MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis alpha710 chromosome

Total Repeats: 1630

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017505	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385327374
2	NC_017505	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385327375
3	NC_017505	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385327375
4	NC_017505	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385327377
5	NC_017505	CCAGC	2	10	4773	4782	20 %	0 %	20 %	60 %	385327380
6	NC_017505	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385327382
7	NC_017505	GCTTT	2	10	6442	6451	0 %	60 %	20 %	20 %	385327383
8	NC_017505	GGTGC	2	10	8363	8372	0 %	20 %	60 %	20 %	385327384
9	NC_017505	CAATC	2	10	9037	9046	40 %	20 %	0 %	40 %	385327385
10	NC_017505	TCAAT	2	10	10555	10564	40 %	40 %	0 %	20 %	385327386
11	NC_017505	CGCGC	2	10	11568	11577	0 %	0 %	40 %	60 %	385327387
12	NC_017505	CCCGT	2	10	11589	11598	0 %	20 %	20 %	60 %	385327387
13	NC_017505	CACGC	2	10	11884	11893	20 %	0 %	20 %	60 %	385327388
14	NC_017505	TCCCG	2	10	12738	12747	0 %	20 %	20 %	60 %	385327388
15	NC_017505	CGCGC	2	10	14112	14121	0 %	0 %	40 %	60 %	385327389
16	NC_017505	TGTCG	2	10	14194	14203	0 %	40 %	40 %	20 %	385327389
17	NC_017505	ATTTA	2	10	14541	14550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017505	CTTGC	2	10	17285	17294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017505	GGAAA	2	10	17915	17924	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017505	AATTT	2	10	18293	18302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017505	ATTTC	2	10	18861	18870	20 %	60 %	0 %	20 %	385327392
22	NC_017505	CCGCT	2	10	20945	20954	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017505	ATTTC	2	10	21215	21224	20 %	60 %	0 %	20 %	385327395
24	NC_017505	ATTTC	2	10	21818	21827	20 %	60 %	0 %	20 %	385327396
25	NC_017505	AGGGC	2	10	26821	26830	20 %	0 %	60 %	20 %	385327402
26	NC_017505	GGCGC	2	10	27101	27110	0 %	0 %	60 %	40 %	385327403
27	NC_017505	TCCGC	2	10	30822	30831	0 %	20 %	20 %	60 %	385327405
28	NC_017505	GCCTT	2	10	33657	33666	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017505	GCAGG	2	10	33743	33752	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017505	CATTC	2	10	35408	35417	20 %	40 %	0 %	40 %	385327409
31	NC_017505	AGGTG	2	10	35856	35865	20 %	20 %	60 %	0 %	385327410
32	NC_017505	GGGCT	2	10	38519	38528	0 %	20 %	60 %	20 %	385327412
33	NC_017505	GGCGG	2	10	42018	42027	0 %	0 %	80 %	20 %	385327415
34	NC_017505	GCGGT	2	10	42493	42502	0 %	20 %	60 %	20 %	385327416
35	NC_017505	GCGCG	2	10	42890	42899	0 %	0 %	60 %	40 %	385327416
36	NC_017505	ACGGC	2	10	43435	43444	20 %	0 %	40 %	40 %	385327416
37	NC_017505	CCCGT	2	10	44268	44277	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_017505	CGGCG	2	10	44601	44610	0 %	0 %	60 %	40 %	385327418
39	NC_017505	GAAAA	2	10	45480	45489	80 %	0 %	20 %	0 %	385327418
40	NC_017505	GGGCA	2	10	46816	46825	20 %	0 %	60 %	20 %	385327418
41	NC_017505	GAAAA	2	10	47257	47266	80 %	0 %	20 %	0 %	385327418
42	NC_017505	CAATT	2	10	47601	47610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017505	AAACC	2	10	51472	51481	60 %	0 %	0 %	40 %	385327420
44	NC_017505	CCCGC	2	10	51969	51978	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
45	NC_017505	GTGCG	2	10	53823	53832	0 %	20 %	60 %	20 %	385327422
46	NC_017505	GTAGC	2	10	56998	57007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017505	TCGTG	2	10	57215	57224	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017505	AGAAA	2	10	58177	58186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017505	GGGAG	2	10	58843	58852	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017505	AGGTT	2	10	59785	59794	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017505	AAGGG	2	10	61966	61975	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017505	ACGGC	2	10	62662	62671	20 %	0 %	40 %	40 %	385327428
