MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	CTTTT	2	10	635	644	0 %	80 %	0 %	20 %	385334156
2	NC_017509	ATTAA	2	10	817	826	60 %	40 %	0 %	0 %	385334156
3	NC_017509	ATTCG	2	10	944	953	20 %	40 %	20 %	20 %	385334156
4	NC_017509	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017509	AATTA	2	10	1911	1920	60 %	40 %	0 %	0 %	385334157
6	NC_017509	TTCGA	2	10	2498	2507	20 %	40 %	20 %	20 %	385334157
7	NC_017509	TATAA	2	10	3458	3467	60 %	40 %	0 %	0 %	385334158
8	NC_017509	TTGAA	2	10	3840	3849	40 %	40 %	20 %	0 %	385334158
9	NC_017509	CAAAG	2	10	4186	4195	60 %	0 %	20 %	20 %	385334158
10	NC_017509	GAAAA	2	10	5110	5119	80 %	0 %	20 %	0 %	385334160
11	NC_017509	AAATT	2	10	5687	5696	60 %	40 %	0 %	0 %	385334160
12	NC_017509	AGAAC	2	10	5711	5720	60 %	0 %	20 %	20 %	385334160
13	NC_017509	CAGAC	2	10	6158	6167	40 %	0 %	20 %	40 %	385334161
14	NC_017509	AATTT	2	10	6201	6210	40 %	60 %	0 %	0 %	385334161
15	NC_017509	GTTGA	2	10	6454	6463	20 %	40 %	40 %	0 %	385334161
16	NC_017509	CAATA	2	10	7401	7410	60 %	20 %	0 %	20 %	385334162
17	NC_017509	TTGTT	2	10	7559	7568	0 %	80 %	20 %	0 %	385334162
18	NC_017509	AATAA	2	10	8888	8897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017509	ATTTT	2	10	10911	10920	20 %	80 %	0 %	0 %	385334164
20	NC_017509	CTTAA	2	10	11177	11186	40 %	40 %	0 %	20 %	385334165
21	NC_017509	CAAGA	2	10	11598	11607	60 %	0 %	20 %	20 %	385334165
22	NC_017509	AAGAT	2	10	12368	12377	60 %	20 %	20 %	0 %	385334166
23	NC_017509	TTATT	2	10	14011	14020	20 %	80 %	0 %	0 %	385334167
24	NC_017509	AGATC	2	10	14667	14676	40 %	20 %	20 %	20 %	385334168
25	NC_017509	AAAAG	2	10	15788	15797	80 %	0 %	20 %	0 %	385334169
26	NC_017509	TTGAG	2	10	19022	19031	20 %	40 %	40 %	0 %	385334172
27	NC_017509	AATTA	2	10	19740	19749	60 %	40 %	0 %	0 %	385334172
28	NC_017509	TTATT	2	10	19793	19802	20 %	80 %	0 %	0 %	385334172
29	NC_017509	ATTTG	2	10	20013	20022	20 %	60 %	20 %	0 %	385334173
30	NC_017509	TTGTT	2	10	21887	21896	0 %	80 %	20 %	0 %	385334174
31	NC_017509	TAAAA	2	10	21972	21981	80 %	20 %	0 %	0 %	385334174
32	NC_017509	AATTA	2	10	22281	22290	60 %	40 %	0 %	0 %	385334174
33	NC_017509	AATTA	2	10	23786	23795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017509	ATATT	2	10	23958	23967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017509	GTTTT	2	10	24309	24318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017509	TAAAA	2	10	24392	24401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017509	AATTA	2	10	24701	24710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017509	TTATT	2	10	24754	24763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017509	TATTT	2	10	25156	25165	20 %	80 %	0 %	0 %	385334175
40	NC_017509	ACAAA	2	10	27274	27283	80 %	0 %	0 %	20 %	385334178
41	NC_017509	CGATT	2	10	27359	27368	20 %	40 %	20 %	20 %	385334178
42	NC_017509	TTTAA	2	10	29416	29425	40 %	60 %	0 %	0 %	385334179
43	NC_017509	TTTTG	2	10	31064	31073	0 %	80 %	20 %	0 %	385334181
44	NC_017509	AATCA	2	10	32168	32177	60 %	20 %	0 %	20 %	385334182
45	NC_017509	AAATT	2	10	35184	35193	60 %	40 %	0 %	0 %	385334183
46	NC_017509	ATCGC	2	10	35917	35926	20 %	20 %	20 %	40 %	385334183
47	NC_017509	CTTTT	2	10	37002	37011	0 %	80 %	0 %	20 %	385334184
