MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-187

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017507	CGTGG	2	10	1506	1515	0 %	20 %	60 %	20 %	385333926
2	NC_017507	TCTTG	2	10	2462	2471	0 %	60 %	20 %	20 %	385333927
3	NC_017507	GTCGA	2	10	3355	3364	20 %	20 %	40 %	20 %	385333929
4	NC_017507	TGAAC	2	10	6592	6601	40 %	20 %	20 %	20 %	385333932
5	NC_017507	AGTGA	2	10	7496	7505	40 %	20 %	40 %	0 %	385333932
6	NC_017507	CGACC	2	10	10991	11000	20 %	0 %	20 %	60 %	385333936
7	NC_017507	CAAAC	2	10	11308	11317	60 %	0 %	0 %	40 %	385333936
8	NC_017507	GGATC	2	10	13097	13106	20 %	20 %	40 %	20 %	385333937
9	NC_017507	GGCTT	2	10	13984	13993	0 %	40 %	40 %	20 %	385333937
10	NC_017507	GCGAT	2	10	16409	16418	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017507	AAACA	2	10	16629	16638	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017507	CCAAC	2	10	25665	25674	40 %	0 %	0 %	60 %	385333956
13	NC_017507	ATCGA	2	10	26441	26450	40 %	20 %	20 %	20 %	385333957
14	NC_017507	GGTTG	2	10	28532	28541	0 %	40 %	60 %	0 %	385333958
15	NC_017507	GGTAG	2	10	28899	28908	20 %	20 %	60 %	0 %	385333959
16	NC_017507	TTGAC	2	10	29258	29267	20 %	40 %	20 %	20 %	385333959
17	NC_017507	GTTTG	2	10	29975	29984	0 %	60 %	40 %	0 %	385333960
18	NC_017507	GAGGG	2	10	30173	30182	20 %	0 %	80 %	0 %	385333960
19	NC_017507	TTGGG	2	10	32178	32187	0 %	40 %	60 %	0 %	385333961
20	NC_017507	CGGCT	2	10	33163	33172	0 %	20 %	40 %	40 %	385333962
21	NC_017507	GGTAT	2	10	33740	33749	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017507	GAATA	2	10	34573	34582	60 %	20 %	20 %	0 %	385333963
23	NC_017507	CGGCA	2	10	35057	35066	20 %	0 %	40 %	40 %	385333964
24	NC_017507	CGACA	2	10	37321	37330	40 %	0 %	20 %	40 %	385333967
25	NC_017507	CAACA	2	10	37946	37955	60 %	0 %	0 %	40 %	385333967
26	NC_017507	GATCT	2	10	38252	38261	20 %	40 %	20 %	20 %	385333967
27	NC_017507	TTCCT	2	10	46730	46739	0 %	60 %	0 %	40 %	385333977
28	NC_017507	TTGGG	2	10	49381	49390	0 %	40 %	60 %	0 %	385333979
29	NC_017507	AGAAA	2	10	50615	50624	80 %	0 %	20 %	0 %	385333980
30	NC_017507	GGCTT	2	10	51414	51423	0 %	40 %	40 %	20 %	385333981
31	NC_017507	CGCTG	2	10	56373	56382	0 %	20 %	40 %	40 %	385333984
32	NC_017507	TGCAG	2	10	59490	59499	20 %	20 %	40 %	20 %	385333989
33	NC_017507	TTGCC	2	10	59971	59980	0 %	40 %	20 %	40 %	385333990
34	NC_017507	CAAAG	2	10	60276	60285	60 %	0 %	20 %	20 %	385333990
35	NC_017507	AACCG	2	10	60507	60516	40 %	0 %	20 %	40 %	385333990
36	NC_017507	ATTTG	2	10	62218	62227	20 %	60 %	20 %	0 %	385333991
37	NC_017507	CAAGC	2	10	65467	65476	40 %	0 %	20 %	40 %	385333994
38	NC_017507	TGCCG	2	10	67559	67568	0 %	20 %	40 %	40 %	385333996
39	NC_017507	ACGAT	2	10	70716	70725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017507	ATAAA	2	10	70745	70754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017507	TTCAG	2	10	71737	71746	20 %	40 %	20 %	20 %	385334000
42	NC_017507	GAATT	2	10	71856	71865	40 %	40 %	20 %	0 %	385334000
43	NC_017507	ACCGA	2	10	72916	72925	40 %	0 %	20 %	40 %	385334001
44	NC_017507	GATTC	2	10	74217	74226	20 %	40 %	20 %	20 %	385334001
45	NC_017507	AACGC	2	10	76366	76375	40 %	0 %	20 %	40 %	385334002
46	NC_017507	AGGGC	2	10	76659	76668	20 %	0 %	60 %	20 %	385334003
47	NC_017507	GATCA	2	10	76789	76798	40 %	20 %	20 %	20 %	385334003
48	NC_017507	ATTGA	2	10	79170	79179	40 %	40 %	20 %	0 %	385334004
49	NC_017507	CAGAA	2	10	80979	80988	60 %	0 %	20 %	20 %	385334006
50	NC_017507	AGCTG	2	10	82039	82048	20 %	20 %	40 %	20 %	385334007
51	NC_017507	AAACG	2	10	85047	85056	60 %	0 %	20 %	20 %	385334010
52	NC_017507	ACGAT	2	10	86922	86931	40 %	20 %	20 %	20 %	385334013
53	NC_017507	TCGAT	2	10	87310	87319	20 %	40 %	20 %	20 %	385334014
54	NC_017507	ATTTC	2	10	87539	87548	20 %	60 %	0 %	20 %	385334014
55	NC_017507	CTTTT	2	10	87915	87924	0 %	80 %	0 %	20 %	385334014
56	NC_017507	GGAAT	2	10	90670	90679	40 %	20 %	40 %	0 %	385334017
57	NC_017507	GAGGT	2	10	91051	91060	20 %	20 %	60 %	0 %	385334018
58	NC_017507	TCGCT	2	10	91084	91093	0 %	40 %	20 %	40 %	385334018
