MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis G2136 chromosome

Total Repeats: 197

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017513	TTATTT	2	12	14639	14650	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017513	ATTTGC	2	12	21927	21938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017513	GGCTTG	2	12	32107	32118	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017513	GTTTCC	2	12	36828	36839	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017513	TTGCCG	2	12	40240	40251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017513	CGGCAT	2	12	40969	40980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017513	ACAAAG	2	12	58573	58584	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017513	CTTATA	2	12	77068	77079	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017513	CAAACA	2	12	82163	82174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017513	GATGTG	2	12	97216	97227	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017513	CAAACA	2	12	100464	100475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017513	CAAACA	2	12	101991	102002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017513	CTTATG	2	12	106559	106570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017513	GGAAAA	2	12	123892	123903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017513	CAAAAA	2	12	181874	181885	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017513	TTCGGT	2	12	188517	188528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017513	TTCGGT	2	12	188973	188984	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017513	TAGGGA	2	12	205393	205404	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017513	TTTCCG	2	12	205412	205423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017513	CAAAAA	2	12	211915	211926	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017513	AACCAA	2	12	213979	213990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017513	CCGGTA	2	12	215499	215510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017513	TCCCTT	2	12	231745	231756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017513	CAAACA	2	12	240843	240854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017513	CAAACA	2	12	249416	249427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017513	CAAACA	2	12	289865	289876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017513	TAAAAA	2	12	299954	299965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017513	CAAAAA	2	12	301910	301921	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017513	GCAGGG	2	12	303294	303305	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017513	GGGGCG	2	12	311351	311362	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017513	ATGCTG	2	12	330186	330197	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017513	TTTGTT	2	12	380699	380710	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017513	TTAAAT	2	12	395215	395226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017513	ATTTAA	2	12	411963	411974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017513	ACCGAA	2	12	420960	420971	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017513	ACCGAA	2	12	421483	421494	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017513	ACCGAA	2	12	421683	421694	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017513	ACCGAA	2	12	421883	421894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017513	AACCGG	2	12	424316	424327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017513	ATTTAA	2	12	441575	441586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017513	TTAAAT	2	12	453530	453541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017513	GAATTT	2	12	456729	456740	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017513	AACTTC	2	12	456843	456854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017513	ATTTAA	2	12	458323	458334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017513	CAAAAT	2	12	479949	479960	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017513	TTAAAT	2	12	513643	513654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017513	CAAATC	2	12	513845	513856	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017513	GGTTTT	2	12	524613	524624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017513	AATTTA	2	12	528636	528647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017513	ATGCCG	2	12	535487	535498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017513	CGAAAA	2	12	543413	543424	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017513	TCGGTT	2	12	554708	554719	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017513	AAAAAC	2	12	555027	555038	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017513	CAAACA	2	12	557603	557614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017513	TCAAAA	2	12	559597	559608	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017513	TTCAAA	2	12	563858	563869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017513	GTATCC	2	12	573586	573597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017513	CGGACA	2	12	594124	594135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017513	TTATGT	2	12	629696	629707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017513	CAAACA	2	12	637546	637557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017513	TTCGGT	2	12	666511	666522	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017513	TTTTTG	2	12	682782	682793	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017513	ATTTAA	2	12	683602	683613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017513	CCTTAA	2	12	689053	689064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017513	CCGAAC	2	12	689478	689489	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017513	CGTTTG	2	12	714135	714146	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017513	CAAACA	2	12	724134	724145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017513	CGCCTG	2	12	727192	727203	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017513	AAAATA	2	12	730722	730733	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017513	TTCGGA	2	12	740511	740522	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017513	ATTTAA	2	12	744642	744653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017513	GTTGGT	2	12	792158	792169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017513	ACGGAT	3	18	809855	809872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017513	GTCGAT	2	12	812024	812035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017513	AAGGAT	2	12	828495	828506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017513	AAGGAA	2	12	841043	841054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017513	ATTTAT	2	12	841943	841954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017513	TTCAAT	2	12	841955	