48	NC_017509	TAAAT	2	10	38243	38252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017509	CCTTG	2	10	38671	38680	0 %	40 %	20 %	40 %	385334185
50	NC_017509	AAATC	2	10	39168	39177	60 %	20 %	0 %	20 %	385334185
51	NC_017509	ATGAT	2	10	39353	39362	40 %	40 %	20 %	0 %	385334185
52	NC_017509	AGTTC	2	10	39617	39626	20 %	40 %	20 %	20 %	385334186
53	NC_017509	AATTC	2	10	39653	39662	40 %	40 %	0 %	20 %	385334186
54	NC_017509	TAAAT	2	10	40528	40537	60 %	40 %	0 %	0 %	385334188
55	NC_017509	TTCAG	2	10	40607	40616	20 %	40 %	20 %	20 %	385334188
56	NC_017509	CCAAA	2	10	42085	42094	60 %	0 %	0 %	40 %	385334189
57	NC_017509	TGGAT	2	10	43431	43440	20 %	40 %	40 %	0 %	385334189
58	NC_017509	TTAGA	2	10	44537	44546	40 %	40 %	20 %	0 %	385334191
59	NC_017509	ATTCA	2	10	45397	45406	40 %	40 %	0 %	20 %	385334191
60	NC_017509	TTTTA	2	10	46742	46751	20 %	80 %	0 %	0 %	385334193
61	NC_017509	TTATT	2	10	47285	47294	20 %	80 %	0 %	0 %	385334194
62	NC_017509	AAACA	2	10	47425	47434	80 %	0 %	0 %	20 %	385334194
63	NC_017509	TTTCA	2	10	47878	47887	20 %	60 %	0 %	20 %	385334195
64	NC_017509	CAAAA	2	10	48431	48440	80 %	0 %	0 %	20 %	385334195
65	NC_017509	GTTTG	2	10	48468	48477	0 %	60 %	40 %	0 %	385334195
66	NC_017509	TTACC	2	10	50280	50289	20 %	40 %	0 %	40 %	385334197
67	NC_017509	AATTT	2	10	52957	52966	40 %	60 %	0 %	0 %	385334201
68	NC_017509	TAATT	2	10	56687	56696	40 %	60 %	0 %	0 %	385334206
69	NC_017509	TGAAA	2	10	57751	57760	60 %	20 %	20 %	0 %	385334207
70	NC_017509	AAAAC	2	10	58641	58650	80 %	0 %	0 %	20 %	385334208
71	NC_017509	TAATT	2	10	59515	59524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017509	CAAAA	2	10	59745	59754	80 %	0 %	0 %	20 %	385334210
73	NC_017509	CAAAA	2	10	60138	60147	80 %	0 %	0 %	20 %	385334210
74	NC_017509	AAAAT	2	10	63239	63248	80 %	20 %	0 %	0 %	385334213
75	NC_017509	GAAAT	2	10	63566	63575	60 %	20 %	20 %	0 %	385334213
76	NC_017509	GGGTG	2	10	63808	63817	0 %	20 %	80 %	0 %	385334213
77	NC_017509	TGATA	2	10	67365	67374	40 %	40 %	20 %	0 %	385334215
78	NC_017509	TTATA	2	10	69209	69218	40 %	60 %	0 %	0 %	385334217
79	NC_017509	CATGT	2	10	69523	69532	20 %	40 %	20 %	20 %	385334217
80	NC_017509	CATTT	2	10	70577	70586	20 %	60 %	0 %	20 %	385334218
81	NC_017509	ACTCA	2	10	72111	72120	40 %	20 %	0 %	40 %	385334219
82	NC_017509	ATTTT	2	10	72156	72165	20 %	80 %	0 %	0 %	385334219
83	NC_017509	GAAAA	2	10	73505	73514	80 %	0 %	20 %	0 %	385334219
84	NC_017509	AATTA	2	10	75376	75385	60 %	40 %	0 %	0 %	385334219
85	NC_017509	ACAAA	2	10	75760	75769	80 %	0 %	0 %	20 %	385334219
86	NC_017509	TTGTT	2	10	75863	75872	0 %	80 %	20 %	0 %	385334220
87	NC_017509	ATTTT	2	10	76894	76903	20 %	80 %	0 %	0 %	385334221
88	NC_017509	AATTT	2	10	76958	76967	40 %	60 %	0 %	0 %	385334221
89	NC_017509	TTTAT	2	10	77581	77590	20 %	80 %	0 %	0 %	385334221
90	NC_017509	AATAT	2	10	78678	78687	60 %	40 %	0 %	0 %	385334221
91	NC_017509	AAATT	2	10	78802	78811	60 %	40 %	0 %	0 %	385334221
92	NC_017509	AATTA	2	10	79085	79094	60 %	40 %	0 %	0 %	385334222
93	NC_017509	AAATC	2	10	79120	79129	60 %	20 %	0 %	20 %	385334222
94	NC_017509	TAAAA	2	10	80569	80578	80 %	20 %	0 %	0 %	385334223
95	NC_017509	ACTTG	2	10	80708	80717	20 %	40 %	20 %	20 %	385334223
96	NC_017509	TCAAA	2	10	81765	81774	60 %	20 %	0 %	20 %	385334224
97	NC_017509	CAAAA	2	10	82621	82630	80 %	0 %	0 %	20 %	385334224
