MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. F chromosome

Total Repeats: 464

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017503	AACTAA	2	12	4202	4213	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325856
2	NC_017503	GCAATC	2	12	5893	5904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385325857
3	NC_017503	GATCTT	2	12	6135	6146	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385325857
4	NC_017503	AGAAAA	2	12	8484	8495	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325861
5	NC_017503	AATCTT	2	12	9863	9874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325863
6	NC_017503	CTGATA	2	12	13995	14006	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325867
7	NC_017503	ACCTGA	2	12	19974	19985	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385325871
8	NC_017503	CACTAC	2	12	20009	20020	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385325871
9	NC_017503	CATTAG	2	12	22242	22253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325874
10	NC_017503	TCAAGA	2	12	25298	25309	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325875
11	NC_017503	TTAATG	2	12	25779	25790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325875
12	NC_017503	CAAAGA	2	12	27026	27037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325875
13	NC_017503	TGATCT	2	12	27985	27996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385325875
14	NC_017503	ATTATC	2	12	32716	32727	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325880
15	NC_017503	GCTAAA	2	12	33512	33523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325880
16	NC_017503	AACTAA	2	12	34494	34505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325880
17	NC_017503	AAGCAA	2	12	35608	35619	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325882
18	NC_017503	TGAAGA	2	12	36542	36553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325883
19	NC_017503	AGCTAA	2	12	37590	37601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325884
20	NC_017503	CATTAG	2	12	44922	44933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325888
21	NC_017503	TTAAGA	2	12	47535	47546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325890
22	NC_017503	AATCTT	2	12	47926	47937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325890
23	NC_017503	CTAAAG	2	12	52391	52402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325892
24	NC_017503	AATCGT	2	12	56514	56525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325895
25	NC_017503	TTGAGC	2	12	57654	57665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385325897
26	NC_017503	ACCTAA	2	12	58218	58229	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385325897
27	NC_017503	AAACCA	2	12	60387	60398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385325899
28	NC_017503	AAAATC	2	12	65946	65957	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325903
29	NC_017503	AAGAAA	2	12	68557	68568	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325908
30	NC_017503	TTTATG	2	12	69797	69808	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325910
31	NC_017503	AACAAA	2	12	70764	70775	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325911
32	NC_017503	AGGTAA	2	12	71080	71091	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325912
33	NC_017503	AGTTAA	2	12	72621	72632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325916
34	NC_017503	TAAAGG	2	12	74363	74374	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325920
35	NC_017503	TAGGTG	2	12	79816	79827	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385325927
36	NC_017503	CTATTT	2	12	85138	85149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385325928
37	NC_017503	AATATT	2	12	85821	85832	50 %	50 %	0 %	0 %	385325928
38	NC_017503	AATAAA	2	12	87320	87331	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385325929
39	NC_017503	ATTTAG	2	12	87363	87374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325929
40	NC_017503	AATCTT	2	12	91547	91558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325932
41	NC_017503	TCATGA	2	12	91616	91627	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325932
42	NC_017503	AAGAAA	2	12	98331	98342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325938
43	NC_017503	CTTGAT	2	12	100840	100851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385325940
44	NC_017503	AAAACA	2	12	106892	106903	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325943
45	NC_017503	CAAAAG	2	12	109561	109572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325946
46	NC_017503	GTTTTA	2	12	110481	110492	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325947
47	NC_017503	TTAAAG	2	12	114584	114595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325948
48	NC_017503	TAGAAG	2	12	117359	117370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325949
49	NC_017503	TTTTCT	2	12	119238	119249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385325950
50	NC_017503	ATCCAT	2	12	119795	119806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325950
51	NC_017503	ATTAAT	2	12	122364	122375	50 %	50 %	0 %	0 %	385325952
52	NC_017503	CTTTAA	2	12	125750	125761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325955
53	NC_017503	TACTTA	2	12	126503	126514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325955
54	NC_017503	ATAAAT	2	12	127960	127971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385325957
55	NC_017503	AGTAAA	2	12	134640	134651	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385325962
56	NC_017503	ACAGAA	2	12	135649	135660	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325962
