MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis WUE 2594

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017512	TGGCGG	2	12	16835	16846	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017512	CGGCGT	3	18	17171	17188	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017512	GGCTTG	2	12	23746	23757	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017512	TCCGAT	2	12	24541	24552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017512	TTGCCG	2	12	31866	31877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017512	CGGCAT	2	12	32595	32606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017512	TTCGGT	2	12	39432	39443	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017512	TGCCAA	2	12	51314	51325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017512	CGATTA	2	12	51796	51807	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017512	AAAATA	2	12	57751	57762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017512	ATTTTT	2	12	60652	60663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017512	GCTGTT	2	12	61196	61207	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017512	TTTTGA	2	12	63293	63304	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017512	TTAAAT	2	12	68502	68513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017512	TATTTT	2	12	72425	72436	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017512	GGCCGC	2	12	79664	79675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017512	ACAAAG	2	12	157070	157081	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017512	TCTTTT	2	12	166407	166418	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017512	GAGGGG	2	12	167144	167155	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017512	TTTGGG	2	12	167189	167200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017512	TCGCGC	2	12	168246	168257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017512	AAGCCG	2	12	177119	177130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017512	TTAAAT	2	12	192678	192689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017512	GGAAGC	2	12	199902	199913	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017512	TTTGCA	2	12	231005	231016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017512	TGCAGT	2	12	232052	232063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017512	ATTTAA	2	12	274739	274750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017512	CAAAAA	2	12	277630	277641	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017512	GCAGGG	2	12	279015	279026	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017512	GGGGCG	2	12	286969	286980	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017512	CAACCC	2	12	345428	345439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017512	TTTTGT	2	12	355848	355859	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017512	TTAAAT	2	12	370040	370051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017512	TTTTAC	2	12	384399	384410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017512	ACCGAA	2	12	398645	398656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017512	ACCGAA	2	12	398845	398856	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017512	ACCGAA	2	12	401609	401620	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017512	AACCGG	2	12	401678	401689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017512	GCTGCC	2	12	423509	423520	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017512	TTAAAT	2	12	430375	430386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017512	ATTTAA	2	12	435665	435676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017512	CAAAAT	2	12	448521	448532	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017512	CAAAAT	2	12	454659	454670	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017512	CAAAAT	2	12	458669	458680	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017512	TTAAAT	2	12	488351	488362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017512	CAAATC	2	12	488553	488564	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017512	GGTTTT	2	12	500130	500141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017512	CTTGGG	2	12	500955	500966	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017512	AATTTA	2	12	503558	503569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017512	ATGCCG	2	12	510409	510420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017512	CGAAAA	2	12	518336	518347	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017512	GGCGCA	2	12	525237	525248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017512	ATTTAA	2	12	526166	526177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017512	AAATCC	2	12	529171	529182	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017512	TCGGTT	2	12	529560	529571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017512	TCGGTT	2	12	529913	529924	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017512	AAAAAC	2	12	531262	531273	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017512	ATAGAA	2	12	537985	537996	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017512	TCAAAA	2	12	542974	542985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017512	GACGGT	2	12	543352	543363	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017512	AACGGC	2	12	543481	543492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017512	CGGTAA	2	12	543756	543767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017512	TAAAGC	2	12	544191	544202	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017512	TGGCAA	2	12	545220	545231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017512	TTCAAA	2	12	546035	546046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017512	TTAAAT	2	12	567719	567730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017512	CGGACA	2	12	576327	576338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017512	TTATGT	2	12	605414	605425	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017512	TTCGGT	2	12	633624	633635	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017512	TTTTTG	2	12	651112	651123	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017512	ATTTAA	2	12	652254	652265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017512	CCTTAA	2	12	657706	657717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017512	CATTCC	2	12	657808	657819	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017512	ATTTAA	2	12	658031	658042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017512	CCGAAC	2	