98	NC_017509	GATTT	2	10	83317	83326	20 %	60 %	20 %	0 %	385334225
99	NC_017509	CAAAA	2	10	83613	83622	80 %	0 %	0 %	20 %	385334225
100	NC_017509	AAAAC	2	10	84696	84705	80 %	0 %	0 %	20 %	385334226
101	NC_017509	GCTTT	2	10	87074	87083	0 %	60 %	20 %	20 %	385334230
102	NC_017509	GGATT	2	10	87801	87810	20 %	40 %	40 %	0 %	385334230
103	NC_017509	TTTTA	2	10	87991	88000	20 %	80 %	0 %	0 %	385334230
104	NC_017509	TATTT	2	10	89114	89123	20 %	80 %	0 %	0 %	385334231
105	NC_017509	AATTA	2	10	89726	89735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017509	TTTTC	2	10	89916	89925	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017509	TTGAT	2	10	90399	90408	20 %	60 %	20 %	0 %	385334232
108	NC_017509	TAACT	2	10	92134	92143	40 %	40 %	0 %	20 %	385334233
109	NC_017509	TTTAT	2	10	92972	92981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017509	CTTTT	2	10	93166	93175	0 %	80 %	0 %	20 %	385334235
111	NC_017509	TAATT	2	10	93293	93302	40 %	60 %	0 %	0 %	385334235
112	NC_017509	TTAAT	2	10	93424	93433	40 %	60 %	0 %	0 %	385334235
113	NC_017509	AAATA	2	10	93608	93617	80 %	20 %	0 %	0 %	385334236
114	NC_017509	CAAAA	2	10	93725	93734	80 %	0 %	0 %	20 %	385334236
115	NC_017509	CAAAA	2	10	93888	93897	80 %	0 %	0 %	20 %	385334236
116	NC_017509	TATAT	2	10	94096	94105	40 %	60 %	0 %	0 %	385334237
117	NC_017509	TTTAA	2	10	94490	94499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017509	TTATT	2	10	95454	95463	20 %	80 %	0 %	0 %	385334238
119	NC_017509	ATATT	2	10	95468	95477	40 %	60 %	0 %	0 %	385334238
120	NC_017509	AGTTT	2	10	95743	95752	20 %	60 %	20 %	0 %	385334238
121	NC_017509	TTTTA	2	10	96155	96164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017509	TAAAA	2	10	96200	96209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017509	TAAAA	2	10	98980	98989	80 %	20 %	0 %	0 %	385334240
124	NC_017509	TATAA	2	10	99890	99899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017509	AATTA	2	10	100054	100063	60 %	40 %	0 %	0 %	385334242
126	NC_017509	AAAAT	2	10	100106	100115	80 %	20 %	0 %	0 %	385334242
127	NC_017509	TAAAT	2	10	101711	101720	60 %	40 %	0 %	0 %	385334243
128	NC_017509	ATTTA	2	10	102748	102757	40 %	60 %	0 %	0 %	385334243
129	NC_017509	TTTAA	2	10	103701	103710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017509	AATTT	2	10	104286	104295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017509	TTTTA	2	10	104861	104870	20 %	80 %	0 %	0 %	385334244
132	NC_017509	CAAAA	2	10	104926	104935	80 %	0 %	0 %	20 %	385334244
133	NC_017509	TAAAA	2	10	104990	104999	80 %	20 %	0 %	0 %	385334244
134	NC_017509	TAAAA	2	10	105095	105104	80 %	20 %	0 %	0 %	385334244
135	NC_017509	TATAA	2	10	106780	106789	60 %	40 %	0 %	0 %	385334245
136	NC_017509	CTTTT	2	10	107989	107998	0 %	80 %	0 %	20 %	385334246
137	NC_017509	TTTTA	2	10	111336	111345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017509	AATTA	2	10	111569	111578	60 %	40 %	0 %	0 %	385334249
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140	NC_017509	GTTTT	2	10	113734	113743	0 %	80 %	20 %	0 %	385334249
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402	NC_017509	TTTAA	2	10	354919	354928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_017509	CGAAT	2	10	355425	355434	40 %	20 %	20 %	20 %	385334455
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