MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae FH chromosome

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017504	AAACA	2	10	656	665	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017504	ACGTA	2	10	4779	4788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017504	CTTTA	2	10	14784	14793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017504	ATTAG	2	10	29774	29783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017504	ATCTT	2	10	46746	46755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017504	AAATA	2	10	46892	46901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017504	CTAAA	2	10	57986	57995	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017504	GAAAA	2	10	58090	58099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017504	CTTTG	2	10	58134	58143	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017504	TTTAC	2	10	61557	61566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017504	TAATT	2	10	67076	67085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017504	ATGGC	2	10	69001	69010	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017504	TACTT	2	10	69355	69364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017504	TCAGT	2	10	69365	69374	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017504	CTTTA	2	10	89264	89273	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017504	AACCC	2	10	104565	104574	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017504	ATAAA	2	10	109259	109268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017504	TTAAT	2	10	109346	109355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017504	TTTTA	2	10	109429	109438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017504	AAGTG	2	10	109847	109856	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017504	TTCTT	2	10	110109	110118	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017504	ATACA	2	10	110561	110570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017504	ATTCA	2	10	111406	111415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017504	TATGA	2	10	115201	115210	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017504	ACCAA	2	10	117948	117957	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017504	TCGTG	2	10	119353	119362	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017504	TTTTC	2	10	119828	119837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017504	AAACA	2	10	119860	119869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017504	CAATA	2	10	120032	120041	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017504	GAAAA	2	10	120254	120263	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017504	CTCAT	2	10	122553	122562	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017504	ACCAA	2	10	128159	128168	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017504	GGTGA	2	10	128188	128197	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017504	TCCCC	2	10	130403	130412	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_017504	TATGA	2	10	133234	133243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017504	TTGGT	2	10	139624	139633	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017504	GCAAG	2	10	140116	140125	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017504	CTTTT	2	10	142395	142404	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017504	GCAAG	2	10	145095	145104	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017504	AAAGT	2	10	146593	146602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017504	AATTG	2	10	146832	146841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017504	GTTTT	2	10	146848	146857	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017504	ATTTT	2	10	161778	161787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017504	AAAGC	3	15	162532	162546	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017504	AAATT	2	10	166945	166954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017504	GGTGA	2	10	170064	170073	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017504	ATCAA	2	10	191226	191235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017504	TTTTC	2	10	193609	193618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017504	CAGTC	2	10	200561	200570	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017504	TAGAG	2	10	204498	204507	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017504	TGAGT	2	10	204588	204597	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017504	AGCAA	2	10	205317	205326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017504	TGAAT	2	10	208392	208401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017504	ACCTT	2	10	209280	209289	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017504	TTAAG	2	10	237579	237588	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017504	TAACC	2	10	237958	237967	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017504	GAAGA	2	10	238753	238762	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017504	GAAAA	2	10	239692	239701	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017504	AAAGC	2	10	239884	239893	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017504	CCTAA	2	10	242197	242206	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017504	ATAGA	2	10	242626	242635	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017504	ACCAC	2	10	244270	244279	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_017504	GGTGA	2	10	244659	244668	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017504	CAAAT	2	10	248295	248304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017504	TTTAA	2	10	260425	260434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017504	GGTCT	2	10	268391	268400	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017504	TGTAC	2	10	270251	270260	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017504	TCTTT	2	10	285620	285629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017504	GCAAA	2	10	285687	285696	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017504	AGGCT	2	10	320449	320458	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017504	GTCTT	2	10	322141	322150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017504	GGAAA	2	10	333041	333050	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017504	AAAAC	2	10	338510	338519	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017504	GAACC	2	10	340070	340079	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017504	GGTGA	2	10	340669	340678	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017504	TCTTT	2	10	341763	341772	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017504	AAAAC	2	10	345437	345446	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017504	AGTTT	2	10	351109	351118	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017504	CTTAC	2	10	357314	357323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017504	CTTTA	2	10	357959	357968	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017504	TTGAC	2	10	358382	358391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017504	TGAAA	2	10	358408	358417	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017504	GAATT	2	10	359055	359064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017504	GTGAT	2	10	359559	359568	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017504	AGCGG	2	10	365851	365860	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017504	GAGCA	2	10	367049	367058	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017504	AAGAA	2	10	367677	367686	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017504	AGCTT	2	10	367911	367920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017504	CAAAA	2	10	370982	370991	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017504	TTAAC	2	10	371394	371403	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017504	AATTA	2	10	427543	427552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017504	TATGA	2	10	436567	436576	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017504	ACCAC	2	10	439858	439867	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_017504	ACCAA	2	10	440241	440250	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017504	GTGAA	2	10	440271	440280	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017504	CCGAA	2	10	441560	441569	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017504	ACCGT	2	10	442359	442368	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017504	TGCAG	2	10	445535	445544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017504	TGAGT	2	10	445548	445557	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017504	GGTAA	2	10	445639	445648	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017504	TAAAA	2	10	451359	451368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017504	AATTA	2	10	461271	461280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017504	TTAAA	2	10	481413	481422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017504	TATGA	2	10	497109	497118	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017504	CAGTT	2	10	499321	499330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017504	CTTTA	2	10	514734	514743	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017504	TATGA	2	10	562263	562272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017504	AAACT	2	10	589305	589314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017504	ACCGC	2	10	589645	589654	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_017504	TTTGG	2	10	590424	590433	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017504	CCCAC	2	10	590609	590618	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_017504	CCCGC	2	10	598665	598674	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_017504	TCCCC	2	10	603860	603869	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
114	NC_017504	TATGA	2	10	606663	606672	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017504	TTTTG	2	10	615065	615074	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017504	TTAAT	2	10	631818	631827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017504	TTCTA	2	10	632282	632291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017504	ATCTC	2	10	632529	632538	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017504	AAGAA	2	10	632691	632700	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017504	TTCTT	2	10	632776	632785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017504	CACAA	2	10	635303	635312	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017504	TATTT	2	10	639980	639989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017504	TCTCC	2	10	643661	643670	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017504	TTTTA	2	10	646000	646009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017504	GTTAT	2	10	654358	654367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017504	TTTCT	2	10	661338	661347	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017504	AGGTT	2	10	662044	662053	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017504	AACTT	2	10	687169	687178	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017504	CAAAA	2	10	688262	688271	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017504	AATTT	2	10	693136	693145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017504	AGTGA	2	10	693311	693320	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017504	TTTAA	2	10	694641	694650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017504	AGTGT	2	10	694662	694671	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017504	AAGAT	2	10	694717	694726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017504	AATTT	2	10	698380	698389	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017504	TTGCT	2	10	699908	699917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017504	TTGGC	2	10	700503	700512	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017504	AACTT	2	10	700907	700916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017504	TACTT	2	10	702130	702139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017504	TCTTT	2	10	702234	702243	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017504	ACCTA	2	10	702400	702409	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017504	TGAAA	2	10	731879	731888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017504	TCTAA	2	10	733714	733723	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017504	TTAAA	2	10	746111	746120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017504	TTTTC	2	10	755630	755639	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017504	AACTG	2	10	756146	756155	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017504	TCTTG	2	10	762638	762647	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017504	TGTTC	2	10	768769	768778	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017504	TTCTT	2	10	771367	771376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017504	AAGCG	2	10	772054	772063	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017504	ATATT	2	10	786149	786158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.