MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. R(high) chromosome

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017502	AACTAA	2	12	4206	4217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325089
2	NC_017502	GCAATC	2	12	5895	5906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385325091
3	NC_017502	AGAAAA	2	12	8488	8499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325093
4	NC_017502	AATCTT	2	12	9894	9905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325095
5	NC_017502	CTGATA	2	12	14026	14037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325099
6	NC_017502	ACCTGA	2	12	20004	20015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385325104
7	NC_017502	CACTAC	2	12	20039	20050	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385325104
8	NC_017502	CATTAG	2	12	22272	22283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325107
9	NC_017502	TCAAGA	2	12	25328	25339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325108
10	NC_017502	TTAATG	2	12	25809	25820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325108
11	NC_017502	CAAAGA	2	12	27056	27067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325108
12	NC_017502	TGATCT	2	12	28015	28026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385325108
13	NC_017502	ATTATC	2	12	32748	32759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325113
14	NC_017502	GCTAAA	2	12	33544	33555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325113
15	NC_017502	AACTAA	2	12	34526	34537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325113
16	NC_017502	AAGCAA	2	12	35640	35651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325115
17	NC_017502	TGAAGA	2	12	36574	36585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325116
18	NC_017502	AGCTAA	2	12	37622	37633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325117
19	NC_017502	AATAAC	2	12	41101	41112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325118
20	NC_017502	CATTAG	2	12	44962	44973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325121
21	NC_017502	TTAAGA	2	12	47575	47586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325123
22	NC_017502	CTAAAG	2	12	52433	52444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325125
23	NC_017502	AATCGT	2	12	56555	56566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325128
24	NC_017502	TTGAGC	2	12	57694	57705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385325130
25	NC_017502	ACCTAA	2	12	58258	58269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385325130
26	NC_017502	AAACCA	2	12	60427	60438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385325132
27	NC_017502	AAAATC	2	12	65985	65996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325136
28	NC_017502	AAGAAA	2	12	68596	68607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325141
29	NC_017502	TTTATG	2	12	69836	69847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325143
30	NC_017502	AACAAA	2	12	70803	70814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325144
31	NC_017502	AGGTAA	2	12	71119	71130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325145
32	NC_017502	AGTTAA	2	12	72660	72671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325149
33	NC_017502	TAAAGG	2	12	74402	74413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325153
34	NC_017502	TAGGTG	2	12	79856	79867	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385325160
35	NC_017502	CTATTT	2	12	85167	85178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385325161
36	NC_017502	AATATT	2	12	85850	85861	50 %	50 %	0 %	0 %	385325161
37	NC_017502	AATAAA	2	12	87349	87360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385325162
38	NC_017502	ATTTAG	2	12	87392	87403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325162
39	NC_017502	AATGTT	2	12	89494	89505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325163
40	NC_017502	AATCTT	2	12	91576	91587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325165
41	NC_017502	GATCAT	2	12	91637	91648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325165
42	NC_017502	AAGAAA	2	12	98329	98340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325171
43	NC_017502	CTTGAT	2	12	100838	100849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385325173
44	NC_017502	GTGCAA	2	12	104282	104293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385325174
45	NC_017502	AAAACA	2	12	106890	106901	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325176
46	NC_017502	CAAAAG	2	12	109559	109570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325179
47	NC_017502	GTTTTA	2	12	110479	110490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325180
48	NC_017502	TTAAAG	2	12	114582	114593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325181
49	NC_017502	TAGAAG	2	12	117357	117368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325182
50	NC_017502	ATCCAT	2	12	119783	119794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325183
51	NC_017502	TTTCTC	2	12	121945	121956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385325184
52	NC_017502	CCAATC	2	12	123164	123175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385325185
53	NC_017502	ATTAAT	2	12	124088	124099	50 %	50 %	0 %	0 %	385325185
54	NC_017502	ATTTAT	2	12	125023	125034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385325186
55	NC_017502	GCTTGA	2	12	125726	125737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385325187
56	NC_017502	CTTTAA	2	12	129134	129145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325188
57	NC_017502	ATAAAT	2	12	131344	131355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385325190
58	NC_017502	ACAGAA	2	12	139034	139045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325195
59	NC_017502	TTGCTG	2	12	139299	139310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385325196
60	NC_017502	CTCGAT	2	12	142089	142100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385325198
61	NC_017502	GAACAA	3	18	144128	144145	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325199
62	NC_017502	AAAAAG	2	12	144297	144308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325199
63	NC_017502	AAAACA	2	12	145978	145989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325201