12	658086	658097	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017512	ATGCCG	2	12	666195	666206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017512	TTAAAT	2	12	667449	667460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017512	TTAAAT	2	12	674351	674362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017512	CGCCTG	2	12	694090	694101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017512	AAAATA	2	12	697622	697633	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017512	TTCGGA	2	12	707409	707420	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017512	ATTTAA	2	12	711643	711654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017512	GTTGGT	2	12	761477	761488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017512	CGATTT	2	12	769039	769050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017512	GTCGAT	2	12	788425	788436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017512	TTAAAT	2	12	801706	801717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017512	AAGGAT	2	12	807840	807851	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017512	AAGGAA	2	12	820505	820516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017512	TTAAAT	2	12	820638	820649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017512	ATTTAT	2	12	821406	821417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017512	TTCAAT	2	12	821418	821429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017512	CAGTTT	2	12	825567	825578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017512	GGTTTT	2	12	833842	833853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017512	TAATCA	2	12	834804	834815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017512	TTTAAA	2	12	837340	837351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017512	ATTTAA	2	12	837418	837429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017512	CGAAAT	2	12	846684	846695	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017512	TCTTTG	2	12	884986	884997	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017512	ATTTTT	2	12	892423	892434	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017512	TTAAAT	2	12	897943	897954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017512	TTGTTT	2	12	914579	914590	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017512	CAGCCC	2	12	915579	915590	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017512	ATTTAA	2	12	915853	915864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017512	TTAAAT	2	12	923444	923455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017512	GGGGTG	2	12	924405	924416	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017512	ATTTAA	2	12	925870	925881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017512	TGGCGG	2	12	928594	928605	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017512	TTCGGC	2	12	935508	935519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017512	ATTTAA	2	12	949464	949475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017512	AATTTG	2	12	959242	959253	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017512	ATTTAA	2	12	968564	968575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017512	GGAAAA	2	12	968604	968615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017512	TTGATG	2	12	975888	975899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017512	CGGTGC	2	12	1016725	1016736	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017512	GAAAAA	2	12	1056529	1056540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017512	GAAACC	2	12	1065434	1065445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017512	TGCCGA	2	12	1118222	1118233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017512	CTACAT	2	12	1148155	1148166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017512	ACGGCT	2	12	1148247	1148258	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017512	GCGCGA	2	12	1166427	1166438	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017512	GCCTAC	2	12	1166620	1166631	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017512	CGGTAA	2	12	1167137	1167148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017512	TTTCAG	2	12	1177173	1177184	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017512	CCGGCT	2	12	1177286	1177297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017512	AAACAC	2	12	1193547	1193558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017512	GCTGCC	2	12	1211148	1211159	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017512	CAAAAA	2	12	1266644	1266655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017512	GCGTTG	2	12	1271664	1271675	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017512	AACAAA	2	12	1272320	1272331	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017512	TTAAAT	2	12	1283887	1283898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017512	TAAATA	2	12	1296185	1296196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017512	TCTTTG	2	12	1299067	1299078	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017512	GCCAAA	2	12	1301422	1301433	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017512	GACGGT	2	12	1306996	1307007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017512	AACGGC	2	12	1307125	1307136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017512	CGGTAA	2	12	1307400	1307411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017512	TAAAGC	2	12	1307835	1307846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_017512	ATTTAA	2	12	1313721	1313732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017512	CTGCAT	2	12	1325020	1325031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017512	ATTTAA	2	12	1329393	1329404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017512	AATTTA	2	12	1374309	1374320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_017512	TTAAAT	2	12	1494331	1494342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017512	ATTTAA	2	12	1500054	1500065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017512	TTCGGT	2	12	1508118	1508129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_017512	CTTCCC	2	12	1510763	1510774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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155	NC_017512	TTTAAA	2	12	1519320	1519331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017512	ACCGAA	2	12	1519746	1519757	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017512	TTAAAT	2	12	1520001	1520012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.