MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	AAAATA	2	12	1386	1397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334156
2	NC_017509	ATTTTG	2	12	5673	5684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334160
3	NC_017509	TAAAAA	2	12	6221	6232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334161
4	NC_017509	TCATTT	2	12	6261	6272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385334161
5	NC_017509	AATTTA	2	12	6385	6396	50 %	50 %	0 %	0 %	385334161
6	NC_017509	AAGAAA	2	12	6865	6876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385334161
7	NC_017509	TAATTT	2	12	7767	7778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017509	GAAAAT	2	12	11342	11353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385334165
9	NC_017509	AATCAA	2	12	14336	14347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334167
10	NC_017509	ATTAAC	2	12	14826	14837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385334168
11	NC_017509	TAATTT	2	12	15802	15813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334169
12	NC_017509	CAAAAA	2	12	17792	17803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334172
13	NC_017509	TAAATT	2	12	20816	20827	50 %	50 %	0 %	0 %	385334174
14	NC_017509	AATTGA	2	12	21531	21542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334174
15	NC_017509	TAAATT	2	12	22104	22115	50 %	50 %	0 %	0 %	385334174
16	NC_017509	TTTTCA	2	12	24483	24494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017509	TTTTCT	2	12	24915	24926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385334175
18	NC_017509	AACCTG	2	12	25031	25042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385334175
19	NC_017509	TGCATT	2	12	25530	25541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334175
20	NC_017509	TTATTT	2	12	26040	26051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385334176
21	NC_017509	TGGTTT	2	12	27860	27871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334178
22	NC_017509	TTGAAA	2	12	28589	28600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334179
23	NC_017509	ATTAAA	2	12	30780	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334181
24	NC_017509	TGCAAT	2	12	31512	31523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334182
25	NC_017509	ATCAAT	2	12	33776	33787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385334183
26	NC_017509	TTTTTG	2	12	34628	34639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334183
27	NC_017509	TTATTT	2	12	35554	35565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385334183
28	NC_017509	TTAAAA	2	12	36671	36682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334184
29	NC_017509	TGAAGT	2	12	38582	38593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334185
30	NC_017509	ATAAAA	2	12	40446	40457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334188
31	NC_017509	TTTTAA	2	12	42410	42421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334189
32	NC_017509	AATAAA	2	12	45000	45011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334191
33	NC_017509	TTTTGT	2	12	46135	46146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334192
34	NC_017509	AATTTT	2	12	46896	46907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334194
35	NC_017509	GGGAAT	2	12	48168	48179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385334195
36	NC_017509	TGAATT	2	12	48741	48752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334195
37	NC_017509	ATATTG	2	12	50924	50935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334199
38	NC_017509	ATGATT	2	12	51848	51859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334199
39	NC_017509	TATAAA	2	12	52456	52467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334200
40	NC_017509	CAAAAA	2	12	52475	52486	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334200
41	NC_017509	TAATTT	2	12	53043	53054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334201
42	NC_017509	TAATTT	2	12	53537	53548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334202
43	NC_017509	AAAATT	2	12	53569	53580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017509	ATGTTT	2	12	53665	53676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334203
45	NC_017509	GGTATT	2	12	59007	59018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385334209
46	NC_017509	TAAAAA	2	12	60597	60608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017509	AGCAAC	2	12	61009	61020	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334211
48	NC_017509	GTCGAA	2	12	62805	62816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385334212
49	NC_017509	AATTTT	2	12	63796	63807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334213
50	NC_017509	TGTTTT	2	12	63985	63996	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334213
51	NC_017509	GAACAA	2	12	71495	71506	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385334219
52	NC_017509	TTAATT	2	12	72672	72683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334219
53	NC_017509	GAAAAA	2	12	72734	72745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385334219
54	NC_017509	TAAAAT	2	12	73311	73322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334219
55	NC_017509	AACAAA	2	12	74818	74829	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334219
56	NC_017509	AATCAC	2	12	75570	75581	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385334219
57	NC_017509	CTAATT	2	12	80092	80103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385334222
58	NC_017509	TTGAAC	2	12	81832	81843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334224
59	NC_017509	AATTAA	2	12	82693	82704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334224
60	NC_017509	ATCTGA	2	12	82769	82780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334224
61	NC_017509	TGGTTT	2	12	83354	83365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334225
62	NC_017509	CAAAAT	2	12	84463	84474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334226
63	NC_017509	AACTAA	2	12	86318	86329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334228
64	NC_017509	TTGGTT	2	12	87786	87797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334230
65	NC_017509	GCCCAC	2	12	90504	90515	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385334232
66	NC_017509	TGCAAG	2	12	91366	91377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385334232
67	NC_017509	GGAATT	2	12	91412	91423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334232
