MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis G2136 chromosome

Total Repeats: 1590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017513	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385339064
2	NC_017513	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385339065
3	NC_017513	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385339065
4	NC_017513	GACAT	2	10	3430	3439	40 %	20 %	20 %	20 %	385339067
5	NC_017513	ACCAA	2	10	4389	4398	60 %	0 %	0 %	40 %	385339069
6	NC_017513	AAGGC	2	10	6005	6014	40 %	0 %	40 %	20 %	385339071
7	NC_017513	TGCTT	2	10	6364	6373	0 %	60 %	20 %	20 %	385339072
8	NC_017513	TCAAT	2	10	9395	9404	40 %	40 %	0 %	20 %	385339074
9	NC_017513	CGCGC	2	10	10408	10417	0 %	0 %	40 %	60 %	385339075
10	NC_017513	CACGC	2	10	10724	10733	20 %	0 %	20 %	60 %	385339076
11	NC_017513	TCCCG	2	10	11578	11587	0 %	20 %	20 %	60 %	385339076
12	NC_017513	TGTCG	2	10	13034	13043	0 %	40 %	40 %	20 %	385339077
13	NC_017513	ATTTA	2	10	13381	13390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017513	TAATG	2	10	15597	15606	40 %	40 %	20 %	0 %	385339078
15	NC_017513	GGCGG	2	10	17545	17554	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017513	AACAT	2	10	19277	19286	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017513	TAATT	2	10	19298	19307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017513	GAATT	2	10	19328	19337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017513	TAAAA	2	10	20213	20222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017513	GAAAA	2	10	20297	20306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017513	CATTT	2	10	20471	20480	20 %	60 %	0 %	20 %	385339083
22	NC_017513	TCAAC	2	10	21819	21828	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017513	AACCT	2	10	21885	21894	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017513	CTTGC	2	10	24769	24778	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017513	ATTTC	2	10	25052	25061	20 %	60 %	0 %	20 %	385339087
26	NC_017513	AGGGC	2	10	30008	30017	20 %	0 %	60 %	20 %	385339092
27	NC_017513	AAACC	2	10	30701	30710	60 %	0 %	0 %	40 %	385339093
28	NC_017513	TCCGC	2	10	33996	34005	0 %	20 %	20 %	60 %	385339095
29	NC_017513	CATTC	2	10	38459	38468	20 %	40 %	0 %	40 %	385339099
30	NC_017513	AGGTG	2	10	38906	38915	20 %	20 %	60 %	0 %	385339100
31	NC_017513	GGGCT	2	10	41571	41580	0 %	20 %	60 %	20 %	385339101
32	NC_017513	GGCGG	2	10	45069	45078	0 %	0 %	80 %	20 %	385339104
33	NC_017513	GCGGT	2	10	45544	45553	0 %	20 %	60 %	20 %	385339105
34	NC_017513	GCGCG	2	10	45941	45950	0 %	0 %	60 %	40 %	385339105
35	NC_017513	ACGGC	2	10	46486	46495	20 %	0 %	40 %	40 %	385339105
36	NC_017513	AAACC	2	10	51934	51943	60 %	0 %	0 %	40 %	385339108
37	NC_017513	CCCGC	2	10	52431	52440	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_017513	GTGCG	2	10	54285	54294	0 %	20 %	60 %	20 %	385339110
39	NC_017513	TCGTG	2	10	57673	57682	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017513	GGGAG	2	10	59299	59308	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017513	AGGTT	2	10	60241	60250	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017513	ATTTT	2	10	62738	62747	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017513	TGCCG	2	10	64790	64799	0 %	20 %	40 %	40 %	385339116
44	NC_017513	TGGCT	2	10	65119	65128	0 %	40 %	40 %	20 %	385339116
45	NC_017513	TGCCC	2	10	65726	65735	0 %	20 %	20 %	60 %	385339116
46	NC_017513	GCGTA	2	10	67845	67854	20 %	20 %	40 %	20 %	385339119
47	NC_017513	GGGTA	2	10	69109	69118	20 %	20 %	60 %	0 %	385339120
48	NC_017513	GGAAA	2	10	70252	70261	60 %	0 %	40 %	0 %	385339121
49	NC_017513	CGTTG	2	10	70886	70895	0 %	40 %	40 %	20 %	385339122
50	NC_017513	CCGCG	2	10	71807	71816	0 %	0 %	40 %	60 %	385339122
51	NC_017513	CTTGC	2	10	72867	72876	0 %	40 %	20 %	40 %	385339122
52	NC_017513	GCCAA	2	10	73855	73864	40 %	0 %	20 %	40 %	385339124
53	NC_017513	AGCCA	2	10	74149	74158	40 %	0 %	20 %	40 %	385339124
54	NC_017513	TCAAA	2	10	75082	75091	60 %	20 %	0 %	20 %	385339125
