MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 11583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	AAT	2	6	16	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
2	NC_017509	CAA	2	6	49	54	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
3	NC_017509	TTA	2	6	64	69	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334156
4	NC_017509	TGT	2	6	80	85	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334156
5	NC_017509	AAC	2	6	88	93	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
6	NC_017509	ATT	2	6	136	141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334156
7	NC_017509	AAT	2	6	256	261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
8	NC_017509	TTA	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334156
9	NC_017509	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334156
10	NC_017509	TTC	2	6	564	569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334156
11	NC_017509	TGA	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334156
12	NC_017509	TTG	2	6	686	691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334156
13	NC_017509	ATA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
14	NC_017509	CTT	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334156
15	NC_017509	TGG	2	6	768	773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334156
16	NC_017509	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334156
17	NC_017509	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334156
18	NC_017509	ATG	2	6	908	913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334156
19	NC_017509	TTG	2	6	1058	1063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334156
20	NC_017509	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
21	NC_017509	AAC	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
22	NC_017509	AAT	2	6	1275	1280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334156
23	NC_017509	CAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334156
24	NC_017509	TTA	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017509	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017509	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017509	ATA	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334157
28	NC_017509	AAG	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334157
29	NC_017509	ATT	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334157
30	NC_017509	CAA	2	6	1670	1675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
31	NC_017509	ATG	2	6	1730	1735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334157
32	NC_017509	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334157
33	NC_017509	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334157
34	NC_017509	CAA	3	9	1970	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
35	NC_017509	CAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
36	NC_017509	ACA	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334157
37	NC_017509	TTA	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334157
38	NC_017509	TTG	2	6	2820	2825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334158
39	NC_017509	GGC	2	6	2831	2836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385334158
40	NC_017509	ATT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334158
41	NC_017509	GTT	2	6	2885	2890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334158
42	NC_017509	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334158
43	NC_017509	TGG	2	6	2944	2949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334158
44	NC_017509	GGA	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334158
45	NC_017509	ATT	2	6	3245	3250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334158
46	NC_017509	ACA	2	6	3251	3256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334158
47	NC_017509	TTC	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334158
48	NC_017509	CAA	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334158
49	NC_017509	AAT	2	6	3344	3349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334158
50	NC_017509	CTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334158
51	NC_017509	AGG	2	6	3441	3446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334158
52	NC_017509	ACA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334158
53	NC_017509	CCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334158
54	NC_017509	ATG	2	6	3822	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
55	NC_017509	GAA	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334158
56	NC_017509	ATG	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
57	NC_017509	TGA	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
58	NC_017509	GAT	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334158
59	NC_017509	TCA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334158
60	NC_017509	GTG	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334158
61	NC_017509	CTG	2	6	4569	4574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334158
62	NC_017509	AAT	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334159
63	NC_017509	TAA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334159
64	NC_017509	TGA	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334159
65	NC_017509	ACC	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334159
66	NC_017509	ATA	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334160
67	NC_017509	TCA	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334160
68	NC_017509	CAA	2	6	5210	5215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334160
69	NC_017509	CTG	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334160
70	NC_017509	GCT	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334160
71	NC_017509	GAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334160
72	NC_017509	CTA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334160
73	NC_017509	GAA	2	6	5540	5545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334160
74	NC_017509	CAA	2	6	5625	5630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334160
75	NC_017509	TGC	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334160
76	NC_017509	AAG	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334160
77	NC_017509	GCA	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334160
78	NC_017509	TTG	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334161
79	NC_017509	ACC	2	6	6415	6420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334161
80	NC_017509	GAT	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334161
81	NC_017509	ATT	2	6	6629	6634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334161
82	NC_017509	GAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385334161
83	NC_017509	ATT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334161
84	NC_017509	TGG	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017509	ATT	2	6	7204	7209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334162
86	NC_017509	TTG	2	6	7444	7449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334162
87	NC_017509	AGA	2	6	7472	7477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334162
88	NC_017509	TGA	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334162
89	NC_017509	GAT	2	6	7552	7557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334162
90	NC_017509	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334162
91	NC_017509	TGA	3	9	7694	7702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334162
92	NC_017509	ATT	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017509	TAA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017509	TGA	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017509	GAA	2	6	7982	7987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017509	AGA	2	6	7990	7995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017509	TAA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017509	AAT	2	6	8038	8043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017509	AAT	2	6	8081	8086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	AAT	2	6	8104	8109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017509	ACT	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017509	GCT	2	6	8288	8293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017509	AGC	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017509	AAT	2	6	8474	8479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334163
105	NC_017509	CAA	2	6	8571	8576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334163
106	NC_017509	AAG	2	6	8790	8795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334163
107	NC_017509	TGG	2	6	9013	9018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334164
108	NC_017509	ATA	2	6	9063	9068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334164
109	NC_017509	ATT	2	6	9128	9133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334164
110	NC_017509	TCA	2	6	9183	9188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334164
111	NC_017509	ATT	2	6	9284	9289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334164
112	NC_017509	GAA	2	6	9683	9688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334164
113	NC_017509	ATT	2	6	9707	9712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334164
114	NC_017509	AAC	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334164
115	NC_017509	TAA	2	6	9808	9813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334164
116	NC_017509	GAT	2	6	9935	9940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334164
117	NC_017509	CAA	3	9	10044	10052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334164
118	NC_017509	TTG	2	6	10056	10061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385334164
119	NC_017509	GAT	2	6	10117	10122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385334164
120	NC_017509	TTC	2	6	10146	10151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385334164
121	NC_017509	GAA	2	6	10307	10312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334164
122	NC_017509	ATT	2	6	10394	10399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334164
123	NC_017509	ATT	2	6	10502	10507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334164
124	NC_017509	ATT	2	6	10514	10519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385334164
125	NC_017509	TAA	2	6	10522	10527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334164
126	NC_017509	CAA	2	6	10574	10579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334164
127	NC_017509	ATA	2	6	10653	10658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385334164
128	NC_017509	TGC	2	6	10744	10749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334164
129	NC_017509	GAA	2	6	10790	10795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334164
130	NC_017509	GAA	2	6	10850	10855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385334164
131	NC_017509	CGT	2	6	11384	11389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334165
132	NC_017509	TAC	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385334165
133	NC_017509	CAA	3	9	11463	11471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334165
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262	NC_017509	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_017509	ATC	2	6	23018	23023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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