MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma pneumoniae FH chromosome

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017504	CAAAA	2	10	990	999	80 %	0 %	0 %	20 %	385326615
2	NC_017504	CTACA	2	10	1874	1883	40 %	20 %	0 %	40 %	385326616
3	NC_017504	GGTGG	2	10	2425	2434	0 %	20 %	80 %	0 %	385326616
4	NC_017504	TGAAG	2	10	5750	5759	40 %	20 %	40 %	0 %	385326617
5	NC_017504	ACCAA	2	10	8545	8554	60 %	0 %	0 %	40 %	385326618
6	NC_017504	AACCC	2	10	9175	9184	40 %	0 %	0 %	60 %	385326619
7	NC_017504	CACTA	2	10	11563	11572	40 %	20 %	0 %	40 %	385326622
8	NC_017504	GAAAC	2	10	12957	12966	60 %	0 %	20 %	20 %	385326624
9	NC_017504	TTTCA	2	10	13104	13113	20 %	60 %	0 %	20 %	385326624
10	NC_017504	CTTGC	2	10	13648	13657	0 %	40 %	20 %	40 %	385326625
11	NC_017504	GTTCA	2	10	17221	17230	20 %	40 %	20 %	20 %	385326628
12	NC_017504	TTGTT	2	10	18680	18689	0 %	80 %	20 %	0 %	385326630
13	NC_017504	TAAGT	2	10	19514	19523	40 %	40 %	20 %	0 %	385326631
14	NC_017504	CCTTT	2	10	19876	19885	0 %	60 %	0 %	40 %	385326631
15	NC_017504	CTTTC	2	10	21775	21784	0 %	60 %	0 %	40 %	385326632
16	NC_017504	TGGTT	2	10	21994	22003	0 %	60 %	40 %	0 %	385326632
17	NC_017504	GTGAG	2	10	22478	22487	20 %	20 %	60 %	0 %	385326632
18	NC_017504	TTAAG	2	10	24392	24401	40 %	40 %	20 %	0 %	385326633
19	NC_017504	AGTGA	2	10	24762	24771	40 %	20 %	40 %	0 %	385326633
20	NC_017504	CAAGA	2	10	25495	25504	60 %	0 %	20 %	20 %	385326633
21	NC_017504	AAAAC	2	10	26286	26295	80 %	0 %	0 %	20 %	385326634
22	NC_017504	CAGTC	2	10	26750	26759	20 %	20 %	20 %	40 %	385326634
23	NC_017504	ATCTC	2	10	29815	29824	20 %	40 %	0 %	40 %	385326637
24	NC_017504	AACCT	2	10	29929	29938	40 %	20 %	0 %	40 %	385326637
25	NC_017504	TGAGT	2	10	31828	31837	20 %	40 %	40 %	0 %	385326639
26	NC_017504	CATGA	2	10	33386	33395	40 %	20 %	20 %	20 %	385326641
27	NC_017504	AAAAG	2	10	33562	33571	80 %	0 %	20 %	0 %	385326641
28	NC_017504	TTTGG	2	10	37611	37620	0 %	60 %	40 %	0 %	385326647
29	NC_017504	GTTTG	2	10	38674	38683	0 %	60 %	40 %	0 %	385326647
30	NC_017504	TCATT	2	10	38776	38785	20 %	60 %	0 %	20 %	385326647
31	NC_017504	CCATC	2	10	39703	39712	20 %	20 %	0 %	60 %	385326647
32	NC_017504	CTACC	2	10	42799	42808	20 %	20 %	0 %	60 %	385326648
33	NC_017504	ATGGT	2	10	43141	43150	20 %	40 %	40 %	0 %	385326648
34	NC_017504	CTGAA	2	10	44720	44729	40 %	20 %	20 %	20 %	385326649
35	NC_017504	CAGCG	2	10	47396	47405	20 %	0 %	40 %	40 %	385326652
36	NC_017504	AATTA	2	10	47532	47541	60 %	40 %	0 %	0 %	385326652
37	NC_017504	CAAGG	2	10	47542	47551	40 %	0 %	40 %	20 %	385326652
38	NC_017504	TACAT	2	10	50552	50561	40 %	40 %	0 %	20 %	385326654
39	NC_017504	TTTAA	2	10	51622	51631	40 %	60 %	0 %	0 %	385326655
40	NC_017504	GGTTA	2	10	54172	54181	20 %	40 %	40 %	0 %	385326657
41	NC_017504	AACTT	2	10	54398	54407	40 %	40 %	0 %	20 %	385326658
42	NC_017504	TGAAT	2	10	56699	56708	40 %	40 %	20 %	0 %	385326659
43	NC_017504	CTTTG	2	10	60231	60240	0 %	60 %	20 %	20 %	385326660
44	NC_017504	AAAGA	2	10	60644	60653	80 %	0 %	20 %	0 %	385326660
45	NC_017504	AATGA	2	10	61070	61079	60 %	20 %	20 %	0 %	385326660
