MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis M04-240196 chromosome

Total Repeats: 1209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017515	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385850285
2	NC_017515	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385850286
3	NC_017515	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385850286
4	NC_017515	GACAT	2	10	3430	3439	40 %	20 %	20 %	20 %	385850288
5	NC_017515	CCAGC	2	10	4696	4705	20 %	0 %	20 %	60 %	385850290
6	NC_017515	AAGGC	2	10	6006	6015	40 %	0 %	40 %	20 %	385850292
7	NC_017515	GCTTT	2	10	6364	6373	0 %	60 %	20 %	20 %	385850293
8	NC_017515	TCAAT	2	10	9395	9404	40 %	40 %	0 %	20 %	385850295
9	NC_017515	CCCGT	2	10	10429	10438	0 %	20 %	20 %	60 %	385850296
10	NC_017515	TCCCG	2	10	11578	11587	0 %	20 %	20 %	60 %	385850297
11	NC_017515	TGTCG	2	10	13034	13043	0 %	40 %	40 %	20 %	385850298
12	NC_017515	CAAAC	2	10	19438	19447	60 %	0 %	0 %	40 %	385850303
13	NC_017515	CCGCG	2	10	21480	21489	0 %	0 %	40 %	60 %	385850305
14	NC_017515	AGGGC	2	10	25364	25373	20 %	0 %	60 %	20 %	385850307
15	NC_017515	GGCGC	2	10	25644	25653	0 %	0 %	60 %	40 %	385850308
16	NC_017515	AAACC	2	10	26067	26076	60 %	0 %	0 %	40 %	385850308
17	NC_017515	TCCGC	2	10	29367	29376	0 %	20 %	20 %	60 %	385850310
18	NC_017515	CATTC	2	10	33950	33959	20 %	40 %	0 %	40 %	385850314
19	NC_017515	AGGTG	2	10	34397	34406	20 %	20 %	60 %	0 %	385850315
20	NC_017515	GTCGG	2	10	35086	35095	0 %	20 %	60 %	20 %	385850315
21	NC_017515	TGCAG	2	10	35402	35411	20 %	20 %	40 %	20 %	385850315
22	NC_017515	GGGCT	2	10	37061	37070	0 %	20 %	60 %	20 %	385850316
23	NC_017515	GGCGG	2	10	40560	40569	0 %	0 %	80 %	20 %	385850319
24	NC_017515	GCGGT	2	10	41035	41044	0 %	20 %	60 %	20 %	385850320
25	NC_017515	GCGCG	2	10	41432	41441	0 %	0 %	60 %	40 %	385850320
26	NC_017515	ACGGC	2	10	41977	41986	20 %	0 %	40 %	40 %	385850320
27	NC_017515	TAATG	2	10	44582	44591	40 %	40 %	20 %	0 %	385850322
28	NC_017515	GTTGG	2	10	56900	56909	0 %	40 %	60 %	0 %	385850332
29	NC_017515	AAACC	2	10	59290	59299	60 %	0 %	0 %	40 %	385850333
30	NC_017515	TGCCG	2	10	72087	72096	0 %	20 %	40 %	40 %	385850341
31	NC_017515	TGGCT	2	10	72416	72425	0 %	40 %	40 %	20 %	385850341
32	NC_017515	TGCCC	2	10	73023	73032	0 %	20 %	20 %	60 %	385850341
33	NC_017515	TCTTT	2	10	74916	74925	0 %	80 %	0 %	20 %	385850343
34	NC_017515	GCGTA	2	10	75142	75151	20 %	20 %	40 %	20 %	385850344
35	NC_017515	CGTTG	2	10	78287	78296	0 %	40 %	40 %	20 %	385850345
36	NC_017515	CCGCG	2	10	79208	79217	0 %	0 %	40 %	60 %	385850345
37	NC_017515	CTTGC	2	10	80268	80277	0 %	40 %	20 %	40 %	385850345