53	NC_017505	TGCCG	2	10	65144	65153	0 %	20 %	40 %	40 %	385327430
54	NC_017505	TGGCT	2	10	65473	65482	0 %	40 %	40 %	20 %	385327430
55	NC_017505	TGCCC	2	10	66080	66089	0 %	20 %	20 %	60 %	385327430
56	NC_017505	TCTTT	2	10	67973	67982	0 %	80 %	0 %	20 %	385327432
57	NC_017505	GCGTA	2	10	68199	68208	20 %	20 %	40 %	20 %	385327433
58	NC_017505	AATGG	2	10	69379	69388	40 %	20 %	40 %	0 %	385327434
59	NC_017505	GGGTA	2	10	69563	69572	20 %	20 %	60 %	0 %	385327434
60	NC_017505	TCGGC	2	10	69956	69965	0 %	20 %	40 %	40 %	385327434
61	NC_017505	TGCTA	2	10	71365	71374	20 %	40 %	20 %	20 %	385327435
62	NC_017505	AGGCC	2	10	72576	72585	20 %	0 %	40 %	40 %	385327436
63	NC_017505	AAGCA	2	10	74151	74160	60 %	0 %	20 %	20 %	385327437
64	NC_017505	TTTAA	2	10	74401	74410	40 %	60 %	0 %	0 %	385327437
65	NC_017505	GATTT	2	10	76314	76323	20 %	60 %	20 %	0 %	385327439
66	NC_017505	TGTAT	2	10	77708	77717	20 %	60 %	20 %	0 %	385327440
67	NC_017505	AAAAG	2	10	77892	77901	80 %	0 %	20 %	0 %	385327441
68	NC_017505	GTTTG	2	10	78220	78229	0 %	60 %	40 %	0 %	385327441
69	NC_017505	TTTGA	2	10	78515	78524	20 %	60 %	20 %	0 %	385327441
70	NC_017505	TGGCT	2	10	79448	79457	0 %	40 %	40 %	20 %	385327442
71	NC_017505	GCGCG	2	10	81788	81797	0 %	0 %	60 %	40 %	385327444
72	NC_017505	CAACG	2	10	82710	82719	40 %	0 %	20 %	40 %	385327444
73	NC_017505	TTGAT	2	10	83023	83032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017505	TTTCC	2	10	83344	83353	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017505	ATTTT	2	10	83693	83702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017505	GCACG	2	10	85282	85291	20 %	0 %	40 %	40 %	385327446
77	NC_017505	GTTGG	2	10	85792	85801	0 %	40 %	60 %	0 %	385327446
78	NC_017505	ATATT	2	10	87729	87738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017505	TTGAT	2	10	88129	88138	20 %	60 %	20 %	0 %	385327449
80	NC_017505	GTTTG	2	10	88526	88535	0 %	60 %	40 %	0 %	385327449
81	NC_017505	CCCGT	2	10	89066	89075	0 %	20 %	20 %	60 %	385327449
82	NC_017505	CCGTA	2	10	89303	89312	20 %	20 %	20 %	40 %	385327449
83	NC_017505	ACATC	2	10	90204	90213	40 %	20 %	0 %	40 %	385327450
84	NC_017505	GGCAA	2	10	91459	91468	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017505	CGCAA	2	10	91913	91922	40 %	0 %	20 %	40 %	385327451
86	NC_017505	AAAAC	2	10	96516	96525	80 %	0 %	0 %	20 %	385327456
87	NC_017505	TTTGA	2	10	98842	98851	20 %	60 %	20 %	0 %	385327457
88	NC_017505	AAACC	2	10	100566	100575	60 %	0 %	0 %	40 %	385327459
89	NC_017505	ACCAA	2	10	102307	102316	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017505	ATTTA	2	10	103148	103157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017505	AAATA	2	10	103158	103167	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017505	ATTAA	2	10	103182	103191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017505	CAGGT	2	10	104761	104770	20 %	20 %	40 %	20 %	385327464
94	NC_017505	TTTGA	2	10	105471	105480	20 %	60 %	20 %	0 %	385327464
95	NC_017505	AATGA	2	10	106178	106187	60 %	20 %	20 %	0 %	385327465
96	NC_017505	GAACA	2	10	108063	108072	60 %	0 %	20 %	20 %	385327465
97	NC_017505	CGTGC	2	10	109367	109376	0 %	20 %	40 %	40 %	385327467
98	NC_017505	GCCGC	2	10	110527	110536	0 %	0 %	40 %	60 %	385327468
99	NC_017505	AATTG	2	10	111311	111320	40 %	40 %	20 %	0 %	385327469
100	NC_017505	AAAAT	2	10	111572	111581	80 %	20 %	0 %	0 %	385327469
101	NC_017505	CGGCG	2	10	113411	113420	0 %	0 %	60 %	40 %	385327472
102	NC_017505	CAGGT	2	10	114877	114886	20 %	20 %	40 %	20 %	385327474
103	NC_017505	CGCCT	2	10	115563	115572	0 %	20 %	20 %	60 %	385327475
104	NC_017505	GGTAT	2	10	115803	115812	20 %	40 %	40 %	0 %	385327475
105	NC_017505	GGCGC	2	10	116054	116063	0 %	0 %	60 %	40 %	385327475
106	NC_017505	TGCCG	2	10	117177	117186	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017505	CCGCC	2	10	117387	117396	0 %	0 %	20 %	80 %	385327477
108	NC_017505	TGGCG	2	10	117599	117608	0 %	20 %	60 %	20 %	385327477
