MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN3

Total Repeats: 978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017499	ATT	2	6	110	115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017499	TAA	2	6	131	136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017499	ACC	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017499	CAC	2	6	1117	1122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017499	ATT	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017499	CAT	2	6	1199	1204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017499	TAA	2	6	2324	2329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017499	AAT	2	6	2621	2626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017499	AAG	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017499	GTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017499	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017499	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017499	AAT	2	6	4654	4659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017499	CTA	2	6	4704	4709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017499	CTA	2	6	4719	4724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017499	TCT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017499	ATA	2	6	4932	4937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017499	TTC	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017499	TGA	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017499	ATT	2	6	5011	5016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017499	GTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017499	AAT	2	6	5056	5061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017499	ATT	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017499	ATT	3	9	5095	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017499	TCC	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017499	TAA	2	6	5146	5151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017499	ACA	2	6	5181	5186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017499	AAG	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017499	TTA	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017499	TAA	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017499	TGA	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017499	ATA	2	6	6489	6494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017499	AAG	2	6	6516	6521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017499	AAT	2	6	6719	6724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017499	ATA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017499	ACA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017499	TAA	2	6	6782	6787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017499	ATT	2	6	6793	6798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017499	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017499	GGA	2	6	6978	6983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017499	CGC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017499	GGT	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017499	AAT	3	9	7220	7228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017499	ATG	2	6	8344	8349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017499	TTA	2	6	8384	8389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017499	ACT	2	6	8432	8437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017499	CGA	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017499	AGT	2	6	8554	8559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017499	CAT	2	6	8588	8593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017499	ATA	2	6	8691	8696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017499	TAT	2	6	8742	8747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017499	TTA	2	6	8915	8920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017499	AGC	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017499	AAT	2	6	11495	11500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017499	ATA	2	6	11692	11697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017499	AGA	2	6	11787	11792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017499	TAT	2	6	11841	11846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017499	GAA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017499	GAA	2	6	11866	11871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017499	AAC	2	6	11927	11932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017499	AAG	2	6	11997	12002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017499	GAA	3	9	12095	12103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017499	TGT	2	6	12226	12231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017499	ATT	2	6	12311	12316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017499	GAA	2	6	13229	13234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017499	ATT	2	6	13309	13314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017499	TAT	2	6	13328	13333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017499	TAT	2	6	14049	14054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017499	GGT	2	6	14334	14339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017499	AGC	2	6	14359	14364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017499	AGT	2	6	14365	14370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017499	AGA	2	6	14371	14376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017499	ATA	2	6	17303	17308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017499	CTT	2	6	17318	17323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017499	ATT	2	6	17334	17339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017499	TAG	2	6	17346	17351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017499	AAC	2	6	17367	17372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017499	TAT	2	6	17493	17498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017499	GAA	2	6	20355	20360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017499	AAG	2	6	20407	20412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017499	GAT	2	6	20443	20448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017499	TGG	2	6	20494	20499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017499	AGG	2	6	20582	20587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017499	AAG	2	6	20609	20614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017499	CTG	2	6	22892	22897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017499	AAT	2	6	22917	22922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017499	GTA	2	6	23051	23056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017499	AAC	2	6	23118	23123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017499	CAC	2	6	24945	24950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017499	AAG	2	6	24961	24966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017499	TAA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017499	ATA	2	6	26221	26226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017499	GTT	2	6	27287	27292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017499	ATA	2	6	27314	27319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017499	ACA	2	6	27347	27352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017499	ACT	3	9	29514	29522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017499	AGA	2	6	29553	29558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017499	TAG	2	6	29655	29660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017499	ATA	2	6	29750	29755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017499	ATA	2	6	29862	29867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017499	TAG	2	6	30485	30490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017499	TGA	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017499	GAT	2	6	38520	38525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017499	GTT	2	6	38531	38536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017499	AGA	2	6	38555	38560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017499	TGA	2	6	38581	38586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017499	ATA	2	6	42005	42010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017499	AGT	2	6	42085	42090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017499	TAG	2	6	42164	42169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017499	AGA	2	6	42239	42244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017499	ATG	2	6	44953	44958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017499	AAT	2	6	47840	47845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017499	GTA	2	6	49079	49084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017499	AGC	2	6	49164	49169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017499	TGA	2	6	49180	49185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017499	ATT	3	9	49212	49220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017499	TAT	2	6	49326	49331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017499	ATT	2	6	49338	49343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017499	TTA	2	6	49352	49357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017499	TGT	2	6	50985	50990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017499	CAG	2	6	50994	50999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017499	TGA	2	6	51780	51785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017499	CTT	2	6	51804	51809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017499	CTG	2	6	51810	51815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017499	CAG	2	6	51831	51836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017499	TTC	2	6	51949	51954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017499	CTT	2	6	51958	51963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017499	ATA	2	6	51989	51994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017499	AAT	2	6	52029	52034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017499	ATT	2	6	52210	52215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017499	TAA	2	6	52373	52378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017499	ATT	2	6	52383	52388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017499	AGC	2	6	52636	52641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017499	GCA	2	6	53444	53449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017499	TAA	2	6	54019	54024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017499	GAA	2	6	54030	54035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017499	AAT	2	6	54036	54041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017499	CAG	2	6	54050	54055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017499	ATA	2	6	55013	55018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017499	TTG	2	6	55122	55127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_017499	ATT	2	6	55171	55176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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