MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis 8013

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017501	ACCGAA	2	12	16306	16317	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017501	CGGTGG	3	18	20893	20910	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017501	TGGCGG	2	12	21785	21796	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017501	GGCTTG	2	12	27864	27875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017501	TTCGGT	2	12	43085	43096	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017501	TTCGGT	2	12	44319	44330	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017501	ACAAAG	2	12	59876	59887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017501	CAGGAG	2	12	84670	84681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017501	CGCGGT	2	12	101540	101551	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017501	AAATTT	2	12	102750	102761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017501	GTTTTA	2	12	106535	106546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017501	CGCGGT	2	12	108446	108457	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017501	CTTATG	2	12	112591	112602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017501	GGAAAA	2	12	129923	129934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017501	CAAAAA	2	12	188627	188638	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017501	CAAAAA	2	12	218472	218483	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017501	AGCAAA	2	12	219438	219449	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017501	CAAAAA	2	12	219495	219506	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017501	TCCCTT	2	12	237944	237955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017501	TTAAAT	2	12	283586	283597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017501	TAAAAA	2	12	304069	304080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017501	ACAAAG	2	12	317119	317130	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017501	TTTCTT	2	12	324863	324874	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017501	TTCGGT	2	12	328443	328454	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017501	TTCGGT	2	12	328964	328975	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017501	TTCGGT	2	12	329486	329497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017501	TTTGAA	2	12	356322	356333	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017501	TTAAAT	2	12	389849	389860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017501	TTCGGA	2	12	393002	393013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017501	TTGATA	2	12	410451	410462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017501	CCACAC	2	12	410796	410807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017501	TGATTT	2	12	427428	427439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017501	AAACGC	2	12	439053	439064	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017501	TTTCCG	2	12	471030	471041	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017501	TTAAAT	2	12	475106	475117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017501	TTCGGT	2	12	495203	495214	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017501	TTCGGT	2	12	495478	495489	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017501	TTCGGT	2	12	495782	495793	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017501	TTCGGT	2	12	496349	496360	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017501	ATAAAA	2	12	519610	519621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017501	ACCGAA	2	12	521712	521723	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017501	CTGTCG	2	12	526653	526664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017501	TGTCGG	2	12	529070	529081	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017501	CTGTCG	2	12	533278	533289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017501	CTTTAC	2	12	533861	533872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017501	ATATTG	2	12	534058	534069	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017501	AGCGGT	2	12	534878	534889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017501	GGGTAT	2	12	537269	537280	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017501	CAAAAT	2	12	560492	560503	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017501	CCGGAG	2	12	564005	564016	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017501	GAGCCG	2	12	564062	564073	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017501	TCCAAA	2	12	565119	565130	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017501	CACCAA	2	12	565760	565771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017501	CCGGAG	2	12	566322	566333	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017501	CTATAC	2	12	583985	583996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017501	AGGTTA	2	12	584889	584900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017501	CTTTGG	2	12	585036	585047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017501	CAAGAC	2	12	585186	585197	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017501	TTCCAG	2	12	586185	586196	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017501	ACATCA	2	12	588404	588415	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017501	ACATCA	2	12	588683	588694	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017501	CAAAGC	2	12	588946	588957	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017501	CCAAGC	2	12	589509	589520	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017501	GCCATA	2	12	589817	589828	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017501	AAGAGA	2	12	591140	591151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017501	CACTTA	2	12	592449	592460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017501	TATGCC	2	12	604440	604451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017501	ATTTAA	2	12	613241	613252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017501	GTATAT	2	12	632595	632606	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017501	GAAATG	2	12	666580	666591	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017501	ACAAAG	2	12	702987	702998	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017501	CGCGGT	2	12	713509	713520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017501	TGATTT	2	12	714352	714363	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017501	GGCTGC	2	12	733869	733880	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017501	ACCGAA	2	12	734632	734643	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017501	CATGGT	2	12	738332	738343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017501	GGAAGT	2	12	739741	739752	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017501	TTCGGT	2	12	747685	747696	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017501	ATTTAA	2	12	756990	757001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017501	TCTGAA	2	12	763049	763060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017501	CGTATC	2	12	764910	764921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017501	CAAAAA	2	12	781065	781076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017501	ATTTAA	2	12	781652	781663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017501	TTTGAC	2	12	801669	801680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017501	AAGTGA	2	12	830399	830410	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017501	TCCGAT	2	12	869814	869825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017501	CGGTTT	2	12	871908	871919	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017501	AACCGA	2	12	883500	883511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017501	TTTTTG	2	12	899429	899440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017501	GCAGCC	2	12	915279	915290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017501	AGACAA	2	12	915364	915375	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017501	AAACCA	2	12	915726	915737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017501	TTAAAT	2	12	917962	917973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017501	TTAAAT	2	12	918430	918441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017501	TGCCTG	2	12	918781	918792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017501	TATTTT	2	12	958359	958370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017501	TCTCTT	2	12	969186	969197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017501	GCTGTC	2	12	969937	969948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017501	TTAAAT	2	12	980410	980421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017501	ATTTAT	2	12	980437	980448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017501	GTTACC	2	12	988099	988110	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017501	GCCGTT	2	12	988375	988386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017501	TGCCGT	2	12	988443	988454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017501	GCCGTC	2	12	988504	988515	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017501	TTTGTT	2	12	1021847	1021858	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017501	CATATT	2	12	1034828	1034839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017501	AGCCGG	2	12	1113758	1113769	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017501	CTGAAA	2	12	1113871	1113882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017501	AAGCCC	2	12	1128615	1128626	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017501	CACAGC	2	12	1140511	1140522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017501	GACGAA	2	12	1148754	1148765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017501	TCGGCA	2	12	1167878	1167889	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017501	CGGTTT	2	12	1224580	1224591	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017501	CGATGA	2	12	1225445	1225456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017501	AACGGG	2	12	1258140	1258151	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017501	GCTTTG	2	12	1277100	1277111	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017501	CATCAA	2	12	1305856	1305867	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017501	TTAAAT	2	12	1313600	1313611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017501	TCAAAT	2	12	1323355	1323366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017501	GCCGAA	2	12	1342185	1342196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017501	ATTTAA	2	12	1351354	1351365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017501	TTAAAT	2	12	1359514	1359525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017501	ATCGGC	2	12	1361574	1361585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017501	CAAACG	2	12	1378481	1378492	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017501	ATTTAA	2	12	1378636	1378647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017501	TGCATT	2	12	1383707	1383718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017501	ATAAAA	2	12	1384151	1384162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017501	ACCGAA	2	12	1386253	1386264	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017501	CAAAGA	2	12	1391586	1391597	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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132	NC_017501	GAAAAA	2	12	1419927	1419938	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.