MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 chromosome

Total Repeats: 1287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017511	TGTTT	2	10	3231	3240	0 %	80 %	20 %	0 %	385334900
2	NC_017511	CGGGT	2	10	5398	5407	0 %	20 %	60 %	20 %	385334901
3	NC_017511	TGCGG	2	10	12355	12364	0 %	20 %	60 %	20 %	385334907
4	NC_017511	TTCCG	2	10	14629	14638	0 %	40 %	20 %	40 %	385334910
5	NC_017511	CGACC	2	10	17985	17994	20 %	0 %	20 %	60 %	385334914
6	NC_017511	TGGTT	2	10	21039	21048	0 %	60 %	40 %	0 %	385334916
7	NC_017511	GCCGC	2	10	21731	21740	0 %	0 %	40 %	60 %	385334916
8	NC_017511	GTTTC	2	10	24144	24153	0 %	60 %	20 %	20 %	385334918
9	NC_017511	GATGC	2	10	26624	26633	20 %	20 %	40 %	20 %	385334921
10	NC_017511	CGGGC	2	10	27867	27876	0 %	0 %	60 %	40 %	385334922
11	NC_017511	CCGTG	2	10	28839	28848	0 %	20 %	40 %	40 %	385334924
12	NC_017511	TTTGG	2	10	30537	30546	0 %	60 %	40 %	0 %	385334925
13	NC_017511	ATAAA	2	10	33200	33209	80 %	20 %	0 %	0 %	385334926
14	NC_017511	TTTTC	2	10	38096	38105	0 %	80 %	0 %	20 %	385334931
15	NC_017511	TCAAA	2	10	38753	38762	60 %	20 %	0 %	20 %	385334931
16	NC_017511	TTTTC	2	10	40070	40079	0 %	80 %	0 %	20 %	385334931
17	NC_017511	TCAAA	2	10	40727	40736	60 %	20 %	0 %	20 %	385334931
18	NC_017511	TCAAA	2	10	42701	42710	60 %	20 %	0 %	20 %	385334931
19	NC_017511	TTTCC	2	10	44068	44077	0 %	60 %	0 %	40 %	385334931
20	NC_017511	TTGTT	2	10	44707	44716	0 %	80 %	20 %	0 %	385334931
21	NC_017511	GCCCG	2	10	46105	46114	0 %	0 %	40 %	60 %	385334932
22	NC_017511	GCCGG	2	10	48056	48065	0 %	0 %	60 %	40 %	385334934
23	NC_017511	CGGCT	2	10	50811	50820	0 %	20 %	40 %	40 %	385334936
24	NC_017511	CGTTG	2	10	53519	53528	0 %	40 %	40 %	20 %	385334938
25	NC_017511	TGCCT	2	10	56167	56176	0 %	40 %	20 %	40 %	385334940
26	NC_017511	TTTGG	2	10	58319	58328	0 %	60 %	40 %	0 %	385334941
27	NC_017511	CCCAA	2	10	60092	60101	40 %	0 %	0 %	60 %	385334943
28	NC_017511	TTTCG	2	10	60313	60322	0 %	60 %	20 %	20 %	385334943
29	NC_017511	CGCGG	2	10	60629	60638	0 %	0 %	60 %	40 %	385334943
30	NC_017511	CGGTG	2	10	66420	66429	0 %	20 %	60 %	20 %	385334947
31	NC_017511	AAACC	2	10	67450	67459	60 %	0 %	0 %	40 %	385334948
32	NC_017511	CAGGG	2	10	68486	68495	20 %	0 %	60 %	20 %	385334949
33	NC_017511	CGATG	2	10	69471	69480	20 %	20 %	40 %	20 %	385334951
34	NC_017511	GGCAG	2	10	70484	70493	20 %	0 %	60 %	20 %	385334952
35	NC_017511	GGCGC	2	10	72604	72613	0 %	0 %	60 %	40 %	385334953
36	NC_017511	ATGTG	2	10	73890	73899	20 %	40 %	40 %	0 %	385334953
37	NC_017511	GGCGG	2	10	78856	78865	0 %	0 %	80 %	20 %	385334960
38	NC_017511	GGGCG	2	10	85507	85516	0 %	0 %	80 %	20 %	385334964
39	NC_017511	TTTGG	2	10	90897	90906	0 %	60 %	40 %	0 %	385334969
40	NC_017511	GTTTT	2	10	91620	91629	0 %	80 %	20 %	0 %	385334969
41	NC_017511	GTATT	2	10	92158	92167	20 %	60 %	20 %	0 %	385334969
42	NC_017511	TCGCG	2	10	92962	92971	0 %	20 %	40 %	40 %	385334970
43	NC_017511	CGGTT	2	10	97078	97087	0 %	40 %	40 %	20 %	385334974
44	NC_017511	GAAAG	2	10	97711	97720	60 %	0 %	40 %	0 %	385334974
45	NC_017511	GGCAG	2	10	101008	101017	20 %	0 %	60 %	20 %	385334977
46	NC_017511	GAATC	2	10	103109	103118	40 %	20 %	20 %	20 %	385334979
