MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis 8013

Total Repeats: 1644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017501	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385323174
2	NC_017501	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385323175
3	NC_017501	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385323175
4	NC_017501	ACCAA	2	10	4463	4472	60 %	0 %	0 %	40 %	385323179
5	NC_017501	AAGGC	2	10	6080	6089	40 %	0 %	40 %	20 %	385323181
6	NC_017501	GCTTT	2	10	6438	6447	0 %	60 %	20 %	20 %	385323182
7	NC_017501	TCAAT	2	10	9467	9476	40 %	40 %	0 %	20 %	385323184
8	NC_017501	CGCGC	2	10	10480	10489	0 %	0 %	40 %	60 %	385323185
9	NC_017501	CCCGT	2	10	10501	10510	0 %	20 %	20 %	60 %	385323185
10	NC_017501	CACGC	2	10	10796	10805	20 %	0 %	20 %	60 %	385323186
11	NC_017501	TCCCG	2	10	11650	11659	0 %	20 %	20 %	60 %	385323186
12	NC_017501	TGTCG	2	10	13106	13115	0 %	40 %	40 %	20 %	385323187
13	NC_017501	ATTTA	2	10	13453	13462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017501	CTTGC	2	10	16885	16894	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017501	GGAAA	2	10	17512	17521	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017501	AATTT	2	10	17890	17899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017501	AGGCG	2	10	23634	23643	20 %	0 %	60 %	20 %	385323192
18	NC_017501	AGGGC	2	10	25756	25765	20 %	0 %	60 %	20 %	385323193
19	NC_017501	AAACC	2	10	26459	26468	60 %	0 %	0 %	40 %	385323194
20	NC_017501	TCCGC	2	10	29756	29765	0 %	20 %	20 %	60 %	385323196
21	NC_017501	GCCTT	2	10	32588	32597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_017501	CATTC	2	10	34351	34360	20 %	40 %	0 %	40 %	385323200
23	NC_017501	AGGTG	2	10	34798	34807	20 %	20 %	60 %	0 %	385323201
24	NC_017501	GTCGG	2	10	35487	35496	0 %	20 %	60 %	20 %	385323201
25	NC_017501	GGGCT	2	10	37461	37470	0 %	20 %	60 %	20 %	385323203
26	NC_017501	TGCGG	2	10	40000	40009	0 %	20 %	60 %	20 %	385323206
27	NC_017501	GGCGG	2	10	40959	40968	0 %	0 %	80 %	20 %	385323206
28	NC_017501	GCGGT	2	10	41435	41444	0 %	20 %	60 %	20 %	385323207
29	NC_017501	GCGCG	2	10	41832	41841	0 %	0 %	60 %	40 %	385323207
30	NC_017501	ACGGC	2	10	42377	42386	20 %	0 %	40 %	40 %	385323207
31	NC_017501	CCCGT	2	10	44537	44546	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017501	GATTG	2	10	44964	44973	20 %	40 %	40 %	0 %	385323209
33	NC_017501	GGGCA	2	10	47061	47070	20 %	0 %	60 %	20 %	385323209
34	NC_017501	GAAAA	2	10	47496	47505	80 %	0 %	20 %	0 %	385323209
35	NC_017501	CAATT	2	10	47839	47848	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017501	GTTGG	2	10	50845	50854	0 %	40 %	60 %	0 %	385323210
37	NC_017501	AAACC	2	10	53235	53244	60 %	0 %	0 %	40 %	385323211
38	NC_017501	GCCAA	2	10	54194	54203	40 %	0 %	20 %	40 %	385323212
39	NC_017501	GTGCG	2	10	55586	55595	0 %	20 %	60 %	20 %	385323213
40	NC_017501	GTAGC	2	10	58761	58770	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017501	TCGTG	2	10	58978	58987	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017501	AGAAA	2	10	59939	59948	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017501	GGGAG	2	10	60603	60612	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017501	AGGTT	2	10	61545	61554	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017501	ATTTT	2	10	63959	63968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017501	TGCCG	2	10	66011	66020	0 %	20 %	40 %	40 %	385323219
47	NC_017501	TGGCT	2	10	66340	66349	0 %	40 %	40 %	20 %	385323219
48	NC_017501	TGCCC	2	10	66947	66956	0 %	20 %	20 %	60 %	385323219
49	NC_017501	TCTTT	2	10	68831	68840	0 %	80 %	0 %	20 %	385323221