64	NC_017502	TAATAT	2	12	146113	146124	50 %	50 %	0 %	0 %	385325201
65	NC_017502	TGTTAA	2	12	152157	152168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325205
66	NC_017502	TTTGAT	2	12	153566	153577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325207
67	NC_017502	TAAATC	2	12	155703	155714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325208
68	NC_017502	TTAGAT	2	12	157905	157916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325209
69	NC_017502	TGGTGA	2	12	159391	159402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385325210
70	NC_017502	TTAAAG	2	12	164691	164702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325217
71	NC_017502	AAAGCT	2	12	166376	166387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325217
72	NC_017502	ATTGGT	2	12	171885	171896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385325222
73	NC_017502	ACATTC	2	12	172347	172358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325222
74	NC_017502	ATTCTT	2	12	172703	172714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385325222
75	NC_017502	CAGGTG	2	12	176637	176648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385325225
76	NC_017502	GAAAAA	2	12	176795	176806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325225
77	NC_017502	TTACTA	2	12	181108	181119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325233
78	NC_017502	GGTTTA	2	12	182138	182149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385325235
79	NC_017502	ATAATC	2	12	182269	182280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325235
80	NC_017502	ATTTAA	2	12	182526	182537	50 %	50 %	0 %	0 %	385325237
81	NC_017502	GATTTT	2	12	184854	184865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325239
82	NC_017502	CTTTAA	2	12	184879	184890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325239
83	NC_017502	CTTTAT	2	12	186811	186822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385325240
84	NC_017502	TTTTGT	2	12	187994	188005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385325241
85	NC_017502	TTTATT	2	12	192171	192182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385325245
86	NC_017502	AGAAAA	2	12	193159	193170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325246
87	NC_017502	TTTTGT	2	12	193358	193369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385325247
88	NC_017502	ACTTAA	2	12	193943	193954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325247
89	NC_017502	CTTGGG	2	12	195263	195274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385325248
90	NC_017502	ATCTTA	2	12	195370	195381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325248
91	NC_017502	TATCAT	2	12	196557	196568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325249
92	NC_017502	AAATGA	2	12	201016	201027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385325252
93	NC_017502	CAAAAA	2	12	201744	201755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325252
94	NC_017502	AAACAA	2	12	202535	202546	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325253
95	NC_017502	TTTATT	2	12	203084	203095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385325253
96	NC_017502	ACAGAA	2	12	206844	206855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325256
97	NC_017502	AAAAGA	2	12	211177	211188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385325260
98	NC_017502	ATCAAA	2	12	211290	211301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325260
99	NC_017502	AAATTA	2	12	214486	214497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385325263
100	NC_017502	GGGTTT	2	12	215844	215855	0 %	50 %	50 %	0 %	385325265
101	NC_017502	AACCAG	2	12	219202	219213	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385325267
102	NC_017502	TAAATT	2	12	219548	219559	50 %	50 %	0 %	0 %	385325267
103	NC_017502	TATGAT	2	12	220986	220997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385325267
104	NC_017502	CAAGTT	2	12	221588	221599	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325268
105	NC_017502	GGGATT	2	12	222366	222377	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385325269
106	NC_017502	TCAAGA	2	12	223590	223601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325271
107	NC_017502	CCTAAA	2	12	223921	223932	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385325271
108	NC_017502	AGATTA	2	12	225991	226002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325271
109	NC_017502	GGTATT	2	12	226216	226227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385325271
110	NC_017502	AATAAA	2	12	229739	229750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385325272
111	NC_017502	ATGCTA	2	12	230110	230121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325273
112	NC_017502	TCAAAA	2	12	236892	236903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325276
113	NC_017502	CCAAAT	2	12	238198	238209	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385325276
114	NC_017502	CATCGT	2	12	241925	241936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385325278
115	NC_017502	CTTTGT	2	12	244616	244627	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385325279
116	NC_017502	CAAAAA	2	12	247104	247115	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385325283
117	NC_017502	GGGATC	2	12	248947	248958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385325284
118	NC_017502	CAACAC	4	24	250874	250897	50 %	0 %	0 %	50 %	385325286
119	NC_017502	CTCCTA	2	12	251348	251359	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385325286
120	NC_017502	CACCAA	2	12	254104	254115	50 %	0 %	0 %	50 %	385325287
121	NC_017502	AGGAAC	2	12	255287	255298	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385325287
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123	NC_017502	TAATCC	2	12	265541	265552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325293
124	NC_017502	ATAGTG	2	12	266452	266463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385325293
125	NC_017502	ACTCCA	5	30	267773	267802	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385325294
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127	NC_017502	AACAGA	2	12	278313	278324	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325299
128	NC_017502	TAATCC	2	12	279726	279737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325300
