MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha710 chromosome

Total Repeats: 1261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017505	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385327374
2	NC_017505	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385327375
3	NC_017505	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385327375
4	NC_017505	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385327377
5	NC_017505	CCAGC	2	10	4773	4782	20 %	0 %	20 %	60 %	385327380
6	NC_017505	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385327382
7	NC_017505	GCTTT	2	10	6442	6451	0 %	60 %	20 %	20 %	385327383
8	NC_017505	GGTGC	2	10	8363	8372	0 %	20 %	60 %	20 %	385327384
9	NC_017505	CAATC	2	10	9037	9046	40 %	20 %	0 %	40 %	385327385
10	NC_017505	TCAAT	2	10	10555	10564	40 %	40 %	0 %	20 %	385327386
11	NC_017505	CGCGC	2	10	11568	11577	0 %	0 %	40 %	60 %	385327387
12	NC_017505	CCCGT	2	10	11589	11598	0 %	20 %	20 %	60 %	385327387
13	NC_017505	CACGC	2	10	11884	11893	20 %	0 %	20 %	60 %	385327388
14	NC_017505	TCCCG	2	10	12738	12747	0 %	20 %	20 %	60 %	385327388
15	NC_017505	CGCGC	2	10	14112	14121	0 %	0 %	40 %	60 %	385327389
16	NC_017505	TGTCG	2	10	14194	14203	0 %	40 %	40 %	20 %	385327389
17	NC_017505	ATTTC	2	10	18861	18870	20 %	60 %	0 %	20 %	385327392
18	NC_017505	ATTTC	2	10	21215	21224	20 %	60 %	0 %	20 %	385327395
19	NC_017505	ATTTC	2	10	21818	21827	20 %	60 %	0 %	20 %	385327396
20	NC_017505	AGGGC	2	10	26821	26830	20 %	0 %	60 %	20 %	385327402
21	NC_017505	GGCGC	2	10	27101	27110	0 %	0 %	60 %	40 %	385327403
22	NC_017505	TCCGC	2	10	30822	30831	0 %	20 %	20 %	60 %	385327405
23	NC_017505	CATTC	2	10	35408	35417	20 %	40 %	0 %	40 %	385327409
24	NC_017505	AGGTG	2	10	35856	35865	20 %	20 %	60 %	0 %	385327410
25	NC_017505	GGGCT	2	10	38519	38528	0 %	20 %	60 %	20 %	385327412
26	NC_017505	GGCGG	2	10	42018	42027	0 %	0 %	80 %	20 %	385327415
27	NC_017505	GCGGT	2	10	42493	42502	0 %	20 %	60 %	20 %	385327416
28	NC_017505	GCGCG	2	10	42890	42899	0 %	0 %	60 %	40 %	385327416
29	NC_017505	ACGGC	2	10	43435	43444	20 %	0 %	40 %	40 %	385327416
30	NC_017505	CGGCG	2	10	44601	44610	0 %	0 %	60 %	40 %	385327418
31	NC_017505	GAAAA	2	10	45480	45489	80 %	0 %	20 %	0 %	385327418
32	NC_017505	GGGCA	2	10	46816	46825	20 %	0 %	60 %	20 %	385327418
33	NC_017505	GAAAA	2	10	47257	47266	80 %	0 %	20 %	0 %	385327418
34	NC_017505	AAACC	2	10	51472	51481	60 %	0 %	0 %	40 %	385327420
35	NC_017505	GTGCG	2	10	53823	53832	0 %	20 %	60 %	20 %	385327422
36	NC_017505	ACGGC	2	10	62662	62671	20 %	0 %	40 %	40 %	385327428
37	NC_017505	TGCCG	2	10	65144	65153	0 %	20 %	40 %	40 %	385327430
38	NC_017505	TGGCT	2	10	65473	65482	0 %	40 %	40 %	20 %	385327430
39	NC_017505	TGCCC	2	10	66080	66089	0 %	20 %	20 %	60 %	385327430
40	NC_017505	TCTTT	2	10	67973	67982	0 %	80 %	0 %	20 %	385327432
41	NC_017505	GCGTA	2	10	68199	68208	20 %	20 %	40 %	20 %	385327433
42	NC_017505	AATGG	2	10	69379	69388	40 %	20 %	40 %	0 %	385327434
43	NC_017505	GGGTA	2	10	69563	69572	20 %	20 %	60 %	0 %	385327434
44	NC_017505	TCGGC	2	10	69956	69965	0 %	20 %	40 %	40 %	385327434
45	NC_017505	TGCTA	2	10	71365	71374	20 %	40 %	20 %	20 %	385327435
