MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 chromosome

Total Repeats: 27639

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017511	CTG	3	9	523	531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334896
2	NC_017511	GAA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334896
3	NC_017511	TGC	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334896
4	NC_017511	CGG	2	6	681	686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334896
5	NC_017511	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334896
6	NC_017511	TAA	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334896
7	NC_017511	TGA	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334897
8	NC_017511	CGC	2	6	930	935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334897
9	NC_017511	CGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334897
10	NC_017511	CCG	2	6	1001	1006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334897
11	NC_017511	AAT	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334897
12	NC_017511	GCG	2	6	1285	1290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
13	NC_017511	CGG	2	6	1377	1382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
14	NC_017511	GTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334897
15	NC_017511	GCA	2	6	1485	1490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334897
16	NC_017511	GCG	2	6	1505	1510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
17	NC_017511	CGG	2	6	1530	1535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334897
18	NC_017511	GGA	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334897
19	NC_017511	GTT	3	9	1567	1575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334897
20	NC_017511	ATG	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334898
21	NC_017511	TGG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334898
22	NC_017511	CGG	3	9	1945	1953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334898
23	NC_017511	AGG	2	6	1960	1965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334898
24	NC_017511	GGT	2	6	2111	2116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334898
25	NC_017511	TGA	2	6	2252	2257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334898
26	NC_017511	GGC	2	6	2324	2329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334898
27	NC_017511	CAG	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
28	NC_017511	GGA	2	6	2522	2527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334899
29	NC_017511	GAC	2	6	2748	2753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
30	NC_017511	CGG	2	6	2882	2887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334899
31	NC_017511	CGG	2	6	2933	2938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334899
32	NC_017511	TGG	2	6	3037	3042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334899
33	NC_017511	GAC	2	6	3051	3056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334899
34	NC_017511	CGG	2	6	3195	3200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
35	NC_017511	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334900
36	NC_017511	GCG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
37	NC_017511	GGC	2	6	3443	3448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334900
38	NC_017511	CGC	2	6	3780	3785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
39	NC_017511	TTG	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
40	NC_017511	ATG	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
41	NC_017511	GGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
42	NC_017511	TGT	2	6	3938	3943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
43	NC_017511	CGG	2	6	3944	3949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
44	NC_017511	GGC	2	6	3960	3965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
45	NC_017511	GGC	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
46	NC_017511	GCC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
47	NC_017511	TAG	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
48	NC_017511	CTG	2	6	4271	4276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
49	NC_017511	GTT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
50	NC_017511	CGG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
51	NC_017511	TTG	2	6	4369	4374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
52	NC_017511	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
53	NC_017511	TGT	2	6	4541	4546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
54	NC_017511	GCC	2	6	4575	4580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
55	NC_017511	CGG	2	6	4601	4606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
56	NC_017511	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
57	NC_017511	GCC	2	6	4640	4645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
58	NC_017511	GAT	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
59	NC_017511	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
60	NC_017511	TTG	2	6	4762	4767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
61	NC_017511	GGC	2	6	4902	4907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
62	NC_017511	GCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
63	NC_017511	CTG	2	6	5160	5165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
64	NC_017511	GCC	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
65	NC_017511	CGC	2	6	5267	5272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
66	NC_017511	GGC	2	6	5291	5296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
67	NC_017511	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334901
68	NC_017511	GGC	2	6	5496	5501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
69	NC_017511	GGC	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
70	NC_017511	TTG	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334901
71	NC_017511	TGA	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334901
72	NC_017511	CGT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
73	NC_017511	CGG	2	6	5807	5812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
74	NC_017511	GTC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334901
75	NC_017511	GGC	2	6	5901	5906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334901
76	NC_017511	GGC	2	6	6202	6207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334902
77	NC_017511	CAC	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334902
78	NC_017511	AGC	2	6	6243	6248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334902
79	NC_017511	GCC	2	6	6322	6327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334902
80	NC_017511	TGA	2	6	6450	6455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334902
81	NC_017511	GGC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334902
82	NC_017511	ACT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334903
83	NC_017511	CGC	2	6	6588	6593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
84	NC_017511	CCG	2	6	6605	6610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
85	NC_017511	GAT	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334903
86	NC_017511	GGC	2	6	6753	6758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
87	NC_017511	GAT	2	6	6768	6773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334903
88	NC_017511	GGC	2	6	6859	6864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
89	NC_017511	TTG	2	6	6925	6930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334903
90	NC_017511	CGC	2	6	7073	7078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
91	NC_017511	TGG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334903
92	NC_017511	CCG	2	6	7162	7167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
93	NC_017511	GCC	2	6	7237	7242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
94	NC_017511	GGT	2	6	7284	7289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334903
95	NC_017511	CGC	2	6	7329	7334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
96	NC_017511	TTC	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334903
97	NC_017511	GCG	2	6	7438	7443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
98	NC_017511	CGG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
99	NC_017511	GGC	2	6	7479	7484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334903
100	NC_017511	TAT	2	6	7562	7567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334903
101	NC_017511	AAC	2	6	7574	7579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334903
102	NC_017511	CGC	2	6	7592	7597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334903
103	NC_017511	CCG	2	6	7769	7774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334904
104	NC_017511	GCG	3	9	7937	7945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334904
105	NC_017511	GGC	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334904
106	NC_017511	CTG	2	6	8110	8115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334904
107	NC_017511	GCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334904
108	NC_017511	ACG	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334904
109	NC_017511	CGC	2	6	8213	8218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334904
110	NC_017511	CGG	3	9	8273	8281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334904
111	NC_017511	CTG	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334904
112	NC_017511	CGA	2	6	8334	8339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334904
113	NC_017511	ATT	2	6	8367	8372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334904
114	NC_017511	CCG	2	6	8385	8390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334904
115	NC_017511	CCG	3	9	8406	8414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334904
116	NC_017511	GCC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334904
117	NC_017511	GCC	2	6	8564	8569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334904
118	NC_017511	GCA	2	6	8606	8611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334904
119	NC_017511	GGC	2	6	8675	8680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334904
120	NC_017511	CGG	2	6	8878	8883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334905
121	NC_017511	GCC	3	9	8912	8920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334905
122	NC_017511	GCG	2	6	8944	8949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334905
123	NC_017511	GTC	2	6	9002	9007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334905
124	NC_017511	TGG	2	6	9016	9021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334905
125	NC_017511	CGG	2	6	9145	9150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334905
126	NC_017511	CAG	2	6	9152	9157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334905
127	NC_017511	GGC	3	9	9230	9238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334905
128	NC_017511	GCC	2	6	9248	9253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334905
129	NC_017511	TGC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334905
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131	NC_017511	ATC	2	6	9332	9337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334905
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257	NC_017511	CGC	2	6	17084	17089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385334913
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260	NC_017511	CAT	2	6	17181	17186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334913
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