MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 1606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017515	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385850285
2	NC_017515	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385850286
3	NC_017515	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385850286
4	NC_017515	GACAT	2	10	3430	3439	40 %	20 %	20 %	20 %	385850288
5	NC_017515	CCAGC	2	10	4696	4705	20 %	0 %	20 %	60 %	385850290
6	NC_017515	AAGGC	2	10	6006	6015	40 %	0 %	40 %	20 %	385850292
7	NC_017515	GCTTT	2	10	6364	6373	0 %	60 %	20 %	20 %	385850293
8	NC_017515	TCAAT	2	10	9395	9404	40 %	40 %	0 %	20 %	385850295
9	NC_017515	CCCGT	2	10	10429	10438	0 %	20 %	20 %	60 %	385850296
10	NC_017515	TCCCG	2	10	11578	11587	0 %	20 %	20 %	60 %	385850297
11	NC_017515	TGTCG	2	10	13034	13043	0 %	40 %	40 %	20 %	385850298
12	NC_017515	ATTTA	2	10	13381	13390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017515	CAAAC	2	10	19438	19447	60 %	0 %	0 %	40 %	385850303
14	NC_017515	CCGCT	2	10	20530	20539	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_017515	CCGCG	2	10	21480	21489	0 %	0 %	40 %	60 %	385850305
16	NC_017515	AGGGC	2	10	25364	25373	20 %	0 %	60 %	20 %	385850307
17	NC_017515	GGCGC	2	10	25644	25653	0 %	0 %	60 %	40 %	385850308
18	NC_017515	AAACC	2	10	26067	26076	60 %	0 %	0 %	40 %	385850308
19	NC_017515	TCCGC	2	10	29367	29376	0 %	20 %	20 %	60 %	385850310
20	NC_017515	GCCTT	2	10	32199	32208	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017515	CATTC	2	10	33950	33959	20 %	40 %	0 %	40 %	385850314
22	NC_017515	AGGTG	2	10	34397	34406	20 %	20 %	60 %	0 %	385850315
23	NC_017515	GTCGG	2	10	35086	35095	0 %	20 %	60 %	20 %	385850315
24	NC_017515	TGCAG	2	10	35402	35411	20 %	20 %	40 %	20 %	385850315
25	NC_017515	GGGCT	2	10	37061	37070	0 %	20 %	60 %	20 %	385850316
26	NC_017515	GGCGG	2	10	40560	40569	0 %	0 %	80 %	20 %	385850319
27	NC_017515	GCGGT	2	10	41035	41044	0 %	20 %	60 %	20 %	385850320
28	NC_017515	GCGCG	2	10	41432	41441	0 %	0 %	60 %	40 %	385850320
29	NC_017515	ACGGC	2	10	41977	41986	20 %	0 %	40 %	40 %	385850320
30	NC_017515	TAATG	2	10	44582	44591	40 %	40 %	20 %	0 %	385850322
31	NC_017515	GGCGG	2	10	46531	46540	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017515	GAAAA	2	10	49266	49275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017515	CCCGT	2	10	51747	51756	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_017515	CGGCG	2	10	52079	52088	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017515	GAAAA	2	10	52958	52967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017515	GGGCA	2	10	54273	54282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017515	GAAAA	2	10	54705	54714	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017515	CAATT	2	10	55048	55057	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017515	GTTGG	2	10	56900	56909	0 %	40 %	60 %	0 %	385850332
40	NC_017515	AAACC	2	10	59290	59299	60 %	0 %	0 %	40 %	385850333
41	NC_017515	CCCGC	2	10	59787	59796	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
42	NC_017515	TCGTG	2	10	65032	65041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017515	GGGAG	2	10	66657	66666	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017515	AGGTT	2	10	67599	67608	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017515	TTTGC	2	10	69326	69335	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017515	ATTTT	2	10	70035	70044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017515	TGCCG	2	10	72087	72096	0 %	20 %	40 %	40 %	385850341
48	NC_017515	TGGCT	2	10	72416	72425	0 %	40 %	40 %	20 %	385850341
49	NC_017515	TGCCC	2	10	73023	73032	0 %	20 %	20 %	60 %	385850341
50	NC_017515	TCTTT	2	10	74916	74925	0 %	80 %	0 %	20 %	385850343
