MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	AAAATA	2	12	1386	1397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334156
2	NC_017509	ATTTTG	2	12	5673	5684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334160
3	NC_017509	TAAAAA	2	12	6221	6232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334161
4	NC_017509	TCATTT	2	12	6261	6272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385334161
5	NC_017509	AATTTA	2	12	6385	6396	50 %	50 %	0 %	0 %	385334161
6	NC_017509	AAGAAA	2	12	6865	6876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385334161
7	NC_017509	GAAAAT	2	12	11342	11353	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385334165
8	NC_017509	AATCAA	2	12	14336	14347	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334167
9	NC_017509	ATTAAC	2	12	14826	14837	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385334168
10	NC_017509	TAATTT	2	12	15802	15813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334169
11	NC_017509	CAAAAA	2	12	17792	17803	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334172
12	NC_017509	TAAATT	2	12	20816	20827	50 %	50 %	0 %	0 %	385334174
13	NC_017509	AATTGA	2	12	21531	21542	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334174
14	NC_017509	TAAATT	2	12	22104	22115	50 %	50 %	0 %	0 %	385334174
15	NC_017509	TTTTCT	2	12	24915	24926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385334175
16	NC_017509	AACCTG	2	12	25031	25042	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385334175
17	NC_017509	TGCATT	2	12	25530	25541	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334175
18	NC_017509	TTATTT	2	12	26040	26051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385334176
19	NC_017509	TGGTTT	2	12	27860	27871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334178
20	NC_017509	TTGAAA	2	12	28589	28600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334179
21	NC_017509	ATTAAA	2	12	30780	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334181
22	NC_017509	TGCAAT	2	12	31512	31523	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334182
23	NC_017509	ATCAAT	2	12	33776	33787	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385334183
24	NC_017509	TTTTTG	2	12	34628	34639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334183
25	NC_017509	TTATTT	2	12	35554	35565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385334183
26	NC_017509	TTAAAA	2	12	36671	36682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334184
27	NC_017509	TGAAGT	2	12	38582	38593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334185
28	NC_017509	ATAAAA	2	12	40446	40457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334188
29	NC_017509	TTTTAA	2	12	42410	42421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334189
30	NC_017509	AATAAA	2	12	45000	45011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334191
31	NC_017509	TTTTGT	2	12	46135	46146	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334192
32	NC_017509	AATTTT	2	12	46896	46907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334194
33	NC_017509	GGGAAT	2	12	48168	48179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385334195
34	NC_017509	TGAATT	2	12	48741	48752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334195
35	NC_017509	ATATTG	2	12	50924	50935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334199
36	NC_017509	ATGATT	2	12	51848	51859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334199
37	NC_017509	TATAAA	2	12	52456	52467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334200
38	NC_017509	CAAAAA	2	12	52475	52486	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334200
39	NC_017509	TAATTT	2	12	53043	53054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334201
40	NC_017509	TAATTT	2	12	53537	53548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334202
41	NC_017509	ATGTTT	2	12	53665	53676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334203
42	NC_017509	GGTATT	2	12	59007	59018	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385334209
43	NC_017509	AGCAAC	2	12	61009	61020	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334211
44	NC_017509	GTCGAA	2	12	62805	62816	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385334212
45	NC_017509	AATTTT	2	12	63796	63807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334213
46	NC_017509	TGTTTT	2	12	63985	63996	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334213
47	NC_017509	GAACAA	2	12	71495	71506	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385334219
48	NC_017509	TTAATT	2	12	72672	72683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334219
49	NC_017509	GAAAAA	2	12	72734	72745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385334219
50	NC_017509	TAAAAT	2	12	73311	73322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334219
51	NC_017509	AACAAA	2	12	74818	74829	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334219
52	NC_017509	AATCAC	2	12	75570	75581	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385334219
53	NC_017509	CTAATT	2	12	80092	80103	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385334222
54	NC_017509	TTGAAC	2	12	81832	81843	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334224
55	NC_017509	AATTAA	2	12	82693	82704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334224
56	NC_017509	ATCTGA	2	12	82769	82780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334224
57	NC_017509	TGGTTT	2	12	83354	83365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334225
58	NC_017509	CAAAAT	2	12	84463	84474	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334226
59	NC_017509	AACTAA	2	12	86318	86329	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334228
60	NC_017509	TTGGTT	2	12	87786	87797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334230
61	NC_017509	GCCCAC	2	12	90504	90515	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385334232