109	NC_017505	CAAAG	2	10	117809	117818	60 %	0 %	20 %	20 %	385327477
110	NC_017505	GCGCC	2	10	119016	119025	0 %	0 %	40 %	60 %	385327478
111	NC_017505	GGCGC	2	10	119245	119254	0 %	0 %	60 %	40 %	385327478
112	NC_017505	TGAGT	2	10	120862	120871	20 %	40 %	40 %	0 %	385327480
113	NC_017505	CGGCG	2	10	121366	121375	0 %	0 %	60 %	40 %	385327480
114	NC_017505	GGCAA	2	10	121439	121448	40 %	0 %	40 %	20 %	385327480
115	NC_017505	GTTTT	2	10	123879	123888	0 %	80 %	20 %	0 %	385327482
116	NC_017505	CGTGT	2	10	125643	125652	0 %	40 %	40 %	20 %	385327484
117	NC_017505	GAAAA	2	10	126057	126066	80 %	0 %	20 %	0 %	385327484
118	NC_017505	AGGGC	2	10	126194	126203	20 %	0 %	60 %	20 %	385327484
119	NC_017505	TGATT	2	10	129101	129110	20 %	60 %	20 %	0 %	385327486
120	NC_017505	AATTC	2	10	129176	129185	40 %	40 %	0 %	20 %	385327486
121	NC_017505	GAAGG	2	10	132959	132968	40 %	0 %	60 %	0 %	385327491
122	NC_017505	GTACC	2	10	134530	134539	20 %	20 %	20 %	40 %	385327494
123	NC_017505	TTGGG	2	10	139560	139569	0 %	40 %	60 %	0 %	385327497
124	NC_017505	CATAC	2	10	142036	142045	40 %	20 %	0 %	40 %	385327498
125	NC_017505	GTGAT	2	10	142915	142924	20 %	40 %	40 %	0 %	385327498
126	NC_017505	CCTGC	2	10	148266	148275	0 %	20 %	20 %	60 %	385327503
127	NC_017505	CTTTA	2	10	150823	150832	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017505	TGATT	2	10	153617	153626	20 %	60 %	20 %	0 %	385327511
129	NC_017505	AATGC	2	10	154311	154320	40 %	20 %	20 %	20 %	385327512
130	NC_017505	GTAAA	2	10	155262	155271	60 %	20 %	20 %	0 %	385327515
131	NC_017505	AATTT	2	10	155486	155495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017505	TCAAA	2	10	156335	156344	60 %	20 %	0 %	20 %	385327517
133	NC_017505	TTTGG	2	10	157146	157155	0 %	60 %	40 %	0 %	385327519
134	NC_017505	GAAAT	2	10	160992	161001	60 %	20 %	20 %	0 %	385327526
135	NC_017505	AAAAT	2	10	161254	161263	80 %	20 %	0 %	0 %	385327528
136	NC_017505	GGGTT	2	10	162741	162750	0 %	40 %	60 %	0 %	385327531
137	NC_017505	GTCAT	2	10	163263	163272	20 %	40 %	20 %	20 %	385327532
138	NC_017505	GGTAT	2	10	164629	164638	20 %	40 %	40 %	0 %	385327534
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146	NC_017505	TGGTT	2	10	173223	173232	0 %	60 %	40 %	0 %	385327542
147	NC_017505	TGCCG	2	10	173929	173938	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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243	NC_017505	AAATA	2	10	319251	319260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_017505	AGGCG	2	10	337443	337452	20 %	0 %	60 %	20 %	385327683
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266	NC_017505	CAAAA	2	10	341980	341989	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017505	GTGCG	2	10	347050	347059	0 %	20 %	60 %	20 %	385327692
268	NC_017505	ACAGG	2	10	349734	349743	40 %	0 %	40 %	20 %	385327696
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271	NC_017505	GTTTT	2	10	354123	354132	0 %	80 %	20 %	0 %	385327699
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285	NC_017505	TATTT	2	10	380352	380361	20 %	80 %	0 %	0 %	385327731
286	NC_017505	TCTGT	2	10	381931	381940	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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352	NC_017505	TACAG	2	10	467187	467196	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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381	NC_017505	GTTTT	2	10	503554	503563	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_017505	TAAAT	2	10	534188	534197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_017505	GTTAT	2	10	537207	537216	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
401	NC_017505	AATTT	2	10	537494	537503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_017505	AGCGG	2	10	537867	537876	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
403	NC_017505	AAGAA	2	10	540733	540742	80 %	0 %	20 %	0 %	385327852
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