MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	AGAAC	2	10	375	384	60 %	0 %	20 %	20 %	385836854
2	NC_017496	TTTTG	2	10	2020	2029	0 %	80 %	20 %	0 %	385836855
3	NC_017496	ATACA	2	10	2416	2425	60 %	20 %	0 %	20 %	385836856
4	NC_017496	CTTAT	2	10	2435	2444	20 %	60 %	0 %	20 %	385836856
5	NC_017496	ATAAG	2	10	2621	2630	60 %	20 %	20 %	0 %	385836856
6	NC_017496	CCGTT	2	10	4902	4911	0 %	40 %	20 %	40 %	385836857
7	NC_017496	ATTTT	2	10	5451	5460	20 %	80 %	0 %	0 %	385836859
8	NC_017496	TAGTA	2	10	7451	7460	40 %	40 %	20 %	0 %	385836863
9	NC_017496	ATTGC	2	10	8351	8360	20 %	40 %	20 %	20 %	385836863
10	NC_017496	TAATT	2	10	8455	8464	40 %	60 %	0 %	0 %	385836863
11	NC_017496	TCCAA	2	10	11469	11478	40 %	20 %	0 %	40 %	385836864
12	NC_017496	TCTTT	2	10	13111	13120	0 %	80 %	0 %	20 %	385836866
13	NC_017496	TTAAT	2	10	13156	13165	40 %	60 %	0 %	0 %	385836866
14	NC_017496	ATTAG	2	10	13392	13401	40 %	40 %	20 %	0 %	385836866
15	NC_017496	ATTCC	2	10	14077	14086	20 %	40 %	0 %	40 %	385836868
16	NC_017496	GCATG	2	10	14409	14418	20 %	20 %	40 %	20 %	385836868
17	NC_017496	AAAAT	2	10	17471	17480	80 %	20 %	0 %	0 %	385836871
18	NC_017496	TCATT	2	10	20439	20448	20 %	60 %	0 %	20 %	385836873
19	NC_017496	CAAAA	2	10	22091	22100	80 %	0 %	0 %	20 %	385836876
20	NC_017496	ATTTT	2	10	22506	22515	20 %	80 %	0 %	0 %	385836876
21	NC_017496	CTCAA	2	10	23499	23508	40 %	20 %	0 %	40 %	385836877
22	NC_017496	TTTGA	2	10	25720	25729	20 %	60 %	20 %	0 %	385836879
23	NC_017496	TAAAA	2	10	26797	26806	80 %	20 %	0 %	0 %	385836879
24	NC_017496	GAAAT	2	10	28216	28225	60 %	20 %	20 %	0 %	385836882
25	NC_017496	ATCCA	2	10	31131	31140	40 %	20 %	0 %	40 %	385836887
26	NC_017496	GAAAA	2	10	35277	35286	80 %	0 %	20 %	0 %	385836895
27	NC_017496	AGTCG	2	10	37286	37295	20 %	20 %	40 %	20 %	385836897
28	NC_017496	CAATT	2	10	38960	38969	40 %	40 %	0 %	20 %	385836899
29	NC_017496	GATTG	2	10	39512	39521	20 %	40 %	40 %	0 %	385836900
30	NC_017496	ATTTA	2	10	42663	42672	40 %	60 %	0 %	0 %	385836905
31	NC_017496	TAAAT	2	10	46466	46475	60 %	40 %	0 %	0 %	385836912
32	NC_017496	TTCTT	2	10	53097	53106	0 %	80 %	0 %	20 %	385836920

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.