MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma pneumoniae FH chromosome

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017504	GACTTT	2	12	2125	2136	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326616
2	NC_017504	AAACGG	2	12	9788	9799	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385326620
3	NC_017504	TGGTAA	2	12	14290	14301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017504	AAAGAC	2	12	15104	15115	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385326626
5	NC_017504	TATTTT	2	12	15805	15816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017504	TAATTG	2	12	17483	17494	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326629
7	NC_017504	AAGGAA	2	12	23971	23982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385326633
8	NC_017504	AGGGTG	2	12	26264	26275	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385326634
9	NC_017504	TTGGGC	2	12	27728	27739	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385326635
10	NC_017504	GGACAA	2	12	29232	29243	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385326636
11	NC_017504	ATTTAC	2	12	33770	33781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326641
12	NC_017504	ATTAAG	2	12	33939	33950	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385326641
13	NC_017504	GTTTTA	2	12	37702	37713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385326647
14	NC_017504	TTTCGG	2	12	41092	41103	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385326647
15	NC_017504	ATACTG	2	12	41473	41484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326648
16	NC_017504	TTACAA	2	12	42036	42047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385326648
17	NC_017504	ACTTTA	2	12	44242	44253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326649
18	NC_017504	CTTAAA	2	12	44435	44446	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385326649
19	NC_017504	AAGTTT	2	12	45198	45209	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326649
20	NC_017504	TACTTT	2	12	46406	46417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017504	AAAAAT	2	12	47061	47072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017504	GGTTAT	2	12	50702	50713	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326654
23	NC_017504	TAACTG	2	12	52446	52457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326656
24	NC_017504	TGCGTT	2	12	54626	54637	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385326658
25	NC_017504	ATTTGA	2	12	61122	61133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326660
26	NC_017504	TTTTAA	2	12	61937	61948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017504	TCTTAA	2	12	69073	69084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017504	ACCATT	2	12	79173	79184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326676
29	NC_017504	ACCAAC	2	12	82427	82438	50 %	0 %	0 %	50 %	385326680
30	NC_017504	ATGCCA	2	12	85489	85500	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385326683
31	NC_017504	CCTTAA	2	12	85650	85661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326684
32	NC_017504	AATCAC	2	12	85744	85755	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385326684
33	NC_017504	TTTACT	2	12	86499	86510	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385326685
34	NC_017504	ACTTTA	2	12	89120	89131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326687
35	NC_017504	AATTGC	2	12	94159	94170	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326690
36	NC_017504	ACATTG	2	12	94383	94394	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326690
37	NC_017504	CGGGAG	2	12	95971	95982	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385326691
38	NC_017504	CCCAAA	2	12	97263	97274	50 %	0 %	0 %	50 %	385326693
39	NC_017504	ACTTTG	2	12	99189	99200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326693
40	NC_017504	AATCAG	2	12	99203	99214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326693
41	NC_017504	GATTAA	2	12	99370	99381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385326693
42	NC_017504	CAAAAT	2	12	100507	100518	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385326693
43	NC_017504	CCAAGC	2	12	100638	100649	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385326694
44	NC_017504	TTTGGA	2	12	101739	101750	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326694
45	NC_017504	GGTGAT	2	12	102405	102416	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385326695
46	NC_017504	AAATTT	2	12	107184	107195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017504	TAAATA	2	12	110422	110433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017504	TTAAAT	2	12	113320	113331	50 %	50 %	0 %	0 %	385326702
49	NC_017504	AAGCAG	2	12	115027	115038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017504	TTAACT	2	12	115540	115551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017504	GGCGAA	2	12	119013	119024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017504	TTATGC	2	12	126247	126258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326707
53	NC_017504	AAAACA	2	12	126443	126454	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385326707
54	NC_017504	ACGGGC	2	12	127803	127814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017504	CCCAGC	2	12	128918	128929	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017504	CAAGCT	2	12	129373	129384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385326709
57	NC_017504	GGAAGG	2	12	132446	132457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017504	TTCCAC	2	12	132855	132866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017504	AAACCA	2	12	134255	134266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385326711
60	NC_017504	AAAATA	2	12	134879	134890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017504	AAGTTA	2	12	142203	142214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017504	CAAGAA	2	12	143210	143221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017504	AGGTAA	2	12	143236	143247	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017504	AAGCAT	2	12	143426	143437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017504	ACAAAC	2	12	143845	143856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017504	AAGATG	2	12	144060	144071	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017504	AAAAGC	2	12	144280	144291	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017504	CAACTT	2	12	144444	144455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017504	AGAAAA	2	12	144655	144666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017504	GAACCA	2	12	153484	153495	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385326720