38	NC_017515	GCCAA	2	10	81255	81264	40 %	0 %	20 %	40 %	385850347
39	NC_017515	AGCCA	2	10	81549	81558	40 %	0 %	20 %	40 %	385850347
40	NC_017515	TCAAA	2	10	82482	82491	60 %	20 %	0 %	20 %	385850348
41	NC_017515	CTTTT	2	10	83105	83114	0 %	80 %	0 %	20 %	385850348
42	NC_017515	ATACA	2	10	83289	83298	60 %	20 %	0 %	20 %	385850349
43	NC_017515	TCAAA	2	10	85526	85535	60 %	20 %	0 %	20 %	385850351
44	NC_017515	ATTAA	2	10	87440	87449	60 %	40 %	0 %	0 %	385850353
45	NC_017515	TGCTT	2	10	87691	87700	0 %	60 %	20 %	20 %	385850353
46	NC_017515	TCAAA	2	10	88183	88192	60 %	20 %	0 %	20 %	385850353
47	NC_017515	GGCCT	2	10	89266	89275	0 %	20 %	40 %	40 %	385850354
48	NC_017515	AATTT	2	10	89417	89426	40 %	60 %	0 %	0 %	385850354
49	NC_017515	AATAA	2	10	90913	90922	80 %	20 %	0 %	0 %	385850355
50	NC_017515	GCCGA	2	10	91886	91895	20 %	0 %	40 %	40 %	385850356
51	NC_017515	CTACC	2	10	92278	92287	20 %	20 %	0 %	60 %	385850356
52	NC_017515	TACGC	2	10	93643	93652	20 %	20 %	20 %	40 %	385850357
53	NC_017515	GCACC	2	10	94993	95002	20 %	0 %	20 %	60 %	385850359
54	NC_017515	CCGTA	2	10	98962	98971	20 %	20 %	20 %	40 %	385850362
55	NC_017515	ACATC	2	10	99863	99872	40 %	20 %	0 %	40 %	385850363
56	NC_017515	CGCAA	2	10	101572	101581	40 %	0 %	20 %	40 %	385850364
57	NC_017515	CAAGC	2	10	101937	101946	40 %	0 %	20 %	40 %	385850364
58	NC_017515	ACCGC	2	10	107860	107869	20 %	0 %	20 %	60 %	385850369
59	NC_017515	AAACC	2	10	108302	108311	60 %	0 %	0 %	40 %	385850369
60	NC_017515	CGTGC	2	10	116749	116758	0 %	20 %	40 %	40 %	385850373
61	NC_017515	AATTG	2	10	118703	118712	40 %	40 %	20 %	0 %	385850374
62	NC_017515	AAAAT	2	10	118964	118973	80 %	20 %	0 %	0 %	385850374
63	NC_017515	CGGCG	2	10	120807	120816	0 %	0 %	60 %	40 %	385850377
64	NC_017515	CGCCT	2	10	122959	122968	0 %	20 %	20 %	60 %	385850379
65	NC_017515	GGTAT	2	10	123199	123208	20 %	40 %	40 %	0 %	385850379
66	NC_017515	GGCGC	2	10	123450	123459	0 %	0 %	60 %	40 %	385850379
67	NC_017515	GGCGC	3	15	124996	125010	0 %	0 %	60 %	40 %	385850381
68	NC_017515	CAAAG	2	10	125205	125214	60 %	0 %	20 %	20 %	385850381
69	NC_017515	GCGCC	2	10	126412	126421	0 %	0 %	40 %	60 %	385850382
70	NC_017515	TGAGT	2	10	128258	128267	20 %	40 %	40 %	0 %	385850384
71	NC_017515	CGGCG	2	10	128762	128771	0 %	0 %	60 %	40 %	385850384
72	NC_017515	GGCAA	2	10	128835	128844	40 %	0 %	40 %	20 %	385850384
73	NC_017515	CGGCG	2	10	130602	130611	0 %	0 %	60 %	40 %	385850385
74	NC_017515	GTTTT	2	10	131275	131284	0 %	80 %	20 %	0 %	385850386
75	NC_017515	CGTGT	2	10	133045	133054	0 %	40 %	40 %	20 %	385850388
76	NC_017515	GAAAA	2	10	133459	133468	80 %	0 %	20 %	0 %	385850388
77	NC_017515	AGGGC	2	10	133596	133605	20 %	0 %	60 %	20 %	385850388