46	NC_017505	AGGCC	2	10	72576	72585	20 %	0 %	40 %	40 %	385327436
47	NC_017505	AAGCA	2	10	74151	74160	60 %	0 %	20 %	20 %	385327437
48	NC_017505	TTTAA	2	10	74401	74410	40 %	60 %	0 %	0 %	385327437
49	NC_017505	GATTT	2	10	76314	76323	20 %	60 %	20 %	0 %	385327439
50	NC_017505	TGTAT	2	10	77708	77717	20 %	60 %	20 %	0 %	385327440
51	NC_017505	AAAAG	2	10	77892	77901	80 %	0 %	20 %	0 %	385327441
52	NC_017505	GTTTG	2	10	78220	78229	0 %	60 %	40 %	0 %	385327441
53	NC_017505	TTTGA	2	10	78515	78524	20 %	60 %	20 %	0 %	385327441
54	NC_017505	TGGCT	2	10	79448	79457	0 %	40 %	40 %	20 %	385327442
55	NC_017505	GCGCG	2	10	81788	81797	0 %	0 %	60 %	40 %	385327444
56	NC_017505	CAACG	2	10	82710	82719	40 %	0 %	20 %	40 %	385327444
57	NC_017505	GCACG	2	10	85282	85291	20 %	0 %	40 %	40 %	385327446
58	NC_017505	GTTGG	2	10	85792	85801	0 %	40 %	60 %	0 %	385327446
59	NC_017505	TTGAT	2	10	88129	88138	20 %	60 %	20 %	0 %	385327449
60	NC_017505	GTTTG	2	10	88526	88535	0 %	60 %	40 %	0 %	385327449
61	NC_017505	CCCGT	2	10	89066	89075	0 %	20 %	20 %	60 %	385327449
62	NC_017505	CCGTA	2	10	89303	89312	20 %	20 %	20 %	40 %	385327449
63	NC_017505	ACATC	2	10	90204	90213	40 %	20 %	0 %	40 %	385327450
64	NC_017505	CGCAA	2	10	91913	91922	40 %	0 %	20 %	40 %	385327451
65	NC_017505	AAAAC	2	10	96516	96525	80 %	0 %	0 %	20 %	385327456
66	NC_017505	TTTGA	2	10	98842	98851	20 %	60 %	20 %	0 %	385327457
67	NC_017505	AAACC	2	10	100566	100575	60 %	0 %	0 %	40 %	385327459
68	NC_017505	CAGGT	2	10	104761	104770	20 %	20 %	40 %	20 %	385327464
69	NC_017505	TTTGA	2	10	105471	105480	20 %	60 %	20 %	0 %	385327464
70	NC_017505	AATGA	2	10	106178	106187	60 %	20 %	20 %	0 %	385327465
71	NC_017505	GAACA	2	10	108063	108072	60 %	0 %	20 %	20 %	385327465
72	NC_017505	CGTGC	2	10	109367	109376	0 %	20 %	40 %	40 %	385327467
73	NC_017505	GCCGC	2	10	110527	110536	0 %	0 %	40 %	60 %	385327468
74	NC_017505	AATTG	2	10	111311	111320	40 %	40 %	20 %	0 %	385327469
75	NC_017505	AAAAT	2	10	111572	111581	80 %	20 %	0 %	0 %	385327469
76	NC_017505	CGGCG	2	10	113411	113420	0 %	0 %	60 %	40 %	385327472
77	NC_017505	CAGGT	2	10	114877	114886	20 %	20 %	40 %	20 %	385327474
78	NC_017505	CGCCT	2	10	115563	115572	0 %	20 %	20 %	60 %	385327475
79	NC_017505	GGTAT	2	10	115803	115812	20 %	40 %	40 %	0 %	385327475
80	NC_017505	GGCGC	2	10	116054	116063	0 %	0 %	60 %	40 %	385327475
81	NC_017505	CCGCC	2	10	117387	117396	0 %	0 %	20 %	80 %	385327477
82	NC_017505	TGGCG	2	10	117599	117608	0 %	20 %	60 %	20 %	385327477
83	NC_017505	CAAAG	2	10	117809	117818	60 %	0 %	20 %	20 %	385327477
84	NC_017505	GCGCC	2	10	119016	119025	0 %	0 %	40 %	60 %	385327478
85	NC_017505	GGCGC	2	10	119245	119254	0 %	0 %	60 %	40 %	385327478
86	NC_017505	TGAGT	2	10	120862	120871	20 %	40 %	40 %	0 %	385327480
87	NC_017505	CGGCG	2	10	121366	121375	0 %	0 %	60 %	40 %	385327480
88	NC_017505	GGCAA	2	10	121439	121448	40 %	0 %	40 %	20 %	385327480
89	NC_017505	GTTTT	2	10	123879	123888	0 %	80 %	20 %	0 %	385327482
90	NC_017505	CGTGT	2	10	125643	125652	0 %	40 %	40 %	20 %	385327484
91	NC_017505	GAAAA	2	10	126057	126066	80 %	0 %	20 %	0 %	385327484
