MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae TCDC-NG08107 plasmid pNGTCDC08107

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017510	GAGCA	2	10	269	278	40 %	0 %	40 %	20 %	385334850
2	NC_017510	AGTGA	2	10	2336	2345	40 %	20 %	40 %	0 %	385334850
3	NC_017510	TACAT	2	10	4463	4472	40 %	40 %	0 %	20 %	385334852
4	NC_017510	AAACC	2	10	6296	6305	60 %	0 %	0 %	40 %	385334853
5	NC_017510	GAAAC	2	10	10830	10839	60 %	0 %	20 %	20 %	385334856
6	NC_017510	GTTCA	2	10	11955	11964	20 %	40 %	20 %	20 %	385334858
7	NC_017510	AATTT	2	10	12940	12949	40 %	60 %	0 %	0 %	385334860
8	NC_017510	CAAAT	2	10	18986	18995	60 %	20 %	0 %	20 %	385334868
9	NC_017510	TGGTG	2	10	20522	20531	0 %	40 %	60 %	0 %	385334871
10	NC_017510	ACCGC	2	10	23499	23508	20 %	0 %	20 %	60 %	385334874
11	NC_017510	CGTTC	2	10	25906	25915	0 %	40 %	20 %	40 %	385334877
12	NC_017510	TACGG	2	10	26011	26020	20 %	20 %	40 %	20 %	385334877
13	NC_017510	GCATT	2	10	26462	26471	20 %	40 %	20 %	20 %	385334878
14	NC_017510	GTAAC	2	10	28531	28540	40 %	20 %	20 %	20 %	385334878
15	NC_017510	CCTTG	2	10	30541	30550	0 %	40 %	20 %	40 %	385334881
16	NC_017510	TGCCC	2	10	31080	31089	0 %	20 %	20 %	60 %	385334882
17	NC_017510	AAATA	2	10	33816	33825	80 %	20 %	0 %	0 %	385334886
18	NC_017510	AAGAA	2	10	34727	34736	80 %	0 %	20 %	0 %	385334888
19	NC_017510	CTGTT	2	10	35676	35685	0 %	60 %	20 %	20 %	385334889
20	NC_017510	TTCCG	2	10	35977	35986	0 %	40 %	20 %	40 %	385334889
21	NC_017510	CCTTG	2	10	38255	38264	0 %	40 %	20 %	40 %	385334893
22	NC_017510	CTTGG	2	10	38796	38805	0 %	40 %	40 %	20 %	385334894

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.