62	NC_017509	TGCAAG	2	12	91366	91377	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385334232
63	NC_017509	GGAATT	2	12	91412	91423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334232
64	NC_017509	CAAAAA	2	12	93223	93234	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334235
65	NC_017509	TTTTGC	2	12	94917	94928	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385334238
66	NC_017509	CATATG	2	12	94967	94978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334238
67	NC_017509	TTGGTT	2	12	95234	95245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334238
68	NC_017509	TTAGGA	2	12	95479	95490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334238
69	NC_017509	TTCAGG	2	12	97895	97906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385334240
70	NC_017509	AATTTT	2	12	98294	98305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334240
71	NC_017509	ATTTTA	2	12	98487	98498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334240
72	NC_017509	TAGTAA	2	12	104944	104955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334244
73	NC_017509	AATTTA	2	12	105877	105888	50 %	50 %	0 %	0 %	385334245
74	NC_017509	CAAGAA	2	12	109938	109949	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385334247
75	NC_017509	AAAGAT	2	12	109950	109961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385334247
76	NC_017509	TCCAGA	2	12	112247	112258	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385334249
77	NC_017509	ATTTTT	2	12	114558	114569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385334250
78	NC_017509	ACAAAA	2	12	115237	115248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334250
79	NC_017509	AATTTT	2	12	115626	115637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334250
80	NC_017509	ACCAGA	2	12	125429	125440	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334257
81	NC_017509	AGTTCA	2	12	129601	129612	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334259
82	NC_017509	ATAATT	2	12	129775	129786	50 %	50 %	0 %	0 %	385334259
83	NC_017509	AGTATT	3	18	136858	136875	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385334262
84	NC_017509	CTTCAA	2	12	137946	137957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334262
85	NC_017509	GCTTGC	2	12	138244	138255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334262
86	NC_017509	AATCAG	2	12	139290	139301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334262
87	NC_017509	AATTAA	2	12	140917	140928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334264
88	NC_017509	CAAAGC	2	12	141442	141453	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334265
89	NC_017509	GGTGGA	2	12	141624	141635	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385334265
90	NC_017509	GTTGAA	2	12	146487	146498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334274
91	NC_017509	ATGGAA	2	12	147747	147758	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385334277
92	NC_017509	TAAAAA	2	12	152483	152494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334285
93	NC_017509	TAGCTT	2	12	162248	162259	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334299
94	NC_017509	TCCAAT	2	12	163193	163204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334300
95	NC_017509	AGAACT	2	12	164213	164224	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334301
96	NC_017509	ATTTTG	2	12	169101	169112	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334306
97	NC_017509	TAAAAA	2	12	169653	169664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334307
98	NC_017509	ATTAAA	2	12	170363	170374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334308
99	NC_017509	TAAAGT	2	12	173416	173427	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385334311
100	NC_017509	GTTTTT	2	12	173491	173502	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334311
101	NC_017509	TCAATT	2	12	174870	174881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385334312
102	NC_017509	TTTCAA	2	12	175876	175887	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385334313
103	NC_017509	AAAATA	2	12	176571	176582	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385334314
104	NC_017509	CAAAAA	2	12	178534	178545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334317
105	NC_017509	GTTTTT	2	12	180223	180234	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334319
106	NC_017509	ACTTTT	2	12	182053	182064	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385334321
107	NC_017509	TTTTCT	2	12	182562	182573	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385334322
108	NC_017509	TCAAGA	2	12	183204	183215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334322
109	NC_017509	TTTGTT	2	12	183672	183683	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334322
110	NC_017509	AGTCAA	2	12	184108	184119	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385334322
111	NC_017509	TATAAT	2	12	185396	185407	50 %	50 %	0 %	0 %	385334322
112	NC_017509	TTTTTC	2	12	185855	185866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385334323
113	NC_017509	TCAAAA	2	12	186597	186608	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385334323
114	NC_017509	AAAACA	2	12	187300	187311	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334324
115	NC_017509	TTTTAG	2	12	190535	190546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385334326
116	NC_017509	TAAATT	2	12	194382	194393	50 %	50 %	0 %	0 %	385334332
117	NC_017509	CAAAAA	2	12	194883	194894	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385334333
118	NC_017509	CAGATT	2	12	195037	195048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334333
119	NC_017509	GATCTT	2	12	199341	199352	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334339
120	NC_017509	AAGAAA	2	12	200904	200915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385334340
121	NC_017509	GATCTT	2	12	201709	201720	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385334341
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