47	NC_017511	TACCG	2	10	107824	107833	20 %	20 %	20 %	40 %	385334982
48	NC_017511	GGTGT	2	10	109748	109757	0 %	40 %	60 %	0 %	385334984
49	NC_017511	CGGCA	2	10	111834	111843	20 %	0 %	40 %	40 %	385334986
50	NC_017511	CAGCG	2	10	114635	114644	20 %	0 %	40 %	40 %	385334988
51	NC_017511	GCGTG	2	10	115055	115064	0 %	20 %	60 %	20 %	385334989
52	NC_017511	CGGTA	2	10	115104	115113	20 %	20 %	40 %	20 %	385334989
53	NC_017511	GGCGT	2	10	116420	116429	0 %	20 %	60 %	20 %	385334990
54	NC_017511	GCGCG	2	10	117010	117019	0 %	0 %	60 %	40 %	385334990
55	NC_017511	GGCGC	2	10	118707	118716	0 %	0 %	60 %	40 %	385334992
56	NC_017511	ACCGC	2	10	119654	119663	20 %	0 %	20 %	60 %	385334994
57	NC_017511	GACGG	2	10	123654	123663	20 %	0 %	60 %	20 %	385334998
58	NC_017511	CTGGG	2	10	123929	123938	0 %	20 %	60 %	20 %	385334998
59	NC_017511	CGTAT	2	10	125443	125452	20 %	40 %	20 %	20 %	385334999
60	NC_017511	CTCAA	2	10	125809	125818	40 %	20 %	0 %	40 %	385335000
61	NC_017511	CCGCC	2	10	126083	126092	0 %	0 %	20 %	80 %	385335000
62	NC_017511	ACGGC	2	10	126134	126143	20 %	0 %	40 %	40 %	385335000
63	NC_017511	CCGAC	2	10	126392	126401	20 %	0 %	20 %	60 %	385335000
64	NC_017511	TGGTT	2	10	126650	126659	0 %	60 %	40 %	0 %	385335000
65	NC_017511	CCTGC	2	10	128950	128959	0 %	20 %	20 %	60 %	385335002
66	NC_017511	CAATA	2	10	132195	132204	60 %	20 %	0 %	20 %	385335006
67	NC_017511	CGCGC	2	10	133326	133335	0 %	0 %	40 %	60 %	385335006
68	NC_017511	CAAGC	2	10	133474	133483	40 %	0 %	20 %	40 %	385335006
69	NC_017511	CCGAA	2	10	134988	134997	40 %	0 %	20 %	40 %	385335008
70	NC_017511	GCGGG	2	10	135138	135147	0 %	0 %	80 %	20 %	385335008
71	NC_017511	GGCAG	2	10	141133	141142	20 %	0 %	60 %	20 %	385335014
72	NC_017511	CGGAA	2	10	143612	143621	40 %	0 %	40 %	20 %	385335017
73	NC_017511	AGGCG	2	10	146726	146735	20 %	0 %	60 %	20 %	385335020
74	NC_017511	GCGCG	2	10	146864	146873	0 %	0 %	60 %	40 %	385335020
75	NC_017511	GAAAA	2	10	148194	148203	80 %	0 %	20 %	0 %	385335023
76	NC_017511	CGGCG	2	10	151195	151204	0 %	0 %	60 %	40 %	385335026
77	NC_017511	GATGT	2	10	151400	151409	20 %	40 %	40 %	0 %	385335026
78	NC_017511	CCGCA	2	10	153509	153518	20 %	0 %	20 %	60 %	385335026
79	NC_017511	CAAAC	2	10	153922	153931	60 %	0 %	0 %	40 %	385335027
80	NC_017511	TTTTC	2	10	155742	155751	0 %	80 %	0 %	20 %	385335031
81	NC_017511	CGGCT	2	10	157713	157722	0 %	20 %	40 %	40 %	385335035
82	NC_017511	GCAGT	2	10	164029	164038	20 %	20 %	40 %	20 %	385335043
83	NC_017511	TGGTG	2	10	164634	164643	0 %	40 %	60 %	0 %	385335043
84	NC_017511	TTGCC	2	10	167381	167390	0 %	40 %	20 %	40 %	385335046
85	NC_017511	GTCCA	2	10	167642	167651	20 %	20 %	20 %	40 %	385335046
86	NC_017511	GAAGG	2	10	168298	168307	40 %	0 %	60 %	0 %	385335046
87	NC_017511	GCAGG	2	10	168946	168955	20 %	0 %	60 %	20 %	385335046
88	NC_017511	TGCCG	2	10	170273	170282	0 %	20 %	40 %	40 %	385335049
89	NC_017511	ATGCC	2	10	170407	170416	20 %	20 %	20 %	40 %	385335049
90	NC_017511	AGCGG	2	10	171955	171964	20 %	0 %	60 %	20 %	385335051
91	NC_017511	TTCCC	2	10	173807	173816	0 %	40 %	0 %	60 %	385335054
92	NC_017511	GTCGC	2	10	177829	177838	0 %	20 %	40 %	40 %	385335059
93	NC_017511	GAAAA	2	10	178732	178741	80 %	0 %	20 %	0 %	385335059