78	NC_017515	CAAAT	2	10	134494	134503	60 %	20 %	0 %	20 %	385850388
79	NC_017515	TAATA	2	10	136313	136322	60 %	40 %	0 %	0 %	385850390
80	NC_017515	GAAGG	2	10	139950	139959	40 %	0 %	60 %	0 %	385850395
81	NC_017515	GTACC	2	10	141521	141530	20 %	20 %	20 %	40 %	385850398
82	NC_017515	TTGGG	2	10	146552	146561	0 %	40 %	60 %	0 %	385850401
83	NC_017515	CATAC	2	10	149028	149037	40 %	20 %	0 %	40 %	385850402
84	NC_017515	GTGAT	2	10	149907	149916	20 %	40 %	40 %	0 %	385850402
85	NC_017515	CCTGC	2	10	155258	155267	0 %	20 %	20 %	60 %	385850408
86	NC_017515	GAAAA	2	10	159508	159517	80 %	0 %	20 %	0 %	385850415
87	NC_017515	TGATT	2	10	160595	160604	20 %	60 %	20 %	0 %	385850417
88	NC_017515	AATGC	2	10	161289	161298	40 %	20 %	20 %	20 %	385850418
89	NC_017515	GTAAA	2	10	162240	162249	60 %	20 %	20 %	0 %	385850421
90	NC_017515	TCAAA	2	10	163315	163324	60 %	20 %	0 %	20 %	385850423
91	NC_017515	TTTGG	2	10	164126	164135	0 %	60 %	40 %	0 %	385850425
92	NC_017515	GAAAT	2	10	167972	167981	60 %	20 %	20 %	0 %	385850432
93	NC_017515	AAAAT	2	10	168234	168243	80 %	20 %	0 %	0 %	385850434
94	NC_017515	GGGTT	2	10	169721	169730	0 %	40 %	60 %	0 %	385850437
95	NC_017515	GTCAT	2	10	170243	170252	20 %	40 %	20 %	20 %	385850438
96	NC_017515	GCAAA	2	10	172615	172624	60 %	0 %	20 %	20 %	385850441
97	NC_017515	CGGTT	2	10	172645	172654	0 %	40 %	40 %	20 %	385850441
98	NC_017515	TGGTT	2	10	177132	177141	0 %	60 %	40 %	0 %	385850444
99	NC_017515	CGGCG	2	10	177685	177694	0 %	0 %	60 %	40 %	385850445
100	NC_017515	CCAAA	2	10	178074	178083	60 %	0 %	0 %	40 %	385850445
101	NC_017515	TGGTT	2	10	178977	178986	0 %	60 %	40 %	0 %	385850446
102	NC_017515	GCCGC	2	10	180077	180086	0 %	0 %	40 %	60 %	385850447
103	NC_017515	CGGCG	2	10	181694	181703	0 %	0 %	60 %	40 %	385850448
104	NC_017515	CTCGG	2	10	186895	186904	0 %	20 %	40 %	40 %	385850452
105	NC_017515	GCCGT	2	10	189397	189406	0 %	20 %	40 %	40 %	385850454
106	NC_017515	CAGAC	2	10	190052	190061	40 %	0 %	20 %	40 %	385850455
107	NC_017515	ACCAA	2	10	190239	190248	60 %	0 %	0 %	40 %	385850455
108	NC_017515	TGCCG	2	10	192814	192823	0 %	20 %	40 %	40 %	385850458
109	NC_017515	GTTGC	2	10	193129	193138	0 %	40 %	40 %	20 %	385850458
110	NC_017515	CCTGC	2	10	201119	201128	0 %	20 %	20 %	60 %	385850464
111	NC_017515	CGGGG	2	10	204321	204330	0 %	0 %	80 %	20 %	385850465
112	NC_017515	CCGCG	2	10	205001	205010	0 %	0 %	40 %	60 %	385850465
113	NC_017515	TGCGT	2	10	205903	205912	0 %	40 %	40 %	20 %	385850465
114	NC_017515	GCGCC	2	10	206808	206817	0 %	0 %	40 %	60 %	385850466
115	NC_017515	AAATT	2	10	209061	209070	60 %	40 %	0 %	0 %	385850468
