MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 31787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017514	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385340992
2	NC_017514	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340992
3	NC_017514	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340992
4	NC_017514	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385340992
5	NC_017514	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340992
6	NC_017514	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340993
7	NC_017514	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340993
8	NC_017514	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
9	NC_017514	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
10	NC_017514	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340994
11	NC_017514	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
12	NC_017514	TCG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
13	NC_017514	TCG	3	9	1471	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
14	NC_017514	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340994
15	NC_017514	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385340994
16	NC_017514	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
17	NC_017514	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
18	NC_017514	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385340994
19	NC_017514	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
20	NC_017514	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340994
21	NC_017514	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340994
22	NC_017514	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
23	NC_017514	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
24	NC_017514	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
25	NC_017514	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
26	NC_017514	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340994
27	NC_017514	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
28	NC_017514	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
29	NC_017514	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340994
30	NC_017514	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
31	NC_017514	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340994
32	NC_017514	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340994
33	NC_017514	CGC	2	6	2461	2466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017514	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017514	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340995
36	NC_017514	TCC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385340995
37	NC_017514	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340995
38	NC_017514	CAC	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385340995
39	NC_017514	TGT	2	6	2749	2754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385340995
40	NC_017514	CCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340995
41	NC_017514	CGG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340995
42	NC_017514	CGG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340995
43	NC_017514	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340996
44	NC_017514	GAT	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340996
45	NC_017514	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340996
46	NC_017514	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340996
47	NC_017514	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340996
48	NC_017514	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385340996
49	NC_017514	GCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340996
50	NC_017514	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340996
51	NC_017514	TTC	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340996
52	NC_017514	GGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340996
53	NC_017514	TGC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340996
54	NC_017514	TTA	2	6	3539	3544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017514	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340997
56	NC_017514	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340997
57	NC_017514	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340997
58	NC_017514	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017514	CCT	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017514	CGG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340998
61	NC_017514	CAA	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340998
62	NC_017514	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340998
63	NC_017514	CGG	2	6	4728	4733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340998
64	NC_017514	AAC	3	9	4736	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340998
65	NC_017514	CGT	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340998
66	NC_017514	CTG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340998
67	NC_017514	CGA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340998
68	NC_017514	AAC	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340998
69	NC_017514	TCG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340998
70	NC_017514	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340998
71	NC_017514	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340999
72	NC_017514	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
73	NC_017514	CCG	3	9	5170	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
74	NC_017514	CTG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340999
75	NC_017514	ACA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340999
76	NC_017514	AGA	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340999
77	NC_017514	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340999
78	NC_017514	AGA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340999
79	NC_017514	CGT	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340999
80	NC_017514	CCG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
81	NC_017514	CCG	3	9	5662	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
82	NC_017514	GCT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340999
83	NC_017514	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340999
84	NC_017514	CCA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385340999
85	NC_017514	CAA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017514	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341000
87	NC_017514	GCC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341000
88	NC_017514	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341000
89	NC_017514	CGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
90	NC_017514	AGC	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341001
91	NC_017514	CCG	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
92	NC_017514	CGC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
93	NC_017514	CGG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341001
94	NC_017514	GCG	3	9	6565	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341001
95	NC_017514	ATC	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341001
96	NC_017514	ACG	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341001
97	NC_017514	GCC	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
98	NC_017514	TTC	2	6	6735	6740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341001
99	NC_017514	CCG	3	9	6811	6819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
100	NC_017514	TGG	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341001
101	NC_017514	TGC	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341001
102	NC_017514	AAG	2	6	7064	7069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341001