51	NC_017515	GCGTA	2	10	75142	75151	20 %	20 %	40 %	20 %	385850344
52	NC_017515	GGGTA	2	10	76506	76515	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017515	GGAAA	2	10	77653	77662	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017515	CGTTG	2	10	78287	78296	0 %	40 %	40 %	20 %	385850345
55	NC_017515	CCGCG	2	10	79208	79217	0 %	0 %	40 %	60 %	385850345
56	NC_017515	CTTGC	2	10	80268	80277	0 %	40 %	20 %	40 %	385850345
57	NC_017515	GCCAA	2	10	81255	81264	40 %	0 %	20 %	40 %	385850347
58	NC_017515	AGCCA	2	10	81549	81558	40 %	0 %	20 %	40 %	385850347
59	NC_017515	TCAAA	2	10	82482	82491	60 %	20 %	0 %	20 %	385850348
60	NC_017515	CTTTT	2	10	83105	83114	0 %	80 %	0 %	20 %	385850348
61	NC_017515	ATACA	2	10	83289	83298	60 %	20 %	0 %	20 %	385850349
62	NC_017515	ACCGT	2	10	84614	84623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017515	TCAAA	2	10	85526	85535	60 %	20 %	0 %	20 %	385850351
64	NC_017515	ATTAA	2	10	87440	87449	60 %	40 %	0 %	0 %	385850353
65	NC_017515	TGCTT	2	10	87691	87700	0 %	60 %	20 %	20 %	385850353
66	NC_017515	TCAAA	2	10	88183	88192	60 %	20 %	0 %	20 %	385850353
67	NC_017515	GGCCT	2	10	89266	89275	0 %	20 %	40 %	40 %	385850354
68	NC_017515	AATTT	2	10	89417	89426	40 %	60 %	0 %	0 %	385850354
69	NC_017515	AATAA	2	10	90913	90922	80 %	20 %	0 %	0 %	385850355
70	NC_017515	GCCGA	2	10	91886	91895	20 %	0 %	40 %	40 %	385850356
71	NC_017515	CTACC	2	10	92278	92287	20 %	20 %	0 %	60 %	385850356
72	NC_017515	TACGC	2	10	93643	93652	20 %	20 %	20 %	40 %	385850357
73	NC_017515	GCACC	2	10	94993	95002	20 %	0 %	20 %	60 %	385850359
74	NC_017515	ACGGT	2	10	96566	96575	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017515	CCGTA	2	10	98962	98971	20 %	20 %	20 %	40 %	385850362
76	NC_017515	ACATC	2	10	99863	99872	40 %	20 %	0 %	40 %	385850363
77	NC_017515	CGCAA	2	10	101572	101581	40 %	0 %	20 %	40 %	385850364
78	NC_017515	CAAGC	2	10	101937	101946	40 %	0 %	20 %	40 %	385850364
79	NC_017515	ACCGC	2	10	107860	107869	20 %	0 %	20 %	60 %	385850369
80	NC_017515	AAACC	2	10	108302	108311	60 %	0 %	0 %	40 %	385850369
81	NC_017515	ACCAA	2	10	109977	109986	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017515	ATTTA	2	10	110339	110348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017515	AAATA	2	10	110349	110358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017515	ATTAA	2	10	110373	110382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017515	CAGGT	2	10	111956	111965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017515	TTTGA	2	10	112666	112675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017515	AATGA	2	10	113559	113568	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017515	GAACA	2	10	115443	115452	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017515	CGTGC	2	10	116749	116758	0 %	20 %	40 %	40 %	385850373
90	NC_017515	GCCGC	2	10	117919	117928	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_017515	AATTG	2	10	118703	118712	40 %	40 %	20 %	0 %	385850374
92	NC_017515	AAAAT	2	10	118964	118973	80 %	20 %	0 %	0 %	385850374
93	NC_017515	CGGCG	2	10	120807	120816	0 %	0 %	60 %	40 %	385850377
94	NC_017515	CAGGT	2	10	122273	122282	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017515	CGCCT	2	10	122959	122968	0 %	20 %	20 %	60 %	385850379
96	NC_017515	GGTAT	2	10	123199	123208	20 %	40 %	40 %	0 %	385850379
97	NC_017515	GGCGC	2	10	123450	123459	0 %	0 %	60 %	40 %	385850379
98	NC_017515	TGCCG	2	10	124573	124582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017515	GGCGC	3	15	124996	125010	0 %	0 %	60 %	40 %	385850381
100	NC_017515	CAAAG	2	10	125205	125214	60 %	0 %	20 %	20 %	385850381
101	NC_017515	GCGCC	2	10	126412	126421	0 %	0 %	40 %	60 %	385850382
102	NC_017515	TGAGT	2	10	128258	128267	20 %	40 %	40 %	0 %	385850384