94	NC_017511	GCGCC	3	15	179064	179078	0 %	0 %	40 %	60 %	385335060
95	NC_017511	CGGCG	2	10	185646	185655	0 %	0 %	60 %	40 %	385335063
96	NC_017511	TCGCG	2	10	186279	186288	0 %	20 %	40 %	40 %	385335063
97	NC_017511	GGTCG	2	10	186493	186502	0 %	20 %	60 %	20 %	385335063
98	NC_017511	GAAAA	2	10	186963	186972	80 %	0 %	20 %	0 %	385335064
99	NC_017511	GCCGT	2	10	187203	187212	0 %	20 %	40 %	40 %	385335064
100	NC_017511	GAAAA	2	10	190594	190603	80 %	0 %	20 %	0 %	385335067
101	NC_017511	GAAAA	2	10	192944	192953	80 %	0 %	20 %	0 %	385335070
102	NC_017511	TCGGT	2	10	193320	193329	0 %	40 %	40 %	20 %	385335070
103	NC_017511	GAAGC	2	10	193678	193687	40 %	0 %	40 %	20 %	385335070
104	NC_017511	GATGT	2	10	193763	193772	20 %	40 %	40 %	0 %	385335070
105	NC_017511	GTTCC	2	10	193843	193852	0 %	40 %	20 %	40 %	385335071
106	NC_017511	AAAGC	2	10	194006	194015	60 %	0 %	20 %	20 %	385335071
107	NC_017511	CCTGT	2	10	194876	194885	0 %	40 %	20 %	40 %	385335072
108	NC_017511	TCGCT	2	10	195658	195667	0 %	40 %	20 %	40 %	385335073
109	NC_017511	CAGGG	2	10	197835	197844	20 %	0 %	60 %	20 %	385335075
110	NC_017511	CATCG	2	10	198210	198219	20 %	20 %	20 %	40 %	385335075
111	NC_017511	CGCGG	2	10	198758	198767	0 %	0 %	60 %	40 %	385335076
112	NC_017511	ATTTT	2	10	200181	200190	20 %	80 %	0 %	0 %	385335077
113	NC_017511	ATCGC	2	10	200803	200812	20 %	20 %	20 %	40 %	385335078
114	NC_017511	GATTC	2	10	203340	203349	20 %	40 %	20 %	20 %	385335081
115	NC_017511	GTTTT	2	10	205517	205526	0 %	80 %	20 %	0 %	385335083
116	NC_017511	GTGGC	2	10	206334	206343	0 %	20 %	60 %	20 %	385335084
117	NC_017511	GCCGA	2	10	208171	208180	20 %	0 %	40 %	40 %	385335086
118	NC_017511	TTCAA	2	10	209608	209617	40 %	40 %	0 %	20 %	385335086
119	NC_017511	GGGTG	2	10	210985	210994	0 %	20 %	80 %	0 %	385335087
120	NC_017511	ACGGC	2	10	212765	212774	20 %	0 %	40 %	40 %	385335088
121	NC_017511	CCGCG	2	10	213469	213478	0 %	0 %	40 %	60 %	385335090
122	NC_017511	AAGCC	2	10	213639	213648	40 %	0 %	20 %	40 %	385335090
123	NC_017511	GGTTT	2	10	220104	220113	0 %	60 %	40 %	0 %	385335098
124	NC_017511	GCATT	2	10	222076	222085	20 %	40 %	20 %	20 %	385335100
125	NC_017511	AGGGC	2	10	225790	225799	20 %	0 %	60 %	20 %	385335104
126	NC_017511	AATTT	2	10	225990	225999	40 %	60 %	0 %	0 %	385335104
127	NC_017511	CCCGT	2	10	227757	227766	0 %	20 %	20 %	60 %	385335105
128	NC_017511	AAAGA	2	10	228280	228289	80 %	0 %	20 %	0 %	385335105
129	NC_017511	CAATC	2	10	232680	232689	40 %	20 %	0 %	40 %	385335110
130	NC_017511	ACGGC	2	10	233577	233586	20 %	0 %	40 %	40 %	385335110
131	NC_017511	TGTGG	2	10	237659	237668	0 %	40 %	60 %	0 %	385335111
132	NC_017511	CGGCG	2	10	242867	242876	0 %	0 %	60 %	40 %	385335115
133	NC_017511	GGTAA	2	10	243331	243340	40 %	20 %	40 %	0 %	385335116
134	NC_017511	TTTCT	2	10	245037	245046	0 %	80 %	0 %	20 %	385335117
135	NC_017511	TTGCT	2	10	248688	248697	0 %	60 %	20 %	20 %	385335121
136	NC_017511	CCGTA	2	10	249180	249189	20 %	20 %	20 %	40 %	385335122
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174	NC_017511	CCGAT	2	10	311007	311016	20 %	20 %	20 %	40 %	385335187
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