50	NC_017501	GCGTA	2	10	69057	69066	20 %	20 %	40 %	20 %	385323222
51	NC_017501	TCGGC	2	10	70814	70823	0 %	20 %	40 %	40 %	385323223
52	NC_017501	TGCTA	2	10	72223	72232	20 %	40 %	20 %	20 %	385323224
53	NC_017501	ACATA	2	10	74991	75000	60 %	20 %	0 %	20 %	385323226
54	NC_017501	AAGCA	2	10	75965	75974	60 %	0 %	20 %	20 %	385323227
55	NC_017501	TTTAA	2	10	76215	76224	40 %	60 %	0 %	0 %	385323227
56	NC_017501	GATTT	2	10	78128	78137	20 %	60 %	20 %	0 %	385323229
57	NC_017501	TGTAT	2	10	79538	79547	20 %	60 %	20 %	0 %	385323230
58	NC_017501	AAAAG	2	10	79722	79731	80 %	0 %	20 %	0 %	385323231
59	NC_017501	TTTGA	2	10	80345	80354	20 %	60 %	20 %	0 %	385323231
60	NC_017501	TGGCT	2	10	81278	81287	0 %	40 %	40 %	20 %	385323232
61	NC_017501	GCAAG	2	10	82559	82568	40 %	0 %	40 %	20 %	385323234
62	NC_017501	GCGCG	2	10	83618	83627	0 %	0 %	60 %	40 %	385323234
63	NC_017501	CAACG	2	10	84540	84549	40 %	0 %	20 %	40 %	385323234
64	NC_017501	TTGAT	2	10	84853	84862	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017501	TTTCC	2	10	85174	85183	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017501	ATTTT	2	10	85523	85532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017501	CTACC	2	10	86320	86329	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_017501	TACGC	2	10	87685	87694	20 %	20 %	20 %	40 %	385323235
69	NC_017501	CCCGT	2	10	90761	90770	0 %	20 %	20 %	60 %	385323238
70	NC_017501	CCGTA	2	10	90998	91007	20 %	20 %	20 %	40 %	385323238
71	NC_017501	ACATC	2	10	91899	91908	40 %	20 %	0 %	40 %	385323239
72	NC_017501	GGCAA	2	10	93157	93166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017501	CGCAA	2	10	93611	93620	40 %	0 %	20 %	40 %	385323240
74	NC_017501	ACCGC	2	10	99907	99916	20 %	0 %	20 %	60 %	385323245
75	NC_017501	AAACC	2	10	100349	100358	60 %	0 %	0 %	40 %	385323245
76	NC_017501	ACCAA	2	10	102024	102033	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017501	ATTTA	2	10	102846	102855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017501	AAATA	2	10	102856	102865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017501	ATTAA	2	10	102881	102890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017501	CAGGT	2	10	104463	104472	20 %	20 %	40 %	20 %	385323249
81	NC_017501	TTTGA	2	10	105173	105182	20 %	60 %	20 %	0 %	385323249
82	NC_017501	AATGA	2	10	105880	105889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017501	GAACA	2	10	107763	107772	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017501	CGTGC	2	10	109068	109077	0 %	20 %	40 %	40 %	385323251
85	NC_017501	GCCGC	2	10	110227	110236	0 %	0 %	40 %	60 %	385323252
86	NC_017501	AATTG	2	10	111013	111022	40 %	40 %	20 %	0 %	385323254
87	NC_017501	AAAAT	2	10	111274	111283	80 %	20 %	0 %	0 %	385323254
88	NC_017501	CGGCG	2	10	113114	113123	0 %	0 %	60 %	40 %	385323257
89	NC_017501	CAGGT	2	10	114580	114589	20 %	20 %	40 %	20 %	385323259
90	NC_017501	CGCCT	2	10	115266	115275	0 %	20 %	20 %	60 %	385323260
91	NC_017501	GGTAT	2	10	115506	115515	20 %	40 %	40 %	0 %	385323260
92	NC_017501	GGCGC	2	10	115757	115766	0 %	0 %	60 %	40 %	385323260
93	NC_017501	TGCCG	2	10	116880	116889	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017501	GGCGC	3	15	117303	117317	0 %	0 %	60 %	40 %	385323262
95	NC_017501	CAAAG	2	10	117512	117521	60 %	0 %	20 %	20 %	385323262
96	NC_017501	GCGCC	2	10	118719	118728	0 %	0 %	40 %	60 %	385323263
97	NC_017501	GGCGC	2	10	118948	118957	0 %	0 %	60 %	40 %	385323263
98	NC_017501	TGAGT	2	10	120565	120574	20 %	40 %	40 %	0 %	385323265
99	NC_017501	CGGCG	2	10	121069	121078	0 %	0 %	60 %	40 %	385323265
100	NC_017501	GGCAA	2	10	121142	121151	40 %	0 %	40 %	20 %	385323265