71	NC_017504	CTTTAG	2	12	158407	158418	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326724
72	NC_017504	CAAAAC	2	12	160567	160578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385326724
73	NC_017504	GTCACA	2	12	163908	163919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385326726
74	NC_017504	GTTTTC	2	12	164268	164279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017504	CACCGC	2	12	165806	165817	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017504	GGCAGT	2	12	166059	166070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017504	ATCTGG	2	12	166550	166561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017504	CACCCC	2	12	166800	166811	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_017504	CCCAAC	2	12	170807	170818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017504	CTAATA	2	12	171017	171028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017504	GCTAAC	2	12	171114	171125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017504	TTAAAC	2	12	178281	178292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017504	CACCGC	2	12	179346	179357	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385326742
84	NC_017504	GGCAGT	2	12	179599	179610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385326742
85	NC_017504	TGAAGG	2	12	180011	180022	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385326742
86	NC_017504	AGTTCC	2	12	180079	180090	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385326742
87	NC_017504	TCCACC	2	12	180100	180111	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385326742
88	NC_017504	CACCCC	2	12	180351	180362	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	385326742
89	NC_017504	TACCAT	2	12	181077	181088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326742
90	NC_017504	CAGCTT	2	12	182646	182657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385326742
91	NC_017504	CCCAGC	2	12	183155	183166	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385326742
92	NC_017504	CTAATA	2	12	183377	183388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385326742
93	NC_017504	CAAGGC	2	12	185208	185219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385326743
94	NC_017504	AAGCAG	2	12	185583	185594	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385326743
95	NC_017504	TTAACT	2	12	186091	186102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326743
96	NC_017504	TCTCCT	2	12	186562	186573	0 %	50 %	0 %	50 %	385326743
97	NC_017504	CCCAGC	2	12	189960	189971	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017504	CAACTA	2	12	193267	193278	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385326748
99	NC_017504	TTTTTA	2	12	194620	194631	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385326750
100	NC_017504	CAAGGC	2	12	195968	195979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017504	ACTCAA	2	12	198814	198825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385326753
102	NC_017504	CTGGTA	2	12	201577	201588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385326754
103	NC_017504	GAATTG	2	12	203640	203651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385326754
104	NC_017504	AGCTTT	2	12	203733	203744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326754
105	NC_017504	CCAACC	2	12	205429	205440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017504	CCTTAA	2	12	206163	206174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326756
107	NC_017504	AATTAA	2	12	208156	208167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385326757
108	NC_017504	GGGTTT	2	12	212394	212405	0 %	50 %	50 %	0 %	385326760
109	NC_017504	CTGATA	2	12	214503	214514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326762
110	NC_017504	CATGAT	2	12	214766	214777	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326762
111	NC_017504	GACTTT	2	12	215168	215179	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326762
112	NC_017504	AACCAA	2	12	217020	217031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385326764
113	NC_017504	TAAGGG	2	12	224226	224237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385326778
114	NC_017504	AATGCG	2	12	228731	228742	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385326785
115	NC_017504	CGTACC	2	12	229254	229265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385326787
116	NC_017504	AGTGGT	2	12	232020	232031	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385326792
117	NC_017504	TCTTTG	2	12	232898	232909	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385326793
118	NC_017504	TTTAAC	2	12	233146	233157	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326793
119	NC_017504	GCTAAT	2	12	233209	233220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326793
120	NC_017504	GTAAGT	2	12	233407	233418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385326793
121	NC_017504	TGATCA	2	12	233522	233533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326793
122	NC_017504	CAATTG	2	12	233648	233659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326793
123	NC_017504	TGTAAT	2	12	236732	236743	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326796
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125	NC_017504	TAAAAA	2	12	241878	241889	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017504	ATCTGC	2	12	241914	241925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017504	TAAAAA	2	12	243525	243536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385326797
128	NC_017504	CAGCTT	2	12	244867	244878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017504	CCCCAA	3	18	245382	245399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017504	CAAGCT	2	12	245838	245849	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385326798
131	NC_017504	GGCAGT	2	12	246842	246853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385326800
