MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 chromosome

Total Repeats: 1089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017511	TTAT	2	8	28	35	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017511	ATTG	2	8	339	346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017511	TCTG	2	8	1672	1679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017511	GCGG	2	8	1740	1747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017511	CGGG	2	8	2345	2352	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017511	TGCC	2	8	2396	2403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017511	CTGC	2	8	6081	6088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017511	CTTC	2	8	6178	6185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017511	GTTT	2	8	6538	6545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017511	CCAA	2	8	7684	7691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017511	GTTT	2	8	20647	20654	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017511	TCGG	2	8	22333	22340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017511	TGTC	2	8	22502	22509	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017511	GGGA	2	8	22756	22763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017511	TTTG	2	8	24260	24267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017511	TTGT	2	8	24629	24636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017511	CCGT	2	8	29552	29559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017511	AAAG	2	8	29660	29667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017511	TTCT	2	8	33449	33456	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017511	AAAT	2	8	33614	33621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017511	AATT	2	8	33797	33804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017511	ACGC	3	12	34159	34170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017511	CTCC	2	8	34372	34379	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_017511	CTTT	2	8	35577	35584	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017511	CCGC	2	8	37007	37014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_017511	CGCC	2	8	45019	45026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_017511	ATCC	2	8	45152	45159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017511	TGCC	2	8	48654	48661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017511	CCGA	2	8	50007	50014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017511	CCCG	2	8	54941	54948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017511	CGAA	2	8	58987	58994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017511	CCGA	2	8	59175	59182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017511	TGGA	2	8	59193	59200	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017511	GGTT	2	8	59261	59268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017511	GGTT	2	8	59447	59454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017511	CGGG	2	8	59688	59695	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017511	CCCG	2	8	64998	65005	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017511	CGGT	2	8	65021	65028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017511	GGAT	2	8	65441	65448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017511	TGAT	2	8	67670	67677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017511	GAAG	2	8	68024	68031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017511	GGTT	2	8	68774	68781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017511	GGCA	2	8	69752	69759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017511	ACCG	2	8	69831	69838	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017511	ACGG	2	8	70988	70995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017511	CTGT	2	8	71118	71125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017511	ATTT	2	8	71158	71165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017511	GATA	2	8	74888	74895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017511	CGGA	2	8	74939	74946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017511	TTCA	2	8	75932	75939	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017511	CCGG	2	8	84476	84483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017511	GCCC	2	8	84754	84761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_017511	CGGG	2	8	86483	86490	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017511	CCAA	2	8	89703	89710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017511	AAAG	2	8	90254	90261	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017511	TTTA	2	8	95556	95563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017511	GGTT	2	8	98790	98797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017511	TCTG	2	8	99732	99739	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017511	CCGT	2	8	99820	99827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017511	GACG	2	8	109078	109085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017511	TGCC	2	8	110561	110568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017511	CGGG	2	8	114221	114228	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017511	CCTG	2	8	115209	115216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017511	GCAG	2	8	117427	117434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017511	GCGG	2	8	117590	117597	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017511	TTTA	2	8	119328	119335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017511	ACCA	2	8	120862	120869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017511	CTGT	2	8	122691	122698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017511	GCCT	2	8	125341	125348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017511	GCCG	2	8	128093	128100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017511	CAAA	2	8	128395	128402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017511	CGAA	2	8	130745	130752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017511	AATT	2	8	130781	130788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017511	AATG	2	8	133639	133646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017511	CGTC	2	8	135461	135468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017511	CAGC	2	8	136279	136286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017511	GCCC	2	8	142869	142876	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_017511	GGGT	2	8	143838	143845	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017511	CAGG	2	8	144471	144478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017511	GCGG	2	8	144520	144527	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017511	TCTT	2	8	145988	145995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017511	GCCC	2	8	146105	146112	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_017511	TCTG	2	8	147236	147243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017511	TTTA	2	8	149613	149620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017511	TTGT	2	8	149863	149870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017511	GAAA	2	8	150996	151003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017511	AAAG	2	8	153695	153702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017511	AAAT	2	8	155300	155307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017511	TTGA	2	8	157275	157282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017511	TGTT	2	8	158449	158456	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017511	TTAA	2	8	160323	160330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017511	TAAG	2	8	171705	171712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017511	CTTT	2	8	174806	174813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017511	TAAA	2	8	181374	181381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017511	AGGG	2	8	182163	182170	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017511	CAGG	2	8	182541	182548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017511	TAAA	2	8	183530	183537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017511	TTGT	2	8	183762	183769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017511	ATTC	2	8	183903	183910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017511	GTAT	2	8	189314	189321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017511	CAGC	2	8	189348	189355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017511	CGGG	2	8	192286	192293	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017511	AATA	2	8	202031	202038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017511	CAAT	2	8	202547	202554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017511	TCAA	2	8	202668	202675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017511	ATCA	2	8	202794	202801	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017511	TTGA	2	8	202868	202875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017511	ATTG	2	8	202933	202940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017511	TCTG	2	8	202946	202953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017511	CGGG	2	8	216986	216993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017511	GGCA	2	8	218265	218272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017511	CTGC	2	8	218327	218334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017511	GCGG	3	12	218465	218476	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017511	AAAT	2	8	218525	218532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017511	GCAG	2	8	224216	224223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017511	CGGC	2	8	224234	224241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017511	TATT	2	8	224745	224752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017511	TGTA	2	8	224789	224796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017511	TCCG	2	8	228327	228334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017511	AAAG	2	8	230192	230199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017511	TTTG	2	8	230576	230583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017511	TCAA	2	8	230717	230724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017511	CTGA	2	8	236203	236210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017511	CGAA	2	8	236496	236503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017511	GAAT	2	8	236644	236651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017511	ATGG	2	8	239501	239508	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017511	AGAA	2	8	243154	243161	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017511	AGGG	2	8	243568	243575	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017511	CGTT	2	8	248431	248438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017511	AGGC	2	8	250978	250985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017511	TCCG	2	8	251064	251071	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017511	GCAG	2	8	252399	252406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017511	AATT	2	8	254104	254111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017511	GCGG	2	8	254393	254400	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017511	AAAG	2	8	258648	258655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017511	GCCG	2	8	262281	262288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017511	GTTT	2	8	269633	269640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017511	CGGA	2	8	269809	269816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017511	AACA	2	8	269908	269915	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017511	ATGA	2	8	275363	275370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017511	TTGT	2	8	275472	275479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017511	TCGG	2	8	279260	279267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017511	CCGT	2	8	280778	280785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017511	GACA	2	8	280811	280818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017511	TGCC	2	8	281109	281116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017511	AGGA	2	8	284645	284652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017511	CCGC	2	8	296719	296726	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_017511	AAAC	2	8	298330	298337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017511	GATT	2	8	300554	300561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017511	GCAA	2	8	305007	305014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017511	GGTT	2	8	308292	308299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017511	TTTG	2	8	308442	308449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017511	CAGG	2	8	316218	316225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_017511	TTTG	2	8	338521	338528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017511	TGAT	2	8	360039	360046	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_017511	CGGA	2	8	1073917	1073924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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