MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-187

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017507	GCGAT	2	10	16409	16418	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017507	AAACA	2	10	16629	16638	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017507	GGTAT	2	10	33740	33749	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017507	ACGAT	2	10	70716	70725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017507	ATAAA	2	10	70745	70754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017507	TATTT	2	10	102356	102365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017507	CATAA	2	10	108847	108856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017507	AGCAG	2	10	128851	128860	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017507	AAGCC	2	10	142290	142299	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017507	CCCCG	2	10	144175	144184	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_017507	GCTTT	2	10	148489	148498	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017507	TGGCG	2	10	151583	151592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017507	GCTAC	2	10	160472	160481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017507	TACCT	2	10	160506	160515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017507	AAGGA	2	10	167962	167971	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017507	ACTTT	2	10	169225	169234	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017507	GGAAG	3	15	169349	169363	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017507	GGAGG	2	10	169364	169373	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017507	GGAGA	3	15	169374	169388	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017507	TTTCT	2	10	174488	174497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017507	AGCCA	2	10	176033	176042	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.