MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 plasmid pHP-187

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017507	GAA	3	9	14	22	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017507	CAA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017507	TTG	2	6	2098	2103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017507	GTT	2	6	2652	2657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017507	TGC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017507	TTG	2	6	10150	10155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017507	TCG	2	6	10205	10210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017507	TTG	2	6	10242	10247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017507	CAG	2	6	10304	10309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017507	AGC	2	6	10389	10394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017507	AAC	2	6	12237	12242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017507	GAG	2	6	15862	15867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017507	CGG	2	6	16200	16205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017507	ACG	2	6	16280	16285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017507	CTG	2	6	16301	16306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017507	CCG	2	6	16399	16404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017507	TCA	2	6	16453	16458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017507	CAT	2	6	16527	16532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017507	ACC	2	6	16646	16651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017507	GGC	2	6	18279	18284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017507	AGG	2	6	18296	18301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017507	GCC	2	6	18314	18319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017507	GGT	2	6	18782	18787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017507	GAA	2	6	18950	18955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017507	GAG	2	6	19041	19046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017507	GCA	2	6	19052	19057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017507	GTC	2	6	19161	19166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017507	GAA	2	6	19919	19924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017507	GTC	2	6	19931	19936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017507	TGA	2	6	19959	19964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017507	CCT	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017507	GTG	2	6	20502	20507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017507	GAT	2	6	20516	20521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017507	AAG	2	6	21106	21111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017507	CAG	2	6	21138	21143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017507	GTG	2	6	21172	21177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017507	CGC	2	6	21482	21487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017507	ATT	2	6	21734	21739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017507	TCC	2	6	22365	22370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017507	GAA	2	6	22396	22401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017507	GTT	2	6	22718	22723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017507	CAT	2	6	22809	22814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017507	CCA	2	6	22847	22852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017507	CCA	2	6	24095	24100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017507	CCA	2	6	24110	24115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017507	CGT	2	6	24152	24157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017507	GGC	2	6	24213	24218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017507	CGC	2	6	24223	24228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_017507	ACA	2	6	24259	24264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017507	AAG	2	6	24282	24287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017507	AAG	2	6	24309	24314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017507	GAT	2	6	25695	25700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017507	CTT	2	6	25801	25806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017507	AAG	2	6	25917	25922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017507	TCG	2	6	27603	27608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017507	GAT	2	6	27768	27773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017507	CCT	2	6	27850	27855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017507	AAG	2	6	27920	27925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017507	ATC	2	6	28844	28849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017507	TGA	2	6	29426	29431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017507	TTG	2	6	33688	33693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017507	ACT	2	6	33695	33700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017507	GTT	2	6	33704	33709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017507	TTA	2	6	33728	33733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017507	ATT	2	6	34715	34720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017507	CTG	2	6	34741	34746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017507	GAT	2	6	34821	34826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017507	ATT	2	6	34835	34840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017507	TCG	2	6	35732	35737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017507	GAC	2	6	35819	35824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017507	TTG	2	6	41093	41098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017507	CAA	2	6	42208	42213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017507	AGA	2	6	42378	42383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017507	AAC	2	6	42751	42756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017507	GTG	2	6	44562	44567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017507	TGG	2	6	44850	44855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017507	AGA	2	6	44936	44941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017507	TCA	2	6	44966	44971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017507	TCT	2	6	45056	45061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017507	GGT	2	6	45145	45150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017507	GCG	2	6	45217	45222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017507	AAC	2	6	52510	52515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017507	ACG	2	6	60961	60966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017507	AGT	2	6	64233	64238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017507	GGC	2	6	64288	64293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017507	TAA	3	9	64321	64329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017507	TGC	2	6	65525	65530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017507	TGT	2	6	65550	65555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017507	CTC	2	6	65591	65596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017507	CGC	2	6	65667	65672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017507	TCT	2	6	65679	65684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017507	ACT	2	6	65737	65742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017507	ATC	2	6	67747	67752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017507	TGA	2	6	67788	67793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017507	TCG	2	6	67848	67853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017507	GAC	2	6	67860	67865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017507	TGA	2	6	68365	68370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017507	TTG	2	6	68394	68399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017507	TGT	2	6	69837	69842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017507	CGG	2	6	69874	69879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017507	GGT	2	6	70573	70578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017507	CGA	2	6	70658	70663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017507	AGG	2	6	72098	72103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017507	TAA	2	6	75386	75391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017507	GGT	2	6	75402	75407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017507	TCG	2	6	75444	75449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017507	TAG	2	6	75456	75461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017507	GAA	2	6	75640	75645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017507	AAC	2	6	75674	75679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017507	AAC	2	6	75698	75703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017507	TGC	2	6	75728	75733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017507	GTG	2	6	79419	79424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017507	TTG	2	6	79555	79560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017507	GCA	2	6	79609	79614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017507	TCG	2	6	82496	82501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017507	ATG	2	6	82552	82557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017507	GCG	2	6	83891	83896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017507	AAG	2	6	83990	83995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017507	GCT	2	6	85424	85429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017507	CCG	2	6	85486	85491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017507	TGA	2	6	86043	86048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017507	GAC	2	6	86056	86061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017507	CTG	2	6	86143	86148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017507	ATC	2	6	89288	89293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017507	TGT	2	6	89788	89793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017507	AAT	2	6	89885	89890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017507	ATA	2	6	89904	89909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017507	CAT	2	6	89938	89943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017507	CAC	2	6	91126	91131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017507	ATA	2	6	92835	92840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017507	GGT	2	6	92981	92986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017507	GAG	2	6	94358	94363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017507	ATT	2	6	94395	94400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017507	GTT	3	9	94502	94510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017507	TCA	2	6	98046	98051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017507	GAC	2	6	98118	98123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017507	TCG	2	6	98762	98767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017507	GCT	2	6	98806	98811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017507	GTA	3	9	99599	99607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_017507	TAA	2	6	169180	169185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017507	CAA	2	6	169263	169268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_017507	TGA	2	6	169303	169308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_017507	TGA	2	6	169497	169502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.