55	NC_017513	CTTTT	2	10	75705	75714	0 %	80 %	0 %	20 %	385339125
56	NC_017513	ATACA	2	10	75889	75898	60 %	20 %	0 %	20 %	385339126
57	NC_017513	TCAAA	2	10	77289	77298	60 %	20 %	0 %	20 %	385339127
58	NC_017513	ATTAA	2	10	79203	79212	60 %	40 %	0 %	0 %	385339129
59	NC_017513	TGCTT	2	10	79454	79463	0 %	60 %	20 %	20 %	385339129
60	NC_017513	TCAAA	2	10	79946	79955	60 %	20 %	0 %	20 %	385339129
61	NC_017513	GGCCT	2	10	81029	81038	0 %	20 %	40 %	40 %	385339130
62	NC_017513	AATTT	2	10	81180	81189	40 %	60 %	0 %	0 %	385339130
63	NC_017513	ACCGT	2	10	82260	82269	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017513	GCCGA	2	10	84491	84500	20 %	0 %	40 %	40 %	385339133
65	NC_017513	CTACC	2	10	84883	84892	20 %	20 %	0 %	60 %	385339133
66	NC_017513	TACGC	2	10	86148	86157	20 %	20 %	20 %	40 %	385339134
67	NC_017513	CCCGT	2	10	89233	89242	0 %	20 %	20 %	60 %	385339137
68	NC_017513	CCGTA	2	10	89470	89479	20 %	20 %	20 %	40 %	385339137
69	NC_017513	ACATC	2	10	90371	90380	40 %	20 %	0 %	40 %	385339138
70	NC_017513	GGCAA	2	10	91628	91637	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017513	CGCAA	2	10	92082	92091	40 %	0 %	20 %	40 %	385339139
72	NC_017513	TTTGA	2	10	97851	97860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017513	AAACC	2	10	99466	99475	60 %	0 %	0 %	40 %	385339144
74	NC_017513	ACCGT	2	10	100561	100570	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017513	ACCGT	2	10	102088	102097	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017513	CGTGC	2	10	102970	102979	0 %	20 %	40 %	40 %	385339148
77	NC_017513	GCCGC	2	10	104130	104139	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_017513	AATTG	2	10	104981	104990	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017513	AAAAT	2	10	105242	105251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017513	CGGCG	2	10	107085	107094	0 %	0 %	60 %	40 %	385339151
81	NC_017513	CAGGT	2	10	108551	108560	20 %	20 %	40 %	20 %	385339153
82	NC_017513	CGCCT	2	10	109237	109246	0 %	20 %	20 %	60 %	385339154
83	NC_017513	GGTAT	2	10	109477	109486	20 %	40 %	40 %	0 %	385339154
84	NC_017513	GGCGC	2	10	109728	109737	0 %	0 %	60 %	40 %	385339154
85	NC_017513	TGCCG	2	10	110851	110860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017513	GGCGC	3	15	111274	111288	0 %	0 %	60 %	40 %	385339156
87	NC_017513	CAAAG	2	10	111483	111492	60 %	0 %	20 %	20 %	385339156
88	NC_017513	GCGCC	2	10	112690	112699	0 %	0 %	40 %	60 %	385339157
89	NC_017513	GGCGC	2	10	112919	112928	0 %	0 %	60 %	40 %	385339157
90	NC_017513	TGAGT	2	10	114533	114542	20 %	40 %	40 %	0 %	385339159
91	NC_017513	GGCAA	2	10	115110	115119	40 %	0 %	40 %	20 %	385339159
92	NC_017513	CGGCG	2	10	116877	116886	0 %	0 %	60 %	40 %	385339160
93	NC_017513	GTTTT	2	10	117550	117559	0 %	80 %	20 %	0 %	385339161
94	NC_017513	CGTGT	2	10	119314	119323	0 %	40 %	40 %	20 %	385339163
95	NC_017513	GAAAA	2	10	119728	119737	80 %	0 %	20 %	0 %	385339163
96	NC_017513	AGGGC	2	10	119865	119874	20 %	0 %	60 %	20 %	385339163
97	NC_017513	CAAAT	2	10	120763	120772	60 %	20 %	0 %	20 %	385339163
98	NC_017513	TAATA	2	10	122583	122592	60 %	40 %	0 %	0 %	385339165
99	NC_017513	GAAGG	2	10	126221	126230	40 %	0 %	60 %	0 %	385339170
100	NC_017513	GTACC	2	10	127792	127801	20 %	20 %	20 %	40 %	385339173
101	NC_017513	TTGGG	2	10	132823	132832	0 %	40 %	60 %	0 %	385339176
102	NC_017513	CATAC	2	10	135299	135308	40 %	20 %	0 %	40 %	385339177
103	NC_017513	GTGAT	2	10	136178	136187	20 %	40 %	40 %	0 %	385339177
104	NC_017513	TTTCC	2	10	137945	137954	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017513	CCTGC	2	10	140913	140922	0 %	20 %	20 %	60 %	385339180
106	NC_017513	CAAAC	2	10	143157	143166	60 %	0 %	0 %	40 %	385339184
107	NC_017513	CTTTA	2	10	143784	143793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017513	TGATT	2	10	146578	146587	20 %	60 %	20 %	0 %	385339190
109	NC_017513	AATGC	2	10	147272	147281	40 %	20 %	20 %	20 %	385339191
110	NC_017513	GTAAA	2	10	148223	148232	60 %	20 %	20 %	0 %	385339194