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133	NC_017504	TTTTTC	2	12	251770	251781	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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135	NC_017504	TTTCAA	2	12	252443	252454	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326803
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141	NC_017504	GTTTGG	2	12	264205	264216	0 %	50 %	50 %	0 %	385326810
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144	NC_017504	GATTGC	2	12	269838	269849	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_017504	GAAGAG	2	12	280526	280537	50 %	0 %	50 %	0 %	385326825
154	NC_017504	TTCGGG	2	12	281373	281384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385326825
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164	NC_017504	GTTAGT	2	12	298889	298900	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326841
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232	NC_017504	TTTGAT	2	12	404316	404327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385326926
233	NC_017504	TAAAAT	2	12	406108	406119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_017504	AAAATA	2	12	406497	406508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385326927
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238	NC_017504	CACCCA	2	12	415235	415246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385326935
239	NC_017504	TAAGTT	2	12	416650	416661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326937
240	NC_017504	AATCTT	2	12	416993	417004	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326938
241	NC_017504	TCAAAG	2	12	420392	420403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326940
242	NC_017504	CGTTTT	2	12	422987	422998	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385326942
243	NC_017504	TTTTGC	2	12	426160	426171	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385326944
244	NC_017504	CTTTGA	2	12	426593	426604	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326944
245	NC_017504	TTACAG	2	12	427656	427667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326945
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250	NC_017504	AAGCAG	2	12	436393	436404	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_017504	TCAAAA	2	12	438495	438506	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385326952
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254	NC_017504	GGCAGT	2	12	441525	441536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_017504	ATCTGG	2	12	442012	442023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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257	NC_017504	GGTTTT	2	12	448662	448673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385326957
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261	NC_017504	ATTTTC	2	12	457209	457220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
262	NC_017504	CATTAC	2	12	460378	460389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326964
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278	NC_017504	TAGGTC	2	12	488558	488569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385326987
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284	NC_017504	CAAATA	2	12	493392	493403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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289	NC_017504	TTAACT	2	12	497449	497460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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333	NC_017504	CCAATG	2	12	575012	575023	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385327041
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339	NC_017504	GCTTTC	2	12	587756	587767	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
340	NC_017504	GCCGTA	2	12	587940	587951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
341	NC_017504	GAGGGG	2	12	590342	590353	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
342	NC_017504	AGGTGA	2	12	591108	591119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
343	NC_017504	AAAACT	2	12	593152	593163	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385327056
344	NC_017504	TGAAAG	2	12	593241	593252	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385327056
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346	NC_017504	TTCTGT	2	12	594640	594651	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385327057
347	NC_017504	TAGCAA	2	12	594948	594959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385327057
348	NC_017504	AGTGGG	2	12	601221	601232	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385327065
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350	NC_017504	CCCAGC	2	12	602338	602349	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	385327065
351	NC_017504	CAAGCT	2	12	602802	602813	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385327066
352	NC_017504	CACCCC	2	12	604685	604696	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	385327068
353	NC_017504	CAAGGC	2	12	606120	606131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
354	NC_017504	AAGCAG	2	12	606495	606506	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
355	NC_017504	TAACAA	2	12	611072	611083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385327072
356	NC_017504	CGTGGT	2	12	612116	612127	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385327073
357	NC_017504	TGCTTT	2	12	614015	614026	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385327074
358	NC_017504	CCTTTT	2	12	616033	616044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385327075
359	NC_017504	ACGTTC	2	12	616158	616169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385327075
360	NC_017504	ATTTAA	2	12	619459	619470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
361	NC_017504	TTTTGT	2	12	620393	620404	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385327078
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369	NC_017504	GATTAG	2	12	635235	635246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_017504	TAATAT	2	12	685197	685208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_017504	CAATTG	2	12	717506	717517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385327157
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.