103	NC_017514	TCT	2	6	7100	7105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341001
104	NC_017514	TTG	2	6	7111	7116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341001
105	NC_017514	GCA	2	6	7130	7135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341001
106	NC_017514	GCC	2	6	7212	7217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
107	NC_017514	CGT	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341001
108	NC_017514	TCA	2	6	7289	7294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341001
109	NC_017514	GTC	2	6	7359	7364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341001
110	NC_017514	GGT	2	6	7609	7614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341002
111	NC_017514	AAT	2	6	7750	7755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385341002
112	NC_017514	GAT	2	6	7907	7912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341002
113	NC_017514	AAT	2	6	7944	7949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385341002
114	NC_017514	CGA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341002
115	NC_017514	GAC	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341002
116	NC_017514	TGC	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341002
117	NC_017514	TGC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341002
118	NC_017514	TGC	2	6	8131	8136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341002
119	NC_017514	TGG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341002
120	NC_017514	TGG	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341002
121	NC_017514	GCG	2	6	8240	8245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341002
122	NC_017514	TGC	2	6	8352	8357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341002
123	NC_017514	CCG	3	9	8584	8592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017514	CGC	2	6	8725	8730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341003
125	NC_017514	CCA	2	6	8908	8913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385341003
126	NC_017514	GAC	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341003
127	NC_017514	GGC	2	6	9113	9118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341003
128	NC_017514	ACC	2	6	9129	9134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385341003
129	NC_017514	GCC	2	6	9137	9142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341003
130	NC_017514	GAC	2	6	9191	9196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341003
131	NC_017514	CGT	2	6	9338	9343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341003
132	NC_017514	CGC	2	6	9359	9364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341003
133	NC_017514	CAG	2	6	9368	9373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341003
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136	NC_017514	GTT	2	6	9635	9640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341003
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139	NC_017514	TGG	2	6	10097	10102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_017514	CAG	2	6	18319	18324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
244	NC_017514	GTG	2	6	18533	18538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_017514	ATG	2	6	19721	19726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017514	CCG	2	6	19771	19776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_017514	TCG	2	6	19805	19810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_017514	CGT	2	6	19928	19933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341010
261	NC_017514	GGC	2	6	19941	19946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341010
262	NC_017514	GTT	2	6	19959	19964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341010
263	NC_017514	GTT	2	6	20049	20054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341010
264	NC_017514	ACG	2	6	20083	20088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341010
265	NC_017514	GTT	2	6	20160	20165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017514	GGT	2	6	20374	20379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341011
267	NC_017514	ATC	2	6	20403	20408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341011
268	NC_017514	CGG	2	6	20456	20461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341011
269	NC_017514	CGT	2	6	20465	20470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341011
270	NC_017514	TGG	2	6	20477	20482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341011
271	NC_017514	TGT	2	6	20684	20689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341011
272	NC_017514	ATG	2	6	20804	20809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017514	CCG	2	6	20854	20859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_017514	GGT	2	6	21066	21071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017514	TGC	2	6	21092	21097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017514	CGT	2	6	21157	21162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_017514	GTT	2	6	21170	21175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_017514	ACG	2	6	21300	21305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017514	CGG	2	6	21370	21375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017514	CAT	2	6	21376	21381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017514	GTG	2	6	21574	21579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341012
283	NC_017514	ATC	2	6	21602	21607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341012
284	NC_017514	GTC	2	6	21644	21649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341012
285	NC_017514	CGT	2	6	21676	21681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341012
286	NC_017514	GTT	2	6	21782	21787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341012
287	NC_017514	CGC	2	6	21790	21795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341012
288	NC_017514	CAG	2	6	21849	21854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341013
289	NC_017514	CGC	2	6	21893	21898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341013
290	NC_017514	CCG	2	6	21967	21972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341013
291	NC_017514	TGA	2	6	21992	21997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341013
292	NC_017514	GGC	2	6	22031	22036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341013
293	NC_017514	CTT	2	6	22115	22120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385341013
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295	NC_017514	AAT	2	6	22146	22151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385341013
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297	NC_017514	TTG	2	6	22181	22186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017514	ACG	2	6	22332	22337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341014
299	NC_017514	CAT	2	6	22457	22462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341014
300	NC_017514	GAT	2	6	22491	22496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_017514	AGA	2	6	22588	22593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385341015
302	NC_017514	AGT	2	6	22595	22600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341015
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351	NC_017514	CGG	2	6	25772	25777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
352	NC_017514	GAG	2	6	25859	25864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385341017
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381	NC_017514	CGG	2	6	27963	27968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341018
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500	NC_017514	GAC	2	6	35599	35604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341024

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