MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	TAATTT	2	12	7767	7778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017509	TTTTCA	2	12	24483	24494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017509	AAAATT	2	12	53569	53580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017509	TAAAAA	2	12	60597	60608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017509	TTTTAA	2	12	109481	109492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017509	TAAATT	2	12	111134	111145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017509	TCATAA	2	12	116764	116775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017509	ATTTTT	3	18	117273	117290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017509	TAATTT	2	12	119800	119811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017509	TATAAT	2	12	132847	132858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017509	CTTGAT	2	12	134157	134168	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017509	TGACTT	2	12	134519	134530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017509	ATTTTT	2	12	140753	140764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017509	TGAATA	2	12	156491	156502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017509	CAAATA	2	12	168397	168408	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017509	AATTTT	2	12	172517	172528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017509	TATAAT	2	12	174000	174011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017509	AAAATT	2	12	196315	196326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017509	ATTATA	2	12	199625	199636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017509	GTTTTT	2	12	199776	199787	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017509	ATTATA	2	12	201993	202004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017509	ATTTTC	3	18	208515	208532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017509	TTTAAA	2	12	210344	210355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017509	CATATT	2	12	214332	214343	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017509	AAATTA	2	12	224458	224469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017509	TTTAAT	2	12	238024	238035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017509	TAAAAA	2	12	239347	239358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017509	ATTTTT	2	12	239377	239388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017509	TAAATA	2	12	239665	239676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017509	AATAAA	2	12	254077	254088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017509	CAAAAA	2	12	262515	262526	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017509	TGATAA	2	12	273503	273514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017509	TAAAAA	2	12	276767	276778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017509	AAATAA	2	12	282346	282357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017509	TTTATA	2	12	282359	282370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017509	TTTTAA	2	12	300424	300435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017509	CATATT	2	12	309484	309495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017509	TTAAGT	2	12	319363	319374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017509	ATACAA	2	12	319693	319704	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017509	TTATAA	2	12	325036	325047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017509	TTATAA	2	12	339456	339467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017509	AACTTC	2	12	340168	340179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017509	TATTTT	2	12	343733	343744	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017509	TTTATT	2	12	347163	347174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017509	ATGAAA	2	12	350234	350245	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017509	AATTTT	2	12	361411	361422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017509	AATTTA	2	12	368866	368877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017509	GAATTA	2	12	369725	369736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017509	CATATT	2	12	380614	380625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017509	CATATT	2	12	417587	417598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017509	TTATAA	2	12	432035	432046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017509	TCAAGA	2	12	435916	435927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017509	TATAAA	2	12	441401	441412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017509	TTAATT	2	12	447433	447444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017509	AAATTT	2	12	449231	449242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017509	TATAAT	2	12	453201	453212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017509	TCTTGA	2	12	459483	459494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017509	TTTTTC	2	12	460585	460596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017509	CATATT	2	12	483822	483833	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017509	AAATTT	2	12	483877	483888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017509	TTAAAT	2	12	485939	485950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017509	ATTTTT	2	12	494576	494587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017509	TTAAAT	2	12	494784	494795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017509	TGAATA	2	12	501811	501822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017509	TTTTTA	2	12	511602	511613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017509	AATATT	2	12	514719	514730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017509	TGAATA	2	12	521954	521965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017509	TTTTAA	2	12	523931	523942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017509	TTATTT	2	12	523944	523955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017509	TTATAT	2	12	534592	534603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017509	CAAATT	2	12	537418	537429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017509	GTTTTT	2	12	556348	556359	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017509	TGTTTT	2	12	557124	557135	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017509	GTTTTT	2	12	557244	557255	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017509	GATTTT	2	12	557730	557741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017509	CAAAAA	2	12	559668	559679	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017509	TTAACT	2	12	572897	572908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017509	TCTATA	2	12	574336	574347	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017509	GACAAA	2	12	576039	576050	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017509	ATTTTA	2	12	577493	577504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017509	ATTTTA	2	12	578092	578103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017509	TTTAAT	2	12	578484	578495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017509	CTTGCC	2	12	579320	579331	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017509	TGTATT	2	12	580689	580700	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017509	TCTTTT	2	12	581131	581142	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017509	AATCTT	2	12	581331	581342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017509	AAAGAA	2	12	582125	582136	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017509	CAAAAC	2	12	601398	601409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017509	ATTTTT	2	12	602201	602212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017509	AAATAA	2	12	637113	637124	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017509	TTTAAA	2	12	638550	638561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017509	TGAATT	2	12	642465	642476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017509	TTTATA	2	12	665599	665610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017509	TAAAAA	2	12	665925	665936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017509	ATTTTT	2	12	666297	666308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017509	AGTTTT	2	12	666318	666329	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017509	GTTTTT	2	12	669403	669414	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017509	CATATT	2	12	694414	694425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017509	ATTTTT	2	12	700239	700250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	ATATTT	2	12	701088	701099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017509	CATATT	2	12	745541	745552	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017509	TTTTTA	2	12	748015	748026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017509	TTAAAA	2	12	753115	753126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017509	AAATAA	2	12	765591	765602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017509	TCGACT	2	12	782251	782262	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017509	TTTAAT	2	12	783281	783292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017509	TTTAGG	2	12	795760	795771	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017509	GAAAAA	2	12	796941	796952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017509	AAACTA	2	12	819216	819227	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017509	TATAAT	2	12	821162	821173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017509	ATTTAT	2	12	821315	821326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017509	ATTACA	2	12	828058	828069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017509	ATTTTT	2	12	841780	841791	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017509	TATAAT	2	12	841804	841815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017509	TTATAA	2	12	843320	843331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017509	TTAAAA	2	12	853946	853957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017509	TTATAA	2	12	863899	863910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017509	TGAATA	2	12	871964	871975	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017509	ATTTTA	2	12	873923	873934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017509	ATTTAA	2	12	892181	892192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017509	CATATT	2	12	905320	905331	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017509	TATTAG	2	12	905682	905693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017509	AGAATA	2	12	908951	908962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.