101	NC_017501	CGGCG	2	10	122909	122918	0 %	0 %	60 %	40 %	385323266
102	NC_017501	GTTTT	2	10	123582	123591	0 %	80 %	20 %	0 %	385323267
103	NC_017501	CGTGT	2	10	125346	125355	0 %	40 %	40 %	20 %	385323269
104	NC_017501	GAAAA	2	10	125760	125769	80 %	0 %	20 %	0 %	385323269
105	NC_017501	AGGGC	2	10	125897	125906	20 %	0 %	60 %	20 %	385323269
106	NC_017501	TAATA	2	10	128614	128623	60 %	40 %	0 %	0 %	385323271
107	NC_017501	GAAGG	2	10	132253	132262	40 %	0 %	60 %	0 %	385323276
108	NC_017501	GTACC	2	10	133824	133833	20 %	20 %	20 %	40 %	385323279
109	NC_017501	TTGGG	2	10	138854	138863	0 %	40 %	60 %	0 %	385323282
110	NC_017501	CATAC	2	10	141325	141334	40 %	20 %	0 %	40 %	385323283
111	NC_017501	GTGAT	2	10	142204	142213	20 %	40 %	40 %	0 %	385323283
112	NC_017501	CTTTA	2	10	150845	150854	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017501	TGATT	2	10	153639	153648	20 %	60 %	20 %	0 %	385323296
114	NC_017501	AATGC	2	10	154333	154342	40 %	20 %	20 %	20 %	385323297
115	NC_017501	GTAAA	2	10	155284	155293	60 %	20 %	20 %	0 %	385323300
116	NC_017501	AATTT	2	10	155508	155517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017501	TCAAA	2	10	156356	156365	60 %	20 %	0 %	20 %	385323302
118	NC_017501	TTTGG	2	10	157167	157176	0 %	60 %	40 %	0 %	385323304
119	NC_017501	GAAAT	2	10	161013	161022	60 %	20 %	20 %	0 %	385323311
120	NC_017501	AAAAT	2	10	161275	161284	80 %	20 %	0 %	0 %	385323313
121	NC_017501	GGGTT	2	10	162762	162771	0 %	40 %	60 %	0 %	385323316
122	NC_017501	GTCAT	2	10	163284	163293	20 %	40 %	20 %	20 %	385323317
123	NC_017501	GCAAA	2	10	165657	165666	60 %	0 %	20 %	20 %	385323320
124	NC_017501	CGGTT	2	10	165687	165696	0 %	40 %	40 %	20 %	385323320
125	NC_017501	TGGCG	2	10	169200	169209	0 %	20 %	60 %	20 %	385323323
126	NC_017501	CGGCG	2	10	170727	170736	0 %	0 %	60 %	40 %	385323324
127	NC_017501	CCAAA	2	10	171116	171125	60 %	0 %	0 %	40 %	385323324
128	NC_017501	TTTAT	2	10	171323	171332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017501	TGGTT	2	10	172019	172028	0 %	60 %	40 %	0 %	385323325
130	NC_017501	TTGAT	2	10	172378	172387	20 %	60 %	20 %	0 %	385323325
131	NC_017501	TGCCG	2	10	172725	172734	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017501	GCCGC	2	10	173119	173128	0 %	0 %	40 %	60 %	385323326
133	NC_017501	CGGCG	2	10	174583	174592	0 %	0 %	60 %	40 %	385323327
134	NC_017501	TCTGC	2	10	174670	174679	0 %	40 %	20 %	40 %	385323327
135	NC_017501	TTTCC	2	10	175295	175304	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017501	CTCGG	2	10	179783	179792	0 %	20 %	40 %	40 %	385323331
137	NC_017501	GCCGT	2	10	182285	182294	0 %	20 %	40 %	40 %	385323333
138	NC_017501	ACCAA	2	10	183127	183136	60 %	0 %	0 %	40 %	385323334
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182	NC_017501	CATTT	2	10	247278	247287	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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254	NC_017501	ATTGT	2	10	344068	344077	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_017501	GTCGC	2	10	348542	348551	0 %	20 %	40 %	40 %	385323469
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263	NC_017501	CGGGG	2	10	356007	356016	0 %	0 %	80 %	20 %	385323475
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267	NC_017501	GTTTT	2	10	361771	361780	0 %	80 %	20 %	0 %	385323480
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271	NC_017501	GGGCA	2	10	373145	373154	20 %	0 %	60 %	20 %	385323495
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274	NC_017501	CAAAA	2	10	375980	375989	80 %	0 %	0 %	20 %	385323497
