MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. F chromosome

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017503	AAAAC	2	10	823	832	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017503	ATCAT	2	10	1086	1095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017503	AAAGT	2	10	1574	1583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017503	ATATT	2	10	1851	1860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017503	TTAAA	2	10	20537	20546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017503	AGTTA	2	10	30050	30059	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017503	ATTTT	2	10	36618	36627	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017503	TTAGC	2	10	63791	63800	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017503	TTTAT	2	10	64342	64351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017503	GCAAA	2	10	68413	68422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017503	CTAAA	2	10	78887	78896	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017503	TTTAA	2	10	80102	80111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017503	CAAAC	2	10	80207	80216	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017503	ATCAA	2	10	80412	80421	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017503	ATATA	2	10	80427	80436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017503	CTCAT	2	10	82988	82997	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017503	CTTCC	2	10	83262	83271	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017503	TAAAA	2	10	94942	94951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017503	GAGAT	2	10	118532	118541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017503	ATCTC	2	10	118558	118567	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017503	GTTTT	2	10	118723	118732	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017503	ACATA	2	10	121120	121129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017503	TTTGC	2	10	121246	121255	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017503	ATTTT	2	10	131330	131339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017503	ATTTT	2	10	132824	132833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017503	TTATA	2	10	133598	133607	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017503	TAAAT	2	10	139095	139104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017503	TAAAA	2	10	139168	139177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017503	GTTAG	2	10	147386	147395	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017503	CATTT	2	10	147837	147846	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017503	TAAAA	2	10	152964	152973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017503	TCTTA	2	10	167195	167204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017503	TAAAG	2	10	177816	177825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017503	TGATC	2	10	180776	180785	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017503	TTTTC	2	10	185897	185906	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017503	TAAAA	2	10	194389	194398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017503	TAGCT	2	10	195197	195206	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017503	TTAAA	2	10	196352	196361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017503	TATAT	2	10	203211	203220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017503	TCTTT	2	10	243401	243410	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017503	AAAAT	2	10	316356	316365	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017503	AATTT	2	10	322769	322778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017503	CAAAA	2	10	324329	324338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017503	TTTTG	2	10	330724	330733	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017503	AAAAT	2	10	342042	342051	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017503	AATTT	2	10	348455	348464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017503	CAAAA	2	10	350015	350024	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017503	TTTTG	2	10	356410	356419	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017503	TAAAT	2	10	367982	367991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017503	AAACT	2	10	373077	373086	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017503	ATTTT	2	10	373509	373518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017503	ACAAA	2	10	373633	373642	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017503	ACTTA	2	10	373674	373683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017503	AATAC	2	10	374365	374374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017503	TAACG	2	10	375535	375544	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017503	GATCT	2	10	375610	375619	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017503	TTAAA	2	10	399759	399768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017503	TAATA	2	10	402573	402582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017503	GTTAA	2	10	413268	413277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017503	ATATA	2	10	427536	427545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017503	ATAAG	2	10	430695	430704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017503	TTATT	2	10	431968	431977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017503	TAGAA	2	10	432102	432111	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017503	AATTA	2	10	433566	433575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017503	AATTA	2	10	433577	433586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017503	CATTT	2	10	459923	459932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017503	TTTAA	2	10	472377	472386	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017503	TAATT	2	10	472407	472416	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017503	AATTA	2	10	478596	478605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017503	GACTA	2	10	480719	480728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017503	TTAAT	2	10	481261	481270	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017503	TAATA	2	10	488360	488369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017503	TAATA	2	10	493909	493918	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017503	TAAAA	2	10	504204	504213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017503	AAAAT	2	10	506437	506446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017503	ACTAA	2	10	506721	506730	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017503	AAAAG	2	10	518948	518957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017503	AAGAT	2	10	521704	521713	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017503	TTTTA	2	10	522518	522527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017503	AAATA	2	10	536757	536766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017503	GGGTT	2	10	559127	559136	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017503	AATTA	2	10	560640	560649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017503	ATAAA	2	10	563779	563788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017503	TTTTA	2	10	569998	570007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017503	ACAAT	2	10	576135	576144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017503	GTTAA	2	10	587802	587811	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017503	ATTTT	2	10	597942	597951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017503	CTGAC	2	10	619406	619415	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017503	ATATT	2	10	621199	621208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017503	TTTCT	2	10	645072	645081	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017503	AATTT	2	10	663799	663808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017503	ATTAT	2	10	667209	667218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017503	ATTTT	2	10	673476	673485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017503	AACTT	2	10	674299	674308	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017503	TACTA	2	10	674419	674428	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017503	AAACT	2	10	679116	679125	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017503	AAAAT	2	10	689522	689531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017503	TAAAA	2	10	690360	690369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017503	TAATA	2	10	690995	691004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017503	ATTAT	2	10	691008	691017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017503	TAATA	2	10	696691	696700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017503	TTTTA	2	10	706805	706814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017503	CATCT	2	10	706918	706927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017503	AAAAT	2	10	708406	708415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017503	TATTT	2	10	708859	708868	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017503	CATCT	2	10	715732	715741	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017503	ATTTA	2	10	716403	716412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017503	ATTTA	2	10	716474	716483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017503	TAATT	2	10	721276	721285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017503	GGAAG	2	10	746374	746383	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017503	GATGA	2	10	746647	746656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017503	TCGGT	2	10	748406	748415	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017503	TTCAC	2	10	748981	748990	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017503	TATAT	2	10	749209	749218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017503	ATTTG	2	10	749222	749231	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017503	CCCTA	2	10	749906	749915	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_017503	CACGA	2	10	750287	750296	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017503	CTAGA	2	10	750706	750715	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017503	TAACT	2	10	758701	758710	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017503	AACTC	2	10	764224	764233	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017503	ATAAA	2	10	781714	781723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017503	AAAAT	2	10	782604	782613	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017503	TTTTA	2	10	791169	791178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017503	AAAAG	2	10	808868	808877	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017503	TTTTG	2	10	814685	814694	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017503	TTTTA	2	10	828339	828348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017503	ATTAA	2	10	837709	837718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017503	CCCTA	2	10	842186	842195	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017503	CACGA	2	10	842567	842576	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017503	CTAGA	2	10	842986	842995	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017503	ACTTC	2	10	860828	860837	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017503	AGATC	2	10	873971	873980	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017503	TTAAT	2	10	879956	879965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017503	CAATT	2	10	888483	888492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017503	TTATT	2	10	894487	894496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017503	GTTTG	2	10	896082	896091	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017503	AACTA	2	10	897186	897195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017503	TTGTT	2	10	899588	899597	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017503	AAAAT	2	10	906344	906353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017503	TAAAT	2	10	906399	906408	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017503	ATTAA	2	10	906424	906433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017503	AGATG	2	10	911569	911578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017503	TAAAA	2	10	912443	912452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017503	AATTA	2	10	927702	927711	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017503	ATGAC	2	10	928381	928390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017503	AAAAG	2	10	928448	928457	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017503	ATGTT	2	10	931527	931536	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017503	TGATT	2	10	931825	931834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017503	TCCTT	2	10	935513	935522	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
150	NC_017503	AATTT	2	10	935721	935730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017503	AATCA	2	10	949663	949672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017503	TAACA	2	10	949960	949969	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017503	TAACC	2	10	964788	964797	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.