57	NC_017503	TTGCTG	2	12	135914	135925	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385325963
58	NC_017503	TTGCTG	2	12	137685	137696	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385325964
59	NC_017503	GAACAA	2	12	140744	140755	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325965
60	NC_017503	AAAAAG	2	12	140907	140918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325965
61	NC_017503	GACAAA	2	12	141071	141082	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325965
62	NC_017503	AAAACA	2	12	142588	142599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325967
63	NC_017503	TAATAT	2	12	142723	142734	50 %	50 %	0 %	0 %	385325967
64	NC_017503	TGTTAA	2	12	148765	148776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325970
65	NC_017503	TTTGAT	2	12	150174	150185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325972
66	NC_017503	TAAATC	2	12	152311	152322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325973
67	NC_017503	TTAGAT	2	12	154511	154522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325974
68	NC_017503	TGGTGA	2	12	155997	156008	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385325975
69	NC_017503	AATCTA	2	12	160721	160732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325981
70	NC_017503	TTAAAG	2	12	161297	161308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325982
71	NC_017503	AAAGCT	2	12	162982	162993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325982
72	NC_017503	ATTGGT	2	12	168477	168488	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385325987
73	NC_017503	ACATTC	2	12	168939	168950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325987
74	NC_017503	ATTCTT	2	12	169295	169306	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385325987
75	NC_017503	TGGTAC	2	12	169565	169576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385325987
76	NC_017503	AACGAT	2	12	173143	173154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325990
77	NC_017503	CAGGTG	2	12	173232	173243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385325990
78	NC_017503	GAAAAA	2	12	173390	173401	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325990
79	NC_017503	TTACTA	2	12	177702	177713	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325998
80	NC_017503	GGTTTA	2	12	178732	178743	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326000
81	NC_017503	ATTTAA	2	12	179119	179130	50 %	50 %	0 %	0 %	385326002
82	NC_017503	GATTTT	2	12	181442	181453	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385326004
83	NC_017503	CTTTAT	2	12	183399	183410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385326005
84	NC_017503	TTTTGT	2	12	184582	184593	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385326006
85	NC_017503	TTGGTG	2	12	188272	188283	0 %	50 %	50 %	0 %	385326012
86	NC_017503	TTTATT	2	12	188757	188768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385326012
87	NC_017503	AGAAAA	2	12	189747	189758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385326013
88	NC_017503	ACTTAA	2	12	190551	190562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385326014
89	NC_017503	CTTGGG	2	12	191871	191882	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385326015
90	NC_017503	ATCTTA	2	12	191978	191989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326015
91	NC_017503	TATCAT	2	12	193165	193176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326016
92	NC_017503	TACTGA	2	12	193752	193763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326017
93	NC_017503	AAATGA	2	12	197618	197629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385326019
94	NC_017503	CAAAAA	2	12	198346	198357	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385326019
95	NC_017503	AAACAA	2	12	199137	199148	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385326020
96	NC_017503	TTTATT	2	12	199674	199685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385326020
97	NC_017503	ACAGAA	2	12	202042	202053	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385326021
98	NC_017503	AAAAGA	2	12	206375	206386	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385326025
99	NC_017503	ATCAAA	2	12	206488	206499	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385326025
100	NC_017503	AAATTA	2	12	209684	209695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385326028
101	NC_017503	GGGTTT	2	12	211042	211053	0 %	50 %	50 %	0 %	385326030
102	NC_017503	TAAATT	2	12	214791	214802	50 %	50 %	0 %	0 %	385326032
103	NC_017503	TATGAT	2	12	216208	216219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326032
104	NC_017503	GGGATT	2	12	217588	217599	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385326034
105	NC_017503	TCAAGA	2	12	218844	218855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326035
106	NC_017503	CCTAAA	2	12	219172	219183	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385326035
107	NC_017503	AGATTA	2	12	221236	221247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385326035
108	NC_017503	GGTATT	2	12	221461	221472	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326035
109	NC_017503	TGCTGA	2	12	223011	223022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385326036
110	NC_017503	ATGCTA	2	12	225337	225348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326037
111	NC_017503	TCAAGT	2	12	228459	228470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326038
112	NC_017503	TCAAAA	2	12	232119	232130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385326040
113	NC_017503	CCAAAT	2	12	233425	233436	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385326040