129	NC_017502	ATAGTG	2	12	280637	280648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385325300
130	NC_017502	ACTCCA	5	30	281955	281984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385325301
131	NC_017502	CAACAC	6	36	284317	284352	50 %	0 %	0 %	50 %	385325302
132	NC_017502	AATCCT	2	12	284457	284468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325302
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135	NC_017502	GATAAA	2	12	292835	292846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385325305
136	NC_017502	TTTAAA	2	12	293722	293733	50 %	50 %	0 %	0 %	385325305
137	NC_017502	TTAAAT	2	12	296869	296880	50 %	50 %	0 %	0 %	385325307
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139	NC_017502	TTTAGT	2	12	301078	301089	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325311
140	NC_017502	GATTAA	2	12	304540	304551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325316
141	NC_017502	ACTTTA	2	12	305312	305323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325316
142	NC_017502	AGCTAA	2	12	307180	307191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325316
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150	NC_017502	TAATCT	2	12	327425	327436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325327
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227	NC_017502	TCCCCA	2	12	464233	464244	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385325432
228	NC_017502	CTAGAA	2	12	466789	466800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325434
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231	NC_017502	AGCTAA	2	12	469603	469614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325435
232	NC_017502	CAAAGA	2	12	469915	469926	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325435
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234	NC_017502	AGAAGT	2	12	473979	473990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385325437
235	NC_017502	GAACAA	2	12	475754	475765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385325438
236	NC_017502	TCAACC	2	12	476897	476908	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385325440
237	NC_017502	TGGTGC	2	12	476945	476956	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385325440
238	NC_017502	TTAATT	2	12	476992	477003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385325440
239	NC_017502	CTCCAG	2	12	477265	477276	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385325440
240	NC_017502	ACATTT	2	12	477783	477794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325440
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242	NC_017502	AATCAA	2	12	478179	478190	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385325441
243	NC_017502	GATAAT	2	12	479842	479853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385325442
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260	NC_017502	TGCAGT	2	12	512028	512039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385325462
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348	NC_017502	TTAGCA	2	12	694473	694484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325615
349	NC_017502	AACTTC	2	12	694988	694999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325615
350	NC_017502	AACTTC	2	12	695075	695086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325615
351	NC_017502	TTTGTT	2	12	697084	697095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385325615
352	NC_017502	ACTTCA	2	12	697914	697925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385325615
353	NC_017502	TTGGGT	2	12	702871	702882	0 %	50 %	50 %	0 %	385325618
354	NC_017502	TTTCAC	2	12	704128	704139	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385325619
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357	NC_017502	GCAATC	2	12	710587	710598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385325626
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360	NC_017502	TATCAA	2	12	711236	711247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325626
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366	NC_017502	TCATGA	2	12	731393	731404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325638
367	NC_017502	TTAATC	2	12	737390	737401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325643
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371	NC_017502	TACTGC	2	12	742409	742420	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385325648
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373	NC_017502	CGTGAC	2	12	743913	743924	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385325651
374	NC_017502	AGCTTC	2	12	746212	746223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385325652
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445	NC_017502	TCAGTA	2	12	934753	934764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385325804
446	NC_017502	TGTTTA	2	12	936289	936300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325804
447	NC_017502	GGCAAT	2	12	937411	937422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385325805
448	NC_017502	GCTGAA	2	12	945052	945063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385325809
449	NC_017502	GTTATT	2	12	947902	947913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385325811
450	NC_017502	TTGATC	2	12	949227	949238	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385325812
451	NC_017502	TAAAGA	2	12	952995	953006	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385325813
452	NC_017502	CATTAA	2	12	953210	953221	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385325813
453	NC_017502	ATTACT	2	12	953316	953327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385325813
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456	NC_017502	TCAGAA	2	12	958304	958315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385325815
457	NC_017502	TATTTT	2	12	960575	960586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385325816
458	NC_017502	AAACCT	2	12	963429	963440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385325817
459	NC_017502	AAACCT	3	18	969014	969031	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385325820
460	NC_017502	TTTTTA	2	12	969148	969159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385325821
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