MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-42

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017508	CCGAA	2	10	4229	4238	40 %	0 %	20 %	40 %	385334107
2	NC_017508	TTTTC	2	10	5232	5241	0 %	80 %	0 %	20 %	385334109
3	NC_017508	CCCTT	2	10	7828	7837	0 %	40 %	0 %	60 %	385334114
4	NC_017508	TGTCC	2	10	7876	7885	0 %	40 %	20 %	40 %	385334114
5	NC_017508	ATTCA	2	10	7905	7914	40 %	40 %	0 %	20 %	385334114
6	NC_017508	GCAAC	2	10	8613	8622	40 %	0 %	20 %	40 %	385334115
7	NC_017508	CCCTT	2	10	9397	9406	0 %	40 %	0 %	60 %	385334116
8	NC_017508	ACCCT	2	10	9676	9685	20 %	20 %	0 %	60 %	385334117
9	NC_017508	GCAGG	2	10	13391	13400	20 %	0 %	60 %	20 %	385334121
10	NC_017508	AGCAA	2	10	14974	14983	60 %	0 %	20 %	20 %	385334124
11	NC_017508	TTCGC	2	10	16771	16780	0 %	40 %	20 %	40 %	385334124
12	NC_017508	CCAAT	2	10	19482	19491	40 %	20 %	0 %	40 %	385334126
13	NC_017508	GCACC	2	10	22021	22030	20 %	0 %	20 %	60 %	385334129
14	NC_017508	AACAA	2	10	22243	22252	80 %	0 %	0 %	20 %	385334129
15	NC_017508	TCGGA	2	10	22633	22642	20 %	20 %	40 %	20 %	385334129
16	NC_017508	GCGCG	2	10	23789	23798	0 %	0 %	60 %	40 %	385334129
17	NC_017508	ACATG	2	10	25151	25160	40 %	20 %	20 %	20 %	385334130
18	NC_017508	GCCAA	2	10	25416	25425	40 %	0 %	20 %	40 %	385334131
19	NC_017508	ACCAG	2	10	27050	27059	40 %	0 %	20 %	40 %	385334134
20	NC_017508	GTTGG	2	10	29078	29087	0 %	40 %	60 %	0 %	385334139
21	NC_017508	TCAAA	2	10	29762	29771	60 %	20 %	0 %	20 %	385334141
22	NC_017508	TGCCC	2	10	30384	30393	0 %	20 %	20 %	60 %	385334142
23	NC_017508	CAGCC	2	10	31251	31260	20 %	0 %	20 %	60 %	385334143
24	NC_017508	CCGCA	2	10	31374	31383	20 %	0 %	20 %	60 %	385334143
25	NC_017508	TTTCA	2	10	31504	31513	20 %	60 %	0 %	20 %	385334143
26	NC_017508	GCCCT	2	10	32078	32087	0 %	20 %	20 %	60 %	385334144
27	NC_017508	AGCGC	2	10	32490	32499	20 %	0 %	40 %	40 %	385334144
28	NC_017508	CGGTG	2	10	36785	36794	0 %	20 %	60 %	20 %	385334149
29	NC_017508	GTCCA	2	10	37455	37464	20 %	20 %	20 %	40 %	385334150
30	NC_017508	ATTTC	2	10	38837	38846	20 %	60 %	0 %	20 %	385334151
31	NC_017508	TCCAT	2	10	38895	38904	20 %	40 %	0 %	40 %	385334151
32	NC_017508	AACGG	2	10	39165	39174	40 %	0 %	40 %	20 %	385334151
33	NC_017508	CCGCA	2	10	40563	40572	20 %	0 %	20 %	60 %	385334151
34	NC_017508	GCCGC	2	10	40953	40962	0 %	0 %	40 %	60 %	385334153
35	NC_017508	TCCGC	2	10	41635	41644	0 %	20 %	20 %	60 %	385334154

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.