46	NC_017504	AACCA	2	10	61437	61446	60 %	0 %	0 %	40 %	385326660
47	NC_017504	TACCA	2	10	62761	62770	40 %	20 %	0 %	40 %	385326661
48	NC_017504	TCATG	2	10	62884	62893	20 %	40 %	20 %	20 %	385326661
49	NC_017504	TGCTG	2	10	64138	64147	0 %	40 %	40 %	20 %	385326662
50	NC_017504	GTGAT	2	10	65145	65154	20 %	40 %	40 %	0 %	385326663
51	NC_017504	CTTTA	2	10	72749	72758	20 %	60 %	0 %	20 %	385326669
52	NC_017504	TTACC	2	10	73496	73505	20 %	40 %	0 %	40 %	385326670
53	NC_017504	GAAAG	2	10	75893	75902	60 %	0 %	40 %	0 %	385326672
54	NC_017504	CCAGT	2	10	76454	76463	20 %	20 %	20 %	40 %	385326673
55	NC_017504	ACTCC	2	10	77696	77705	20 %	20 %	0 %	60 %	385326675
56	NC_017504	CATGG	2	10	79191	79200	20 %	20 %	40 %	20 %	385326676
57	NC_017504	TGGGT	2	10	86549	86558	0 %	40 %	60 %	0 %	385326685
58	NC_017504	TGGGC	2	10	87288	87297	0 %	20 %	60 %	20 %	385326686
59	NC_017504	CAAAC	2	10	88397	88406	60 %	0 %	0 %	40 %	385326687
60	NC_017504	CTTTA	2	10	88497	88506	20 %	60 %	0 %	20 %	385326687
61	NC_017504	CCATA	2	10	89850	89859	40 %	20 %	0 %	40 %	385326688
62	NC_017504	TTGTT	2	10	91714	91723	0 %	80 %	20 %	0 %	385326689
63	NC_017504	CGTGT	2	10	93252	93261	0 %	40 %	40 %	20 %	385326690
64	NC_017504	AAACC	2	10	100767	100776	60 %	0 %	0 %	40 %	385326694
65	NC_017504	CTCAC	2	10	101003	101012	20 %	20 %	0 %	60 %	385326694
66	NC_017504	TCTGT	2	10	109618	109627	0 %	60 %	20 %	20 %	385326698
67	NC_017504	CATTT	2	10	113568	113577	20 %	60 %	0 %	20 %	385326702
68	NC_017504	CATGA	2	10	116296	116305	40 %	20 %	20 %	20 %	385326703
69	NC_017504	ACCAC	2	10	117585	117594	40 %	0 %	0 %	60 %	385326705
70	NC_017504	CTAAT	2	10	126945	126954	40 %	40 %	0 %	20 %	385326708
71	NC_017504	GAAAA	2	10	134204	134213	80 %	0 %	20 %	0 %	385326711
72	NC_017504	TGTTT	2	10	134620	134629	0 %	80 %	20 %	0 %	385326711
73	NC_017504	GTGAT	2	10	135969	135978	20 %	40 %	40 %	0 %	385326712
74	NC_017504	CTTAA	2	10	137383	137392	40 %	40 %	0 %	20 %	385326713
75	NC_017504	AGTTT	2	10	144877	144886	20 %	60 %	20 %	0 %	385326714
76	NC_017504	CTTTC	2	10	149802	149811	0 %	60 %	0 %	40 %	385326715
77	NC_017504	AAACC	2	10	150946	150955	60 %	0 %	0 %	40 %	385326716
78	NC_017504	TAATT	2	10	151401	151410	40 %	60 %	0 %	0 %	385326717
79	NC_017504	GCAAA	2	10	151523	151532	60 %	0 %	20 %	20 %	385326718
80	NC_017504	ACCAC	2	10	153710	153719	40 %	0 %	0 %	60 %	385326720
81	NC_017504	AGCGA	2	10	156462	156471	40 %	0 %	40 %	20 %	385326723
82	NC_017504	GCATT	2	10	156908	156917	20 %	40 %	20 %	20 %	385326723
83	NC_017504	ATTCG	2	10	157261	157270	20 %	40 %	20 %	20 %	385326723
84	NC_017504	GTGAT	2	10	157318	157327	20 %	40 %	40 %	0 %	385326723
85	NC_017504	TTTCG	2	10	161624	161633	0 %	60 %	20 %	20 %	385326725
86	NC_017504	TAATT	2	10	167789	167798	40 %	60 %	0 %	0 %	385326729
87	NC_017504	ACCAC	2	10	168442	168451	40 %	0 %	0 %	60 %	385326730
88	NC_017504	GAAAA	2	10	171839	171848	80 %	0 %	20 %	0 %	385326733
89	NC_017504	CAACG	2	10	174230	174239	40 %	0 %	20 %	40 %	385326734
90	NC_017504	CTTTA	2	10	174379	174388	20 %	60 %	0 %	20 %	385326735
91	NC_017504	TTACC	2	10	174927	174936	20 %	40 %	0 %	40 %	385326735
92	NC_017504	ACCAA	2	10	179297	179306	60 %	0 %	0 %	40 %	385326742