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287	NC_017501	CGGTA	2	10	391808	391817	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_017501	TATGT	2	10	410068	410077	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017501	TGCCG	2	10	419045	419054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
304	NC_017501	TCGGA	2	10	419408	419417	20 %	20 %	40 %	20 %	385323530
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343	NC_017501	GAAGA	10	50	466345	466394	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_017501	TACAG	2	10	475262	475271	40 %	20 %	20 %	20 %	385323575
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370	NC_017501	ATAAA	2	10	509718	509727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
371	NC_017501	TTATT	2	10	512052	512061	20 %	80 %	0 %	0 %	385323598
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377	NC_017501	GTTTT	2	10	518319	518328	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
378	NC_017501	AACAT	2	10	519275	519284	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
379	NC_017501	TAATT	2	10	519296	519305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_017501	GAATT	2	10	519326	519335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
381	NC_017501	ATGAA	2	10	521817	521826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
382	NC_017501	GCACC	2	10	522406	522415	20 %	0 %	20 %	60 %	385323610
383	NC_017501	CCGCC	2	10	526042	526051	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
384	NC_017501	TTTGA	2	10	526910	526919	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
385	NC_017501	CTTTG	2	10	526981	526990	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
386	NC_017501	TCAAC	2	10	527416	527425	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
387	NC_017501	AAATG	2	10	527713	527722	60 %	20 %	20 %	0 %	385323611
388	NC_017501	TTATT	2	10	530737	530746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017501	TGAAA	2	10	530760	530769	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
390	NC_017501	TTTGA	2	10	533535	533544	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
391	NC_017501	CTTTG	2	10	533606	533615	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
392	NC_017501	TTTGC	2	10	533958	533967	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
393	NC_017501	GATGT	2	10	537175	537184	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
394	NC_017501	CAAAC	2	10	539686	539695	60 %	0 %	0 %	40 %	385323614
395	NC_017501	TTGCC	2	10	540256	540265	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
396	NC_017501	GTGAA	2	10	542690	542699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017501	AGCGA	2	10	543461	543470	40 %	0 %	40 %	20 %	385323616
398	NC_017501	TTTTC	2	10	544270	544279	0 %	80 %	0 %	20 %	385323617
399	NC_017501	AGCAC	2	10	545903	545912	40 %	0 %	20 %	40 %	385323618
400	NC_017501	ATATG	2	10	551662	551671	40 %	40 %	20 %	0 %	385323619
401	NC_017501	TAAAT	2	10	553498	553507	60 %	40 %	0 %	0 %	385323621
402	NC_017501	GTTTG	2	10	554526	554535	0 %	60 %	40 %	0 %	385323622
403	NC_017501	CGGTA	2	10	558734	558743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_017501	GACAG	2	10	559494	559503	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
405	NC_017501	ATTGG	2	10	562250	562259	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_017501	AGCGG	2	10	568734	568743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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413	NC_017501	TTTGT	2	10	572712	572721	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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