68	NC_017509	CAAAAA	2	12	93223	93234	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334235
69	NC_017509	TTTTGC	2	12	94917	94928	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385334238
70	NC_017509	CATATG	2	12	94967	94978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334238
71	NC_017509	TTGGTT	2	12	95234	95245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334238
72	NC_017509	TTAGGA	2	12	95479	95490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334238
73	NC_017509	TTCAGG	2	12	97895	97906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385334240
74	NC_017509	AATTTT	2	12	98294	98305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334240
75	NC_017509	ATTTTA	2	12	98487	98498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334240
76	NC_017509	TAGTAA	2	12	104944	104955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334244
77	NC_017509	AATTTA	2	12	105877	105888	50 %	50 %	0 %	0 %	385334245
78	NC_017509	TTTTAA	2	12	109481	109492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017509	CAAGAA	2	12	109938	109949	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385334247
80	NC_017509	AAAGAT	2	12	109950	109961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385334247
81	NC_017509	TAAATT	2	12	111134	111145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017509	TCCAGA	2	12	112247	112258	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385334249
83	NC_017509	ATTTTT	2	12	114558	114569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385334250
84	NC_017509	ACAAAA	2	12	115237	115248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334250
85	NC_017509	AATTTT	2	12	115626	115637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334250
86	NC_017509	TCATAA	2	12	116764	116775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017509	ATTTTT	3	18	117273	117290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017509	TAATTT	2	12	119800	119811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017509	ACCAGA	2	12	125429	125440	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334257
90	NC_017509	AGTTCA	2	12	129601	129612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334259
91	NC_017509	ATAATT	2	12	129775	129786	50 %	50 %	0 %	0 %	385334259
92	NC_017509	TATAAT	2	12	132847	132858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017509	CTTGAT	2	12	134157	134168	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017509	TGACTT	2	12	134519	134530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017509	AGTATT	3	18	136858	136875	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334262
96	NC_017509	CTTCAA	2	12	137946	137957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334262
97	NC_017509	GCTTGC	2	12	138244	138255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334262
98	NC_017509	AATCAG	2	12	139290	139301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334262
99	NC_017509	ATTTTT	2	12	140753	140764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	AATTAA	2	12	140917	140928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334264
101	NC_017509	CAAAGC	2	12	141442	141453	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334265
102	NC_017509	GGTGGA	2	12	141624	141635	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385334265
103	NC_017509	GTTGAA	2	12	146487	146498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334274
104	NC_017509	ATGGAA	2	12	147747	147758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385334277
105	NC_017509	TAAAAA	2	12	152483	152494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334285
106	NC_017509	TGAATA	2	12	156491	156502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017509	TAGCTT	2	12	162248	162259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334299
108	NC_017509	TCCAAT	2	12	163193	163204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334300
109	NC_017509	AGAACT	2	12	164213	164224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334301
110	NC_017509	CAAATA	2	12	168397	168408	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017509	ATTTTG	2	12	169101	169112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334306
112	NC_017509	TAAAAA	2	12	169653	169664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334307
113	NC_017509	ATTAAA	2	12	170363	170374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334308
114	NC_017509	AATTTT	2	12	172517	172528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017509	TAAAGT	2	12	173416	173427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334311
116	NC_017509	GTTTTT	2	12	173491	173502	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334311
117	NC_017509	TATAAT	2	12	174000	174011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017509	TCAATT	2	12	174870	174881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385334312
119	NC_017509	TTTCAA	2	12	175876	175887	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385334313
120	NC_017509	AAAATA	2	12	176571	176582	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334314
121	NC_017509	CAAAAA	2	12	178534	178545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334317
122	NC_017509	GTTTTT	2	12	180223	180234	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334319
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240	NC_017509	ATACAA	2	12	319693	319704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
241	NC_017509	TTGCAA	2	12	320269	320280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334425
242	NC_017509	AATTTT	2	12	323611	323622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334428
243	NC_017509	TTATAA	2	12	325036	325047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_017509	AAAATC	2	12	326559	326570	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334431
245	NC_017509	GACTTT	2	12	327426	327437	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334432
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250	NC_017509	AACTTC	2	12	340168	340179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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353	NC_017509	CGTTGC	2	12	485178	485189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334551
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355	NC_017509	TTAAAT	2	12	485939	485950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
356	NC_017509	TTATGA	2	12	487506	487517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334554
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