103	NC_017515	CGGCG	2	10	128762	128771	0 %	0 %	60 %	40 %	385850384
104	NC_017515	GGCAA	2	10	128835	128844	40 %	0 %	40 %	20 %	385850384
105	NC_017515	CGGCG	2	10	130602	130611	0 %	0 %	60 %	40 %	385850385
106	NC_017515	GTTTT	2	10	131275	131284	0 %	80 %	20 %	0 %	385850386
107	NC_017515	CGTGT	2	10	133045	133054	0 %	40 %	40 %	20 %	385850388
108	NC_017515	GAAAA	2	10	133459	133468	80 %	0 %	20 %	0 %	385850388
109	NC_017515	AGGGC	2	10	133596	133605	20 %	0 %	60 %	20 %	385850388
110	NC_017515	CAAAT	2	10	134494	134503	60 %	20 %	0 %	20 %	385850388
111	NC_017515	TAATA	2	10	136313	136322	60 %	40 %	0 %	0 %	385850390
112	NC_017515	GAAGG	2	10	139950	139959	40 %	0 %	60 %	0 %	385850395
113	NC_017515	GTACC	2	10	141521	141530	20 %	20 %	20 %	40 %	385850398
114	NC_017515	TTGGG	2	10	146552	146561	0 %	40 %	60 %	0 %	385850401
115	NC_017515	CATAC	2	10	149028	149037	40 %	20 %	0 %	40 %	385850402
116	NC_017515	GTGAT	2	10	149907	149916	20 %	40 %	40 %	0 %	385850402
117	NC_017515	CCTGC	2	10	155258	155267	0 %	20 %	20 %	60 %	385850408
118	NC_017515	CTTTA	2	10	157801	157810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017515	GAAAA	2	10	159508	159517	80 %	0 %	20 %	0 %	385850415
120	NC_017515	TGATT	2	10	160595	160604	20 %	60 %	20 %	0 %	385850417
121	NC_017515	AATGC	2	10	161289	161298	40 %	20 %	20 %	20 %	385850418
122	NC_017515	GTAAA	2	10	162240	162249	60 %	20 %	20 %	0 %	385850421
123	NC_017515	AATTT	2	10	162464	162473	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017515	TCAAA	2	10	163315	163324	60 %	20 %	0 %	20 %	385850423
125	NC_017515	TTTGG	2	10	164126	164135	0 %	60 %	40 %	0 %	385850425
126	NC_017515	GAAAT	2	10	167972	167981	60 %	20 %	20 %	0 %	385850432
127	NC_017515	AAAAT	2	10	168234	168243	80 %	20 %	0 %	0 %	385850434
128	NC_017515	GGGTT	2	10	169721	169730	0 %	40 %	60 %	0 %	385850437
129	NC_017515	GTCAT	2	10	170243	170252	20 %	40 %	20 %	20 %	385850438
130	NC_017515	GCAAA	2	10	172615	172624	60 %	0 %	20 %	20 %	385850441
131	NC_017515	CGGTT	2	10	172645	172654	0 %	40 %	40 %	20 %	385850441
132	NC_017515	TGGTT	2	10	177132	177141	0 %	60 %	40 %	0 %	385850444
133	NC_017515	CGGCG	2	10	177685	177694	0 %	0 %	60 %	40 %	385850445
134	NC_017515	CCAAA	2	10	178074	178083	60 %	0 %	0 %	40 %	385850445
135	NC_017515	TTTAT	2	10	178281	178290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017515	TGGTT	2	10	178977	178986	0 %	60 %	40 %	0 %	385850446
137	NC_017515	TGCCG	2	10	179683	179692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017515	GCCGC	2	10	180077	180086	0 %	0 %	40 %	60 %	385850447
139	NC_017515	CGGCG	2	10	181694	181703	0 %	0 %	60 %	40 %	385850448
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266	NC_017515	ACCGT	2	10	371437	371446	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
267	NC_017515	GTTAT	2	10	372146	372155	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017515	CAAAA	2	10	373645	373654	80 %	0 %	0 %	20 %	385850613
269	NC_017515	TCGTA	2	10	375101	375110	20 %	40 %	20 %	20 %	385850614
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382	NC_017515	ATGAA	2	10	514904	514913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
383	NC_017515	GGTTG	2	10	515595	515604	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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396	NC_017515	TGGCT	2	10	534207	534216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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401	NC_017515	TAAAA	2	10	540807	540816	80 %	20 %	0 %	0 %	385850746
402	NC_017515	TTGAT	2	10	542970	542979	20 %	60 %	20 %	0 %	385850748
403	NC_017515	GTTTC	2	10	543482	543491	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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