852385
134	NC_017516	TGCCG	2	10	173701	173710	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017516	GCCGC	2	10	174095	174104	0 %	0 %	40 %	60 %	385852386
136	NC_017516	CGGCG	2	10	175559	175568	0 %	0 %	60 %	40 %	385852387
137	NC_017516	TCTGC	2	10	175646	175655	0 %	40 %	20 %	40 %	385852387
138	NC_017516	TTTCC	2	10	176271	176280	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017516	AACCC	2	10	179577	179586	40 %	0 %	0 %	60 %	385852391
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261	NC_017516	TGCCC	2	10	335965	335974	0 %	20 %	20 %	60 %	385852516
262	NC_017516	TGGCT	2	10	336325	336334	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_017516	TCCGT	2	10	524497	524506	0 %	40 %	20 %	40 %	385852682
402	NC_017516	TGGCT	2	10	525165	525174	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
403	NC_017516	CAAGC	2	10	525485	525494	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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