116	NC_017515	GCCGT	2	10	212010	212019	0 %	20 %	40 %	40 %	385850472
117	NC_017515	TGTCG	2	10	212713	212722	0 %	40 %	40 %	20 %	385850473
118	NC_017515	GGCAG	2	10	214247	214256	20 %	0 %	60 %	20 %	385850474
119	NC_017515	GTCAA	2	10	215823	215832	40 %	20 %	20 %	20 %	385850475
120	NC_017515	CCTTT	2	10	216427	216436	0 %	60 %	0 %	40 %	385850475
121	NC_017515	AAATG	2	10	216643	216652	60 %	20 %	20 %	0 %	385850475
122	NC_017515	GGCGC	2	10	219392	219401	0 %	0 %	60 %	40 %	385850477
123	NC_017515	GCATG	2	10	219907	219916	20 %	20 %	40 %	20 %	385850477
124	NC_017515	CATTG	2	10	220956	220965	20 %	40 %	20 %	20 %	385850477
125	NC_017515	ATCAA	2	10	223013	223022	60 %	20 %	0 %	20 %	385850479
126	NC_017515	GGTCA	2	10	227252	227261	20 %	20 %	40 %	20 %	385850481
127	NC_017515	CGTGC	2	10	231994	232003	0 %	20 %	40 %	40 %	385850483
128	NC_017515	ATCCG	2	10	234910	234919	20 %	20 %	20 %	40 %	385850487
129	NC_017515	TTGGG	2	10	235691	235700	0 %	40 %	60 %	0 %	385850489
130	NC_017515	GATTT	2	10	237085	237094	20 %	60 %	20 %	0 %	385850491
131	NC_017515	GGTGC	2	10	240455	240464	0 %	20 %	60 %	20 %	385850492
132	NC_017515	TCGTT	2	10	241375	241384	0 %	60 %	20 %	20 %	385850493
133	NC_017515	ACAAT	2	10	242139	242148	60 %	20 %	0 %	20 %	385850494
134	NC_017515	TGCCA	2	10	242366	242375	20 %	20 %	20 %	40 %	385850494
135	NC_017515	GCACG	2	10	244314	244323	20 %	0 %	40 %	40 %	385850496
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185	NC_017515	GGAAA	2	10	333716	333725	60 %	0 %	40 %	0 %	385850571
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248	NC_017515	GTGCA	2	10	445510	445519	20 %	20 %	40 %	20 %	385850672
249	NC_017515	TGCAA	2	10	445780	445789	40 %	20 %	20 %	20 %	385850673
250	NC_017515	TATGG	2	10	448275	448284	20 %	40 %	40 %	0 %	385850674
251	NC_017515	GAATC	2	10	449000	449009	40 %	20 %	20 %	20 %	385850675
252	NC_017515	GCGAT	2	10	452387	452396	20 %	20 %	40 %	20 %	385850678
253	NC_017515	ATTTG	2	10	453159	453168	20 %	60 %	20 %	0 %	385850678
254	NC_017515	TGCCG	2	10	457560	457569	0 %	20 %	40 %	40 %	385850680
255	NC_017515	TTTTA	2	10	458932	458941	20 %	80 %	0 %	0 %	385850681
256	NC_017515	TGTTT	2	10	465530	465539	0 %	80 %	20 %	0 %	385850686
257	NC_017515	GAAGA	9	45	465851	465895	60 %	0 %	40 %	0 %	385850686
258	NC_017515	GGACG	2	10	469424	469433	20 %	0 %	60 %	20 %	385850688
259	NC_017515	CGAAC	2	10	470910	470919	40 %	0 %	20 %	40 %	385850689
260	NC_017515	ACGGC	2	10	472031	472040	20 %	0 %	40 %	40 %	385850690
261	NC_017515	ATCGT	2	10	474410	474419	20 %	40 %	20 %	20 %	385850692
262	NC_017515	CGCGG	2	10	475070	475079	0 %	0 %	60 %	40 %	385850693
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