59	NC_017507	ACCAA	2	10	94031	94040	60 %	0 %	0 %	40 %	385334022
60	NC_017507	CTGAG	2	10	95189	95198	20 %	20 %	40 %	20 %	385334024
61	NC_017507	GTTGC	2	10	95410	95419	0 %	40 %	40 %	20 %	385334024
62	NC_017507	GCCGA	2	10	97965	97974	20 %	0 %	40 %	40 %	385334025
63	NC_017507	CCTTC	2	10	100173	100182	0 %	40 %	0 %	60 %	385334028
64	NC_017507	GCAAC	2	10	101323	101332	40 %	0 %	20 %	40 %	385334030
65	NC_017507	TATCG	2	10	102244	102253	20 %	40 %	20 %	20 %	385334030
66	NC_017507	TATTT	2	10	102356	102365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017507	CATAA	2	10	108847	108856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017507	GCGTC	2	10	112478	112487	0 %	20 %	40 %	40 %	385334037
69	NC_017507	GCCAG	2	10	116274	116283	20 %	0 %	40 %	40 %	385334038
70	NC_017507	CGAAG	2	10	117730	117739	40 %	0 %	40 %	20 %	385334040
71	NC_017507	AGCCA	2	10	118648	118657	40 %	0 %	20 %	40 %	385334040
72	NC_017507	GCGGG	2	10	125225	125234	0 %	0 %	80 %	20 %	385334046
73	NC_017507	GCCCT	2	10	126731	126740	0 %	20 %	20 %	60 %	385334047
74	NC_017507	AGCAG	2	10	128851	128860	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017507	CAGAT	2	10	129311	129320	40 %	20 %	20 %	20 %	385334049
76	NC_017507	AATCC	2	10	134319	134328	40 %	20 %	0 %	40 %	385334054
77	NC_017507	CTCCA	2	10	136017	136026	20 %	20 %	0 %	60 %	385334056
78	NC_017507	CGGTC	2	10	137383	137392	0 %	20 %	40 %	40 %	385334056
79	NC_017507	GGCTT	2	10	139160	139169	0 %	40 %	40 %	20 %	385334058
80	NC_017507	CGGAC	2	10	139380	139389	20 %	0 %	40 %	40 %	385334058
81	NC_017507	ACGCA	2	10	141764	141773	40 %	0 %	20 %	40 %	385334061
82	NC_017507	AAGCC	2	10	142290	142299	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017507	CCCCG	2	10	144175	144184	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
84	NC_017507	GCCGC	2	10	144314	144323	0 %	0 %	40 %	60 %	385334065
85	NC_017507	GCTTT	2	10	148489	148498	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017507	CAAGC	2	10	149973	149982	40 %	0 %	20 %	40 %	385334072
87	NC_017507	TGGCG	2	10	151583	151592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017507	CGTTC	2	10	152295	152304	0 %	40 %	20 %	40 %	385334074
89	NC_017507	TTCGT	2	10	158648	158657	0 %	60 %	20 %	20 %	385334080
90	NC_017507	CGATT	2	10	159755	159764	20 %	40 %	20 %	20 %	385334081
91	NC_017507	GCTAC	2	10	160472	160481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017507	TACCT	2	10	160506	160515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017507	AAGGA	2	10	167962	167971	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017507	GGAGT	2	10	168729	168738	20 %	20 %	60 %	0 %	385334087
95	NC_017507	ACTTT	2	10	169225	169234	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017507	GGAAG	3	15	169349	169363	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017507	GGAGG	2	10	169364	169373	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017507	GGAGA	3	15	169374	169388	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017507	CAAGG	2	10	170459	170468	40 %	0 %	40 %	20 %	385334089
100	NC_017507	TGGGA	2	10	174260	174269	20 %	20 %	60 %	0 %	385334092
101	NC_017507	TTTCT	2	10	174488	174497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017507	ATTCA	2	10	175515	175524	40 %	40 %	0 %	20 %	385334093
103	NC_017507	AGCCA	2	10	176033	176042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017507	TTGGG	2	10	176459	176468	0 %	40 %	60 %	0 %	385334094
105	NC_017507	TTCGC	2	10	176775	176784	0 %	40 %	20 %	40 %	385334094
106	NC_017507	CGATT	2	10	180062	180071	20 %	40 %	20 %	20 %	385334096
107	NC_017507	GGTTT	2	10	180600	180609	0 %	60 %	40 %	0 %	385334096
108	NC_017507	TGGGG	2	10	181088	181097	0 %	20 %	80 %	0 %	385334096
109	NC_017507	CCAGA	2	10	185709	185718	40 %	0 %	20 %	40 %	385334100
110	NC_017507	TCCAT	2	10	186226	186235	20 %	40 %	0 %	40 %	385334100
111	NC_017507	ATGAG	2	10	186963	186972	40 %	20 %	40 %	0 %	385334101

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.