114	NC_017503	CTTTGT	2	12	239843	239854	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385326043
115	NC_017503	CAAAAA	2	12	242330	242341	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385326047
116	NC_017503	GGGATC	2	12	244174	244185	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385326048
117	NC_017503	CAGCAC	3	18	246100	246117	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385326050
118	NC_017503	CAACAC	7	42	246118	246159	50 %	0 %	0 %	50 %	385326050
119	NC_017503	CTCCTA	2	12	246610	246621	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385326050
120	NC_017503	CACCAA	2	12	249366	249377	50 %	0 %	0 %	50 %	385326051
121	NC_017503	TCAGCT	2	12	249398	249409	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385326051
122	NC_017503	ACTCCA	7	42	251446	251487	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385326052
123	NC_017503	CAACAC	2	12	253814	253825	50 %	0 %	0 %	50 %	385326053
124	NC_017503	AATCCT	2	12	253924	253935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326053
125	NC_017503	ACTACA	2	12	254923	254934	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385326053
126	NC_017503	ACACCA	2	12	258505	258516	50 %	0 %	0 %	50 %	385326055
127	NC_017503	GCAAAT	2	12	259717	259728	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326055
128	NC_017503	AAATTT	2	12	259779	259790	50 %	50 %	0 %	0 %	385326055
129	NC_017503	TTCAAC	2	12	265021	265032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326058
130	NC_017503	AAATTT	2	12	269846	269857	50 %	50 %	0 %	0 %	385326063
131	NC_017503	AACTAA	2	12	271245	271256	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385326065
132	NC_017503	CTGAAA	2	12	271712	271723	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326065
133	NC_017503	CGTGAT	2	12	273775	273786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385326067
134	NC_017503	TGTTCT	2	12	274267	274278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385326068
135	NC_017503	GCTAAA	2	12	275524	275535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326069
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138	NC_017503	TGGTTA	2	12	282381	282392	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326076
139	NC_017503	TTTAAA	2	12	291646	291657	50 %	50 %	0 %	0 %	385326084
140	NC_017503	TGCTAA	2	12	298243	298254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326088
141	NC_017503	CAAAAA	2	12	298963	298974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385326089
142	NC_017503	TTTATC	2	12	303219	303230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385326090
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147	NC_017503	CGATCT	2	12	307287	307298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385326094
148	NC_017503	GTAATA	2	12	307641	307652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385326094
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150	NC_017503	GGTTAT	2	12	309168	309179	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326095
151	NC_017503	GATGTT	2	12	310659	310670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326095
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189	NC_017503	CAAGAT	2	12	383258	383269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326148
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200	NC_017503	TGAAGT	2	12	408447	408458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385326168
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219	NC_017503	CACCCA	2	12	438492	438503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385326189
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221	NC_017503	GGTTAT	2	12	443920	443931	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385326194
222	NC_017503	TGATAT	2	12	450568	450579	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385326200
223	NC_017503	TAGTTT	2	12	451564	451575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385326201
224	NC_017503	AAATCT	2	12	453047	453058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385326202
225	NC_017503	AATCTT	2	12	455310	455321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326203
226	NC_017503	GCTTTA	2	12	456312	456323	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326205
227	NC_017503	GATCAA	2	12	456612	456623	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385326205
228	NC_017503	CATTAG	2	12	457255	457266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385326205
229	NC_017503	ATCGCG	2	12	457762	457773	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385326206
230	NC_017503	AGAATA	2	12	459900	459911	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385326207
231	NC_017503	CTAGTT	2	12	460194	460205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385326208
232	NC_017503	TGTTAT	2	12	460299	460310	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385326208
233	NC_017503	TTAATT	2	12	460596	460607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385326208
234	NC_017503	ATCTTA	2	12	463145	463156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326211
235	NC_017503	ATCTTA	2	12	466356	466367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385326214
236	NC_017503	TTAACC	2	12	470890	470901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385326216
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343	NC_017503	GATCCA	2	12	703364	703375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385326407
344	NC_017503	TTTAAA	2	12	704239	704250	50 %	50 %	0 %	0 %	385326407
345	NC_017503	AAACCA	2	12	704948	704959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385326408
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