841966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017513	AAACCG	2	12	886017	886028	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017513	GGTTTT	2	12	901852	901863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017513	TAATCA	2	12	902815	902826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017513	TTTAAA	2	12	905351	905362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017513	ATTTAA	2	12	905429	905440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017513	CGAAAT	2	12	916518	916529	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017513	TGCCCG	2	12	921326	921337	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017513	ATTTAA	2	12	943177	943188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017513	TCTTTG	2	12	954781	954792	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017513	ATTTTT	2	12	962214	962225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017513	TTAAAT	2	12	967736	967747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017513	GCCGAT	2	12	971058	971069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017513	TTGTTT	2	12	984192	984203	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017513	ATTTAA	2	12	985466	985477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017513	TTAAAT	2	12	993069	993080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017513	TGGCGG	2	12	995360	995371	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017513	TTCGGC	2	12	1003359	1003370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017513	AATTTG	2	12	1024977	1024988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017513	ATTTCA	2	12	1036248	1036259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017513	CCCGTT	2	12	1076038	1076049	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017513	GAAAAA	2	12	1100017	1100028	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017513	GTGTGG	2	12	1108904	1108915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017513	GGTTTT	2	12	1109377	1109388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017513	TTAAAT	2	12	1110035	1110046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017513	AACGTT	2	12	1148950	1148961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017513	TTAAAT	2	12	1156545	1156556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017513	TGCCGA	2	12	1162255	1162266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017513	CAAACC	2	12	1177436	1177447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017513	CAAACA	2	12	1182220	1182231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017513	CTTCGT	2	12	1183695	1183706	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017513	GCTGTG	2	12	1191864	1191875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017513	TTTCAG	2	12	1217688	1217699	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017513	CCGGCT	2	12	1217801	1217812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017513	AAACAC	2	12	1233974	1233985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017513	GCTGCC	2	12	1251580	1251591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017513	AAGCCC	2	12	1254645	1254656	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017513	GCCAAA	2	12	1291588	1291599	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017513	TAAATA	2	12	1333692	1333703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017513	GACAAA	2	12	1334944	1334955	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017513	GACGGC	2	12	1341977	1341988	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017513	AAAAAT	2	12	1342125	1342136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017513	TTAATT	2	12	1344794	1344805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017513	TTTAAT	2	12	1357842	1357853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017513	TTAAAT	2	12	1363818	1363829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017513	ACAGGC	2	12	1416509	1416520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017513	ATTTAA	2	12	1416860	1416871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017513	ATTTAA	2	12	1417328	1417339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017513	TTCGGT	2	12	1449264	1449275	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017513	CAAACA	2	12	1449356	1449367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017513	TTCGGT	2	12	1450520	1450531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017513	TTCGGT	2	12	1451298	1451309	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017513	ATCGGA	2	12	1464027	1464038	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017513	TTAAAT	2	12	1470365	1470376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017513	ATTTAA	2	12	1470442	1470453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017513	AAAACG	2	12	1478201	1478212	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017513	TTAAAT	2	12	1483891	1483902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017513	CAAACA	2	12	1555234	1555245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017513	GGTTTT	2	12	1560608	1560619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017513	GATTCA	2	12	1562626	1562637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_017513	ACCGAA	2	12	1568419	1568430	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017513	ACCGAA	2	12	1568617	1568628	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017513	ACCGAA	2	12	1568815	1568826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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144	NC_017513	CACTTC	2	12	1587638	1587649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017513	ACCATG	2	12	1589048	1589059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_017513	CATTTC	2	12	1656371	1656382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017513	CAAACA	2	12	1676731	1676742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017513	ATTTTT	2	12	1719331	1719342	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017513	GAAATA	2	12	1740190	1740201	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017513	TTAAAT	2	12	1751343	1751354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017513	TCGCTG	2	12	1754710	1754721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_017513	CCATAT	2	12	1755695	1755706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017513	ATTTAA	2	12	1759221	1759232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017513	CGGAAA	2	12	1763295	1763306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_017513	GGTTTT	2	12	1766587	1766598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017513	TTCGGT	2	12	1767551	1767562	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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171	NC_017513	ATAAAA	2	12	1893226	1893237	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.