92	NC_017505	AGGGC	2	10	126194	126203	20 %	0 %	60 %	20 %	385327484
93	NC_017505	TGATT	2	10	129101	129110	20 %	60 %	20 %	0 %	385327486
94	NC_017505	AATTC	2	10	129176	129185	40 %	40 %	0 %	20 %	385327486
95	NC_017505	GAAGG	2	10	132959	132968	40 %	0 %	60 %	0 %	385327491
96	NC_017505	GTACC	2	10	134530	134539	20 %	20 %	20 %	40 %	385327494
97	NC_017505	TTGGG	2	10	139560	139569	0 %	40 %	60 %	0 %	385327497
98	NC_017505	CATAC	2	10	142036	142045	40 %	20 %	0 %	40 %	385327498
99	NC_017505	GTGAT	2	10	142915	142924	20 %	40 %	40 %	0 %	385327498
100	NC_017505	CCTGC	2	10	148266	148275	0 %	20 %	20 %	60 %	385327503
101	NC_017505	TGATT	2	10	153617	153626	20 %	60 %	20 %	0 %	385327511
102	NC_017505	AATGC	2	10	154311	154320	40 %	20 %	20 %	20 %	385327512
103	NC_017505	GTAAA	2	10	155262	155271	60 %	20 %	20 %	0 %	385327515
104	NC_017505	TCAAA	2	10	156335	156344	60 %	20 %	0 %	20 %	385327517
105	NC_017505	TTTGG	2	10	157146	157155	0 %	60 %	40 %	0 %	385327519
106	NC_017505	GAAAT	2	10	160992	161001	60 %	20 %	20 %	0 %	385327526
107	NC_017505	AAAAT	2	10	161254	161263	80 %	20 %	0 %	0 %	385327528
108	NC_017505	GGGTT	2	10	162741	162750	0 %	40 %	60 %	0 %	385327531
109	NC_017505	GTCAT	2	10	163263	163272	20 %	40 %	20 %	20 %	385327532
110	NC_017505	GGTAT	2	10	164629	164638	20 %	40 %	40 %	0 %	385327534
111	NC_017505	GCAAA	2	10	165636	165645	60 %	0 %	20 %	20 %	385327535
112	NC_017505	CGGTT	2	10	165666	165675	0 %	40 %	40 %	20 %	385327535
113	NC_017505	CAAAC	2	10	168368	168377	60 %	0 %	0 %	40 %	385327539
114	NC_017505	TGGTT	2	10	171378	171387	0 %	60 %	40 %	0 %	385327540
115	NC_017505	CGGCG	2	10	171931	171940	0 %	0 %	60 %	40 %	385327541
116	NC_017505	CCAAA	2	10	172320	172329	60 %	0 %	0 %	40 %	385327541
117	NC_017505	TGGTT	2	10	173223	173232	0 %	60 %	40 %	0 %	385327542
118	NC_017505	GCCGC	2	10	174323	174332	0 %	0 %	40 %	60 %	385327543
119	NC_017505	CGGCG	2	10	175940	175949	0 %	0 %	60 %	40 %	385327544
120	NC_017505	CTCGG	2	10	181141	181150	0 %	20 %	40 %	40 %	385327548
121	NC_017505	GCCGT	2	10	183643	183652	0 %	20 %	40 %	40 %	385327550
122	NC_017505	CAGAC	2	10	184298	184307	40 %	0 %	20 %	40 %	385327551
123	NC_017505	ACCAA	2	10	184485	184494	60 %	0 %	0 %	40 %	385327551
124	NC_017505	TGCCG	2	10	187059	187068	0 %	20 %	40 %	40 %	385327554
125	NC_017505	GTTGC	2	10	187374	187383	0 %	40 %	40 %	20 %	385327554
126	NC_017505	CCTGC	2	10	195457	195466	0 %	20 %	20 %	60 %	385327562
127	NC_017505	GCGCC	2	10	199562	199571	0 %	0 %	40 %	60 %	385327564
128	NC_017505	TGCGT	2	10	199873	199882	0 %	40 %	40 %	20 %	385327564
129	NC_017505	GCGCC	2	10	200777	200786	0 %	0 %	40 %	60 %	385327565
130	NC_017505	AAATT	2	10	203597	203606	60 %	40 %	0 %	0 %	385327568
131	NC_017505	GCCGT	2	10	206561	206570	0 %	20 %	40 %	40 %	385327573
132	NC_017505	GCCGT	2	10	206690	206699	0 %	20 %	40 %	40 %	385327573
133	NC_017505	TGTCG	2	10	207264	207273	0 %	40 %	40 %	20 %	385327574
134	NC_017505	GGCAG	2	10	208798	208807	20 %	0 %	60 %	20 %	385327575
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261	NC_017505	ATTTG	2	10	446707	446716	20 %	60 %	20 %	0 %	385327783
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