MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	GTTTGA	2	12	1285	1296	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385836855
2	NC_017496	CTTTGT	2	12	1332	1343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385836855
3	NC_017496	AATTTC	2	12	1574	1585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385836855
4	NC_017496	TCATTG	2	12	5925	5936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385836861
5	NC_017496	ATTTAG	2	12	11080	11091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385836864
6	NC_017496	ATCCAT	2	12	14555	14566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836868
7	NC_017496	ACCAGC	2	12	17190	17201	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385836871
8	NC_017496	TTTCTT	2	12	20382	20393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385836873
9	NC_017496	TGACAA	2	12	23643	23654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385836877
10	NC_017496	TGCAGT	2	12	25227	25238	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385836879
11	NC_017496	TTTGAT	2	12	27310	27321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385836880
12	NC_017496	TTTTTC	2	12	27362	27373	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385836880
13	NC_017496	TTTGAT	2	12	29237	29248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385836883
14	NC_017496	TTTTTC	2	12	29289	29300	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385836883
15	NC_017496	AACGTG	2	12	30043	30054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385836885
16	NC_017496	GATTAT	2	12	32398	32409	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385836890
17	NC_017496	CTTTAT	2	12	34300	34311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017496	TTAATT	2	12	39238	39249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017496	GCAATA	2	12	39843	39854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017496	TTTATT	2	12	40786	40797	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017496	ATAACA	2	12	43349	43360	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017496	AATTAA	2	12	44780	44791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836910
23	NC_017496	GAAAAA	2	12	46347	46358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385836912
24	NC_017496	TGTAAC	2	12	51649	51660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.