111	NC_017513	AATTT	2	10	148447	148456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017513	TCAAA	2	10	149295	149304	60 %	20 %	0 %	20 %	385339196
113	NC_017513	TTTGG	2	10	150106	150115	0 %	60 %	40 %	0 %	385339198
114	NC_017513	GAAAT	2	10	153952	153961	60 %	20 %	20 %	0 %	385339205
115	NC_017513	AAAAT	2	10	154214	154223	80 %	20 %	0 %	0 %	385339207
116	NC_017513	GGGTT	2	10	155701	155710	0 %	40 %	60 %	0 %	385339210
117	NC_017513	GTCAT	2	10	156223	156232	20 %	40 %	20 %	20 %	385339211
118	NC_017513	GCAAA	2	10	158595	158604	60 %	0 %	20 %	20 %	385339214
119	NC_017513	CGGTT	2	10	158625	158634	0 %	40 %	40 %	20 %	385339214
120	NC_017513	TGGCG	2	10	162138	162147	0 %	20 %	60 %	20 %	385339217
121	NC_017513	TGGTT	2	10	163112	163121	0 %	60 %	40 %	0 %	385339217
122	NC_017513	CGGCG	2	10	163665	163674	0 %	0 %	60 %	40 %	385339218
123	NC_017513	CCAAA	2	10	164054	164063	60 %	0 %	0 %	40 %	385339218
124	NC_017513	TTTAT	2	10	164261	164270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017513	TGGTT	2	10	164957	164966	0 %	60 %	40 %	0 %	385339219
126	NC_017513	TGCCG	2	10	165663	165672	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017513	GCCGC	2	10	166057	166066	0 %	0 %	40 %	60 %	385339220
128	NC_017513	CGGCG	2	10	167674	167683	0 %	0 %	60 %	40 %	385339221
129	NC_017513	TTTCC	2	10	168386	168395	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017513	CTCGG	2	10	172875	172884	0 %	20 %	40 %	40 %	385339225
131	NC_017513	GCCGT	2	10	175377	175386	0 %	20 %	40 %	40 %	385339227
132	NC_017513	CAGAC	2	10	176032	176041	40 %	0 %	20 %	40 %	385339228
133	NC_017513	ACCAA	2	10	176219	176228	60 %	0 %	0 %	40 %	385339228
134	NC_017513	TGCCG	2	10	178794	178803	0 %	20 %	40 %	40 %	385339231
135	NC_017513	GTTGC	2	10	179109	179118	0 %	40 %	40 %	20 %	385339231
136	NC_017513	GTTTG	2	10	179713	179722	0 %	60 %	40 %	0 %	385339232
137	NC_017513	TAAAA	2	10	181680	181689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017513	AGCGT	2	10	182768	182777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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403	NC_017513	CGGCG	2	10	581386	581395	0 %	0 %	60 %	40 %	385339574
404	NC_017513	TGCGG	2	10	581486	581495	0 %	20 %	60 %	20 %	385339574
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407	NC_017513	CATTG	2	10	583566	583575	20 %	40 %	20 %	20 %	385339576
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413	NC_017513	CCGTA	2	10	587032	587041	20 %	20 %	20 %	40 %	385339581
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431	NC_017513	CGCGC	2	10	618710	618719	0 %	0 %	40 %	60 %	385339606
432	NC_017513	ATTAC	2	10	624854	624863	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
433	NC_017513	AAATC	2	10	625337	625346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
434	NC_017513	ATTAC	2	10	626738	626747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
435	NC_017513	TGGAA	2	10	628397	628406	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017513	ATACA	2	10	633568	633577	60 %	20 %	0 %	20 %	385339625
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441	NC_017513	GGTTG	2	10	635475	635484	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017513	GGATT	2	10	637466	637475	20 %	40 %	40 %	0 %	385339631
443	NC_017513	ACCGT	2	10	637643	637652	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
444	NC_017513	TGATT	2	10	639826	639835	20 %	60 %	20 %	0 %	385339636
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452	NC_017513	GCGCG	2	10	646862	646871	0 %	0 %	60 %	40 %	385339642
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491	NC_017513	TGGAT	2	10	698161	698170	20 %	40 %	40 %	0 %	385339690
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498	NC_017513	TGCAT	2	10	703194	703203	20 %	40 %	20 %	20 %	385339695
499	NC_017513	ATCAA	2	10	704329	704338	60 %	20 %	0 %	20 %	385339696
500	NC_017513	GGATG	2	10	706726	706735	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

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