MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-187

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017507	AGTT	2	8	2338	2345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017507	ATAA	2	8	2573	2580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017507	AAGG	2	8	3101	3108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017507	AGTC	2	8	10340	10347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017507	TCGC	2	8	10357	10364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017507	ATAA	2	8	18942	18949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017507	CGAA	2	8	19554	19561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017507	GCAG	2	8	19983	19990	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017507	TACT	2	8	20479	20486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017507	AAAC	2	8	21460	21467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017507	ACAT	2	8	25750	25757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017507	CGGC	2	8	25907	25914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017507	CTCA	2	8	26031	26038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017507	AACG	2	8	27529	27536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017507	ATAA	2	8	27724	27731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017507	GAGT	2	8	27797	27804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017507	TAAA	2	8	44825	44832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017507	AGAA	2	8	44836	44843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017507	AATG	2	8	44899	44906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017507	GTGC	2	8	45104	45111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017507	TAGA	2	8	45130	45137	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017507	TTGT	2	8	52656	52663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017507	AGGA	2	8	56883	56890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017507	GCAA	2	8	70638	70645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017507	ACGT	2	8	79403	79410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017507	ATGC	2	8	82646	82653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017507	CTCG	2	8	82694	82701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017507	ATGC	2	8	82727	82734	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017507	GAAA	2	8	91173	91180	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017507	AGAA	2	8	91181	91188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017507	GAAA	2	8	91426	91433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017507	CTGT	2	8	99670	99677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017507	AAAC	2	8	103462	103469	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017507	CGTA	2	8	113083	113090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017507	TATT	2	8	113370	113377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017507	CTGA	2	8	114415	114422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017507	AGTA	2	8	117085	117092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017507	ACTC	2	8	120247	120254	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017507	ACCG	2	8	123488	123495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017507	CAAT	2	8	123522	123529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017507	GAAA	2	8	123561	123568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017507	ATCT	2	8	128647	128654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017507	ACGA	2	8	132586	132593	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017507	TCAC	2	8	137514	137521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017507	TGCT	2	8	139800	139807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017507	CAGC	2	8	142148	142155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017507	GATG	2	8	142324	142331	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017507	CTAT	2	8	144875	144882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017507	TGCT	2	8	145691	145698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017507	TGAC	2	8	148362	148369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017507	TCGC	2	8	148449	148456	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017507	GCAT	2	8	151565	151572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017507	CATG	2	8	151601	151608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017507	AACG	2	8	153384	153391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017507	GTTG	2	8	155899	155906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017507	GAAT	2	8	158135	158142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017507	AGTT	2	8	160489	160496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017507	AACT	2	8	163460	163467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017507	TACG	2	8	163790	163797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017507	ACCA	2	8	163884	163891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017507	GGCA	2	8	163921	163928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017507	TGAT	2	8	167234	167241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017507	GCTG	2	8	167306	167313	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017507	TGGC	2	8	167485	167492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017507	TTTC	2	8	167623	167630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017507	TGAT	2	8	172566	172573	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017507	TAGG	2	8	172670	172677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017507	GTTA	2	8	172958	172965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017507	GAGT	2	8	173306	173313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017507	TCCG	2	8	173823	173830	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017507	GCTT	2	8	174651	174658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017507	TTAC	2	8	174707	174714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017507	AAAC	2	8	176315	176322	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017507	TCGC	2	8	184301	184308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017507	TGTA	2	8	184397	184404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017507	GCGA	2	8	184433	184440	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017507	AGGA	2	8	187168	187175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.