MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	ATATA	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017509	AATAA	2	10	8888	8897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017509	AATTA	2	10	23786	23795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017509	ATATT	2	10	23958	23967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017509	GTTTT	2	10	24309	24318	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017509	TAAAA	2	10	24392	24401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017509	AATTA	2	10	24701	24710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017509	TTATT	2	10	24754	24763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017509	TAAAT	2	10	38243	38252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017509	TAATT	2	10	59515	59524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017509	AATTA	2	10	89726	89735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017509	TTTTC	2	10	89916	89925	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017509	TTTAT	2	10	92972	92981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017509	TTTAA	2	10	94490	94499	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017509	TTTTA	2	10	96155	96164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017509	TAAAA	2	10	96200	96209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017509	TATAA	2	10	99890	99899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017509	TTTAA	2	10	103701	103710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017509	AATTT	2	10	104286	104295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017509	TTTTA	2	10	111336	111345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017509	ATAAA	2	10	117296	117305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017509	AGGTA	2	10	119862	119871	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017509	TAAAA	2	10	120900	120909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017509	TTTAA	2	10	131540	131549	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017509	GATTT	2	10	132376	132385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017509	ATTTA	2	10	132788	132797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017509	ATATA	2	10	139541	139550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017509	TATAA	2	10	140567	140576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017509	CAACT	2	10	140885	140894	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017509	AAAGA	2	10	143083	143092	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017509	AATTT	2	10	152101	152110	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017509	TTTTA	2	10	156325	156334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017509	TTTTA	2	10	168151	168160	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017509	TTTAT	2	10	168214	168223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017509	ATTTT	2	10	168497	168506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017509	AATTA	2	10	168546	168555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017509	AAATT	2	10	168568	168577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017509	AATTT	2	10	173942	173951	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017509	TATAA	2	10	174117	174126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017509	GTTTT	2	10	182525	182534	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017509	ATTTT	2	10	185599	185608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017509	TAAAA	2	10	189852	189861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017509	TATAA	2	10	196206	196215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017509	AAATT	2	10	197670	197679	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017509	TTTAA	2	10	202202	202211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017509	TTTAA	2	10	202219	202228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017509	AATTT	2	10	208408	208417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017509	TATTT	2	10	208955	208964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017509	ATTTA	2	10	214484	214493	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017509	TATTT	2	10	230440	230449	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017509	AGATA	2	10	253958	253967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017509	TAAAA	2	10	262487	262496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017509	ATTTA	3	15	265762	265776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017509	TAAAC	2	10	272111	272120	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017509	CATAT	2	10	284051	284060	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017509	AATCA	2	10	293295	293304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017509	CAAGA	2	10	293362	293371	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017509	GAAAA	2	10	307208	307217	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017509	ATTTT	2	10	307530	307539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017509	TTTAT	2	10	309555	309564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017509	TAATT	2	10	319438	319447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017509	ATAAA	2	10	339435	339444	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017509	CAAAG	2	10	340642	340651	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017509	TAAAA	2	10	350541	350550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017509	TTTAA	2	10	354919	354928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017509	ATTTA	2	10	361349	361358	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017509	TTATA	2	10	367172	367181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017509	TAAAA	2	10	369802	369811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017509	TACTA	2	10	370887	370896	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017509	AAATT	2	10	370979	370988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017509	TAAAT	2	10	374040	374049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017509	TAATT	2	10	374233	374242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017509	TAGTA	2	10	374326	374335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017509	ATTTT	2	10	380792	380801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017509	TAATT	2	10	400111	400120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017509	AGTTA	2	10	404982	404991	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017509	AAATA	2	10	405582	405591	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017509	TAAGT	2	10	406436	406445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017509	ATAAA	2	10	407761	407770	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017509	TAATT	2	10	420072	420081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017509	TAATT	3	15	421251	421265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017509	TTATT	2	10	423131	423140	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017509	ACAAA	2	10	424174	424183	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017509	AATTA	2	10	424192	424201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017509	TAATT	2	10	428887	428896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017509	AATTA	2	10	429975	429984	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017509	TTAAT	2	10	430949	430958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017509	CAAGC	2	10	433864	433873	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017509	TTTAA	2	10	435532	435541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017509	TTCTT	2	10	435561	435570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017509	AAATT	2	10	435575	435584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017509	AAACT	2	10	435674	435683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017509	TATAA	2	10	435705	435714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017509	ATTAT	2	10	441277	441286	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017509	TAAAT	2	10	441289	441298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017509	TTTAA	2	10	442142	442151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017509	TTTCT	2	10	443959	443968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017509	TAATT	2	10	444037	444046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017509	TTAAT	2	10	444804	444813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	ATTTT	2	10	446965	446974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017509	AGAAA	2	10	447691	447700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017509	ATAGG	2	10	448728	448737	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017509	TATTT	2	10	450654	450663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017509	TATAA	2	10	453290	453299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017509	ATTTT	2	10	453321	453330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017509	TTAAA	2	10	459177	459186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017509	TAAAA	2	10	459790	459799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017509	TTTTC	2	10	460394	460403	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017509	TAAAA	2	10	460804	460813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017509	AAATT	2	10	460874	460883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017509	ATTTT	2	10	462538	462547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017509	TAGTT	2	10	469193	469202	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017509	ATTAA	2	10	494989	494998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017509	TAGAA	2	10	496561	496570	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017509	TTAAT	2	10	496719	496728	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017509	TATAA	2	10	499410	499419	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017509	TTTAA	2	10	499516	499525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017509	TAAAA	2	10	501704	501713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017509	AAATT	2	10	511677	511686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017509	ATTTC	2	10	514738	514747	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017509	AAACA	2	10	529794	529803	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017509	TATAA	2	10	537336	537345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017509	ATTAA	2	10	537394	537403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017509	AAATT	2	10	547319	547328	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017509	TTAAA	2	10	559616	559625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017509	GTTTT	2	10	571905	571914	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017509	ATTTC	2	10	572092	572101	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017509	GATTT	2	10	572559	572568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017509	ATTTG	2	10	572913	572922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017509	TTCAA	2	10	573411	573420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017509	TTTGG	2	10	573675	573684	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017509	ATTTT	2	10	574559	574568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017509	GGAAT	2	10	574586	574595	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017509	TTTTA	2	10	575154	575163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017509	ATTTT	2	10	576871	576880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017509	CCTGT	2	10	577016	577025	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017509	CACCG	2	10	578151	578160	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017509	TTGAT	2	10	580438	580447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017509	CCTGG	2	10	580985	580994	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017509	AATTT	2	10	581713	581722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017509	ATGGT	2	10	585580	585589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017509	ATTAT	2	10	586913	586922	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017509	GTTTT	2	10	587831	587840	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017509	ATTAC	2	10	596079	596088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017509	AATAA	2	10	600787	600796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017509	TAATT	2	10	602408	602417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017509	TATAA	2	10	604865	604874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017509	TTAAT	2	10	634159	634168	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017509	TATAA	2	10	637292	637301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.