MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hyopneumoniae 168 chromosome

Total Repeats: 1644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017509	TTA	2	6	1469	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017509	ATT	2	6	1480	1485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017509	ATT	2	6	1519	1524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017509	TGG	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017509	ATT	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017509	TAA	2	6	7785	7790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017509	TGA	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017509	GAA	2	6	7982	7987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017509	AGA	2	6	7990	7995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017509	TAA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017509	AAT	2	6	8038	8043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017509	AAT	2	6	8081	8086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017509	AAT	2	6	8104	8109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017509	ACT	2	6	8225	8230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017509	GCT	2	6	8288	8293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017509	AGC	2	6	8305	8310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017509	TAT	2	6	16494	16499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017509	TTA	2	6	16502	16507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017509	ATT	2	6	17019	17024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017509	AAT	2	6	17053	17058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017509	AAT	2	6	17138	17143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017509	AAT	2	6	17504	17509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017509	AAT	2	6	17531	17536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017509	ATT	2	6	17560	17565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017509	GTA	2	6	19901	19906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017509	AAT	2	6	19926	19931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017509	TCC	2	6	22435	22440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017509	TAT	2	6	22475	22480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017509	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017509	TAA	3	9	22523	22531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017509	ACA	2	6	22569	22574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017509	ATT	2	6	22599	22604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017509	TTA	2	6	22885	22890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017509	ATT	2	6	22917	22922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017509	ATT	2	6	22982	22987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017509	ATC	2	6	23018	23023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017509	TGA	2	6	23082	23087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017509	TAT	2	6	23122	23127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017509	CAA	2	6	23155	23160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017509	TTA	2	6	23299	23304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017509	ATA	2	6	23336	23341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017509	TCA	2	6	23364	23369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017509	ATG	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017509	TTG	2	6	23554	23559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017509	TAA	2	6	23677	23682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017509	TCA	2	6	23772	23777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017509	ATT	2	6	23879	23884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017509	ACC	2	6	24029	24034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017509	GAA	2	6	24035	24040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017509	TAA	2	6	24059	24064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017509	AAC	2	6	24296	24301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017509	TCA	2	6	24363	24368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017509	CCA	2	6	24450	24455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017509	TTG	2	6	24470	24475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017509	ATT	2	6	24572	24577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017509	TTA	2	6	24684	24689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017509	TAT	2	6	25710	25715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017509	AGA	2	6	25763	25768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017509	AAT	2	6	25786	25791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017509	ATT	2	6	25797	25802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017509	CTT	2	6	25827	25832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017509	ATT	2	6	25844	25849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017509	TAT	2	6	25903	25908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017509	TAA	2	6	25962	25967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017509	CAA	2	6	26541	26546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017509	TAA	2	6	26629	26634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017509	TTG	2	6	29682	29687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017509	TAG	2	6	29828	29833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017509	AAT	2	6	30444	30449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017509	TAA	2	6	30483	30488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017509	TAA	2	6	30491	30496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017509	CAT	2	6	36019	36024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017509	GAA	2	6	36030	36035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017509	GAT	2	6	36046	36051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017509	GTT	2	6	36187	36192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017509	AAT	2	6	38269	38274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017509	AAT	2	6	38325	38330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017509	TAA	2	6	39480	39485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017509	TTA	2	6	40007	40012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017509	TGT	2	6	40060	40065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017509	GAA	2	6	40070	40075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017509	CCT	2	6	40166	40171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017509	TAA	2	6	41574	41579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017509	AAT	3	9	43947	43955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017509	TAA	2	6	43958	43963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017509	TAA	3	9	45515	45523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017509	TTG	2	6	46577	46582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017509	GGT	2	6	47551	47556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017509	ATA	2	6	47563	47568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017509	TGG	2	6	47619	47624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017509	GGT	2	6	47629	47634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017509	ATT	2	6	48767	48772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017509	ATT	2	6	48806	48811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017509	ATT	2	6	50890	50895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017509	GTA	2	6	59460	59465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017509	ACA	2	6	59653	59658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017509	TTG	2	6	60684	60689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017509	TAA	2	6	60748	60753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017509	TAA	2	6	62946	62951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017509	CAG	2	6	69906	69911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017509	TGG	2	6	70059	70064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017509	ACT	2	6	70113	70118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017509	AAT	2	6	70383	70388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017509	TGG	2	6	70398	70403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017509	CGA	2	6	70506	70511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017509	ATT	2	6	80459	80464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017509	TAA	2	6	80870	80875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017509	TAA	2	6	82983	82988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017509	GAA	2	6	83024	83029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017509	TTA	2	6	84200	84205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017509	ACT	2	6	84212	84217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017509	TAT	2	6	84218	84223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017509	TAA	2	6	88654	88659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017509	TAA	2	6	89821	89826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017509	TGT	2	6	92516	92521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017509	TTG	2	6	92955	92960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017509	AAC	2	6	93001	93006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017509	ATT	2	6	93083	93088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017509	ATA	2	6	94686	94691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017509	ATA	2	6	94733	94738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017509	TAA	2	6	96119	96124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017509	TAT	2	6	96130	96135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017509	TGT	2	6	96220	96225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017509	ATT	2	6	97715	97720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017509	TAA	2	6	97721	97726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017509	GAA	2	6	100391	100396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017509	AAT	2	6	103546	103551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017509	ATT	2	6	103561	103566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017509	CTA	2	6	103626	103631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017509	TAA	2	6	103638	103643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017509	TTA	2	6	103686	103691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017509	TAA	2	6	103743	103748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017509	TTA	2	6	103762	103767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017509	TGG	2	6	103828	103833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017509	TCC	2	6	103937	103942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017509	TGG	2	6	104204	104209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017509	TGG	2	6	104335	104340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017509	TGG	2	6	104416	104421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017509	CCT	2	6	104446	104451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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141	NC_017509	CTG	2	6	104716	104721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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