MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. F chromosome

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017503	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017503	TTATAT	3	18	61362	61379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017503	AAAGCG	2	12	81120	81131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017503	ATATCG	2	12	83452	83463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017503	TTAGTT	2	12	131343	131354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017503	TTTAAC	2	12	147398	147409	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017503	ATTTTT	2	12	184469	184480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017503	ATAATT	2	12	186295	186306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017503	CAATAT	2	12	210580	210591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017503	AAAACT	2	12	218268	218279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017503	GAAAAA	2	12	245865	245876	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017503	ATATAA	2	12	318435	318446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017503	TCTATT	2	12	324094	324105	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017503	TTATTT	2	12	330643	330654	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017503	ATATAA	2	12	344121	344132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017503	TCTATT	2	12	349780	349791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017503	TTATTT	2	12	356329	356340	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017503	AATATA	2	12	359565	359576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017503	AATTAA	2	12	368503	368514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017503	TTTGCA	2	12	400004	400015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017503	TTTTTA	2	12	404135	404146	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017503	TTATAA	2	12	427432	427443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017503	TATTTC	2	12	447928	447939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017503	GCTTTA	2	12	459964	459975	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017503	ATTTAA	2	12	472305	472316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017503	TTTTAT	2	12	496096	496107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017503	GATTCT	2	12	496684	496695	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017503	ACAAAA	2	12	506601	506612	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017503	CAAAAC	2	12	506864	506875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017503	ATAAAA	2	12	569963	569974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017503	TGCTGA	2	12	576252	576263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017503	TTTATC	2	12	600652	600663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017503	AAAAAT	2	12	609367	609378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017503	GAAAAT	2	12	649262	649273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017503	ATAAAA	2	12	679188	679199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017503	ATAAGC	2	12	699317	699328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017503	GCTTAT	2	12	699336	699347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017503	GCTTAT	2	12	721519	721530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017503	CGATAT	2	12	746183	746194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017503	TCGCTT	2	12	748513	748524	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017503	TCGCCT	2	12	750626	750637	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017503	TAAAAA	2	12	765083	765094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017503	ATAATT	2	12	770400	770411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017503	TAAAAA	2	12	786426	786437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017503	TTTAAC	2	12	789276	789287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017503	GAAAAT	5	30	807752	807781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017503	ATCTAG	2	12	809044	809055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017503	TCTTGT	2	12	809849	809860	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017503	TCGCCT	2	12	842906	842917	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017503	ATATTT	2	12	851923	851934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017503	TATAAA	2	12	876518	876529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017503	CTAAAC	2	12	914383	914394	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017503	ATTCTT	2	12	923736	923747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017503	TTTAAA	2	12	931717	931728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017503	TACAGC	2	12	950152	950163	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017503	TTTTCT	2	12	950621	950632	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017503	AACTAA	2	12	954936	954947	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.