MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-187

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017507	GATTAC	2	12	1048	1059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385333925
2	NC_017507	CGATGA	2	12	3690	3701	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385333929
3	NC_017507	TGCGAT	2	12	8539	8550	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385333934
4	NC_017507	CCGGCG	2	12	26639	26650	0 %	0 %	50 %	50 %	385333957
5	NC_017507	TCGAGC	2	12	28647	28658	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385333958
6	NC_017507	CATGAG	2	12	28708	28719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385333958
7	NC_017507	TACCCA	2	12	31388	31399	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385333960
8	NC_017507	GCAATG	2	12	36116	36127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385333966
9	NC_017507	AAGTTG	2	12	41071	41082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017507	TTTTGC	2	12	47158	47169	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385333977
11	NC_017507	CGGTCG	2	12	63689	63700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385333992
12	NC_017507	AGTCAA	2	12	64349	64360	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385333993
13	NC_017507	TTTTGA	2	12	66427	66438	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385333995
14	NC_017507	CGTTGC	2	12	73121	73132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385334001
15	NC_017507	CGGGAG	2	12	76945	76956	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385334003
16	NC_017507	AGACCG	2	12	76985	76996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334003
17	NC_017507	TGCATC	2	12	82322	82333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385334007
18	NC_017507	CATTGG	2	12	83997	84008	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017507	CCCGTG	2	12	90092	90103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385334017
20	NC_017507	CCCAAA	2	12	93455	93466	50 %	0 %	0 %	50 %	385334022
21	NC_017507	CAAAAC	2	12	101497	101508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334030
22	NC_017507	GGGTTG	2	12	103632	103643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385334032
23	NC_017507	CGACTT	2	12	105920	105931	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385334034
24	NC_017507	ACCCAC	2	12	114715	114726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385334038
25	NC_017507	CAACGG	2	12	120644	120655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334042
26	NC_017507	CAATGG	2	12	120803	120814	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385334042
27	NC_017507	TCCGGA	2	12	123373	123384	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385334043
28	NC_017507	CAAACG	2	12	124505	124516	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334045
29	NC_017507	CAACGA	2	12	125982	125993	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334046
30	NC_017507	CACAAC	2	12	130234	130245	50 %	0 %	0 %	50 %	385334049
31	NC_017507	AAGCCG	2	12	143235	143246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385334064
32	NC_017507	TCTGAC	2	12	145989	146000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017507	ACCGAA	2	12	148685	148696	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385334071
34	NC_017507	TGATCA	2	12	150767	150778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385334073
35	NC_017507	CCAAAA	2	12	153733	153744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385334075
36	NC_017507	TTCACC	2	12	154842	154853	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385334076
37	NC_017507	GTCGCA	2	12	155468	155479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385334076
38	NC_017507	GCAAAC	2	12	155859	155870	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017507	GCACGC	2	12	164152	164163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385334084
40	NC_017507	TCGCCA	2	12	172080	172091	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385334090
41	NC_017507	GAAGCA	2	12	175670	175681	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385334093
42	NC_017507	GAGCGG	2	12	175911	175922	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385334093
43	NC_017507	TTTTTG	2	12	178757	178768	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385334095

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.