MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA504

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017497	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017497	CAA	2	6	29	34	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017497	ATT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017497	TGA	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836923
5	NC_017497	CTT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836923
6	NC_017497	AAT	2	6	329	334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836923
7	NC_017497	TAA	2	6	603	608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836924
8	NC_017497	TAA	2	6	738	743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836924
9	NC_017497	GAT	2	6	748	753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836924
10	NC_017497	GTT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836924
11	NC_017497	ATT	2	6	865	870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836924
12	NC_017497	ATG	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836924
13	NC_017497	GTA	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836924
14	NC_017497	GAG	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836924
15	NC_017497	CCA	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385836924
16	NC_017497	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836924
17	NC_017497	AAG	2	6	1763	1768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836924
18	NC_017497	AGA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836924
19	NC_017497	CAA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017497	AGG	2	6	2278	2283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017497	ACA	2	6	2347	2352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836925
22	NC_017497	TGA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836925
23	NC_017497	AAT	2	6	2431	2436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
24	NC_017497	AAT	2	6	2539	2544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
25	NC_017497	TTA	2	6	2824	2829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836925
26	NC_017497	TGT	2	6	2869	2874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836925
27	NC_017497	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836925
28	NC_017497	TGA	2	6	2959	2964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836925
29	NC_017497	ATA	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
30	NC_017497	TAA	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836925
31	NC_017497	GAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836925
32	NC_017497	GAC	2	6	3254	3259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836925
33	NC_017497	ACA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836925
34	NC_017497	TGG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836925
35	NC_017497	TGA	2	6	3499	3504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836925
36	NC_017497	TGT	2	6	3556	3561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836925
37	NC_017497	ACG	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836925
38	NC_017497	TTA	2	6	3578	3583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836925
39	NC_017497	ACA	2	6	3584	3589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836925
40	NC_017497	TTG	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836925
41	NC_017497	TTC	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836925
42	NC_017497	GTG	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836925
43	NC_017497	TCA	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836925
44	NC_017497	CAT	2	6	3739	3744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836925

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.