93	NC_017504	CCGAA	2	10	179634	179643	40 %	0 %	20 %	40 %	385326742
94	NC_017504	TCCAA	2	10	181308	181317	40 %	20 %	0 %	40 %	385326742
95	NC_017504	ACCAA	2	10	182402	182411	60 %	0 %	0 %	40 %	385326742
96	NC_017504	GGTGA	2	10	182431	182440	20 %	20 %	60 %	0 %	385326742
97	NC_017504	TATGA	2	10	185751	185760	40 %	40 %	20 %	0 %	385326743
98	NC_017504	GAATT	2	10	186757	186766	40 %	40 %	20 %	0 %	385326743
99	NC_017504	AAGCC	2	10	186794	186803	40 %	0 %	20 %	40 %	385326743
100	NC_017504	TTCCC	2	10	187302	187311	0 %	40 %	0 %	60 %	385326743
101	NC_017504	ACCAC	2	10	188847	188856	40 %	0 %	0 %	60 %	385326745
102	NC_017504	ACCAA	2	10	189213	189222	60 %	0 %	0 %	40 %	385326745
103	NC_017504	GGTGA	2	10	189242	189251	20 %	20 %	60 %	0 %	385326745
104	NC_017504	GCACC	2	10	189725	189734	20 %	0 %	20 %	60 %	385326745
105	NC_017504	GATCT	2	10	191524	191533	20 %	40 %	20 %	20 %	385326747
106	NC_017504	GATTC	2	10	192756	192765	20 %	40 %	20 %	20 %	385326748
107	NC_017504	AAGCA	2	10	192891	192900	60 %	0 %	20 %	20 %	385326748
108	NC_017504	TTAAC	2	10	200821	200830	40 %	40 %	0 %	20 %	385326754
109	NC_017504	GTTAA	2	10	201048	201057	40 %	40 %	20 %	0 %	385326754
110	NC_017504	ACTTA	2	10	202048	202057	40 %	40 %	0 %	20 %	385326754
111	NC_017504	ACCAA	2	10	202546	202555	60 %	0 %	0 %	40 %	385326754
112	NC_017504	GTGAC	2	10	203273	203282	20 %	20 %	40 %	20 %	385326754
113	NC_017504	AAAGG	2	10	205938	205947	60 %	0 %	40 %	0 %	385326755
114	NC_017504	ACACC	2	10	211084	211093	40 %	0 %	0 %	60 %	385326759
115	NC_017504	TTAAT	2	10	212369	212378	40 %	60 %	0 %	0 %	385326760
116	NC_017504	AGTTA	2	10	213156	213165	40 %	40 %	20 %	0 %	385326761
117	NC_017504	TGAAA	2	10	213591	213600	60 %	20 %	20 %	0 %	385326761
118	NC_017504	GAAGA	2	10	214871	214880	60 %	0 %	40 %	0 %	385326762
119	NC_017504	GAAAT	2	10	214955	214964	60 %	20 %	20 %	0 %	385326762
120	NC_017504	AGAAA	2	10	217060	217069	80 %	0 %	20 %	0 %	385326764
121	NC_017504	CCATT	2	10	217230	217239	20 %	40 %	0 %	40 %	385326765
122	NC_017504	TTACC	2	10	217972	217981	20 %	40 %	0 %	40 %	385326766
123	NC_017504	TCCCA	2	10	224083	224092	20 %	20 %	0 %	60 %	385326778
124	NC_017504	GAACA	2	10	224312	224321	60 %	0 %	20 %	20 %	385326779
125	NC_017504	TTACC	2	10	226602	226611	20 %	40 %	0 %	40 %	385326782
126	NC_017504	GTTTG	2	10	227586	227595	0 %	60 %	40 %	0 %	385326783
127	NC_017504	AAACG	2	10	228060	228069	60 %	0 %	20 %	20 %	385326784
128	NC_017504	AAGCA	2	10	228616	228625	60 %	0 %	20 %	20 %	385326785
129	NC_017504	AAGCG	2	10	231569	231578	40 %	0 %	40 %	20 %	385326791
130	NC_017504	TCAAC	2	10	236848	236857	40 %	20 %	0 %	40 %	385326796
131	NC_017504	GGAAA	2	10	236864	236873	60 %	0 %	40 %	0 %	385326796
132	NC_017504	AATTG	2	10	243744	243753	40 %	40 %	20 %	0 %	385326797
133	NC_017504	TGCGC	2	10	246910	246919	0 %	20 %	40 %	40 %	385326800
134	NC_017504	GTTGA	2	10	249581	249590	20 %	40 %	40 %	0 %	385326802
135	NC_017504	TAATT	2	10	253015	253024	40 %	60 %	0 %	0 %	385326804
136	NC_017504	AGCAA	2	10	254978	254987	60 %	0 %	20 %	20 %	385326804
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.