MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 plasmid pNGTCDC08107

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017510	CCAAGC	2	12	2459	2470	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385334851
2	NC_017510	GGGTTT	2	12	2954	2965	0 %	50 %	50 %	0 %	385334851
3	NC_017510	GTATGC	2	12	4081	4092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385334851
4	NC_017510	TGGATG	2	12	5510	5521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385334853
5	NC_017510	GGCAGA	2	12	7113	7124	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017510	CATTAC	2	12	10558	10569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334855
7	NC_017510	CATCAA	2	12	10980	10991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385334856
8	NC_017510	CTGAAA	2	12	12243	12254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334858
9	NC_017510	CGTAGT	2	12	18246	18257	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385334867
10	NC_017510	GAAAGT	2	12	18492	18503	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385334867
11	NC_017510	CGGCCA	2	12	19612	19623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385334869
12	NC_017510	CAATAA	2	12	21409	21420	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334871
13	NC_017510	TTTTCG	2	12	24507	24518	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385334875
14	NC_017510	CGTTGC	2	12	25275	25286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334876
15	NC_017510	GGCCAC	2	12	26092	26103	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385334877
16	NC_017510	ATGAAG	2	12	27982	27993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385334878
17	NC_017510	CAAAAT	2	12	32439	32450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334884
18	NC_017510	AAAGAA	2	12	36584	36595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385334890
19	NC_017510	ATGTAC	2	12	38555	38566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017510	CGATCA	2	12	38933	38944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385334894

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.