MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae FH chromosome

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017504	TGGTAA	2	12	14290	14301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017504	TATTTT	2	12	15805	15816	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017504	TACTTT	2	12	46406	46417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017504	AAAAAT	2	12	47061	47072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017504	TTTTAA	2	12	61937	61948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017504	TCTTAA	2	12	69073	69084	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017504	AAATTT	2	12	107184	107195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017504	TAAATA	2	12	110422	110433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017504	AAGCAG	2	12	115027	115038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017504	TTAACT	2	12	115540	115551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017504	GGCGAA	2	12	119013	119024	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017504	ACGGGC	2	12	127803	127814	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017504	CCCAGC	2	12	128918	128929	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017504	GGAAGG	2	12	132446	132457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017504	TTCCAC	2	12	132855	132866	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017504	AAAATA	2	12	134879	134890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017504	AAGTTA	2	12	142203	142214	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017504	CAAGAA	2	12	143210	143221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017504	AGGTAA	2	12	143236	143247	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017504	AAGCAT	2	12	143426	143437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017504	ACAAAC	2	12	143845	143856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017504	AAGATG	2	12	144060	144071	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017504	AAAAGC	2	12	144280	144291	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017504	CAACTT	2	12	144444	144455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017504	AGAAAA	2	12	144655	144666	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017504	GTTTTC	2	12	164268	164279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017504	CACCGC	2	12	165806	165817	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017504	GGCAGT	2	12	166059	166070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017504	ATCTGG	2	12	166550	166561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017504	CACCCC	2	12	166800	166811	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_017504	CCCAAC	2	12	170807	170818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017504	CTAATA	2	12	171017	171028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017504	GCTAAC	2	12	171114	171125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017504	TTAAAC	2	12	178281	178292	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017504	CCCAGC	2	12	189960	189971	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017504	CAAGGC	2	12	195968	195979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017504	CCAACC	2	12	205429	205440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017504	ACGCTA	2	12	239612	239623	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017504	TAAAAA	2	12	241878	241889	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017504	ATCTGC	2	12	241914	241925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017504	CAGCTT	2	12	244867	244878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017504	CCCCAA	3	18	245382	245399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017504	TTTTTC	2	12	251770	251781	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017504	ATTTTG	2	12	251847	251858	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017504	CTTTTT	2	12	264156	264167	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017504	TTAGTG	2	12	268754	268765	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017504	GATTGC	2	12	269838	269849	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017504	TAGTTT	2	12	282801	282812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017504	TAAAAT	2	12	296049	296060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017504	GATTTT	2	12	320337	320348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017504	AACAGT	2	12	322387	322398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017504	ATTTAC	2	12	333091	333102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017504	ATGCTA	2	12	333530	333541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017504	AAAATG	2	12	333730	333741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017504	CCAAAA	2	12	341284	341295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017504	CCCAAC	2	12	341432	341443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017504	GCTCAG	2	12	341531	341542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017504	GTATTA	2	12	357999	358010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017504	TACCCG	2	12	358915	358926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017504	TCATTT	2	12	362445	362456	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017504	AAATTA	2	12	362490	362501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017504	TGCGGA	2	12	364486	364497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017504	AAACAA	2	12	365660	365671	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017504	AAACAA	2	12	365684	365695	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017504	AGAACT	2	12	366640	366651	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017504	GAATTG	2	12	366767	366778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017504	GAAAAG	2	12	366914	366925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017504	CGTGAA	2	12	368417	368428	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017504	ATTTAA	2	12	371037	371048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017504	ACTGGT	2	12	374701	374712	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017504	TACTTT	2	12	375057	375068	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017504	TGTTCT	2	12	391416	391427	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017504	TAAAAT	2	12	406108	406119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017504	GGAAGG	2	12	435626	435637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017504	AAGCAG	2	12	436393	436404	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017504	GTGGGG	2	12	441161	441172	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017504	GGCAGT	2	12	441525	441536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017504	ATCTGG	2	12	442012	442023	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017504	CACCCC	2	12	442252	442263	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_017504	ATTTTC	2	12	457209	457220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017504	GCAACT	2	12	488334	488345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017504	AAAATA	2	12	493292	493303	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017504	CAAATA	2	12	493392	493403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017504	CAAGGC	2	12	496560	496571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017504	TTAACT	2	12	497449	497460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017504	ACTGGT	2	12	551183	551194	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017504	AATATA	2	12	559080	559091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017504	CAAGGC	2	12	561714	561725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017504	AAGCAG	2	12	562089	562100	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017504	TTAACT	2	12	562603	562614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017504	CAGTGG	2	12	566580	566591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017504	ATTGTT	2	12	578103	578114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017504	ATCTTA	2	12	581438	581449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017504	GGCTTT	2	12	587231	587242	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017504	GCTTTC	2	12	587756	587767	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017504	GCCGTA	2	12	587940	587951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017504	GAGGGG	2	12	590342	590353	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017504	AGGTGA	2	12	591108	591119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017504	CAAGGC	2	12	606120	606131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017504	AAGCAG	2	12	606495	606506	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017504	ATTTAA	2	12	619459	619470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017504	ACTGTT	2	12	633286	633297	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017504	TTTCTG	2	12	633572	633583	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017504	AAACCA	2	12	633646	633657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017504	GATTAG	2	12	635235	635246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017504	GCTTCC	2	12	661363	661374	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017504	TTCGGT	2	12	662619	662630	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017504	AATTTT	2	12	685185	685196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017504	TAATAT	2	12	685197	685208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017504	AAATAA	2	12	692407	692418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017504	ATCAGT	2	12	706276	706287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017504	ATTTAA	2	12	711226	711237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017504	CTGTTT	2	12	768961	768972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017504	AAAAGT	2	12	770708	770719	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017504	AACAAA	2	12	774351	774362	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017504	GAAAAA	2	12	775665	775676	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017504	CCTTTT	2	12	792375	792386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.