MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinobacter adhaerens HP15 chromosome

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017506	TTTGGT	2	12	27720	27731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017506	TTTGTG	2	12	49919	49930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017506	ATGTCG	2	12	79016	79027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017506	CGAGGA	2	12	87862	87873	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017506	CAAATA	2	12	145981	145992	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017506	TGAAGA	2	12	198873	198884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017506	TCTACA	2	12	323881	323892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017506	CAGGGC	2	12	341688	341699	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017506	TGAAAT	2	12	358594	358605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017506	GTCTAA	2	12	368118	368129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017506	TCTAAA	2	12	384699	384710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017506	GGGGGT	2	12	399808	399819	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017506	ACCCCC	2	12	399879	399890	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_017506	GACCAA	2	12	524339	524350	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017506	TGTCCG	2	12	539749	539760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017506	TGAAAT	2	12	558736	558747	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017506	TCCGGT	2	12	594758	594769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017506	TCCAGA	2	12	682975	682986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017506	CACTGG	2	12	696531	696542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017506	GTATCC	2	12	701271	701282	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017506	TATGCG	2	12	956385	956396	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017506	ACGTAA	2	12	1017735	1017746	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017506	GGGGGT	2	12	1028829	1028840	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017506	TTTTTG	2	12	1103932	1103943	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017506	CTCTAT	2	12	1112842	1112853	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017506	GTCCTG	2	12	1127360	1127371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017506	TAACGG	2	12	1136497	1136508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017506	CTGCCC	2	12	1213881	1213892	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017506	GATCCT	2	12	1254477	1254488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017506	CGGTTG	2	12	1285155	1285166	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017506	TGAAAT	2	12	1303058	1303069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017506	GGCCAG	2	12	1350975	1350986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017506	TCAGTG	2	12	1480596	1480607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017506	AGGGGG	2	12	1512338	1512349	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017506	TTTGCC	2	12	1533357	1533368	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017506	CGACTA	2	12	1541698	1541709	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017506	GTAAAT	2	12	1588086	1588097	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017506	GGCGAC	2	12	1715568	1715579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017506	ATAGAG	2	12	1796172	1796183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017506	GTATGT	2	12	2042561	2042572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017506	TGGTAA	2	12	2054876	2054887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017506	TTCCGT	2	12	2075892	2075903	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017506	CTTAAT	2	12	2097605	2097616	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017506	GCGCCG	2	12	2200209	2200220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017506	GAGATA	2	12	2211440	2211451	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017506	ACAGCC	2	12	2246427	2246438	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017506	TTAGTA	2	12	2325628	2325639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017506	TGGAAC	2	12	2326559	2326570	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017506	ATACGA	2	12	2338419	2338430	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017506	CCGGCC	2	12	2358563	2358574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017506	GGCGCC	2	12	2376336	2376347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017506	GAAACG	2	12	2450095	2450106	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017506	ATCGGG	2	12	2455609	2455620	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017506	TTTGGT	2	12	2563764	2563775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017506	GCCGGA	2	12	2650972	2650983	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017506	GGGGTC	2	12	2744957	2744968	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017506	ACAAGA	2	12	2774031	2774042	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017506	GTCACA	2	12	3061875	3061886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017506	TTGTTT	2	12	3104367	3104378	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017506	TTCGTT	2	12	3149235	3149246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017506	CAAAAA	2	12	3223200	3223211	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017506	CGACTC	2	12	3336570	3336581	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017506	ATGAAA	2	12	3506691	3506702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017506	GACAAT	2	12	3508531	3508542	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017506	CCAATG	2	12	3513620	3513631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017506	AGAAAC	2	12	3535421	3535432	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017506	CAATGA	2	12	3546954	3546965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017506	GCGCTG	2	12	3719522	3719533	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017506	CGCCCC	2	12	3723307	3723318	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
70	NC_017506	CGGCAT	2	12	3795750	3795761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017506	CAGAAA	2	12	3802744	3802755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017506	CGAAAC	2	12	3804411	3804422	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017506	TTCGTC	2	12	3837310	3837321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017506	GATAAT	2	12	3874989	3875000	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017506	GCAGAA	2	12	3904773	3904784	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017506	AATAAC	2	12	3956954	3956965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017506	CACACC	2	12	3981932	3981943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017506	ATCGGG	2	12	4118106	4118117	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017506	CTTCCG	2	12	4129790	4129801	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017506	CCGAAC	2	12	4134554	4134565	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017506	TTAGCT	2	12	4145584	4145595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017506	TCCTAT	2	12	4157349	4157360	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017506	GGCGCC	2	12	4215036	4215047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017506	TGGGGT	2	12	4262096	4262107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017506	TTGATA	2	12	4290762	4290773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017506	AATACC	2	12	4320401	4320412	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017506	CGTATA	2	12	4359681	4359692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017506	GGTCTG	2	12	4399823	4399834	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.